Kết hợp mô phỏng phân mảnh peptit và khối phổ nhiều lần MSn xác định cấu trúc bậc 1 của Interleukin Interleukin 2

T¹p chÝ Hãa häc, T. 45 (6A), Tr. 43 - 48, 2007<br /> <br /> <br /> KÕt hîp m« pháng ph©n m¶nh peptit vµ khèi phæ nhiÒu<br /> lÇn MSn x¸c ®Þnh cÊu tróc bËc 1 cña Interleukin 2<br /> §Õn Tßa so¹n 15-11-2007<br /> Bïi TiÕn Dòng, Ng« V¨n Quang, NguyÔn TiÕn T i<br /> ViÖn Hãa häc, ViÖn Khoa häc v' C«ng nghÖ ViÖt Nam<br /> <br /> <br /> Summary<br /> Interleukin-2, or IL-2, is a natural occurring protein in our immune system, made by body for<br /> controlling the growth and functions of many types of cells. The partial amino acids (aa)<br /> sequences of IL-2 was determined by a combination of simulation by the Fragment Ion Calculator<br /> and MS experiment in ESI iontrap and tandem MSn modes.<br /> <br /> <br /> I - Giíi thiÖu XRD, hoÆc l sö dông c«ng cô NMR víi c¸c<br /> mÉu protein ®< ®ång vÞ hãa theo 13C v 15N [4].<br /> Interleukin-2, th êng ký hiÖu l IL-2, cïng Ngo i 2 ph ¬ng ph¸p truyÒn thèng ®ßi hái c«ng<br /> víi c¸c interleukin kh¸c, nh IL-4, IL-7, IL-9, cô XRD v NMR hiÖn ®¹i nªu trªn, ng êi ta<br /> IL-15 v IL-21, gäi chung l hä interleukin hay còng cã thÓ x¸c ®Þnh cÊu tróc cña protein b»ng<br /> cytokine, l nh÷ng protein cã vai trß quan träng c¸ch sö dông c¸c ph¶n øng enzim ®Ó ph©n ®o¹n<br /> trong hÖ thèng miÔn dÞch cña c¬ thÓ ng êi. C¬ protein th nh c¸c polypeptit råi x¸c ®Þnh cÊu<br /> chÕ miÔn dÞch víi sù tham gia cña IL-2 v c¸c tÕ tróc riªng phÇn. Trong tÊt c¶ c¸c gi¶i ph¸p trªn,<br /> b o T t ¬ng ®èi phøc t¹p nh ng ®< ® îc l m viÖc kÕt hîp c¸c c«ng cô tÝnh to¸n cña Sinh Tin<br /> s¸ng tá. ChÝnh v× vËy, nhÊt l trong giai ®o¹n v Ho¸ Tin víi c¸c ph ¬ng ph¸p phæ ® îc xem<br /> hiÖn nay, khi HIV trë th nh ®¹i dÞch ®èi víi l mét h íng míi cã triÓn väng [5].<br /> nh©n lo¹i, IL-2 ® îc ®Æc biÖt quan t©m nghiªn Trong b¸o c¸o n y, kÕt qu¶ x¸c ®Þnh trËt tù<br /> cøu, tõ chøc n¨ng trong c¬ chÕ miÔn dÞch, tíi amino axit cña mét ®o¹n polypeptit cña IL2<br /> vai trß cô thÓ cña nã trong ®iÒu trÞ mét sè bÖnh b»ng c¸ch kÕt hîp m« pháng ph©n m¶nh peptit<br /> hiÓm nghÌo, nh ung th hay HIV [1, 2]. v thùc nghiÖm MSn ® îc tr×nh b y nh l<br /> VÒ mÆt cÊu tróc, IL-2 l mét protein kÝch nh÷ng kÕt qu¶ tiÕp sau c«ng bè [6] theo h íng<br /> th íc nhá, trong c¬ thÓ th êng ® îc g¾n liÒn víi nghiªn cøu cÊu tróc polypeptit, nh ng ®Þnh<br /> c¸c yÕu tè kh¸c cña hÖ thèng miÔn dÞch h íng chÝnh v o kÕt hîp Ho¸ Sinh Tin. B i<br /> (receptors), t¹o nªn nh÷ng biÕn thÓ kh¸c nhau. to¸n cÊu tróc cô thÓ l kh¼ng ®Þnh trËt tù aa cña<br /> H×nh 1 l cÊu tróc bËc 1 (trËt tù aa) cña mét ph©n ®o¹n polypeptit khi ®< biÕt tr íc nã l<br /> GalNAc-derivative IL-2, ký hiÖu l Aff-IL-2, mét phÇn cña IL-2. M« pháng ph©n m¶nh cã vai<br /> mét d¹ng liªn kÕt cña IL-2 víi c¸c cét kh¸ng trß gióp ®Þnh h íng v lý gi¶i kÕt qu¶ thùc<br /> thÓ. §o¹n protein t ¬ng ®èi ®Æc tr ng cho IL-2 nghiÖm MS, nhÊt l MSn.<br /> n y gåm 133 aa, trong ®ã cã ®ñ mÆt c¶ 20 lo¹i<br /> aa c¬ b¶n cña c¬ thÓ sèng, víi 1 cÇu sunphit nèi II - Thùc nghiÖm<br /> 2 vÞ trÝ 58 v 105.<br /> §Ó nghiªn cøu cÊu tróc protein nãi chung, MÉu: Polypeptit, ký hiÖu (ID): 85 1 15, s¶n<br /> IL-2 nãi riªng, cã thÓ kÕt tinh protein råi ®o phæ phÈm th ¬ng m¹i cña h