Giả mã bộ gen

Bài viết Ứng dụng kỹ thuật Giải trình tự toàn bộ vùng mã hóa trong phân tích đột biến trên bệnh nhân mắc hội chứng Ohtahara tập trung vào đánh giá phương pháp và xây dựng quy trình WES, nghiên cứu này hạn chế ở số lượng bệnh nhân nhỏ (4 bệnh nhân), phương pháp nghiên cứu là cắt ngang mô tả kết hợp hồi cứu, chưa theo dõi và đánh giá được ảnh hưởng của kết quả xét nghiệm gen lên điều trị bệnh.

9p vipriyankagandhi 27-07-2022 1 1   Download

Canine Parvovirus type 2 (CPV-2) là virus gây bệnh viêm ruột tiêu chảy cấp tính trên chó. CPV-2 là một ADN virus và dựa trên trình tự gen VP2, CPV-2 được chia thành 3 biến thể là CPV-2a, CPV-2b và CPV-2c. Hiện nay CPV-2c là biến thể đang lưu hành phổ biến trên thế giới cũng như Việt Nam. Trong nghiên cứu này, trình tự hệ gen của 8 chủng Parvovirus phân lập được từ chó tại một số tỉnh của miền Bắc trong giai đoạn 2018-2020 đã được giải trình tự.

12p viindranooyi 09-05-2022 19 1   Download

Tôm sú (Penaeus monodon) là loài tôm được nuôi phổ biến ở nước ta và trên thế giới. Hiện nay, sản xuất giống tôm sú vẫn phụ thuộc vào nguồn tôm bố mẹ tự nhiên bởi vì chất lượng sinh sản của tôm tự nhiên cao hơn tôm sú gia hóa. Trước thực tế đó, nhóm tác giả đã tiến hành nghiên cứu hệ gen phiên mã của tôm sú cái tự nhiên và gia hóa ở giai đoạn buồng trứng tiền thành thục bằng kỹ thuật giải trình tự gen thế hệ mới.

5p vishivnadar 21-01-2022 10 0   Download

Ung thư gan nguyên phát là bệnh ung thư phổ biến và có tỉ lệ tử vong cao. Gen HLA-DQ mã hóa các chuỗi polypeptid của phân tử MHC lớp II tham gia hoạt hóa tế bào trình diện kháng nguyên trong đáp ứng miễn dịch. Đa hình đơn nucleotide (SNP) rs2856718 của gen HLA-DQ có thể liên quan tới nhiễm virus viêm gan B mãn tính và nguy cơ ung thư biểu mô tế bào gan. Nghiên cứu này được thực hiện nhằm mục tiêu xác định sự phân bố của SNP rs2856718, đồng thời đánh giá mối liên quan giữa SNP này với nguy cơ mắc ung thư biểu mô tế bào gan.

5p viericschmid 13-01-2022 12 0   Download

Trong nghiên cứu này, cDNA gen mã hóa AACT được phân lập từ sâm Ngọc Linh với vùng mang mã có kích thước 1224 bp, mã hóa cho 408 amino acid. Trình tự cDNA gen mã hóa AACT được công bố trên GenBank với mã số MZ272018, có sự tương đồng so với gen này ở loài Panax notoginseng KJ804173.1 là 99,08%. Tuy có một số điểm khác biệt trong trình tự cDNA gen mã hóa AACT ở sâm Ngọc Linh so với loài tham chiếu nhưng trình tự protein do gen mã hóa mang đầy đủ các đặc tính của AACT với các vị trí quan trọng liên quan tới hoạt tính protein đều được bảo toàn.

11p spiritedaway36 25-11-2021 9 0   Download

Mục tiêu của đề tài nghiên cứu nhằm thông qua kết quả giải trình tự DNA metagenome vi sinh vật suối nước nóng Bình Châu bằng hệ thống giải trình tự gen thế hệ mới; đánh giá được nguồn đa dạng vi sinh vật ưa nhiệt và xây dựng được bộ dữ liệu các gen mã hóa cho cellulase; biểu hiện được các cellulase tái tổ hợp đồng thời; tinh sạch và xác định được tính chất của các cellulase tái tổ hợp này.

185p army 19-09-2021 15 2   Download

Nghiên cứu “Đánh giá khả năng phân loại của hai chỉ thị rbcL và trnL với một số mẫu Bách bộ (Stemonaceae) thu tại phía Bắc Việt Nam” để đánh giá mối quan hệ di truyền giữa Bách bộ với những loài cùng chi đã được định danh trên GenBank, qua đó góp phần bổ sung cơ sở dữ liệu về phân tử, đồng thời làm cơ sở cho việc phân tích di truyền và ứng dụng vào thực tiễn, như nhận diện và bảo tồn sự phát triển các loài Bách bộ của Việt Nam.

5p despicableme36 12-09-2021 10 0   Download

Mục tiêu của đề tài là thu nhận được trình tự nucleotide của toàn bộ hệ gen của một chủng virus viêm gan vịt cường độc mới phân lập tại Việt Nam năm 2013; phân tích được trật tự sắp xếp của từng vùng gen và đặc điểm phân tử của các phân đoạn gen trong hệ gen.

59p beloveinhouse03 22-08-2021 15 2   Download

Khóa luận tốt nghiệp đại học: Nghiên cứu DNA barcode cho một số vật nuôi của Việt Nam được thực hiện với mục tiêu nhằm nhân gen COI của một số vật nuôi: Bò, lợn, dê; diải trình tự gen COI; xây dựng cơ sở dữ liệu DNA barcode cho một số vật nuôi của Việt Nam; đánh giá và so sánh cơ sở dữ liệu DNA barcode của vật nuôi Việt Nam với cơ sở dữ liệu quốc tế. Mời các bạn cùng tham khảo.

64p zhangyan 13-07-2021 22 3   Download

Mục tiêu nghiên cứu của đề tài là giải mã hệ gen phiên mã (transcriptome) từ 4 mô (mô cơ, môt tim, mô gan tụy, mô gốc mắt) của tôm sú (Penaeus monodon), thiết lập cơ sở dữ liệu hệ phiên mã phục vụ cho các nghiên cứu tiếp theo. Sàng lọc các gen giả định liên quan đến tính trạng tăng trưởng của tôm sú. Xác định các SNP và microsatellite từ cơ sở dữ liệu hệ phiên mã. Xác định bộ SNP liên quan đến tính trạng tăng trưởng của tôm sú.

147p chuheodethuong 09-07-2021 10 2   Download

Đề tài luận án “Nghiên cứu xây dựng mã vạch ADN của một số nguồn gen cây trồng có giá trị kinh tế nhằm phục vụ công tác bảo tồn và chọn tạo giống” được thực hiện để xây dựng bộ mã vạch ADN từ đó trợ giúp cho công tác phân loại, nhận dạng được nguồn gen cây ăn quả có giá trị kinh tế gồm bưởi, chuối, nhãn và vải.

236p chuheodethuong 09-07-2021 13 0   Download

Trong nghiên cứu này, các dòng lúa BC15 cải tiến được tích hợp hai gen kháng bệnh đạo ôn, Pik-h và Piz-5 đã được phân tích kiểu gen và đánh giá kiểu hình. Cụ thể, các quần thể BC3F3 thể hiện tính kháng tốt với các nòi đạo ôn trong điều kiện lây nhiễm nhân tạo. Các cá thể BC3F3 này sau đó đã được kiểm tra sự có mặt của hai gen Pik-h và Piz-5 với chỉ thị liên kết gen và đánh giá nền di truyền với bộ chỉ thị phân tử SSR đa hình phân bố rải rác trên hệ gen lúa.

6p parasite 02-06-2021 5 0   Download

Mục tiêu của nghiên cứu là tạo được kháng huyết thanh đa dòng thỏ chẩn đoán Passiflora mottle virus (PaMoV), một potyvirus mới (chi Potyvirus, họ Potyviridae) hại chanh leo, được phát hiện và đặt tên đầu tiên tại Việt Nam. Toàn bộ gen mã hóa protein vỏ (coat protein, CP) của PaMoV đã được dòng hóa trên vector pET28a và được đánh giá biểu hiện trong chủng vi khuẩn Escherichia coli (E. coli) Rosetta (DE3).

11p vianttinic2711 19-04-2021 26 0   Download

Vân sam Phan Xi Păng (Abies delavayi subsp. fansipanensis (Q.P. Xiang) Rurhforth) là loài thực vật bản địa thường phân bố ở độ cao từ 2.400 m so với mực nước biển. Đây là loài nằm trong danh lục các loài thực vật nguy cấp cần được bảo vệ và bị cấm khai thác, sử dụng vì mục đích thương mại. Quần thể Vân sam của Việt Nam tập trung duy nhất ở một vùng núi thuộc đỉnh Phan Xi Păng với đường kính quần thể khoảng 3 km, ở độ cao 2.600-2.950 m, cách xa quần thể Vân sam ở Cang Shan, Trung Quốc khoảng 500 km.

5p kethamoi11 01-04-2021 24 0   Download

Trong nghiên cứu này, nhóm tác giả trình bày kết quả tách dòng và biểu hiện đoạn gen mã hóa vùng quyết định kháng nguyên 56 kDa của O. tsutsugamushi thuộc nhóm Karp từ mẫu HT-09 thu thập ở Bệnh viện Quân y 105 trong tế bào E. coli BL21. Kháng nguyên 56 kDa tái tổ hợp (HT-09) sau đó được tinh chế và sử dụng làm nguyên liệu để tạo bộ kit ELISA phát hiện O. tsutsugamushi.

8p viphilippine2711 30-12-2020 23 0   Download

Các đặc tính nông sinh học và chỉ tiêu năng suất của 252 mẫu giống lúa nhập nội từ Viện Nghiên cứu lúa quốc tế (IRRI) đã được khảo sát tại đồng bằng sông Cửu Long. Số liệu về đặc điểm hình thái của 8 tính trạng định lượng và 4 tính trạng định tính đã được sử dụng để xác định ma trận tương quan Pearson, phân tích thành phần chính và phân tích phân nhóm để xác định sự đa dạng và mức độ liên hệ giữa các đặc điểm nông sinh học được đánh giá.

8p vihongkong2711 04-02-2020 53 0   Download

Hà Nội được đánh giá là có đa dạng sinh học (ĐDSH) cao, không chỉ về thành phần động, thực vật, chi (giống), loài, mà còn về hệ sinh thái (HST) và nguồn gen quý hiếm. Trong đó, hồ Tây là ví dụ điển hình đa dạng về HST. HST vùng nước ven bờ và bờ với các quần xã sinh vật nổi thực vật bám đáy, thực vật thủy sinh bậc cao; Bờ hồ còn có các hang hốc, là nơi cư trú của các loài lươn, cua và tôm...

3p vistockholm2711 13-12-2019 35 0   Download

Ở thực vật, SWEET (sugars will eventually be exported transporter) là họ protein vận chuyển đường sucrose đóng vai trò quan trọng, tham gia vào nhiều quá trình sinh học thiết yếu trong tế bào. Trong nghiên cứu này, hiện tượng lặp của họ gen mã hóa SWEET ở cây đậu gà (Cicer arietinum) đã được phân tích thông qua các công cụ tin sinh học. Kết quả đã xác định được 6 sự kiện lặp trong họ gen CaSWEET ở đậu gà.

5p camtucau99 14-11-2019 30 1   Download

Nhân tố phiên mã Nuclear factor-Y (NF-Y) được cấu tạo bởi 3 tiểu phần NF-YA, NF-YB và NF-YC, là nhóm protein điều hòa tham gia vào nhiều quá trình quan trọng ở thực vật. Trong nghiên cứu này, tiểu phần NF-YC đã được phân tích ở cây sắn (Manihot esculenta) dựa trên các phân tích tin sinh học. Kết quả đã xác định được 14 gen mã hóa NFYC ở genome cây sắn, đặt tên là MeNF-YC. Phân tích cấu trúc cho thấy, phần lớn các gen MeNF-YC chỉ có một exon, tương tự như ghi nhận ở các loài thực vật khác.

4p camtucau99 09-11-2019 29 0   Download

Gen cytochrome b ty thể được sử dụng phổ biến trong việc đánh giá tính đa hình và mối quan hệ phát sinh loài của các cá thể lợn (Sus scrofa). Trong đề tài này, vùng trình tự gen cytochrome b dài 552bp được sử dụng để đa giá các điểm đột biến, điểm đa hình và mối quan hệ di truyền giữa các cá thể lợn rừng bản địa của Việt Nam, lợn rừng lai và các cá thể lợn rừng khác trên thế giới. Kết quả sắp xếp cho thấy có 9 vị trí đa hình trong các haplotype lợn rừng, trong đó đã xác định được 3 vị trí đa hình đặc trưng cho các haplotype lợn rừng bản địa của Việt Nam.

7p trinhthamhodang 24-10-2019 53 1   Download