Kế thừa thuật toán BiMeta

Bài báo trình bày giải pháp gom nhóm các trình tự trong metagenomic áp dụng mô hình ẩn (Latent Dirichlet Allocation) để tìm chủ đề ẩn có ý nghĩa, làm chủ đề đặc trưng cho trình tự. Từ chủ đề đặc trưng, tiến hành xác định nhóm của trình tự bằng phương pháp Kullback Leibler dựa trên sự phân bổ của chủ đề thay vì tính toán trực tiếp giữa các trình tự. Giải pháp kế thừa thuật toán BiMeta, tạo các nhóm trình tự gốc dựa vào thông tin trùng lắp trước khi áp dụng mô hình ẩn tìm chủ đề, khi đó, dữ liệu phân tích để tìm chủ đề ẩn được giảm đáng kể.

7p quenchua9 20-11-2020 31 2   Download