Phân tích genome

Các nghiên cứu tương quan toàn bộ hệ gen (GWAS: Genome-wide association study) là một công cụ rất hiệu quả để nghiên cứu vai trò của yếu tố di truyền trong các bệnh lý đa nguyên nhân phức tạp. Tuy nhiên, với số lượng các điểm đa hình đơn nucleotide rất lớn được sử dụng trong các chip microarray, việc kiểm soát chất lượng dữ liệu từ các mẫu nghiên cứu là hết sức cần thiết. Thông qua nghiên cứu này, tác giả đã sử dụng các kỹ thuật sinh tin học để kiểm soát chất lượng các mẫu được phân tích toàn bộ hệ gen trên 494 người bình thường và 503 bệnh nhân đái tháo đường típ 2.

7p kimphuong1129 25-09-2023 10 2   Download

Tiếp nội dung phần 1, Giáo trình Công nghệ Sinh học: Phần 2 cung cấp cho người đọc những kiến thức như: các phương pháp ứng dụng trong phân tích genome; kỹ thuật cải biến di truyền ở thực vật. Mời các bạn cùng tham khảo!

104p trankora06 19-07-2023 15 6   Download

Nối tiếp nội dung phần 1, phần 2 cuốn sách giáo trình "Công nghệ sinh học" trình bày các nội dung: Các phương pháp ứng dụng trong phân tích genome, kỹ thuật cải biến di truyền ở thực vật. Mời các bạn cùng tham khảo nội dung chi tiết.

104p besfriend10 04-07-2023 7 2   Download

Nghiên cứu "Ứng dụng so sánh genome trong chẩn đoán bệnh thủy sản" tổng hợp các kết quả và ứng dụng các phương pháp so sánh genome thao tác trên dữ liệu vi khuẩn gây bệnh thủy sản, bao gồm chi Vibrio và Edwardsiella với mục tiêu hướng đến các phương pháp phân tích hiện đại trong kiểm soát bệnh do vi khuẩn trong nuôi trồng thủy sản ở Việt Nam. Mời các bạn cùng tham khảo bài viết!

8p senda222 22-02-2023 5 3   Download

Nội dung chính của bài viết trình bày ngắn gọn về proteogenomics, tích hợp của proteomics với genomics và transcriptomics, theo đó các công nghệ nền tảng là giải trình tự thế hệ tiếp theo (NGS) và phép đo phổ khối (MS) với xử lý các dữ liệu thu được, một lĩnh vực mới nổi hứa hẹn thúc đẩy nhanh những nghiên cứu cơ bản liên quan đến quá trình phiên mã, dịch mã, cũng như các khả năng ứng dung. Bằng cách kết hợp các thông tin của hệ gen và hệ protein, các nhà khoa học đang đạt được những kết quả mới do sự hiểu biết đầy đủ và thống nhất hơn về các quá trình sinh học phân tử phức tạp.

14p spiritedaway36 25-11-2021 27 2   Download

Trong nghiên cứu này khảo sát pan-genome của chủng Edwardsiella để tìm sự khác biệt về hệ gene, tái định danh loài ở mức độ phát sinh bộ gene (phylogenomics). Kết quả phân tích pan-genome cho thấy, giống Edwardsiella được phân tách thành các kiểu loài trong quần thể và có thể giúp định danh lại loài với độ chính xác cao. Mời các bạn cùng tham khảo!

7p sotritu 18-09-2021 24 3   Download

Đề cương giúp người học nắm được các thông tin cơ bản về môn học Ứng dụng công nghệ sinh học trong bảo tồn. Học phần trang bị cho người học những kiến thức cơ bản về gen và genome, phân tích được những ứng dụng sự hiểu biết về gen và genome trong bảo tồn. Hiểu được tổng quan những giá trị của tài nguyên đa dạng thực vật, công tác bảo tồn và phát triển nguồn gen hiện tại ở Việt Nam và trên thế giới.

5p koxih_kothogmih8 01-10-2020 49 2   Download

Bài viết phân tích đặc điểm kích thước một số đoạn SSR và đánh giá sự đa dạng genome 18 giống/dòng chè thu thập tại địa điểm: xã Tân Cương, Công ty chè Sông Cầu và xã Minh Lập (Đồng Hỷ), Thái Nguyên.

12p vitheseus2711 28-10-2019 46 2   Download

Bài nghiên cứu này áp dụng phương pháp phân tích tổng quan dựa trên hệ gen học (genome-wide characterization) cho họ gen Rboh trên hệ gen của cây đậu tương [(Glycine max L. Merr.)]. Sử dụng trình tự hệ gen chất lượng cao, chúng tôi đã xác định được 17 gen Rboh ở cây đậu tương. Các gen Rboh này phân bố khá đồng đều trải dài trên 14 trong tổng số 20 nhiễm sắc thể của cây đậu tương.

11p viathena2711 08-10-2019 43 1   Download

Trong nghiên cứu, 30 chỉ thị ISSR đã được sử dụng để nghiên cứu đa dạng di truyền genome của 35 mẫu Sơn tra thu thập ở 7 quần thể (Mường La, Cà Mạ, Bắc Yên, Trạm Tấu, Mù Căng Chải, Bát Xát and Sìn Hồ). Kết quả chỉ ra 28/30 chỉ thị chỉ ra tính đa hình và nhân bản được 148 phân đoạn DNA, trong đó có 96 phân đoạn đa hình (chiếm 64,86%). Trung bình giá trị đa dạng gen trên một locus (Hj) và hàm lượng thông tin đa hình của các chỉ thị tương ứng là 0,133 và 0,119.

12p hanh_tv31 26-04-2019 42 1   Download

Nghiên cứu giải mã toàn bộ genome của 3 chủng virus PRRS tại 3 thời điểm dịch khác nhau, phân tích sự tiến hóa về genome và gen ORF5 là thực sự cần thiết để có dữ liệu gen học về các chủng đại diện, giúp cho việc nghiên cứu sản xuất các vacxin thế hệ mới phù hợp với virus PRRS đang lưu hành, đồng thời xác định được mức độ tiến hóa của virus đương nhiễm với các chủng trước đó tại Việt Nam và trên thế giới.

9p vidanh95 12-12-2018 73 1   Download

Khoảng cách di truyền giữa mtDNA chó Phú Quốc nòi E1, E4 và và chó Pusang (EU789662) nằm chung trong 1 cụm trên cây tiến hóa lần lượt là 0,072% và 0,24% cho thấy chó Phú Quốc mang haplotype E có quan hệ rất gần với các chó Pungsan ở Triều Tiên. Mặc dù cùng haplogroup nhưng khoảng cách di truyền của chó Phú Quốc dòng E1 và E4 lại ở mức 0,23%. Trong khi đó khoảng cách di truyền giữa chó Phú Quốc dòng E1, E4 so với các chó sói xám nằm ở vị trí phân kỳ chị em trên phả hệ đồ lần lượt là 0,3, và 0,1%. Genome ty thể chó mang dòng E4 là lần đầu tiên được giải mã và phân tích trên thế giới.

10p nguyenhong1235 28-11-2018 47 4   Download

Bài viết này phân tích phân lập gen phyA thành thục tử A niger để tạo chủng tái tổ hợp, sản xuất phytase giá thành thấp thay thế cho phytase nhập ngoại.

8p trieuroger 13-09-2018 56 2   Download

Trong nghiên cứu này, từ các 4 chủng P. aeruginosa và 4 chủng S. aureus đã được phân lập tại bệnh viện Đa khoa Trung ương Thái Nguyên, chúng tôi tiến hành phân tích sự tương đồng trong cấu trúc genome giữa các chủng của mỗi loài bằng kỹ thuật RAPD nhằm xác định sơ bộ xem thực chất có bao nhiêu chủng khác nhau về cấu trúc di truyền trong số các chủng được phân lập.

6p cumeo2005 02-07-2018 68 3   Download

Trong nghiên cứu này, bài viết phân tích đặc điểm kích thước của một số đoạn SSR và đánh giá sự đa dạng genome các giống/dòng chè thu thập tại xã Tân Cương, thành phố Thái Nguyên, tỉnh Thải Nguyên; Công ty chè Sông Cầu và xã Trại Cài – huyện Đồng Hỷ tỉnh Thái Nguyên. DNA tổng số từ các mẫu nghiên cứu được sử dụng làm khuôn để thực hiện kỹ thuật PCRSSR với 5 cặp mồi đặc hiệu.

10p blackwidow123 15-06-2018 85 2   Download

Bài viết nghiên cứu về việc tăng cường biểu hiện kháng nguyên GP5 của virus PRRS biểu hiện ở thực vật bằng cách phát triển cấu trúc vector dựa trên virus thực vật. Cấu trúc vector được thiết kế mang genome của virus TMV (Tobaco Mosaic Virus) tái tổ hợp với GP5 dưới sự điều khiển của promoter cảm ứng nhiệt Hsp18.2, phân lập từ Arabidopsis thaliana hoặc promoter cơ định 35S. Hiệu quả của các vector biểu hiện sẽ được đánh giá phân tích trong các dòng tế bào thuốc lá BY-2.

7p jangni 16-04-2018 72 1   Download

Bài viết áp dụng kỹ thuật giải trình tự Ion Torrent nhằm xây dựng cơ sở dữ liệu EST từ mô thận của cá tra nuôi ở độ mặn 9 ppt. Kết quả giải trình tự đạt được 2.623.929 đoạn trình tự có chiều dài trung bình là 104 bp sau khi sàng lọc loại bỏ các đoạn trình tự có chất lượng thấp. Các đoạn trình tự được lắp ráp thành contig sử dụng các phần mềm lắp ráp CLC Genomic Workbench, Trinity và Velvet/Oases, trong đó CLC là chương trình lắp ráp tối ưu nhất.

8p jangni 16-04-2018 54 0   Download

Trong bài viết này, chúng tôi đã tìm được 121 protein giàu Met (AtMRP) từ cơ sở dữ liệu genome của cây Arabidopsis thaliana, trong đó, khoảng 50% số gen là chưa được xác định chức năng. Dựa trên các nghiên cứu trước đây về biểu hiện của gen trong điều kiện bất lợi, chúng tôi đã xác định được 23 và 16 gen AtMRP có mức độ phiên mã tăng và giảm tương ứng trong điều kiện hạn, 11 và 17 gen có mức biểu hiện tăng và giảm khi xử lý mặn.

9p jangni 16-04-2018 76 3   Download

Trong bài viết này, dữ liệu trình tự vùng D-loop trong nghiên cứu này từ 77 cá thể chó Phú Quốc và 30 chó nhà được phân tích để có thể kết luận về nguồn gốc của giống nòi chó quý này. Mời các bạn cùng tham khảo.

10p jangni 16-04-2018 69 4   Download

Tiếp nối phần 1, phần 2 của giáo trình Sản xuất protein trong Y học trình bày về vectors; tạo dòng gen; xác định gen; tạo đột biến; sản xuất và tinh sạch protein; phân tích hậu genome. Giáo trình phục vụ cho các bạn chuyên ngành Y học và những bạn quan tâm tới lĩnh vực này.

168p maiyeumaiyeu09 14-09-2016 55 6   Download