Phương pháp nghiên cứu in silico

Nghiên cứu này mô tả đánh giá sàng lọc in silico về các hợp chất thực vật của cây Chùa dù nhằm mục tiêu vào yếu tố hoại tử khối u α (TNF-α) bằng phương pháp mô phỏng gắn kết phân tử (molecular docking). Cấu trúc phân tử đã được thực hiện để xem xét mô hình gắn kết của các hợp chất thực vật cây Chùa dù cùng với cấu trúc tinh thể của TNF-α (PDB ID: 2AZ5) bằng cách sử dụng chương trình AutoDock Vina, tiếp theo là nghiên cứu về các axit amin tương tác và tác động của chúng đối với khả năng ức chế của các hợp chất tiềm năng.

8p viritesh 02-04-2024 6 2   Download

Bài viết trình bày việc khám phá cơ chế tác dụng của các chất trong cây lá đắng - Vernonia Amygdalina (VA) Asteraceae trên bệnh đái tháo đường týp 2 (ĐTĐ T2) ở cấp độ phân tử. Phương pháp nghiên cứu: Sử dụng kỹ thuật mô phỏng trên máy tính (in silico) gồm dược lý nối mạng (network pharmacology) và gắn kết phân tử (molecular docking) để dự đoán cơ chế thông qua xác định các đích tác động cho các chất của VA trên ĐTĐ T2.

12p vipanda 29-01-2024 10 3   Download

Kháng kháng sinh (KKS) là mối đe dọa sức khỏe cộng đồng và ảnh hưởng lớn đến con người. Pseudomonas aeruginosa (PA) là tác nhân gây ra nhiều bệnh nhiễm trùng và tỉ lệ xuất hiện kháng kháng sinh ở vi khuẩn này ngày càng gia tăng. Nghiên cứu này phân tích tần số xuất hiện gen KKS ở PA, từ đó tiến hành sàng lọc chất ức chế gen KKS có tần số xuất hiện cao nhất bằng phương pháp sàng lọc ảo in silico.

5p vipierre 30-09-2023 14 6   Download

Bài viết Sàng lọc in silico các hợp chất Xanthone có tác dụng ức chế enzym α-glucosidase định hướng điều trị đái tháo đường type 2 tiến hành đánh giá khả năng ức chế enzym α-glucosidase của 133 hợp chất xanthone định hướng điều trị đái tháo đường bằng phương pháp docking phân tử.

8p vihulk 28-07-2023 9 3   Download

Một loạt hợp chất lai mới chứa nhân benzimidazol và 1,3,5-triazin được thiết kế từ thuốc Gedatolisib. Các hợp chất này đã được sàng lọc cho hoạt tính kháng ung thư in silico trên thụ thể phosphoinositide 3-kinase (PI3K) bằng phương pháp docking phân tử sử dụng AutoDock Vina. Mời các bạn cùng tham khảo bài viết "Thiết kế, đánh giá hoạt tính kháng ung thư in silico và nghiên cứu ADME của dẫn chất tương đồng thuốc Gedatolisib như chất ức chế PI3K" để nắm được nội dung chi tiết.

10p phuong3128 23-06-2023 12 3   Download

Bài viết Nghiên cứu sàng lọc in silico các phân tử nhỏ có tiềm năng ức chế interleukin-2 trình bày tổng quát là dự đoán khả năng gắn kết của các phân tử nhỏ với IL-2 bằng phương pháp docking bằng phần mềm LeadIT sẽ giúp chọn ra các hợp chất tiềm năng.

6p vihawkeye 02-06-2023 14 2   Download

Bài viết Nghiên cứu khả năng gắn kết in silico của các hợp chất tự nhiên ức chế HER2 định hướng điều trị ung thư vú nghiên cứu khả năng gắn kết của các hợp chất tự nhiên có tiềm năng ức chế hoạt động đích phân tử HER2 bằng phương pháp docking phân tử, từ đó, đưa ra các hợp chất tiềm năng trong phát triển thuốc điều trị ung thư vú.

10p vihawkeye 02-06-2023 10 2   Download

Luận văn "Sàng lọc in silico các hợp chất polyphenol có tác dụng ức chế enzym HMGCoA reductase định hướng điều trị rối loạn lipid máu" nghiên cứu sàng lọc các hợp chất polyphenol có tác dụng ức chế enzym HMG-CoA reductase bằng phương pháp docking phân tử; đánh giá các đặc điểm giống thuốc và phân tích các thông số dược động học và độc tính của các hợp chất tốt nhất thu được sau quá trình sàng lọc.

74p bigdargon08 13-02-2023 20 11   Download

Mục tiêu của đề tài "Sàng lọc in silico các hợp chất xanthone có tác dụng ức chế enzym alpha glucosidase định hướng điều trị đái tháo đường typ 2" là sàng lọc các hợp chất xanthone có tác dụng ức chế enzym AG bằng phương pháp docking phân tử; nghiên cứu các đặc điểm giống thuốc và tính toán các thông số dược động học và độc tính của các hợp chất tốt nhất thu được sau quá trình sàng lọc.

63p bigdargon08 13-02-2023 23 7   Download

Đề tài "Nghiên cứu tác dụng ức chế enzym αglucosidase của cây Chè vằng (Jasminum subtriplinerve) trên mô hình in vitro và in silico" nghiên cứu nhằm đánh giá tác dụng ức chế enzym α-glucosidase của cây Chè vằng trên mô hình in vitro; xác định những hợp chất trong cây Chè vằng có tác dụng ức chế enzym αglucosidase bằng phương pháp docking phân tử.

53p unforgottennight09 26-10-2022 23 11   Download

Đề tài "Sàng lọc in silico các hợp chất alkaloid có tác dụng ức chế thụ thể ERalpha hướng điều trị bệnh ung thư vú" nghiên cứu nhằm 2 mục tiêu: Sàng lọc các hợp chất alkaloid có tác dụng ức chế thụ thể ER-alpha bằng phương pháp docking phân tử; phân tích các đặc điểm giống thuốc và tính toán các thông số dược động học và độc tính của các hợp chất tốt nhất thu được sau quá trình sàng lọc.

59p unforgottennight09 26-10-2022 24 12   Download

Đề tài "Nghiên cứu tác dụng chống lão hoá của Lãnh công (Fissistigma oldhamii (Hemsl.) Merr.) trên một số enzyme kết hợp mô hình dược lý mạng in silico" nghiên cứu nhằm đánh giá tác dụng sinh học của Lãnh công qua mô hình thu dọn gốc tự do DPPH và khả năng ức chế các enzyme Tyrosinase, Elastase và Hyaluronidase; phân tích, dự đoán cơ chế chống lão hóa của Lãnh công sử dụng phương pháp network pharmacology.

54p unforgottennight09 26-10-2022 22 9   Download

Bài viết Nghiên cứu in vitro và in silico sàng lọc các hợp chất của cây Chè vằng (Jasminum subtriplinerve Blume) có tác dụng ức chế enzym α-glucosidase trình bày đánh giá tác dụng ức chế α-glucosidase in vitro của cây chè vằng (Jasminum subtriplinerve Blume.) và xác định những hợp chất trong cây chè vằng có tác dụng ức chế α-glucosidase bằng phương pháp docking phân tử.

11p vipriyankagandhi 27-07-2022 15 2   Download

Nghiên cứu thuốc điều trị ung thư mới hiện nay đang là mối quan tâm hàng đầu của thế giới. Một trong số các mục tiêu phân tử đáng chú ý là enzym Histon Deacetylase 2 (HDAC2). Hiện nay, khoa học máy tính ngày càng được sử dụng rộng rãi trong tìm kiếm và phát triển thuốc mới.

6p viclerkmaxwel 16-02-2022 28 3   Download

Bệnh hại do vi khuẩn, virus là mối đe dọa nghiêm trọng đối với ngành sản xuất chuối trên thế giới nói chung, Việt Nam nói riêng. Ngoài các biện pháp canh tác, việc khai thác và ứng dụng nguồn gen kháng - phần lớn thuộc họ gen NBS-LRR (Nucleotide binding site - Leucine rich repeat) trong chọn tạo, cải thiện giống chuối là phương thức bền vững để đối phó với dịch bệnh. Hệ gen loài chuối Musa acuminata được giải mã tạo tiền đề cho các nghiên cứu di truyền chuyên sâu, bao gồm xác định họ gen kháng NBS-LRR.

7p vishivnadar 21-01-2022 33 1   Download

Mục tiêu của đề tài là sàng lọc một số hợp chất coumarin có tác dụng ức chế enzyme carbonic anhydrase II (CAII) bằng phương pháp Docking phân tử; nghiên cứu đặc tính giống thuốc và tính toán dược động học - độc tính của chúng; từ đó tìm ra các hợp chất tiềm năng.

62p closefriend03 13-10-2021 42 10   Download

Nghiên cứu này hướng tới mục tiêu xác định và phân tích đặc điểm của các gene SAP ở cây đu đủ, loại cây ăn quả nhiệt đới quan trọng, bằng các phương pháp tin sinh học, phương pháp nghiên cứu hiện đại, phổ biến trong công nghệ sinh học hiện đại. Mời các bạn cùng tham khảo!

8p thehungergames 14-08-2021 33 2   Download

Khóa luận được nghiên cứu với mục tiêu nhằm xây dựng hai mô hình QSAR cho phép tìm kiếm các hợp chất có tác dụng sinh học trên từng đích phân tử là PPARγ và SGLT2 hướng điều trị ĐTĐ tuýp 2. Sàng lọc được một số hợp chất thiên nhiên có tác dụng điều trị tiểu đường tuýp 2 sử dụng hai mô hình QSAR đã xây dựng. Kiểm tra hoạt tính sinh học của các hợp chất đã sàng lọc qua mô hình in vivo.

57p chuheodethuong25 12-07-2021 73 14   Download

Mục tiêu nghiên cứu của khóa luận là: Xây dựng hai mô hình QSAR cho phép tìm kiếm các hợp chất có tác dụng sinh học trên từng đích phân tử là PPARγ và SGLT2 hướng điều trị ĐTĐ tuýp 2. Kiểm tra hoạt tính sinh học của các hợp chất đã sàng lọc qua mô hình in vivo. Mời các bạn tham khảo!

57p hobbsandshaw 09-06-2021 54 11   Download

DREB3 thuộc về họ gen DREB (dehydration-responsive element binding), họ tác nhân điều hòa phiên mã có vai trò quan trọng ở thực vật. Trong công trình này, nhờ sử dụng các phương pháp nghiên cứu in silico, chúng tôi đã xác định được gen DREB3 của cây quýt. CclDREB3 khá giống với các DREB thuộc phân nhóm A3 của các loài thực vật khác.

4p vichengna2711 24-02-2020 37 2   Download