ĐẠI HỌC QUỐC GIA HÀ NỘI
TRƯỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC TỰ NHIÊN
LÊ THỊ QUYÊN
NGHIÊN CỨU QUÁ TRÌNH THỦY PHÂN TINH BỘT
BỞI MUCORACEAE TRONG SẢN XUẤT RƯỢU
TRUYỀN THỐNG VIỆT NAM
LUẬN VĂN THẠC SĨ KHOA HỌC
Hà Nội - 2019
ĐẠI HỌC QUỐC GIA HÀ NỘI
TRƯỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC TỰ NHIÊN
LÊ THỊ QUYÊN
NGHIÊN CỨU QUÁ TRÌNH THỦY PHÂN TINH BỘT
BỞI MUCORACEAE TRONG SẢN XUẤT RƯỢU
TRUYỀN THỐNG VIỆT NAM
Chuyên ngành: Vi Sinh Vật Học
Mã số: 8420101.07
LUẬN VĂN THẠC SĨ KHOA HỌC
NGƯỜI HƯỚNG DẪN KHOA HỌC:
PGS.TS Vũ Nguyên Thành
PGS.TS Bùi Thị Việt Hà
Hà Nội - 2019
LỜI CẢM ƠN
Luận văn Thạc sĩ này được em thực hiện tại Trung tâm Vi sinh vật Công
nghiệp – Viện Công nghiệp thực phẩm, để có được những kết quả này em xin chân
thành cảm ơn Thầy PGS.TS Vũ Nguyên Thành và Cô PGS.TS Bùi Thị Việt Hà -
những người thầy đã luôn tận tình hướng dẫn, chỉ bảo, tạo mọi điều kiện giúp em
thực hiện luận văn.
Để có được nền tảng kiến thức khoa học tốt, phục vụ trong nghiên cứu này em
xin gửi lời cảm ơn đến các thầy cô Khoa Sinh học, Trường Đại học Khoa học Tự
nhiên, Đại học Quốc gia Hà Nội đã luôn tận tình truyền đạt kiến thức, chỉ bảo cho em
trong suốt thời gian sinh viên và học viên cao học. Bên cạnh đó, em xin gửi lời cảm
ơn tới các anh chị cán bộ tại Trung tâm Vi sinh vật Công nghiệp - Viện Công nghiệp
Thực phẩm đã luôn giúp đỡ, chia sẻ kinh nghiệp, hỗ trợ kỹ thuật trong suốt thời gian
qua.
Cuối cùng, em xin dành lời cảm ơn chân thành đến gia đình, người thân và
bạn bè, những người luôn động viên, giúp đỡ, tạo điều kiện tốt nhất để em yên tâm
học tập và nghiên cứu khoa học.
Hà Nội, ngày 11 tháng 12 năm 2019
Học viên
i
Lê Thị Quyên
MỤC LỤC
LỜI CẢM ƠN ............................................................................................................. i
DANH MỤC BẢNG ................................................................................................. iv
DANH MỤC HÌNH ................................................................................................... v
DANH SÁCH KÝ HIỆU VÀ CHỮ VIẾT TẮT ..................................................... vi
MỞ ĐẦU .................................................................................................................... 1
CHƯƠNG 1: TỔNG QUAN ..................................................................................... 3
1.1. Giới thiệu về rượu truyền thống ........................................................................... 3
1.1.1. Men rượu ........................................................................................................... 3
1.1.2. Các giai đoạn lên men rượu .............................................................................. 5
1.2 Giới thiệu về họ Mucoraceae ................................................................................ 9
1.3. Tình hình nghiên cứu về rượu truyền thống Việt Nam ...................................... 11
1.4. Giới thiệu về sắc kí khí kết nối khối phổ (GCMS) ............................................ 12
1.5. Ứng dụng phương pháp HS-SPME GCMS trong phân tích các hợp chất tạo
hương của đồ uống .................................................................................................... 13
CHƯƠNG 2: ĐỐI TƯỢNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU ................... 16
2.1. Đối tượng ........................................................................................................... 16
2.2. Hóa chất, dụng cụ, trang thiết bị máy móc ........................................................ 16
2.2.1. Hóa chất .......................................................................................................... 16
2.2.2. Dụng cụ và trang thiết bị, máy móc ................................................................ 17
2.3. Phương pháp nghiên cứu .................................................................................... 17
2.3.1. Phương pháp phân lập .................................................................................... 17
2.3.2. Làm sạch và giữ giống .................................................................................... 17
2.3.3. Chụp ảnh hình thái khuẩn lạc, tế bào ............................................................. 18
2.3.4. Phương pháp tách chiết DNA tế bào nấm mốc, nấm men, giả men ............... 18
2.3.5. Phương pháp tinh chế DNA ............................................................................ 18
2.3.6. Phương pháp tiến hành phản ứng PCR fingerprinting ................................... 19
2.3.7. Phương pháp điện di ....................................................................................... 20
2.3.8. Nhuộm gel và đọc kết quả ............................................................................... 20
ii
2.3.9. Phương pháp phân loại nấm dựa vào đọc trình tự rDNA .............................. 20
2.3.10. Phân tích hoạt lực enzyme amylase từ các chủng mốc ................................. 21
2.3.11 Kiểm tra khả năng chịu nhiệt của các chủng mốc đại diện ........................... 23
2.3.12. Kiểm tra sự thủy phân tinh bột của một số nhóm mốc khi có đường ............ 23
2.3.13. Lên men rượu từ các chủng mốc và men thuần chọn lọc.............................. 24
2.3.14. Đo độ cồn bằng sôi kế ................................................................................... 25
2.3.15. Phân tích phổ hương của các mẫu rượu gạo chưng cất bằng máy sắc ký khí
kết nối khối phổ GCMS. ............................................................................................ 26
Chương 3: KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU .................................................................. 28
3.1. Kết quả phân lập vi nấm từ 15 bánh men........................................................... 28
3.2. Kết quả hình thái khuẩn lạc, tế bào. ................................................................... 28
3.3. Phân nhóm bằng kỹ thuật PCR-fingerprinting và định danh chủng nấm đại diện
dựa vào phân tích trình tự rDNA .............................................................................. 34
3.4. Phân tích hoạt lực enzyme amylase bằng DNS ................................................. 39
3.5. Kiểm tra khả năng chịu nhiệt của các chủng mốc đại diện ................................ 43
3.6. Kết quả sự thủy phân tinh bột của một số nhóm mốc khi có đường.................. 45
3.7. Kết quả lên men rượu từ các chủng nấm mốc và nấm men thuần. .................... 47
3.8.Phân nhóm mẫu rượu dựa trên kết quả các hợp chất bay hơi trong các mẫu rượu
thu thập và các mẫu sử dụng chủng thuần. ............................................................... 49
KẾT LUẬN .............................................................................................................. 53
TÀI LIỆU THAM KHẢO ...................................................................................... 55
iii
PHỤ LỤC ................................................................................................................. 59
DANH MỤC BẢNG
Bảng 1.1. Các loại giống khởi động để lên men đồ uống có cồn ở Châu Á ................. 4
Bảng 2.1. Tỷ lệ bổ sung giống ở mỗi mẫu lên men ............................................................ 25
Bảng 3.1. Kết quả phân nhóm các chủng bằng fingerprinting và đọc trình tự các chủng
đại diện ...................................................................................................................... 36
Bảng 3.2. Hoạt lực enzyme amylase của các chủng mốc thuần ............................... 39
Bảng 3.3. Kích cỡ khuẩn lạc trên môi trường tinh bột 1% ở các nhiệt độ ................ 44
Bảng 3.4. Kết quả đo độ cồn của dịch lên men rượu từ các chủng thuần và 15 mẫu
bánh men ................................................................................................................... 47
iv
Bảng 3.5. Các nhóm hợp chất xuất hiện trong các mẫu rượu ................................... 50
DANH MỤC HÌNH
Hình 1.1. Một quy trình truyền thống làm men rượu ở Việt Nam .............................. 5
Hình 1.2. Quá trình thủy phân tinh bột bởi các enzyme amylase ............................... 6
Hình 1.3. Sơ đồ tóm tắt quy trình lên men rượu ......................................................... 9
Hình 1.4 Sơ đồ cấu tạo của GC-MS .......................................................................... 13
Hình 1.5. Sơ đồ tách chiết hợp chất bay hơi bằng HS-SPME GCMS ...................... 14
Hình 3.1. Hình thái khuẩn lạc và tế bào của các nhóm nấm đại diện ....................... 32
Hình 3.2. Phổ băng DNA fingerprinting ................................................................... 35
Hình 3.3. Hoạt lực enzyme amylase của các chủng nấm mốc (IU/ml)..................... 42
v
Hình 3.4. Đường kính khuẩn lạc nấm mốc trên môi trường tinh bột 1% ở các nhiệt độ...............................................................................................................................45 Hình 3.5. Kết quả thủy phân tinh bột trong môi trường có đường của các chủng mốc............................................................................................................................46 Hình 3.6. Các nhóm rượu khác nhau từ 32 mẫu rượu………………………..…….51
DANH SÁCH KÝ HIỆU VÀ CHỮ VIẾT TẮT
°C: độ celsius
CNTP: Công nghiệp Thực phẩm
dNTP: deoxyribonucleotide triphosphate.
h: hour (giờ)
ITS: Internal transcribed spacer
PCR: Polymerase chain reaction
rDNA: ribosomal DNA
rpm: round per minute (vòng/phút)
TTVSVCN: Trung tâm Vi sinh vật Công nghiệp
HS-SPME GCMS: headspace-solid phase microextraction gas chromatography
vi
mass spectrometer
MỞ ĐẦU
Rượu truyền thống là loại đồ uống có cồn, xuất hiện từ rất lâu đời và được sử
dùng rộng rãi trong nhân dân. Chúng thường được sản xuất theo quy mô hộ gia đình
và có hương vị đa dạng của từng vùng miền như rượu Làng Vân (tỉnh Bắc Giang), rượu
Kim Sơn (tỉnh Ninh Bình), rượu Bàu Đá (tỉnh Bình Định). Để tạo nên sự khác biệt đó
có nhiều yếu tố như nguyên liệu, cách thức nấu, và đặc biệt là sự biến đổi của hệ vi
sinh vật trong bánh men. Việc sử dụng bánh men với phức hệ vi sinh quá đa dạng
thường gây khó khăn trong quá trình kiểm soát chất lượng sản phẩm rượu, vì vậy việc
nghiên cứu sâu về chủng giống sẽ rất cần thiết. Các loại rượu trên thế giới đều cho thấy
loài Saccharomyces cerevisiae đóng vai trò chủ đạo trong lên men rượu, tuy nhiên nấm
mốc thì khác biệt hơn, với mỗi loại rượu thì loài nấm mốc là khác nhau như khi nói tới
rượu Sake của Nhật Bản thì đều biết đến loài Aspergillus oryzae, khi nhắc tới rượu
Hong Qu ở Trung Quốc thì đều biết đến loài Monascus purpureus, thế nhưng ở Việt
Nam vẫn chưa có nghiên cứu nào chỉ ra loài nấm mốc nào đóng vai trò chủ đạo trong
lên men rượu truyền thống Việt Nam.
Trong lên men rượu truyền thống Việt Nam hầu hết các nhóm chủng được tìm
thấy thuộc họ Mucoraceae có khả năng thủy phân cơ chất giàu tinh bột thành đường
nhưng chưa được nghiên cứu kỹ về đặc tính liên quan tới đường hóa. Các nghiên cứu
trước đây liên quan tới men rượu thì chủ yếu về tính đa dạng vi sinh vật của bánh men
và lựa chọn các chủng nấm mốc có hoạt lực enzyme cao, chủng nấm men có khả năng
lên men rượu tốt để làm bánh men. Vì vậy, luận văn này được thực hiện nhằm đánh
giá đặc tính thủy phân tinh bột của các chủng nấm mốc thuộc họ Mucoraceae phân lập
từ bánh men rượu từ đó biết được chủng nào đóng vai trò quan trọng trong giai đoạn
đường hóa và bước đầu thử nghiệm sử dụng chủng mốc thuần kết hợp với chủng nấm
men thuần làm giống khởi động nhằm mục đích so sánh phổ hương rượu với các dòng
rượu truyền thống để từ đó biết được loài nấm mốc nào đóng vai trò quan trọng trong
lên men rượu truyền thống Việt Nam. Việc sử dụng chủng thuần cũng như phương
pháp phân tích sắc kí khí kết nối khối phổ (GCMS) để nghiên cứu hương rượu cũng là
những tính mới của luận văn.
1
Để thực hiện mục tiêu đề tài đã nêu, các nội dung chính sau đã được thực hiện:
- Phân lập vi nấm từ men rượu truyền thống Việt Nam
- Phân nhóm vi nấm bằng PCR-fingerprinting và định tên chủng đại diện bằng
giải trình tự rDNA
- Đánh giá hoạt tính amylase của nấm mốc thuộc họ Mucoraceae
- Đánh giá khả năng thủy phân tinh bột các chủng mốc thuộc họ Mucoraceae
trong các điều kiện nhiệt độ khác nhau.
- Đánh giá khả năng thủy phân tinh bột của Mucoraceae trong môi trường
đường.
- Thử nghiệm sử dụng chủng thuần khiết làm giống khởi động, phân tích các
hợp chất bay hơi của dịch chưng cất sau lên men và so sánh với các sản phẩm rượu
2
truyền thống khác.
CHƯƠNG 1: TỔNG QUAN
1.1. Giới thiệu về rượu truyền thống
Đồ uống có cồn như bia, rượu là những sản phẩm lên men phổ biến và đóng
vai trò quan trọng trong đời sống tinh thần và văn hóa của con người. Ở Việt Nam,
rượu gạo đã có từ rất lâu đời, cho đến nay nó vẫn là thức uống phổ biến và chiếm 80%
trong tổng số các loại đồ uống có cồn. Tùy thuộc vào từng địa phương mà thành phần
và quy trình sản xuất rượu có sự khác nhau, do đó rượu được sản xuất có tên địa phương
khác nhau. như rượu Làng Vân (tỉnh Bắc Giang), rượu Kim Sơn (tỉnh Ninh Bình), rượu
Kiên Lao (tỉnh Nam Định), rượu Bàu Đá (tỉnh Bình Định), rượu Gò Đen (tỉnh Long
An). Tuy nhiên, phương thức sản xuất chung đều dựa vào quá trình biến đổi hóa sinh
của hệ vi sinh vật trong men rượu [8].
1.1.1. Men rượu
Việc chuẩn bị và sử dụng men rượu như là nguồn cung cấp vi sinh vật trong
sản xuất rượu gạo là rất quan trọng. Thông thường, giống khởi động cho lên men
rượu gồm 3 thành phần vi sinh cơ bản là: nấm mốc, nấm men và vi khuẩn. Trong đó,
nhóm nấm mốc chủ yếu sinh enzyme amylase để đường hóa tinh bột thành các phân
tử đường khử như glucose, maltose, hay n-dextrin dài hơn. Sau đó, lượng đường này
được nấm men chuyển hóa thành ethanol vì vậy chất lượng của các sản phẩm cuối
cùng phụ thuộc chủ yếu vào hoạt động của các vi sinh vật này. Một trong những cách
tiếp cận để cải thiện sản xuất rượu là thiết lập các điều kiện tối ưu cho quá trình đường
hóa và lên men đồng thời với nuôi cấy hỗn hợp vi sinh vật sinh enzyme thủy phân
tinh bột và lên men ethanol [8].
Như được liệt kê trong Bảng 1.1, các loài mốc chính trong các loại giống khởi
động truyền thống ở Châu Á là Rhizopus spp. và Mucor spp. Nhóm nấm men phổ
biến là Saccharomyces cerevisiae, Hansenula spp., và Candida spp., còn loài giả nấm
3
men phổ biến là Saccharomycopsis fibuligera.
Bảng 1. 1. Các loại giống khởi động để lên men đồ uống có cồn ở Châu Á
Sản
phẩm
Đất nước
Mốc và men
Bakhar
Ấn Độ
Mucor spp., Rhizopus spp., Saccharomyces cerevisiae
Mucor spp., Rhizopus spp.,, Candida spp.,
Bubud
Philippines
Saccharomycopsis fibuligera, Saccharomyces cerevisiae,
Torulopsis spp.
Aspergillus oryzae, Rhizopus spp., Saccharomyces
Chu
Trung Quốc
cerevisiae
Look-
Mucor spp., Chlamydomucor oryzae, Candida spp.,
Thái Lan
pang
Saccharomyces cerevisiae
Men
Mucor spp., Rhizopus spp., Aspergillus spp.,
Việt Nam
rượu
Saccharomyces cerevisiae, Saccharomycopsis fibuligera
Rhizopus spp., Mucor spp., Saccharomyces cerevisiae,
Murcha
Nepal
Saccharomycopsis fibuligera.
Aspergillus oryzae, Rhizopus spp., A.niger, Penicillium
Nurock
Hàn Quốc
spp., Mucor spp., Hansenula anomala, Pichia anomala,
Saccharom yces cerevisiae
Mucor spp., Rhizopus spp., Aspergillus spp., Penicillium
spp., Candida spp., Saccharom yces cerevisiae,
Ragi
Indonesia
Saccharomycopsis fibuligera , Hansenula spp.,
Rhodotorula spp.
Tapai
Malaysia
Rhizopus spp., Saccharomycopsis fibuligera
Các thành phần để làm viên men thường là bột gạo, bột sắn hoặc kết hợp cả
bột gạo và bột sắn- Các loại bột đó có thể được trộn với một số loại thảo mộc, những
thành phần bổ sung này được cho là có vai trò trong việc ức chế sự sinh trưởng của
các vi sinh vật tạp nhiễm. Tỷ lệ giữa bột nghiền với các loại thảo mộc thường là 14:1
theo khối lượng. Sau đó, nước được thêm vào để tạo độ ẩm tương đối cho khối bột là
55-60%, và trộn đều với bột men từ những mẻ trước. Những viên men được nặn hình
4
tròn với đường kính 4 cm, dày 1 cm. Các khay bánh men được ủ trong điều kiện nhiệt
độ phòng 28-32 ºC trong 2-5 ngày và được hong khô bởi gió hoặc ánh sáng mặt trời
Bột men
Bột thuốc bắc
Nước
Bột gạo
Khối bột với 50-60% hàm ẩm
Nặn viên men tròn
ủ 2-5 ngày
[8].
Hong khô
Hình 1. 1. Một quy trình truyền thống làm men rượu ở Việt Nam
1.1.2. Các giai đoạn lên men rượu
Có 2 giai đoạn chính trong lên men sản xuất rượu đó là: Giai đoạn đường hóa
và giai đoạn lên men rượu
1.1.2.1. Giai đoạn 1- Giai đoạn đường hóa
Gạo sau khi được nấu chín sẽ được tãi ra khay, vải sạch để nguội đến nhiệt độ
30-35°C thì rắc bột bánh men vào với tỉ lệ bột bánh men so với gạo là 1-5% theo khối
lượng. Trộn đều bột bánh men và ủ khoảng 3 ngày để vi sinh vật sinh amylase thủy
phân tinh bột thành đường trong điều kiện hiếu khí [8].
1.1.2.1.1. Đặc điểm của enzyme amylase
Amylase có thể được tổng hợp từ một số loại nấm mốc, nấm men, vi khuẩn và
5
xạ khuẩn; Tuy nhiên, nấm mốc được biết đến nhiều nhất vì tính phổ biến và ổn định
của enzyme này. Có 3 loại amylase là α-amylases, β-amylases và γ-amylase, (α-
glucosidase) mỗi loại cắt các vị trí khác nhau. Hình 1.2. minh họa vị trí thủy phân
liên kết của 3 loại enzyme này.
Hình 1. 2. Quá trình thủy phân tinh bột bởi các enzyme amylase
a. α- amylase
α-amylases có khả năng cắt liên kết α,1-4 glycoside ở phía trong của mạch
amylose và amylopectin. Enzyme này được tìm thấy ở rất nhiều loài vi sinh vật, nó
cắt ở các vị trí ngẫu nhiên dọc chuỗi tinh bột, cuối cùng tạo ra glucose, maltose, n-
dextrin. α-amylases có xu hướng hoạt động nhanh hơn β-amylase bởi nó có thể thủy
phân nhiều vị trí của cơ chất. Loại enzyme này được tìm thấy nấm Ascomycetes và
Basidiomycetes, vi khuẩn Bacillus, nước bọt và tuyến tụy ở người [22].
Quá trình thủy phân tinh bột bởi α-amylases là quá trình đa giai đoạn:
Giai đoạn 1 (giai đoạn dextrin hóa): Chỉ một số phân tử cơ chất bị thủy phân
tạo thành một lượng lớn dextrin phân tử thấp (α-dextrin), độ nhớt của hồ tinh bột
giảm nhanh (các amylose và amylopectin đều bị dịch hóa nhanh) [2].
Giai đoạn 2 (giai đoạn đường hóa): Các dextrin phân tử thấp ở giai đoạn 1 bị
thủy phân tiếp tạo ra các tetra-trimaltose không cho màu với iodine. Các chất này bị
thủy phân rất chậm bởi α-amylase cho tới disaccharide và monosaccharide. Dưới tác
dụng của α-amylase, amylose bị phân giải khá nhanh thành oligosaccharide gồm 6-7
6
gốc glucose [2].
Giai đoạn 3: Các polyglucose này bị phân cắt tiếp tục tạo nên các mạch
polyglucose ngắn dần và bị phân giải chậm đến maltotetrose, maltotriose và maltose
và glucose. Tóm lại, dưới tác dụng của α-amylase, tinh bột có thể chuyển thành
maltotetrose, maltose, glucose và dextrin phân tử thấp. Tuy nhiên, thông thường α-
amylase chỉ thủy phân tinh bột chủ yếu thành dextrin phân tử thấp không cho màu
với Iodine. Khả năng dextrin hóa cao của α-amylase là tính chất đặc trưng của nó. Vì
vậy, người ta thường gọi loại amylase này là amylase dextrin hóa hay amylase dịch
hóa.[2]
b. β-amylase
β-amylase hay exoamylase có khả năng cắt liên kết α,1-4 glycoside và α,1-6
glycoside. Chúng thủy phân glucose ở phía ngoài của mạch amylose và amylopectin [23].
β-amylase là một enzyme ngoại bào. Tiến trình phân giải bắt đầu từ đầu không
khử của các nhánh ngoài cùng cơ chất. β-amylase phân cắt các liên kết α-1,4glucoside
nhưng khi gặp liên kết α-1,4 glucoside đứng kế cận liên kết α-1,6 glucoside thì nó sẽ
ngừng tác dụng. Phần polysaccharide còn lại là dextrin phân tử lớn có chứa rất nhiều
liên kết α-1,6 glucoside và được gọi là β-dextrin [2].
c. γ-amylase
γ-amylase cắt liên kết α(1-6) và α(1-4) glycoside ở đầu không khử của amylose
và amylopectin, tạo ra glucose. Đa số Enzyme này có hoạt lực cao nhất ở vùng PH
3,5-5,5 và nhiệt độ 50ºC. Nó bền với acid hơn α-amylase nhưng kém bền hơn trong
rượu, aceton [22].
1.1.1.2.2. Đặc điểm của vi nấm trong giai đoạn đường hóa
Quá trình đường hóa tinh bột sẽ cho ra maltose, glucose để sản xuất ethanol
có nguồn gốc từ các quá trình lên men. Thủy phân tinh bột bằng phương pháp enzyme
có nhiều ưu điểm so với phương pháp hóa học, như hoạt động trong điều kiện pH và
nhiệt độ vừa phải, ngăn ngừa ăn mòn thiết bị và các bước trung hòa tiếp theo. Enzyme
có tính đặc hiệu cơ chất, loại bỏ sự hình thành các sản phẩm phụ không mong muốn
như thường được xuất hiện trong quá trình thủy phân axit [26].
7
1.1.2.2. Giai đoạn 2- Giai đoạn lên men rượu.
Nhóm nấm men thường phân lập được từ bánh men là Saccharomyces
cerevisiae, Pichia anomala, Candida tropicalis trong đó Saccharomyces cerevisiae
được cho là đóng vai trò chính, phát triển trong điều kiện ít oxy, lên men chuyển hóa
đường thành ethanol. Ethanol là sản phẩm chính ở giai đoạn này, khi nồng độ cao
trong dịch lên men sẽ ức chế màng sinh chất, thay đổi tính bán thấm tế bào nấm men
và các vi sinh vật khác. Thực tế sản xuất cho thấy giai đoạn ủ cho lên men phụ thuộc
vào thời tiết, vào những ngày nóng, giai đoạn ủ thường ngắn. Ví dụ như ở vùng Đồng
bằng Sông Cửu Long ở miền Nam Việt Nam, nhiệt độ trung bình 30-33ºC, thời gian
ủ cho giai đoạn 1 là 2-3 ngày, giai đoạn 2 là 3-4 ngày [8].
+ Lên men rắn là phương pháp thường được sử dụng ở các vùng núi cao.
Nguyên liệu cho sản xuất rượu ở những vùng này thường là ngô và sắn. Ngô và sắn
sau quá trình đường hóa trở nên ngọt và mềm, sau đó được thêm nước. Quá trình lên
men diễn ra trong 5-7 ngày và sau đó đem đi chưng cất [3].
+ Lên men lỏng thường được sử dụng ở các làng nghề dưới đồng bằng. Gạo,
sau quá trình đường hóa trở nên mền ngọt và được bổ sung nước theo tỉ lệ 1:1. Lên
men tiếp trong 3-5 ngày. Vào mùa hè nhiệt độ cao thì thời gian lên men thường ngắn
hơn mùa đông [3].
Sản phẩm sau lên men rượu gạo.
Đối với rượu không chưng cất, dịch lên men sau khi kết thúc giai đoạn 2 sẽ
được lọc lấy dịch trong chứa glucose, ethanol, và các chất hòa tan khác, với những
loại rượu không chưng cất độ cồn chỉ khoảng 7-10% (v/v), và rượu sẽ không bảo
quản được lâu. Để giải quyết vấn đề này, người sản xuất sẽ tăng hàm lượng cồn bằng
cách hoặc bổ sung đường vào sau giai đoạn 1 hoặc bổ sung cồn vào sau giai đoạn 2,
như vậy vừa đáp ứng được nhu cầu khách hang vừa kéo dài tuổi thọ cho sản phẩm
[3].
Đối với rượu chưng cất, sử dụng thiết bị chưng cất có nguyên lý hoạt động
như hình dưới, gồm 3 phần cơ bản là: khoang đun, hệ thống làm mát, và khoang chứa
rượu chưng cất. Thông thường, mẫu rượu đầu có nồng độ cồn cao có thể lên đến 65%
(v/v) sau giai đoạn chưng cất đầu tiên, và khoảng 25-30% (v/v) cho mẫu rượu sau
8
[3].
Hình 1. 3. Sơ đồ tóm tắt quy trình lên men rượu
1.2 Giới thiệu về họ Mucoraceae
Họ Mucoraceae là họ nấm thuộc bộ Mucorales, đặc trưng bởi hệ sợi không
vách ngăn. Một số chi có thể kể đến bao gồm Absidia, Apophysomyces, Mucor,
Rhizomucor, và Rhizopus.Theo ước tính năm 2008, họ này bao gồm 25 chi và 129
loài [15]. Sau đây là một số loài thuộc chi Rhizopus và Mucor thường xuất hiện ở
bánh men rượu.
a. Rhizopus oryzae
Rhizopus oryzae là thành viên của chi Rhizopus, thuộc họ Mucoraceae. Hệ thống
phân loại Rhizopus oryzae không đơn giản. Những nghiên cứu gần đây về Mucorales
dựa trên trình tự ITS đã đưa ra các tên loài đồng nghĩa sau: Amylomyces rouxii,
Rhizopus achlamydosporus, R. arrhizus, R. boreas, R. delemar, R. chiuniang, R.
javanicus, R. oryzae, R. maydis, R. niveus, R. peka, R. tonkinensis [26]. Mặc dù nhiều
chủng nấm mốc trong bánh men đều có khả năng thủy phân tinh bột gạo nhưng
Rhizopus oryzae (hay Amylomyces rouxii được biết đến là chủng điển hình nhất, được
9
mô tả đầu tiên bởi Calmette năm 1982). Ông coi chủng này đóng vai trò quan trọng
trong quá trình thủy phân tinh bột gạo. Khi sử dụng nấm mốc thuần chủng này và nấm
men thương phẩm ông có thể thu 340 g cồn đặc từ 1000 g gạo thay vì 180 g khi sử
dụng bánh men. Ngoài ra, nấm này cũng được sử dụng trong nghiên cứu tạo bánh men
để sản xuất rượu gạo từ gạo nếp cẩm [1]. Bên cạnh đó, R. oryzae cũng là loài phổ biến
và chiếm ưu thế được phát hiện ở Yao Qu, và ở một số Hồng Qu. Nó cũng được tìm
thấy ở một số giống khởi động khác với khả năng sinh amylase mạnh, đóng góp lớn
cho sản xuất rượu [23]. Nghiên cứu trước còn chỉ ra rằng R. oryzae cũng có thể tạo ra
các hợp chất dễ bay hơi trong quá trình lên men, chẳng hạn như ethanol, 2-methyl-1-
butanol và 3- methyl-1-butanol [4].
b. Rhizopus microsporus
Rhizopus microsporus là nhóm nấm thuộc chi Rhizopus, họ Mucoraceae phổ
biến thứ hai khi phân lập từ bánh men [6]. Các enzyme thủy phân từ các loài Rhizopus
hoạt động tối ưu trong điều kiện pH 4.0-5.5. Nhóm Rhizopus microsporus có khả
năng chịu nhiệt độ cao, chủng Rhizopus microsporus var. rhizopodiformis có thể sinh
trưởng ở 50°C và sinh amylase tối ưu ở 45°C [7]. Rhizopus microsporus var.
chinensis CICIM-CU F0088 cũng cho thấy khả năng phát triển ở 40°C, và tiết ra các
amylase ở nhiệt độ cao hơn Rhizopus oryzae [17].
Các chủng R. microsporus có thể sinh độc tố rhizoxins, nhưng bản thân nó
không tạo ra mà được tạo bởi vi khuẩn Burkholderia chúng sống bên trong tế bào
nấm. Một nghiên cứu đã chỉ ra rằng vi khuẩn này đã từng được tìm thấy ở chủng
Rhizopus microsporus CBS 111563, được phân lập từ sufu. Một lượng đáng kể
rhizoxins được phát hiện trong sản phẩm cuối cùng [7]. Tuy nhiên vẫn chưa biết rõ
rằng Rhizopus microsporus từ bánh men có độc tố không.
c. Mucor indicus
Các chủng Mucor indicus thuộc nhóm này thường khuẩn lạc có màu vàng đậm
đặc trưng, có nhiệt độ tăng trưởng tối đa 42ºC. Bào tử có màu vàng nhạt, sợi liên tục
phân nhánh, với các nhánh dài. Túi bào tử có màu vàng đến nâu, đường kính lên tới
75 µm, với các màng khác nhau. Cuống gần hình cầu, cao tới 40 µm. Bào tử có vách
10
trơn, gần cầu tới elip, và có đường kính 4-5 µm. Có nhiều Chlamydospores, đặc biệt
là trong ánh sáng. Bào tử tiếp hợp zygospores có màu đen, hình cầu, có đường kính
lên tới 100 µm [14].
M. indicus có khả năng sinh ethanol từ nhiều nguồn đường khác nhau như
glucose, mannose, fructose, hay galactose. Chúng cũng có khả năng lên men xylose
thành ethanol nhưng chỉ trong điều kiện hiếu khí hoặc vi hiếu khí. Sản lượng ethanol
sau lên men từ xylose xấp xỉ lượng ethanol do Pichia stipites lên men (Pichia stipites
được biết đến là loài sản xuất ethanol tốt nhất từ xylose). Tuy nhiên, nhiều chủng nấm
này không có khả năng lên men đường sucrose, vì vậy M. indicus không thể thay thế
S. cerevisiae để lên men ethanol từ cơ chất chứa sucrose [14].
M. indicus là loài nấm mốc lên men ethanol khá hiệu quả và có thể sinh ra
ethanol 5% khi sinh trưởng trong môi trường chứa glucose. Bên cạnh đó, một nghiên
cứu khác chỉ ra rằng hoạt lực amylase của M. indicus dường như rất thấp hoặc không
có khi sinh trưởng trong môi trường gạo [14].
d. Mucor circinelloides
Trong số nấm thuộc chi Mucor tìm thấy trong bánh men, Mucor circinelloides
là loài cũng khá phổ biến. Tuy nhiên khả năng thủy phân tinh bột của chúng kém
[12]. Chúng là loài dị hình giới tính và có thể phát triển giống nấm mốc và nấm men.
Bên cạnh khả năng thủy phân tinh bột, chúng còn có khả năng thủy phân cellulose
[14].
1.3. Tình hình nghiên cứu về rượu truyền thống Việt Nam
Các nghiên cứu về lên men rượu truyền thống của Việt Nam có thể được phân
loại thành hai nhóm chính: (i) tính đa dạng vi sinh vật của bánh men và (ii) lựa chọn
các chủng nấm mốc có hoạt lực enzyme cao, chủng nấm men có khả năng lên men
rượu tốt để làm bánh men, cải tiến quy trình [25].
Hệ vi sinh của bánh men đã được nghiên cứu khá rõ, mỗi gam bánh men chứa
103-106 CFU mốc, 103-107 CFU men, và 103-106 CFU vi khuẩn lactic. Bánh men chứa
hệ vi sinh vật tương đối ổn định, bao gồm các loài mốc Rhizopus microsporus, Mucor
indicus, Mucor circinelloides, loài giả men Saccharomycopsis fibuligera, loài nấm
11
men Hyphopichia burtonii, Saccharomyces cerevisiae, Issatchenkia orientalis,
Pichia anomala, Candida tropicalis, Pichia ranongensis, Clavispora lusitaniae,
Pediococcus pentosaceus, và các loài vi khuẩn Lactbacillus plantarum, Lactobacillus
brevis, Weissella confusa, Weissella paramesenteroides. Nó được kết luận rằng hệ vi
sinh trong bánh men tương tự như ragi và các dạng men Châu Á khác. Tuy nhiên, để
có một cái nhìn rõ hơn về đặc tính thủy phân tinh bột của các nhóm chủng vi nấm
xuất hiện phổ biến trong bánh men rượu Việt Nam thì vẫn chưa có nghiên cứu nào
được thực hiện trước đó.
Bên cạnh đó, khi đã chọn các chủng nấm tốt để tạo men rượu cải tiến từ chủng
thuần thì rượu sau khi chưng cất chỉ được đánh giá bằng cảm quan mà ít có phân tích
phổ hương rõ bằng sắc kí khí [9] nên nghiên cứu này sẽ phân tích các hợp chất bay
hơi trong các mẫu rượu sử dụng chủng thuần và so sánh với các sản phẩm rượu truyền
gạo truyền thống.
1.4. Phân tích hợp chất bay hơi
1.4.1. Giới thiệu về sắc kí khí kết nối khối phổ (GCMS)
Sắc kí khí kết nối khối phổ (GCMS) gồm 2 phần chính là GC và MS, trong đó
GC (Gas Chromatography) là loại sắc kí có pha động là khí mang, thường là các khí
trơ như heli, nitơ hay hydro, còn pha tĩnh là một lớp dịch mỏng hoặc polymer bên
trong cột. Mẫu được chạy qua cột bởi dòng khí mang. Các thành phần của mẫu được
tách nhau ra khi đi qua cột dưới một chu trình nhiệt độ từ thấp tới cao. Còn MS (Mass
Spectrometer) là detector khối phổ cho GC, các chất khí sau khi đi qua cột sẽ sang
MS và bị bắn phá thành các mảnh có khối lượng khác nhau, mỗi chất khí có một danh
sách các mảnh khác nhau, dựa vào thông tin khối lượng trên điện tích m/z, sau đó
chất này được so sánh với thư viện phổ để biết tên chất [11].
Sắc kí khí kết nối khối phổ là một phương pháp phân tích kết hợp cả đặc trưng
của sắc kí khí và khối phổ để định tính các hợp chất trong mẫu. GC có thể tách hợp
chất bay hơi và bán bay hơi nhưng không thể định danh chúng. MS có thể cung cấp
thông tin cấu trúc chi tiết cho hầu hết các hợp chất và định danh chúng nhưng MS lại
12
không tách được chúng khỏi mẫu [16]. Sơ đồ cấu tạo được trình bày ở hình 1.4.
Hình 1.4 Sơ đồ cấu tạo của GC-MS
1.4.2. Ứng dụng phương pháp HS-SPME GCMS trong phân tích các hợp chất
tạo hương của đồ uống
Hương rượu được hình thành bởi nhiều hợp chất dễ bay hơi và nó đặc trưng
cho từng sản phẩm. Thông thường nồng độ các chất này rất thấp và có ngưỡng cảm
giác phát hiện rất thấp (giữa ng/L và µg/L). Để phân tích hương rượu cần cô đặc các
chất bay hơi trước khi thực hiện phân tích sắc ký khí. Một số phương pháp chuẩn bị
mẫu để phân tích đã được biết đến như chưng cất, tách chiết pha lỏng (liquid-liquid
extraction, LLE), tách chiết pha rắn (solid phase extraction, SPE), tách chiết khoảng
trống (dynamic headspace extraction) và vi tách chiết pha rắn-khoảng trống
(headspace-solid phase microextraction, HS-SPME) [28].
HS-SPME GCMS (Headspace-Solid Phase Microextraction Gas
Chromatography Mass Spectrometer) được gọi là phương pháp vi tách chiết pha rắn-
khoảng trống kết hợp với sắc kí khí kết nối với khối phổ trong đó ở bước đầu tiên,
pha tĩnh của sợi fiber sẽ hấp phụ các hợp chất hữu cơ ở không gian đầu phía trên mẫu
chất lỏng. Sau một khoảng thời gian xác định, sợi được kéo vào bên trong kim để bảo
vệ. Tiếp theo, kim được đưa vào injector, và sợi được đẩy ra. Dưới ảnh hưởng của
nhiệt độ cao, các hợp chất được giữ lại trong pha tĩnh được giải hấp rồi nhờ dòng khí
mang định lượng trên cột sắc ký [28].
Ưu điểm của SPME như sau: là thiết bị cầm tay, sử dụng đơn giản, chi phí
tương đối thấp, độ nhạy cao, kích thước nhỏ và loại bỏ dung môi; tính năng quan
13
trọng nhất là thời gian chuẩn bị mẫu tương đối ngắn trước khi phân tích. Tuy nhiên,
so với các kỹ thuật khác, SPME có nhiều nhược điểm, ví dụ như sự xuống cấp một
phần của pha tĩnh trong quá trình giải hấp nhiệt ở nhiệt độ cao ảnh hưởng tới khả
năng hấp phụ và tuổi thọ sợi fiber.
Hình 1.5. Sơ đồ tách chiết hợp chất bay hơi bằng HS-SPME GCMS
SPME được phát triển vào những năm 1990 bởi Pawliszyn và cộng sự, mỗi
năm có hàng ngàn bài báo khai thác các khía cạnh khác nhau của phương pháp này
và ứng dụng trong các lĩnh vực khác nhau được công bố (phân tích hóa học, phân tích
sinh học, khoa học thực phẩm, khoa học môi trường, khoa học dược và y). Kỹ thuật
chiết mẫu này đã được mô tả là nhanh, đơn giản, không sử dụng dung môi, và phù
hợp cho việc chiết số lượng lớn các hợp chất dễ bay hơi và bán bay hơi từ dung dịch.
Ngoài ra, SPME chỉ cần lượng mẫu nhỏ, kết hợp với sắc ký khí khối phổ (GC/MS)
với độ nhạy cao. Vì những ưu điểm này, nó đã được sử dụng để nghiên cứu hương
của nhiều loại trái cây, rau quả, đồ uống và rượu [28].
Bằng cách sử dụng phương pháp GCMS để đánh giá định tính hoặc định lượng
những khác biệt này, ngoài các kỹ thuật cảm quan, các nhà phân tích có thể thu được
nhiều thông tin về sản phẩm của họ. Các đặc tính cảm quan độc đáo của các sản phẩm
rượu chưng cất thường là do sự khác biệt nhỏ giữa các hợp chất dễ bay hơi [21].
Nghiên cứu trước đây sử dụng phương pháp này để định tính và bán định lượng các
14
hợp chất bay hơi trong mẫu rượu chưng cất sử dụng bánh men rượu truyền thống
Trung Quốc xác định được 118 hợp chất chủ thuộc 5 nhóm chính là ester (32), alcohol
(22), acid (23), aldehyde (9) và ketone (15) [11]. Các nhóm này cũng xuất hiện ở sản
phẩm makgeolli của Hàn Quốc, ngoài ra còn xuất hiện têm nhóm phenol và terpene
[13]. Đối với sản phẩm rượu của Combodia, phân tích 5 nhóm rượu từ các nhóm bánh
men tương ứng xác định được 25 hợp chất bao gồm ester, alcohol, acid, aldehyde,
and ketone. Trong đó nhóm xuất hiện nhiều nhất là alcohol (chiếm 93% tổng các hợp
chất tạo hương) điển hình như 2-methylbutan-1-ol, 3-methylbutan-1-ol, butane-2,3-
diol, 2-phenylethan-1-ol [18].
Ngoài rượu và các hợp chất tạo hương, đôi khi có khí tạp như khí lưu huỳnh
và có thể dẫn đến mùi hoặc hương vị lạ cho sản phẩm. Bởi vì ngay cả tỷ lệ nhỏ (ppb)
của các hợp chất lưu huỳnh có thể ảnh hưởng đến chất lượng sản phẩm. Phần lớn các
chất gây ô nhiễm này có mặt trong pha khí, đòi hỏi phải có hệ thống lấy mẫu và phân
tích pha khí. Sắc ký khí (GC) là một công cụ mạnh mẽ trong việc phân tích các sản
phẩm đồ uống có cồn. Các hợp chất tạo hương có xu hướng dễ bay hơi trong tự nhiên,
15
đáp ứng một trong những yêu cầu chính của GC [21].
CHƯƠNG 2: ĐỐI TƯỢNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU
2.1. Đối tượng
Trong nghiên cứu này, 15 mẫu bánh men (ký hiệu từ MQ1-MQ15) từ các tỉnh
Ninh Bình, Tuyên Quang, Thái Bình, Hà Nội, Nam Định, Hà Nam, Hưng Yên, Bắc
Giang đã được thu thập và tiến hành thí nghiệm. Danh sách các mẫu bánh men với
những thông tin cụ thể được trình bày trong phần phụ lục S1.
Ngoài ra, một số chủng nấm đã định danh thuộc bộ sưu tập giống của Viện
Công nghiệp Thực phẩm cũng được sử dụng phục vụ nghiên cứu bao gồm::
Rhizopus oryzae BMM 111, R. oryzae BMM 131, R. oryzae BMM 1015,
Saccharomyces cerevisiae BMQ 467: được dùng làm 3 mẫu rượu từ 1 chủng thuần
mốc với 1 chủng thuần men
Saccharomycopsis fibuligera BMQ 908: bổ sung vào mẫu lên men sử dụng 1
chủng nấm mốc R.oryzae và 1 chủng nấm men S. cerevisiae để so sánh với mẫu không
bổ sung chủng này.
Aspergillus oryzae CNTP 5026 : dùng làm mẫu đối chứng trong thí nghiệm
kiểm tra khả năng thủy phân tinh bột trong môi trường đường.
2.2. Hóa chất, dụng cụ, trang thiết bị máy móc
2.2.1. Hóa chất
Hóa chất dùng trong nuôi cấy:
Agar (Việt Nam), Malt (Đan Mạch), Glucose, Yeast extract (Ấn Độ), Malt
extract (Ấn Độ), Peptone (Ấn Độ).
Hóa chất dùng cho PCR
Enzyme Taq DNA Polymease Thermo Scientific (Mỹ)
dNTPs Thermo Scientific (Mỹ)
Mồi cho phản ứng PCR Thermo Scientific (Mỹ)
Thang DNA mẫu dùng trong điện di Thermo Scientific (Mỹ)
Agarose dùng trong điện di Biobasic (Tây Ban Nha)
16
Ethidium Bromide Pharmacia-Biotech (Mỹ)
2.2.2. Dụng cụ và trang thiết bị, máy móc
Máy móc, thiết bị: bộ điện di ngang, box cấy (Bioblock Scientific, Pháp), cân
điện tử (Precisa, Thụy Điển), kính hiển vi quang học (Eclipse E600-Nikon, Nhật), lò
vi sóng (LG, Hàn Quốc), hệ thống soi và chụp ảnh gel điện di (Syngene), máy đo pH
(Toledo - Anh), máy lắc ổn nhiệt, máy ly tâm cao tốc (Heraeus – Sepatech), máy
PCR, nồi hấp thanh trùng (Himayatoko, Nhật), tủ lạnh giữ giống (Electrolux, Thụy
Điển), tủ nuôi cấy (Sanyo,Nhật), máy phá tế bào (Mini Beadbeater, Biospec
Products), máy đông khô (VirTis Freeze Dryers 2.0)
Dụng cụ: Đĩa Petri, pipette tự động các loại, ống Falcon, ống nghiệm, ống
Eppendorf, ống đong, đèn cồn, bình tam giác (loại từ 20-1000), bình Schott, que
cấy,....
2.3. Phương pháp nghiên cứu
2.3.1. Phương pháp phân lập
Sử dụng phương pháp pha loãng mẫu để phân lập nấm mốc, nấm men, giả men
trong bánh men:
Quy trình phân lập như sau:
- Bước 1: Nghiền mịn các mẫu bánh men trong các túi riêng
- Bước 2: Cân 3 gam mẫu bánh men đã nghiền với 27 g dung dịch NaCl 0.9% (đã
hấp) trong ống falcon 50 ml, vortex đều.
- Bước 3: Pha loãng theo hệ số 10 đến nồng độ 10-6
- Bước 4: Sau đó hút 100 µl dịch pha loãng của từng nồng độ chang trên đĩa thạch
Malt 2°Bx rồi nuôi trong điều kiện hiếu khí trong tủ 30°C.
- Bước 5: Từ sau 24 giờ, tiến hành quan sát các khuẩn lạc khác nhau. Chọn lấy
các khuẩn lạc đại diện tiến hành làm sạch và giữ giống.
2.3.2. Làm sạch và giữ giống
Lấy một ít sinh khối cần làm sạch và cấy lên đĩa Petri chứa môi trường Malt
2ºBx, sau đó đem nuôi ở nhiệt độ 30ºC trong 2-3 ngày. Khi thấy nấm đã mọc mà
không thấy xuất hiện khuẩn lạc khác lạ thì lấy một ít sinh khối và cấy giữ giống vào
trong ống nghiệm nút xoáy chứa môi trường Malt 4ºBx. Đem các ống nghiệm nuôi
cấy ở nhiệt độ 30ºC khoảng 2 ngày, sau đó cất giữ trong tủ mát. Trường hợp khuẩn
17
lạc nào chưa sạch (có khuẩn lạc lạ) thì phải làm sạch lại như cách trên.
Đối với các chủng mốc, sử dụng cách bảo quản cát
Lấy sinh khối mốc thuần cho vào các ống cát sấy khô (kích thước dài 8-10 cm,
đường kính 8mm) với độ dày cát 15 mm, mỗi chủng làm 3-5 ống, đảo đều rồi đưa
vào bình hút ẩm chứa hạt silicagen sấy khô. Đợi 3 đến 5 ngày sau, khi các ống cát
khô tơi, tiến hành nhúng đầu bông vào paraffin nóng chảy để khô rồi bảo quản trong
tủ lạnh 5ºC.
Đối với các chủng nấm men và giả men, sử dụng cách bảo quản lạnh sâu, thành
phần môi trường như sau: peptones 1,5%, yeast extract 0,3%, sodium chloride 0,6%,
glucose 0,1%, glycerol 15%. Dùng pipet Pasteur hút dịch cho vào ống nghiệm đã có
giống lấy hết các tế bào cho vào ông sữa, hàn lại. Hấp các ống nghiệm nút xoáy 2ml,
mỗi ống đựng 3 ống sữa, mỗi chủng làm 6 ống sữa, rồi để vào tủ -80ºC.
2.3.3. Chụp ảnh hình thái khuẩn lạc, tế bào
Các chủng nấm mốc, men và giả men được nuôi cấy trên môi trường Malt
2ºBx ở 30ºC sau 2 ngày lấy ra quan sát hình dạng, kích thước, màu sắc khuẩn lạc.
Tiến hành làm tiêu bản và quan sát hình thái tế bào dưới kính hiển vi độ phóng đại
40x. Sau đó chụp ảnh lại.
2.3.4. Phương pháp tách chiết DNA tế bào nấm mốc, nấm men, giả men
Tế bào được nuôi cấy trên môi trường Malt 2ºBx sau 2 ngày. Lấy sinh khối tế
bào cho vào Eppendorf vô trùng và thêm 0,75 ml SSC 2x vào mỗi ống. Lắc đều và
đun ở 100ºC trong 10 phút. Ly tâm 13000 vòng/phút trong 1 phút. Hút bỏ phần dịch
và tiến hành rửa tế bào 2 lần bằng nước cất vô trùng. Qua mỗi lần rửa ly tâm 13000
vòng/phút trong 1 phút, loại bỏ dịch nổi. Thêm 100 µl nước cất vô trùng, 100 µl hạt
thủy tinh, 150 µl dung dịch phenol/chlorofom (tỷ lệ 1:1), đặt vào máy phá tế bào
trong 1 phút. Đem ly tâm ở 13000 vòng/phút trong 10 phút. Lấy phần dịch trong phía
trên có chứa DNA.
2.3.5. Phương pháp tinh chế DNA
Do DNA của nấm mốc còn chứa nhiều chất ức chế PCR nên trước khi dùng
DNA làm khuôn cho phản ứng PCR, tiến hành tinh chế DNA bằng Silica bead DNA
Gel extraction Kit. Hút 50 µl dịch trong chứa DNA cho vào Eppendorf vô trùng. Bổ
18
sung 150µl dung dịch Binding buffer có chứa Silica. Đem ly tâm ở 13000 vòng/phút
trong 1 phút. Hút bỏ dịch do DNA đã bám trên bề mặt các hạt thủy tinh. Rửa 3 lần
bằng Washing buffer. Sau đó phơi khô trong box cấy rồi bổ sung 15 µl nước cất vô
trùng dùng cho PCR . Ly tâm ở 13000 vòng/phút trong 1 phút, DNA ở phần dịch nổi
là DNA đã được tinh chế. DNA sau khi tinh chế có thể dùng làm khuôn cho phản ứng
PCR.
2.3.6. Phương pháp tiến hành phản ứng PCR fingerprinting
Từ các chủng thuần sau khi phân lập, sẽ có nhiều cách khác nhau để phân loại
và định danh loài trong đó phương pháp truyền thống là dựa vào các khóa phân loại
hình thái khuẩn lạc và tế bào, bên cạnh đó các nhà khoa học có thể áp dụng các kỹ
thuật sinh học phân tử để định danh loài một cách chính xác hơn như kỹ thuật PCR-
Fingerprinting.
Phân nhóm bằng kỹ thuật fingerprinting: phương pháp fingerprinting là
phương pháp dùng để phân nhóm loài dựa trên sự tương đồng các đoạn ADN vệ tinh.
ADN vệ tinh là các đoạn ADN có trình tự lặp lại lớn, thường không mã hóa cho gen
và ít bị đột biến, thay đổi. Do đó chúng thường được dùng làm công cụ đắc lực trong
phân loại. Sử dụng các mồi được thiết kế theo trình tự của các ADN vệ tinh trong
phản ứng PCR. Sau đó các đoạn ADN vệ tinh đã khuếch đại sẽ được điện di để so
sánh kích thước. Sự tương đồng của các phổ băng thể hiện sự gần gũi của các chủng
nấm mốc. Phản ứng PCR finger printing được tiến hành với thành phần phản ứng như
sau:
Taq buffer 10x 10 µl
2 µl MgCl2 (25 mM)
dNTPs (10 µM mỗi loại) 4 µl
4 µl MST2 (GAC)5 (10 µM)
Taq polymerase (5u/µl) 0,5 µl
DNA khuôn 5 µl
H2O PCR 7 3,5 µl
19
Tổng cộng 100 µl
Tiến hành hút 20 µl master mix vào mỗi ống effendorf nhỏ, rồi bổ sug 1 µl DNA,
mix đều, spin down. Tiến hành nhân đoạn DNA bằng kĩ thuật PCR sử dụng mồi
MST2 trên máy, chương trình MST2.
Gia nhiệt ở 94ºC trong 3 phút, tiếp theo mẫu được nhân lên bởi 30 chu kì liên
tiếp với các bước: biến tính ở 94ºC trong vòng 1 phút, gắn mồi ở 52ºC trong 1 phút
và kéo dài ở 72ºC trong 10 phút.
2.3.7. Phương pháp điện di
Sản phẩm sau khi chạy PCR được điện di trên gel agarose 1 % với dung dịch
đệm là 0,5x TAE. Để chuẩn bị gel điện di, agarose 1 % được đun tan trong đệm TAE
bằng lò vi sóng. Đợi nhiệt độ gel hạ xuống 60 - 70ºC, đổ gel vào phiến nhựa điện di
(kích thước tùy theo số lượng mẫu cần điện di) được đặt thăng bằng trên mặt phẳng
nằm ngang đã đặt sẵn lược. Để gel đông lại ở nhiệt độ phòng, gỡ bỏ lược, đặt bản gel
vào buồng điện di ngang sao cho bản gel chìm hẳn trong dung dịch đệm TAE. Dùng
micropipette nhỏ các sản phẩm sau PCR vào các giếng của bản gel. Với các gel sử
dụng răng lược nhỏ, dùng 3-5 µl mẫu cho mỗi giếng. Điện di với hiệu điện thế 50-
100V.
2.3.8. Nhuộm gel và đọc kết quả
Bản gel sau khi điện di được ngâm trong dung dịch ethidium bromit 0,5 µg/ml
pha trong nước cất (trong 30 phút), sau đó vớt bản gel ra và rửa qua bằng nước để
loại bỏ Ethidium Bromide bám không đặc hiệu. Sau khi rửa, các băng DNA được
quan sát bằng máy soi gel InGenius của hãng Syngene.
2.3.9. Phương pháp phân loại nấm dựa vào đọc trình tự rDNA
DNA sau khi được tách và tinh chế như trên, tiến hành phản ứng PCR nhằm
khuếch đại vùng ITS hoặc ITS-D1D2 với thành phần master mix như sau:
Đệm phản ứng (10x) 10 l
4 µl MgCl2 (25 mM)
dNTPs (10mM mỗi loại) 4 l
Mồi ITS1 (10 M) 2 l
20
Mồi ITS4 (10 M) (mốc) hoặc NL4 (men, giả men) 2 l
Taq DNA polymerase (5u/l) 0,5 l
DNA khuôn 1 l
Nước dùng cho PCR 76,5 l
Tổng cộng 100 l
Tiến hành nhân đoạn DNA bằng kĩ thuật PCR trên máy Gene Amp, System
9700 (PE). Chu trình gia nhiệt như sau: Gia nhiệt ở 94ºC trong 3 phút, tiếp theo mẫu
được nhân lên bởi 30 chu kì liên tiếp với các bước: biến tính ở 94ºC trong vòng 40
giây, gắn mồi ở 50ºC trong 40 giây và kéo dài ở 72ºC trong 10 phút.
Sản phẩm PCR sau đó cũng được kiểm tra bằng điện di và nhuộm bằng
ethidium bromit như trên, và soi bằng máy soi gel. Sau đó sản phẩm PCR được đọc
trình tự với 3 mồi ITS1, ITS4, NL4. Kết quả đọc trình tự được xử lý với các phần
mềm Bioedit.
2.3.10. Phân tích hoạt lực enzyme amylase từ các chủng mốc
Cân 20 g gạo nếp với 20 g nước RO vào các bình tam giác 100 ml, ngâm trong
1 giờ rồi hấp thanh trùng ở 121 °C/15phút. Làm nguội rồi bổ sung 1 vòng tròn thạch
giống đường kính 1 cm. Sau 2 ngày nuôi hiếu khí bổ sung 40g hoặc 60 g đệm
CH3COONa 0.1M, PH 5 rồi lắc 150 rpm/1h/27°C để chiết enzyme amylase, ly tâm
khối dịch ở 5000 rpm/20 phút/4°C thu dịch trong rồi lại ly tâm 10000 rpm/10
phút/4°C.
Phân tích hoạt lực enzyme amylase bằng DNS. [23]
Nguyên tắc
Phương pháp này dựa trên cơ sở phản ứng tạo màu giữa đường khử với thuốc
thử acid dinitrosalicylic (DNS). Cường độ màu của hỗn hợp phản ứng tỉ lệ thuận với
nồng độ đường khử trong một phạm vi nhất định. So màu tiến hành ở bước sóng 540
nm. Dựa theo đồ thị đường chuẩn của glucose tinh khiết với thuốc thử DNS sẽ tính
được hàm lượng đường khử của mẫu nghiên cứu.
Thành phần DNS
Nước cất 708 g
3,5 Dinitrosalicylic acid (DNS) 5,3g
21
Sodium hydroxide (NaOH) 9,9 g
Hòa tan và bổ sung thêm:
Rochelle salts (sodium potassium tartrate) 153 g
Phenol tinh thể (để tan trong ở 50C trước khi dùng) 3,8 ml
4,15 g Sodium metabisulfite (Na2S2O5)
Tiến hành xây dựng đường chuẩn:
- 200 µL D-glucose theo các nồng độ trên được cho vào eppendorf 1.5 mL
- Bổ sung thêm 400 µL DNS, mix đều. Phản ứng màu ở 100°C trong 5 phút, làm lạnh
nhanh bằng nước đá
- Lấy 40 µL dịch phản ứng + 180 µL nước cất, mix đều trong vi đĩa.
- Đo OD 540nm. Dựng được đường chuẩn y = ax
- Mẫu Blank: nước cất thay cho đường D-glucose và tiến hành tương tự mẫu thí
nghiệm.
Tiến hành phân tích mẫu enzyme.
Mẫu thí nghiệm:
- Bước 1: Cho 0.3 ml enzyme vào ống nghiệm để vào bể ổn nhiệt 50°C trong 5 phút
(làm ấm ống nghiệm enzyme), ống cơ chất cũng được làm ấm 50°C trong 5 phút.
- Bước 2: Cho 0.6 ml cơ chất vào ống nghiệm enzyme, cho enzyme phản ứng với cơ
chất chính xác 20 phút ở 50°C.
- Bước 3: Nhỏ ngay 0.1 ml NaOH 0.1 M để dừng phản ứng. Làm nguội nhanh bằng
nước đá.
- Bước 4: Bổ sung 0.6 ml DNS vào 0.3 ml hỗn hợp phản ứng, mix đều, phản ứng màu
ở 100°C trong 5 phút. Làm lạnh nhanh bằng nước đá.
- Bước 5: Lấy 0.4 ml dịch phản ứng mix đều với 1.8 ml nước cất trong cuvet. Đo OD
540 nm.
Mẫu đối chứng thí nghiệm (kiểm tra lượng đường có sẵn trong enzyme và
ảnh hưởng của các phản ứng phụ khác)-ký hiệu C1:
Bổ sung 0.3 ml enzyme với 0.1 ml NaOH 0.1M, gia nhiệt ở 100°C trong 10 phút (để
diệt enzyme), làm lạnh nhanh trong nước đá, cho bổ sung 0.6 ml cơ chất vào các ống
22
đối chứng vortex đều. Sau đó tiến hành các bước tiếp theo từ bước 4.
Mẫu đối chứng cơ chất- không có enzyme (để kiểm tra cơ chất có đường
không)- ký hiệu C2.
Cho 0.4 ml đệm vào 1 ống nghiệm có chứa 0.6 ml cơ chất, vortex đều. Gia nhiệt ở
50°C trong 5 phút, làm lạnh nhanh trong nước đá. Tiến hành các bước tiếp theo từ
bước 4.
IU/ml =
(𝐓−𝐂𝟏−𝐂𝟐)∗𝐃∗𝐕 𝐚∗𝟎.𝟏𝟖∗𝐭∗𝐯
Trong đó: T: Độ hấp phụ của mẫu thí nghiệm
C1: Độ hấp phụ của mẫu đối chứng 1
C2: Độ hấp phụ của mẫu đối chứng 2
D: hệ số pha loãng
V: tổng thể tích mẫu
a: hệ số góc của đường chuẩn
0.18: 180/1000 của đường D-glucose khan
t: thời gian phản ứng (phút)
2.3.11 Kiểm tra khả năng chịu nhiệt của các chủng mốc đại diện
Để đảm bảo các chủng giống đều khỏe như nhau, tiến hành lấy giống từ các
ống bảo quản cát rắc lên đĩa Malt 2ºBx, sau 1 đến 2 ngày khi có các đĩa giống thuần,
tiến hành cấy chấm sinh khối mốc trên môi trường tinh bột 1%, thạch 1.8% trong 2
ngày ở 6 điều kiện nhiệt: 25°C, 30°C, 35°C, 40°C, 45°C, 50°C. Sau 24 giờ, 48 giờ
tiến hành đo đường kính khuẩn lạc để so sánh sự phát triển của các nhóm chủng rồi
chụp ảnh lại.
2.3.12. Kiểm tra sự thủy phân tinh bột của một số nhóm mốc khi có đường
Như chúng ta đã biết, vi sinh vật có khả năng thủy phân tinh bột khi sống trong
môi trường có tinh bột thì chúng sẽ kích hoạt gen, tổng hợp enzyme amylase, enzyme
này sẽ thủy phân tinh bột thành đường dễ sử dụng để phục vụ sự sinh trưởng và phát
triển của loài đó. Tuy nhiên, trong môi trường có cả tinh bột và đường thì liệu rằng
các nhóm nấm khác nhau có xu hướng sử dụng hết đường rồi mới sử dụng đến tinh
bột hay chúng vẫn sinh enzyme thủy phân tinh bột ngay cả khi môi trường có đường.
23
Để trả lời câu hỏi đó, chúng tôi tiến hành làm thí nghiệm như sau:
Chọn ra các chủng đại diện mỗi nhóm để kiểm tra tính thủy phân tinh bột khi
trong môi trường có sẵn glucose, ta tiến hành thí nghiệm như sau: thu sinh khối các
chủng mốc sau 2 ngày nuôi trên đĩa thạch Malt 2°Bx ở tủ 30°C, bổ sung 0.7 mL NaCl
0.9%, sau đó trộn đều với 25mL thạch Agar-agar Type I 1.5% chứa soluble starch
0.5%, đổ ra đĩa Petri, cắt miếng tròn d=1.3cm, thả vào mỗi bình dịch YM (đã pha
loãng 10 lần có bổ sung chloramphenicol 0.1%) với nồng độ đường glucose khác
nhau rồi nuôi lắc ở 30°C, 150 rpm. (Thành phần môi trường YM gốc không có glusose
và cao malt: cao nấm men 3g/L; peptone 5g/L.)
- Bình 1: 50 ml YM + 0% glucose
- Bình 2: 50 ml YM + 0.5% glucose
- Bình 3: 50 ml YM + 1% glucose
- Bình 4: 50 ml YM + 2% glucose
Sau 12, 24, 36, và 48 giờ, tiến hành lấy mẫu và nhuộm với dung dịch lugol
0.33%, mẫu nào có nhiều tinh bột chưa bị thủy phân sẽ cho màu tím đậm.
2.3.13. Lên men rượu từ các chủng mốc và men thuần chọn lọc
Từ các thí nghiệm trên, tiến hành chọn nhóm chủng nấm mốc Rhizopus oryzae
có hoạt lực enzyme amyase cao, có khả năng thủy phân tinh bột khi trong môi trường
đường, và nhóm chủng này được cho là an toàn trong thực phẩm để thử nghiệm lên
men rượu kết hợp với chủng nấm men Saccharomyces cerevisiae hoặc giả men
Saccharomycopsis fibuligera
Sử dụng 3 chủng nấm mốc thuần có hoạt lực enzyme amylase cao, 1 chủng
nấm men có khả năng lên men rượu tốt, và 1 chủng giả nấm men của Viện Công
nghiệp Thực phẩm:
- Chủng nấm mốc: Rhizopus oryzae BMM 111, Rhizopus arrhizus (Rhizopus
oryzae) BMM131, Rhizopus arrhizus (Rhizopus oryzae) BMM1015. Đĩa giống mốc
thu sinh khối sau 2 ngày cấy trên đĩa malt 2°Bx.
- Chủng nấm men Saccharomyces cerevisiae BMQ 467 (nồng độ 107 tế bào)
- Chủng giả nấm men Saccharomycopsis fibuligera BMQ908 (nồng độ 107 bào
24
tử). Nuôi tăng sinh trong các bình tam giác 100 ml, dịch malt 4°Bx sau 24h nuôi lắc.
Chuẩn bị cơm gạo để lên men rượu như sau: Cân 250 g gạo với 250 g nước
RO (ngâm 2h) vào mỗi bình tam giác 1000 ml. Hấp ở 121°C/15 phút, sau đó để nguội,
bổ sung giống mỗi loại như bảng 2.1. Sau đó lên men ẩm trong 3 ngày, bổ sung 500
ml nước để lên men rượu 7 ngày. Sau 10 ngày thu dịch đem đo độ cồn và chưng cất.
Lượng giống đươc bổ sung như sau:
- Nấm mốc: bổ sung 1 vòng tròn thạch đường kính d= 1.3 cm
- Nấm men: bổ sung 2 ml dịch sinh khối (107 tế bào)
- Giả nấm men: bổ sung 200 µl dịch
Bảng 2. 1. Thành phần giống ở mỗi mẫu lên men
Ký hiệu mẫu Giống bổ sung
Rhizopus oryzae BMM 111 LAB 1 Saccharomyces cerevisiae BMQ 467
Rhizopus oryzae BMM 131 LAB 2 Saccharomyce cerevisiae BMQ 467
Rhizopus oryzae BMM 1015 LAB 3 Saccharomyces cerevisiae BMQ 467
Rhizopus oryzae BMM 111
LAB 4 Saccharomycopsis fibuligera BMQ 908
Saccharomyces cerevisiae BMQ 467
Rhizopus oryzae BMM 131
LAB 5 Saccharomycopsis fibuligera BMQ 908
Saccharomyces cerevisiae BMQ 467
Rhizopus oryzae BMM 1015
LAB 6 Saccharomycopsis fibuligera BMQ 908
Saccharomyces cerevisiae BMQ 467
Ký hiệu: d là đường kính (cm)
2.3.14. Đo độ cồn bằng sôi kế
Đo độ cồn, ta sử dụng sôi kế ebulliometer. Cách đo như sau:
25
➢ Để đo điểm sôi của nước:
- Bước 1: Rửa sạch buồng sôi cẩn thận bằng nước sạch.
- Bước 2: Thêm khoảng 20mL nước RO vào buồng sôi.
- Bước 3: Lắp nhiệt kế rồi đốt đèn và đặt dưới chân thiết bị.
- Bước 4: Khi nước sôi, quan sát nhiệt kế, khi mức thủy ngân ổn định (> 30 giây)
- Bước 5: Để dụng cụ nguội trước khi tháo nhiệt kế và xả nước.
ghi lại nhiệt độ đọc gần nhất có thể. Nhiệt độ này là T1.
➢ Để đo điểm sôi của rượu:
- Bước 1: Rửa sạch khoang sôi với rượu.
- Bước 2: Đo 50mL rượu và đổ vào buồng sôi.
- Bước 3: Lắp nhiệt kế.
- Bước 4: Đổ đầy khoang ngưng bằng nước lạnh.
- Bước 5: Đốt đèn và đặt dưới chân thiết bị
- Bước 6: Khi rượu sôi, quan sát nhiệt kế. Khi mức thủy ngân ổn định (15-30 giây)
ghi lại nhiệt độ đọc gần nhất có thể. Nhiệt độ này là T2.
- Bước 7: Để dụng cụ nguội trước khi tháo nhiệt kế và xả nước.
➢ Để tính toán nồng độ cồn:
1. Tính giá trị T = T1 - T2
2. Xác định nồng độ cồn từ bảng hiển thị đi kèm
2.3.15. Phân tích phổ hương của các mẫu rượu gạo chưng cất bằng máy sắc ký
khí kết nối khối phổ GCMS.
Thông số chạy máy [21].
Việc đánh giá các hợp chất bay hơi trong sản phẩm lên men được thực hiện sử
dụng phương pháp vi tách chiết pha rắn kết hợp với sắc kí khí kết nối khối phổ
(GCMS).
Các mẫu được phân tích bởi GC/MS sử dụng sắc kí khí SCION 456-GC và
khối phổ SQ.
- Cột: mao quản Rt-Wax, dài 30m, 0.25 mm film thickness
- Khí mang: Heli với độ tinh khiết cao
26
- Vận tốc khí mang: 42 cm s-1
- Tốc độ dòng là 1.2 ml/min
- Nhiệt độ lò: bắt đầu là 35 ºC giữ trong 2 phút, sau đó tăng 5 ºC/1 phút lên 155 ºC
và giữ 0 phút. Tiếp theo tăng 20ºC/1 phút lên 200 ºC và giữ trong 10 phút
- Sợi fiber SPME được đưa vào trong liner và giữ trong 20 phút, sử dụng chế độ
chia dòng như sau: trong 1 phút đầu là không chia dòng, từ phút 1.01 thì chia dòng
1:10. Đối với MS, nhiệt độ nguồn ion và nhiệt độ transfer line là 230 ºC. Chế độ
electron impact mode là 70 eV.
Sử dụng 32 mẫu rượu chưng cất bao gồm 26 mẫu thu thập (ký hiệu COM) và 6
mẫu của Trung tâm Vi sinh vật Công nghiệp (LAB1-LAB6) để phân tích. Điều kiện
xử lý mẫu trước khi cho vào injector như sau: Đo cồn kế các mẫu rượu chưng cất rồi
pha loãng về độ cồn 12 % (v/v) bằng nước deion, hút 5 ml vào các ống 20 ml chứa 1.5
g NaCl. Bổ sung 5µl chất nội chuẩn là 2-pentanol,4-methyl với nồng độ 5ppm, sử dụng
khuấy từ trong lúc gia nhiệt mẫu lên 60ºC, giữ sợi hấp phụ fiber The Supelco
Carbowax/divinylbenzene (CW/DVB) 65 mm trong 30 phút rồi đưa vào máy.
Việc bán định lượng các chất bay hơi được thực hiện bằng cách sử dụng 2-
pentanol,4-methyl là chất nội chuẩn. Cách tính bán định lượng của những chất bay
𝐴𝑐
hơi đó được tính theo công thức sau [29].
𝐴is
C (µg/L) = x Cis (µg/L)
Trong đó: C: nồng độ tương đối của chất phân tích
Cis: nồng độ chất chuẩn nội trong mẫu rượu
Ac: diện tích chất phân tích
Ais: diện tích của chất nội chuẩn.
Phổ phổ của các hợp chất chưa biết được so sánh với các hợp chất trong thư
viện phổ. Phân tích mỗi mẫu được lặp lại 2 lần, rồi phân nhóm mẫu theo thứ bậc bằng
27
phần mềm ORANGE.
Chương 3: KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU
3.1. Kết quả phân lập vi nấm từ 15 bánh men
Để nghiên cứu quá trình thủy phân tinh bột, bước đầu tiên các chủng nấm mốc
được phân lập từ 15 mẫu bánh men thì kết quả là hầu hết các chủng nấm mốc đều thuộc
họ Mucoraceae.
Bằng việc phân lập, quan sát hình thái khuẩn lạc, làm sạch các chủng vi nấm
khác nhau từ 15 mẫu bánh men được thu thập từ các tỉnh Ninh Bình, Tuyên Quang,
Thái Bình, Hà Nội, Nam Định, Hà Nam, Hưng Yên, Bắc Giang, có 73 chủng nấm
mốc, 16 chủng nấm men và 12 chủng giả nấm men. Thông tin chi tiết chủng được ghi
rõ trong phụ lục.
Tổng số chủng được phân lập từ 15 mẫu bánh men là 101, trong đó chủ yếu là
nấm mốc chiếm 73 chủng, nấm men 16 chủng và giả men chỉ có 12 chủng. Nấm mốc
xuất hiện ở tất cả các bánh men, từ 2 đến 8 chủng trên một bánh. Tuy nhiên, các chủng
nấm men phân lập được chỉ xuất hiện ở bánh men MQ2, MQ3, MQ4, MQ7, MQ8,
MQ9, MQ11, MQ12, MQ13 mà không phân lập được ở bánh men MQ1, MQ5, MQ6,
MQ10, MQ14, MQ15. Đối với các chủng giả men cũng vậy, chỉ xuất hiện ở bánh men
MQ2, MQ3, MQ7, MQ8, MQ9, MQ12, MQ13, MQ14 mà không có ở bánh men MQ1,
MQ4, MQ5, MQ6, MQ10, MQ11, MQ15.
3.2. Kết quả hình thái khuẩn lạc, tế bào.
Sau khi phân lập, các chủng cần được xếp nhóm trong đó phân nhóm hình thái
khuẩn lạc và tế bào là một bước rất quan trọng. Các chủng được cấy trên đĩa Petri
Malt 2ºBx, sau 2 ngày nuôi trong tủ 30ºC sẽ được xếp nhóm sơ bộ bằng hình thái
khuẩn lạc dựa trên 3 đặc điểm cơ bản của khuẩn lạc là: hình dạng, kích thước, màu
sắc. Sau đó, tiếp tục làm tiêu bản quan sát hình thái tế bào dưới kính hiển vi. Dưới
đây là hình thái khuẩn lạc mặt trước, mặt sau và hình thái tế bào (thứ tự từ trái sang
28
phải) của các chủng vi nấm đại diện các nhóm.
Nhóm 1 (18 chủng): Rhizopus microsporus MQF 4.2
Nhóm 2(8 chủng): Rhizopus microsporus MQF 1.2
Nhóm 3 (3 chủng): Mucor indicus MQF 12.1
29
Nhóm 4 (5 chủng): Rhizopus oryzae MQF 2.4
Nhóm 5 (7 chủng): Rhizopus oryzae MQF 2.5
Nhóm 6 (4 chủng): Rhizopus oryzae MQF 1.3
Nhóm 7 (12 chủng): Rhizopus oryzae MQF 10.5
30
Nhóm 8 (3 chủng): Lichtheimia ramosa MQF 9.4
Nhóm 10(4 chủng): Mucor circinelloides MQF 2.2
Nhóm 11 (5 chủng): Mucor indicus MQF 8.4
Nhóm 12 (2 chủng): Mucor indicus MQF 10.2
Nhóm 13 (2 chủng): Cunninghamella echinulata MQF 8.6
31
Nhóm nấm men
Nhóm 1(14 chủng): Saccharomyces cerevisiae MQY 4.1
Nhóm 2 (2 chủng): Wickerhamomyces anomalus MQY 11.3
Nhóm giả men
Có 12 chủng. Saccharomycopsis fibuligera MQS 14.1
Hình 3. 1. Hình thái khuẩn lạc và tế bào của các nhóm nấm đại diện
Nấm mốc:
Nhóm 1 (18 chủng): Nhóm này có hình thái khuẩn lạc màu xám ghi, hệ sợi
phát triển nhanh, túi bào tử màu đen. Dễ thấy, nhóm khuẩn lạc này rất phổ biến, chúng
xuất hiện ở hầu hết các bánh men từ MQ4 đến MQ15.
Nhóm 2 (8 chủng): Nhóm này đặc trưng bởi hình thái khuẩn lạc màu đen, hệ
sợi bò lan, ít hoặc không có hệ sợi khí, bào tử đen to. Khi quan sát tiêu bản có rễ.
32
Nhóm này cũng khá phổ biến, chúng xuất hiện ở 7 bánh men MQ 1,4,5,6,10,11,14.
Nhóm 3 (3 chủng): Khuẩn lạc màu sáng, hệ sợi dày bò lan, không có hệ sợi
khí. Khi quan sát tế bào có nhiều Chlamydospore. Nhóm này tần xuất xuất hiện thấp,
chỉ có mặt ở bánh men MQ3, MQ12, và MQ14.
Nhóm 4 (5 chủng): Khuẩn lạc màu trắng sữa phát triển nhanh, hệ sợi bò lan là
chủ yếu, không vách ngăn, dường như không quan sát thấy túi bào tử. Khi làm tiêu
bản để quan sát tế bào thì thấy rất nhiều Chlamydospore ở giữa sợi nấm. Nhóm này
chỉ xuất hiện ở 4 bánh men duy nhất là MQ2,3,7,8
Nhóm 5 (7 chủng): Hệ sợi màu trắng, bò lan và cả sợi khí phát triển tốt. Túi
bào tử to, màu trắng, hệ sợi không vách ngăn, và không quan sát thấy rễ nấm. Nhiều
Chlamydospore giữa sợi nấm. Các chủng thuộc nhóm này được tìm thấy ở MQ2,
MQ9, MQ12, và MQ15.
Nhóm 6 (4 chủng): Khuẩn lạc có hệ sợi màu trắng, phát triển nhanh, vừa bò
lan vừa có hệ sợi khí, túi bào tử lớn màu đen có thể nhìn thấy bằng mắt thường, khi
già khuẩn lạc nhìn có màu hơi nâu. Nhóm này chỉ thấy ở 3 bánh men là MQ1, MQ5
và MQ7
Nhóm 7 (12 chủng): Khuẩn lạc có hệ sợi màu trắng, phát triển nhanh, chủ yếu
bò lan, hệ sợi khí mọc thưa, túi bào tử lớn màu đen, ít hơn nhưng to hơn bào tử ở
nhóm 6, có thể nhìn thấy bằng mắt thường. Sợi có nhiều Chlamydospore. Các chủng
thuộc nhóm này xuất hiện ở nhiều các bánh men như MQ2,4,5,6,10,11,14
Nhóm 8 (3 chủng): Khuẩn lạc màu trắng điển hình, sợi mảnh, hệ sợi khí phát
triển tốt. Túi bào tử hình cầu. Nhóm này xuất hiện khá ít, chỉ ở 3 bánh men
MQ9,11,14.
Nhóm 9 (1 chủng): Nhóm này duy nhât phân lập được 1 chủng, xuất hiện ở
bánh men MQ12. Khuẩn lạc màu trắng xốp, sợi mảnh, bào tử đính tròn nhỏ.
Nhóm 10 (4 chủng): Khuẩn lạc màu đậm đặc trưng, hệ sợi dày, Túi bào tử hình
cầu. Các chủng thuộc nhóm này được phân lập từ 3 bánh men là MQ2,3,13.
Nhóm 11 (5 chủng): Các chủng thuộc nhóm này thường khuẩn lạc có màu
vàng ghi đặc trưng, Bào tử có màu vàng nhạt, sợi liên tục phân nhánh, với các nhánh
33
dài. Túi bào tử có màu vàng đến nâu. Cuống gần hình cầu, cao. Bào tử có vách trơn,
gần cầu tới elip, và có đường kính 4-5 µm. Các chủng thuộc nhóm này thuộc các bánh
men MQ1,8,9.
Nhóm 12 (2 chủng): Khuẩn lạc màu vàng nhạt, sợi mọc lan, ở giữa có ít sợi
khí mọc lên, bào tử. Túi bào tử to, hình tròn đính với cuống lớn hình trụ, bào tử nhỏ
hình gần cầu, elip. Nhóm này rất hiếm gặp, chỉ thấy ở bánh men MQ10.
Nhóm 13 (2 chủng): Khuẩn lạc có màu vàng nhạt, hệ sợi phát triển chậm,
bào tử đính hình tròn. Chỉ duy nhất bánh men MQ8 có sự xuât hiện nhóm chủng
này.
Nấm men:
Nhóm 1: (13 chủng): Khuẩn lạc màu trắng sữa, nhẵn bóng, tế bào gần cầu, có
những tế bào dài đang phân đôi. Nhóm chủng này rất phổ biến, xuất hiện ơ nhiều
bánh men như MQ2,3,4,7,8,9,11,12,13.
Nhóm 2 (2 chủng): Khuẩn lạc có màu trắng sáng, sáng hơn nhóm 1, tế bào
tròn, nhiều tế bào quan sát được đang phân đôi, nảy chồi. Nhóm này chỉ có 2 chủng
duy nhất thuộc 2 bánh men MQ9 và MQ11.
Giả men:
Nhóm 1 (12 chủng): Khuẩn lạc màu trắng sữa, xù xì. Khi quan sát tế bào thì
có nhiều sợi và bào tử
Như vậy, kết quả cho thấy hầu hết các chủng vi nấm được phân lập là nấm
mốc với độ đa dạng về hình thái khuẩn lạc và tế bào hơn là nấm men và giả nấm men.
3.3. Phân nhóm bằng kỹ thuật PCR-fingerprinting và định danh chủng nấm
đại diện dựa vào phân tích trình tự rDNA
Việc phân loại bước đầu các chủng nấm mốc bằng hình thái khuẩn lạc và tế
bào tương đối nhanh do sự sai khác khá điển hình giữa các nhóm. Tuy nhiên, với các
chủng nấm men hay giả men thì do sự đa dạng và sự sai khác không rõ ràng giữa các
chủng về mặt hình thái khuẩn lạc cũng như tế bào làm cho việc phân loại dựa vào
những đặc điểm này gặp nhiều khó khăn, phân nhóm bằng hình thái là một bước để
giảm bớt sự khó khăn khi phân nhóm bằng các phương pháp tiếp theo. Để đánh giá
tính đa dạng của các chủng phân lập được một cách chính xác, chúng tôi tiến hành
34
phân nhóm bằng kỹ thuật fingerprinting 103 chủng phân lập được sử dụng mồi MST2
(có trình tự 5’-(GAC)5-3’). Kết quả phân nhóm bằng fingerprinting được đối chiếu
lại với kết quả phân nhóm bằng hình thái.
Hình 3. 2. Phổ băng DNA fingerprinting
Ký hiệu: 1-MQF 4.2; 2- MQF 4.4; 3- MQF 5.2; 4 - MQF 5.6; 5 - MQF 6.4; 6 - MQF 6.5; 7 - MQF 7.2; 8 - MQF 8.3; 9 - MQF 9.5; 10 -
MQF 10.3; 11 - MQF 11.1; 12 - MQF 12.5; 13 - MQF 14.3; 14 - MQF 14.7; 15 - MQF 14.8; 16 - MQF 15.3; 17 - MQF 10.1; 18 - MQF
13.1; 19 - MQF 1.2; 20 - MQF 4.1; 21 - MQF 4.5; 22 - MQF 5.3; 23 - MQF 6.3; 24 - MQF 10.4; 25 - MQF 11.2; 26 - MQF 14.1; 27 -
MQF 3.1; 28 - MQF 12.1; 29 - MQF 12.4; 30 - MQF 2.4; 31 - MQF 3.2; 32 - MQF 8.2; 33 - MQF 2.5; 34 - MQF 9.1; 35- MQF 9.6; 36 -
MQF 12.6; 37 - MQF 15.1; 38 - MQF 15.2; 39 - MQF 15.4; 40 - MQF 1.3; 41 - MQF 1.4; 42 - MQF 5.7; 43 - MQF 7.1; 44 - MQF 7.3;
45 - MQF 8.1; 46 - MQF 2.1; 47 - MQF 4.3; 48 -MQF 5.1; 49 - MQF 5.4; 50 - MQF 5.5; 51 - MQF 6.1; 52 - MQF 6.2; 53 - MQF 10.5;
54 - MQF 10.6; 55 - MQF 14.4; 56 - MQF 14.5; 57 - MQF 9.4; 58 - MQF 11.3; 59 - MQF 14.2; 60 - MQF 12.2; 61 - MQF 2.2; 62 - MQF
2.3; 63 - MQF 3.3; 64 - MQF 13.2; 65 - MQF 1.1; 66 - MQF 8.4; 67 - MQF 8.7; 68 - MQF 9.3; 69- MQF 9.7; 70 - MQF 10.2; 71 - MQF
10.7; 72 - MQF 8.5; 73 - MQF 8.6; 74- MQY 2.1; 75- MQY 3.1; 76- MQY 4.1; 77- MQY 4.2; 78- MQY 7.2; 79- MQY 8.1; 80- MQY
8.2; 81- MQY 9.2; 82- MQY 11.1; 83- MQY 11.2; 84- MQY 12.1; 85- MQY 12.2; 86- MQY 13.1; 87- MQY 7.1; 88- MQY 9.3; 89- MQY
11.3; 90- MQS 8.1; 91- MQS 8.2; 92- MQS 3.2; 93- MQS 3.1; 94- MQS 2.2; 95- MQS 2.1; 96- MQS 12.1; 97- MQS 12.2; 98- MQS 13.2;
99- MQS 13.1; 100- MQS 9.2; 101- MQS 14.1.
35
Kết quả thể hiện ở hình 3.2 cho thấy, sản phẩm PCR nhân với mồi MST2 của
các chủng nấm có các phổ băng khác nhau và rất đa dạng do sự phân bố về số lượng
bản sao cũng như vị trí của DNA vệ tinh trong genome. Kỹ thuật phân nhóm sử dụng
mồi thiết kế dựa trên DNA vệ tinh cho độ phân giải đến loài. Các chủng có cùng hình
thái khuẩn lạc, được điện di cạnh nhau, và cho phổ finger giống nhau như nhóm 1,
nhóm 2, nhóm 3. Bên cạnh đó, các chủng có hình thái khuẩn lạc khác nhau nhưng lại
cho cùng phổ finger như các chủng thuộc nhóm 4,5,6,7. Tùy thuộc vào vị trí phân bố
trên DNA mà số lượng vạch DNA giữa các nhóm có thể khác nhau, ví dụ như nhóm
6,7,8 có nhiều băng DNA nhưng nhóm 9 hay 13 chỉ có 1 băng DNA duy nhất. Các
chủng vừa có hình thái giống nhau, vừa có băng finger giống nhau sẽ được xếp cùng
nhóm. Theo cách đó chúng tôi đã chia 73 chủng nấm mốc thành 13 nhóm, 16 chủng
nấm men thành 2 nhóm, và 12 chủng giả nấm men.
Bảng 3. 1. Kết quả phân nhóm các chủng bằng fingerprinting và đọc trình tự
các chủng đại diện
Nhóm
Chủng
Tên khoa học
Chủng đọc trình tự
Nấm mốc
MQF 4.2
1
Rhizopus microsporus
(18 chủng) MQF 4.2, MQF 4.4, MQF 5.2, MQF 5.6, MQF 6.4, MQF 6.5, MQF 7.2, MQF 8.3, MQF 9.5, MQF 10.3, MQF 11.1, MQF 12.5, MQF 14.3, MQF 14.7, MQF 14.8, MQF 15.3, MQF 10.1, MQF 13.1
MQF 5.3
2
(8 chủng) MQF 1.2, MQF 4.1, MQF 4.5, MQF 5.3, MQF 6.3, MQF 10.4, MQF 11.2, MQF 14.1
Rhizopus microsporus
(3 chủng) MQF 3.1, MQF 12.1, MQF 12.4
Mucor indicus
3
MQF 12.1
MQF 2.4 Rhizopus oryzae
4
(5 chủng) MQF 2.4, MQF 3.2, MQF 7.3, MQF 8.1, MQF 8.2
MQF 2.5 Rhizopus oryzae
5
(7 chủng) MQF 2.5, MQF 9.1, MQF 9.6, MQF 12.6, MQF 15.1, MQF 15.2, MQF 15.4
(4 chủng) MQF 1.3, MQF 1.4, MQF 5.7, MQF 7.1
MQF 1.3 Rhizopus oryzae
6
Rhizopus oryzae
7
MQF 10.5
(11 chủng) MQF 2.1, MQF 4.3, MQF 5.1, MQF 5.4, MQF 5.5, MQF 6.1, MQF 6.2, MQF 10.5, MQF 10.6, MQF 14.4, MQF 14.5
(3 chủng) MQF 9.4, MQF 11.3, MQF 14.2
MQF 9.4 Lichtheimia ramosa
8
36
Nhóm
Chủng
Tên khoa học
Chủng đọc trình tự
9
(1 chủng) MQF 12.2
MQF 12.2
Cunninghamella bertholletiae
10
(3 chủng) MQF 2.2, MQF 2.3, MQF 3.3
MQF 2.2 Mucor circinelloides
MQF 8.4 Mucor indicus
11
(6 chủng) MQF 13.2, MQF 1.1, MQF 8.4, MQF 8.7, MQF 9.3, MQF 9.7
Mucor indicus
12
(2 chủng) MQF 10.2, MQF 10.7
MQF 10.2
MQF 8.6
13
(2 chủng) MQF 8.5, MQF 8.6
Cunninghamella echinulata
Nấm men
MQY 4.1
1
Saccharomyces cerevisiae
(14 chủng) MQY 2.1, MQY 3.1, MQY 4.1, MQY 4.2, MQY 7.2, MQY 8.1, MQY 8.2, MQY 9.2, MQY 11.1, MQY 11.2, MQY 12.1, MQY 12.2, MQY 13.2, MQY 7.1
2
(2 chủng) MQY 9.3, MQY 11.3
MQY 11.3
Wickerhamomyces anomalus
Giả men
1
Saccharomycopsis fibuligera
MQS 14.1
(12 chủng) MQS 8.1, MQS 8.2, MQS 3.2, MQS 3.1, MQS 2.2, MQS 2.1, MQS 12.1, MQS 12.2, MQS 13.2, MQS 13.1, MQS 9.2, MQS 14.1
Xếp nhóm và phân loại các chủng dựa vào hình thái và đặc điểm sinh lý thường
rất khó và tốn thời gian. Các loài khác nhau có thể có hình thái giống nhau và các
chủng cùng loài có thể có nhiều kiểu hình. Bằng việc sử dụng mồi PCR (GAC)5
khuếch đại các đoạn ADN vệ tinh có thể xếp nhóm thành công một lượng lớn các
chủng vi nấm.
Dựa vào kết quả phân nhóm bằng fingerprinting chúng tôi chọn ra 16 chủng
đại diện của 16 nhóm (bảng 3.2) để phân tích trình tự. Chúng tôi chọn đoạn D1/D2
của rDNA 26S và vùng ITS của rDNA để phân tích. Do kích thước của các đoạn
này khá ngắn (khoảng 600 bp), tính bảo thủ rất cao giữa các loài. Đồng thời, trình
tự của các đoạn này của các loài đã biết đã được công bố trên GenBank, nên dễ dàng
cho việc so sánh trình tự với các loài mới phân lập được. Như vậy với các ưu điểm
này, đoạn D1/D2 và vùng ITS rất thích hợp cho việc phân tích trình tự để định tên
37
nấm
DNA của 13 chủng nấm mốc được tách sau đó dùng PCR nhân đặc hiệu đoạn
DNA chứa vùng ITS, nấm men, giả nấm men nhân đoạn D1/D2 bằng cặp mồi ITS1
và NL4. Sản phẩm PCR sau đó được tinh chế và đọc trình tự với mồi ITS4 (nấm
mốc), NL4 (nấm men, giả men). Kết quả đọc trình tự sau đó được so sánh với các
chủng đã được công bố.
Từ kết quả đọc trình tự các chủng đại diện ở bảng 3.2, ta thấy đối với các
chủng nấm mốc.
- Loài Rhizopus oryzae, chiếm 27 chủng (tổng của 5 chủng nhóm 4, 7 chủng
nhóm 5, 4 chủng nhóm 6 và 11 chủng nhóm 7).
- Loài Rhizopus microsporus chiếm 26 chủng (tổng của 26 chủng nhóm 1 và
8 chủng nhóm 2)
- Loài Mucor indicus chiếm 11 chủng (3 chủng nhóm 3, 6 chủng nhóm 11 và
2 chủng nhóm 12)
- Loài Mucor circinelloides có 3 chủng (3 chủng nhóm 10)
- Loài Lichtheimia ramosa có 3 chủng (3 chủng nhóm 8), loài Cunninghamella
echinulata có 2 chủng, và 1 chủng Cunninghamella bertholletiae.
Từ đó có thể kết luận rằng, loài nấm mốc thường gặp ở các bánh men là
Rhizopus oryzae, chiếm 27 chủng trong số 73 chủng nấm được xác định và tiếp theo
là Rhizopus microsporus (26 chủng), Mucor indicus (11 chủng), Mucor circinelloides
(3 chủng), Lichtheimia ramosa (3 chủng), Cunninghamella echinulata (2 chủng),
Cunninghamella bertholletiae (1 chủng). Trong 1 nghiên cứu trước về đa dạng vi sinh
vật trong bánh men truyền thống thì các chủng nấm thuộc họ Mucoraceae không phổ
biến mà loài nấm giả men Saccharomyscopsis fibuligera mới là loài phổ biến hơn cả
[21]. Saccharomyscopsis fibuligera cũng là loài sinh amylase chính ở Loog-pang –
một loại giống khởi động truyền thống ở Thái Lan, tương tự như bánh men Việt Nam.
Trong số các chủng nấm men phân lập được thì chủ yếu các chủng thuộc loài
S.cerevisiae (14 chủng-nhóm 1), Wickerhamomyces anomalus (2 chủng-nhóm 2), và
12 chủng giả nấm men. S. fibuligera. Một nghiên cứu trước đây đã chỉ ra rằng loài
nấm S. cerevisiae đóng vai trò chủ yếu trong quá trình lên men rượu vì chúng được
38
tìm thấy ở tất cả các giai đoạn của quá trình lên men và đến ngày cuối cùng thì chỉ có
sự hiện diện thuần nhất của chúng bên cạnh vi khuẩn, đây được giải thích là kết quả
của việc thuần hóa lâu dài [25].
Kết quả phân lập này tương đồng với nghiên cứu trước đây của Thanh VN và
cộng sự, từ 130 chủng vi nấm được phân lập từ các giai đoạn khác nhau của lên men
rượu gạo. Trong đó, 41 chủng thuộc họ Mucoraceae, 16 chủng giả men là S
.fibuligera, 29 chủng nấm men, chủ yếu là S.cerevisiae [25].
Quá trình lên men gần như thiếu Aspergillus, Trichoderma và Penicillum, loại
nấm hoại sinh phổ biến nhất trong môi trường trong nhà. Lên men rượu truyền thống
của Việt Nam khác biệt đáng kể với quá trình lên men của rượu sake Nhật Bản, nơi
Aspergillus spp. là chủ yếu. Đặc điểm này là do độ ẩm cao của cơ chất được sử dụng
trong quá trình lên men rượu của Việt Nam. Độ ẩm ban đầu của bột làm bánh men và
cơm hấp để lên men rượu nằm trong khoảng từ 50% đến 55%. Đây là điều kiện thuận
lợi cho Mucorceae phát triển vì chúng thích nghi với cơ chất có hàm ẩm cao, điều
kiện lên men vi hiếu khí.
3.4. Phân tích hoạt lực enzyme amylase bằng DNS
Như đã biết, các chủng nấm mốc chủ yếu sinh enzym amylase để thủy phân
cơ chất tinh bột thành đường khử, nên tiến hành phân tích hoạt lực enzyme amylase
với cơ chất là tinh bột hòa tan rồi đo sản phẩm đường khử bằng DNS để xem khả
năng thủy phân tinh bột của các nhóm chủng nấm mốc nhanh hay chậm.
Sau 2 ngày bổ sung chủng mốc với cơm gạo nuôi ở 30ºC dịch đường hóa được
chiết bằng đệm CH3COONa 0.5M rồi ly tâm. Phần dịch phía trên của ống ly tâm chứa
amylase ngoại bào được phân tích hoạt lực bằng phương pháp DNS. Sau đây là bảng
kết quả hoạt lực amylase của 67 chủng nấm mốc Mucoraceae và 1 chủng đối chứng
Cunninghamella echinulata MQF 8.5 (C. echinulata MQF 8.5).
Bảng 3. 2. Hoạt lực enzyme amylase của các chủng mốc thuần
Hoạt lực
Hoạt lực
amylase
amylase
STT
Chủng
STT
Chủng
(IU/ml)
(IU/ml)
1
M. circinelloides MQF 2.2
1,89
35
R.microsporus MQF 4.5
10,17
2
M. circinelloides MQF 2.3
2,06
36
R.microsporus MQF 5.3
6,92
39
M. circinelloides MQF 3.3
2,13
37
R.microsporus MQF 6.3
11,31
3
M. circinelloides MQF 13.2
4,88
38
R.microsporus MQF 10.4
4
6,91
M. indicus MQF 3.1
0,77
39
R.microsporus MQF 11.2
5
13,3
M. indicus MQF 12.1
2,03
40
R.microsporus MQF 14.1
6
8,57
M. indicus MQF 12.4
2,14
41
R.oryzae MQF 2.4
133,46
7
8
M. indicus MQF 1.1
2,43
42
R.oryzae MQF 3.2
117,5
9
M. indicus MQF 8.4
1,15
43
R.oryzae MQF 7.3
80,77
10
M. indicus MQF 8.7
1,88
44
R.oryzae MQF 8.1
61,35
11
M. indicus MQF 9.3
1,27
45
R.oryzae MQF 8.2
73,76
12
M. indicus MQF 9.7
2,68
46
R.oryzae MQF 2.5
50,5
13
M. indicus MQF 10.2
6,14
47
R.oryzae MQF 9.1
125,6
14
M. indicus MQF 10.7
3,51
48
R.oryzae MQF 9.6
72,06
15
R.microsporus MQF 4.2
7,06
49
R.oryzae MQF 12.6
74,23
16
R.microsporus MQF 4.4
7,09
50
R.oryzae MQF 15.1
59,83
17
R.microsporus MQF 5.2
7,34
51
R.oryzae MQF 15.2
50,06
18
R.microsporus MQF 5.6
11,1
52
R.oryzae MQF 15.4
79,01
19
R.microsporus MQF 6.4
4,77
53
R.oryzae MQF 1.3
128,16
20
R.microsporus MQF 6.5
16,21
54
R.oryzae MQF 1.4
141,8
21
R.microsporus MQF 7.2
7,96
55
R.oryzae MQF 5.7
127,21
22
R.microsporus MQF 8.3
3,29
56
R.oryzae MQF 7.1
129,74
23
R.microsporus MQF 9.5
15,45
57
R.oryzae MQF 2.1
92,66
24
R.microsporus MQF 10.3
27,06
58
R.oryzae MQF 4.3
185,03
25
R.microsporus MQF 11.1
33,22
59
R.oryzae MQF 5.1
148,61
26
R.microsporus MQF 12.5
4,05
60
R.oryzae MQF 5.4
109,44
27
R.microsporus MQF 14.3
7,81
61
R.oryzae MQF 5.5
190,01
28
R.microsporus MQF 14.7
4,74
62
R.oryzae MQF 6.1
85,23
29
R.microsporus MQF 14.8
15,96
63
R.oryzae MQF 6.2
112,19
30
R.microsporus MQF 15.3
13,35
64
R.oryzae MQF 10.5
116,49
31
R.microsporus MQF 10.1
12,26
65
R.oryzae MQF 10.6
159,56
32
R.microsporus MQF 13.1
12,98
66
R.oryzae MQF 14.4
183,72
40
33
R.microsporus MQF 1.2
14.48
67
R.oryzae MQF 14.5
128.98
34
R.microsporus MQF 4.1
11.06
68
C. echinulata MQF 8.5
1.04
Bảng 3.2 cho thấy nhóm R.oryzae là nhóm có hoạt lực amylase cao nhất, cụ
thể như các chủng cho hoạt lực vượt trội là R.oryzae BMQ 5.5, R.oryzae MQF 4.3,
R.oryzae MQF 14.4, R.oryzae MQF 10.6 với kết quả lần lượt là 190,01;185,03;
183,72; 59,56 (IU/ml). Các chủng thuộc nhóm này cho hoạt lực thấp nhất là R.oryzae
MQF 15.2 với 50,06 (IU/ml), R.oryzae MQF 2.5 với 50,05 (IU/ml).
Đối với các chủng thuộc nhóm R.microsporus cho hoạt lực thấp hơn nhiều
so với nhóm R.oryzae, giá trị đã phân tích trong khoảng 3,29-33,22 (IU/ml), với
chủng cao nhất là R.microsporus MQF 11.1 và chủng thấp nhất là R.microsporus
MQF 8.3.
Ngược lại, nhóm thuộc chi Mucor như Mucor indicus hay Mucor
circinelloides cho hoạt lực thấp nhất chỉ từ 1-2 (IU/ml), dao động không đáng kể và
thấp tương tự chủng đối chứng C. echinulata MQF 8.5 (1,04 IU/ml).
Kết quả này có sự tương đồng với nghiên cứu trước đây chỉ ra rằng các chủng
thuộc loài R.oryzae có hoạt lực amylase cao vì chúng có khả năng cho vòng thủy phân
tinh bột lớn từ 7,1-9,0 cm sau 2 ngày ở 30°C so với các chủng mốc khác chỉ cho 2,1-
41
4,7 cm [10]. Hình 3.3 dưới đây mô tả số liệu trong bảng 3.2.
42
Hình 3. 3. Hoạt lực enzyme amylase của các chủng nấm mốc (IU/ml)
3.5. Kiểm tra khả năng chịu nhiệt của các chủng mốc đại diện
Bên cạnh hoạt lực enzyme amylase, yếu tố nhiệt độ cũng đóng vai trò quan
trọng trong quá trình thủy phân tinh bột của các chủng nấm mốc, việc tìm ra ngưỡng
nhiệt độ mà các nhóm chủng đó phát triển tốt trên môi trường tinh bột sẽ rất hữu ích
để kiểm soát nhiệt độ khối ủ trong quá trình lên rượu, đặc biệt là khi lên men rượu sử
dụng các chủng thuần làm giống khởi động.
Để kiểm tra khả năng chịu nhiệt của nhóm chủng mốc Mucoraceae đã phân lập
được, tiến hành chọn ra 2 chủng thuộc loài M. circinelloides, 6 chủng thuộc loài M.
indicus, 8 chủng thuộc loài R. Microsporus, 8 chủng thuộc loài R. oryzae và 1 chủng
đối chứng C. echinulata MQF 8.5. Việc chọn lựa các chủng giống phụ vào số lượng
chủng mỗi loại phân lập được và chọn các chủng có nguồn gốc từ các bánh men khác
nhau.25 chủng đại diện được cấy trên môi trường tinh bột gạo 1% rồi nuôi ở 6 điều
kiện nhiệt độ từ thấp đến cao như sau: 25°C, 30°C, 35°C, 40°C, 45°C, 50°C.
Sau 2 ngày cấy chấm, nuôi trên đĩa thạch tinh bột 1%, các chủng được đo
đường kính khuẩn lạc, kết quả này được thể hiện trong bảng 3.3, cho thấy rõ sự phát
triển và khả năng thủy phân tinh bột trong các điều kiện nhiệt độ khác nhau của các
43
chủng khác nhau.
Bảng 3. 3. Đường kính khuẩn lạc phát triển trên môi trường tinh bột 1% ở các
Hầu hết các chủng đại diện đều phát triển tốt ở 30°C, 35°C, mọc chậm ở 40°C,
nhiệt độ
dường như không mọc ở 45°C và 50°C ngoại trừ các chủng R.microsporus có khả
năng chịu được nhiệt cao, đặc biệt là các chủng R.microsporus MQF 1.2, MQF 5.3,
MQF 9.5, MQF 10.3, MQF 11.2 vẫn mọc tốt ở 45°C, mọc chậm ở 50°C. Ngược lại,
các chủng thuộc chi Mucor M. circinelloides khả năng chịu nhiệt kém nhất, chúng
chỉ phát triển tốt ở 25°C, 30°C còn ở 35 độ mọc rất chậm.
Như vậy kết quả này chỉ ra rằng, nhóm loài Rhizopus microsporus là loài chịu
được nhiệt độ nhất trong số tất cả các nhóm nấm mốc đã phân lập. Kết quả này tương
đồng với nghiên cứu trước, khi cho rằng chủng Rhizopus microsporus var.
rhizopodiformis thuộc loài Rhizopus microsporus có thể sinh trưởng ở điều kiện 50°C
44
và sinh amylase tối ưu ở 45°C [20]. Tương tự như vậy, một báo cáo khác cũng báo
cáo rằng chủng Rhizopus microsporus var.chinensis CICIM-CU F0088 thuộc loài
Rhizopus microsporus cũng sinh trưởng tốt ở 40°C và sinh enzyme thủy phân ở nhiệt
độ cao hơn Rhizopus oryzae [17]. Hình 3.4 mô tả số liệu cho bảng 3.3.
Hình 3. 4. Đường kính khuẩn lạc nấm mốc trên môi trường tinh bột 1% ở các nhiệt độ
3.6. Kết quả sự thủy phân tinh bột của một số nhóm mốc khi có đường
Trong thời gian đầu của quá trình thủy phân tinh bột, tinh bột sẽ được thủy phân
thành đường, lượng đường được sinh ra sẽ phục vụ quá trình trao đổi chất, cung cấp
năng lượng cho tế bào. Vậy liệu rằng, chúng chỉ thủy phân đủ để dùng hay ngay cả
khi trong môi trường có đường và tinh bột, thì enzyme amylase vẫn thủy phân tinh
bột. Để trả lời câu hỏi này, mỗi nhóm chủng mốc chọn ra các 24 chủng đại diện để
kiểm tra khả năng thủy phân tinh bột trong môi trường đường. Với 2 chủng cuối cùng
dùng làm đối chứng Aspergillus oryzae CNTP 5026 và C.echinulata MQF 8.5
Với mỗi mẫu lấy tại các thời điểm 0 giờ, 12 giờ, 24 giờ, 36 giờ và 48 giờ rồi
nhuộm lugol. Những mẫu nào bắt màu xanh đậm với lugol nghĩa là tinh bột chưa
được thủy phân hoặc thủy phân không đáng kể, mẫu nào có màu sáng hơn chứng tỏ
45
tinh bôt đã được thủy phân đáng kể. Hình 3.4 cho thấy kết quả như sau.
Hình 3. 5. Kết quả thủy phân tinh bột trong môi trường có đường của các
chủng mốc
Theo hàng ngang của mỗi ảnh là mẫu cùng một chủng được lấy ở các nồng độ
đường tăng dần: 0%; 0,5%;1%, 2%. Hàng dọc là các chủng khác nhau. Trong 48 giờ
trong môi trường có tinh bột hay có cả tinh bột và đường thì nhóm loài thuộc chi
Mucor (thuộc họ Mucoraceae) như Mucor indicus hay Mucor circinelloides dường
như không đóng vai trò thủy phân tinh bột, biểu hiện rõ ở màu sắc miếng tinh bột vẫn
đậm màu sau 48 giờ, bên cạnh đó nhóm Rhizopus microsporus (thuộc họ
Mucoraceae) thủy phân hoàn toàn tinh bột sau 36 giờ khi không có đường, khi có
đường thì enzym bị ức chế nên thủy phân yếu hơn. Còn nhóm Rhizopus oryzae (thuộc
họ Mucoraceae) thì một số chủng như Rhizopus oryzae MQF 3.2, Rhizopus oryzae
46
MQF 15.4 thủy phân rất tốt sau 12 giờ khi không có đường, tuy nhiên khi trong môi
trường có glucose thì ở thời điểm đầu enzym amylase cũng bị ức chế nên thủy phân
yếu miếng tinh bột nhưng sau 36 giờ thì miếng tinh bột ở hầu hết các nồng độ đường
bị thủy phân hoàn toàn.
Như vậy có thể thấy nhóm Rhizopus microsporus và Rhizopus oryzae thuộc
họ Mucoraceae thủy phân tinh bột ngay cả khi trong môi trường đường, trong đó
nhóm Rhizopus oryzae thủy phân nhanh hơn.
Loài đối chứng không thuộc họ Mucoraceae đã phân lập được đó là C.
echinulata MQF 8.5 cho thấy khả năng thủy phân tinh bột trong môi trường đường
kém, cụ thể là sau 48 giờ màu sắc của miếng tinh bột trong môi trường đường như
không thay đổi màu tím đậm. Còn chủng đối chứng Aspergillus oryzae CNTP 5026
thì ngược lại, chủng này enzyme amylase thủy phân tốt cả trong môi trường đường
nên chỉ sau 24 giờ thì miếng tinh bột ở cả 4 nồng độ đường đều bị thủy phân hoàn.
3.7. Kết quả lên men rượu từ các chủng nấm mốc và nấm men thuần.
Từ các thí nghiệm trên, thấy rằng nhóm nấm mốc Rhizopus oryzae thuộc họ
Mucoraceae có tiềm năng ứng dụng làm men rượu trong sản xuất rượu truyền thống.
Do thời gian thực hiện luận văn có hạn nên các chủng R.oryzae đã được định danh,
và cho hoạt lực enzyme amylase cao của Trung tâm vi sinh vật công nghiệp được lựa
chọn cho thí nghiệm này.
Kế thừa 3 chủng nấm mốc Rhizopus oryzae BMM 111, BMM 131, BMM 1015
có hoạt lực amylase cao, 1 chủng nấm men Saccharomyces cerevisiae BMQ 467 có
khả lên men cồn tốt, 1 chủng giả nấm men Saccharomycopsis fibuligera và công thức
bổ sung giống của Trung tâm Vi sinh vật Công nghiệp -Viện Công nghiệp Thực phẩm,
3 mẫu rượu sử dụng 4 chủng nấm thuần làm giống khởi động đã được lên men. Sau
10 ngày lên men, dịch lên men được đo độ cồn bằng sôi kế ebulliometer và kết quả
được trình bày trong bảng 3.4. Đồng thời cũng so sánh với độ cồn của dịch lên men
sử dụng 15 mẫu bánh men đã thu thập.
Bảng 3.4. Kết quả đo độ cồn của dịch lên men rượu từ các chủng thuần và 15
mẫu bánh men
STT
Công thức
Mẫu
Độ cồn (%v/v)
47
R. oryzae BMM111
1
S. cerevisiae BMQ467
12,2
R. oyzae BMM131
2
S. cerevisiae BMQ467
12,2
R. oryzae BMM1015
3
S. cerevisiae BMQ467
12,0
R.oryzae BMM111
Chủng thuần khiết
4
S-copsis fibuligera BMQ908
S. cerevisiae BMQ467
12,2
R.oryzae BMM131
S-copsis fibuligera BMQ908
5
S. cerevisiae BMQ467
12,1
R.oryzae BMM1015
S-copsis fibuligera BMQ908
6
S. cerevisiae BMQ467
12,1
MQ1
12,9
1
MQ2
12,9
2
MQ3
12,7
3
MQ4
13,1
4
MQ5
12,9
5
MQ6
12,7
6
MQ7
12,3
7
Bánh men
MQ8
12,7
8
truyền thống
MQ9
10,8
9
MQ10
12,5
10
MQ11
13,1
11
MQ12
12,5
12
MQ13
11,9
13
MQ14
12,7
14
MQ15
11,7
15
Từ kết quả bảng 3.4 cho thấy độ cồn của các mẫu dịch lên men chỉ sử dụng
chủng thuần cho độ cồn khá cao và đồng đều, từ 12 -12,2 (%v/v), so sánh với các
mẫu dịch lên men khi sử dụng 15 mẫu bánh men đã thu thập thì cho độ cồn tương
đương. Số liệu này cho thấy rằng, trong sản xuất rượu, thay vì bổ sung bánh men, nhà
sản xuất chỉ cần bổ sung một chủng nấm mốc Rhizopus oryzae đóng vai trò quan
48
trọng trong quá trình đường hóa và một chủng nấm men đóng vai trò quan trọng trong
quá trình lên men cồn thì độ cồn của dịch lên men thu được tương đương với các mẫu
sử dụng bánh men truyền thống.
3.8.Phân nhóm mẫu rượu dựa trên kết quả các hợp chất bay hơi trong các mẫu
rượu thu thập và các mẫu sử dụng chủng thuần.
Sau khi đo độ cồn của dịch lên men mà ban đầu sử dụng chủng thuần như là
nguồn giống khởi động, tuy cho độ cồn cao tương đương với các mẫu sử dụng bánh
men truyền thống nhưng liệu rằng các mẫu rượu này có hương vị như thế nào, có
giống với các mẫu rượu truyền thống không, thí nghiệm phân tích hương rượu bằng
sắc kí khí kết nối với khối phổ đã được được thực hiện để minh chứng điều đó.
Các mẫu rượu được đo độ cồn bằng cồn kế, sau đó được pha loãng về 12% độ
cồn với nước deion để phân tích các hợp chất bay hơi trong rượu bằng phương pháp
sắc kí khí kết nối khối phổ (GCMS). Từ sắc kí đồ, dựa vào diện tích peak của chất
nội chuẩn với nồng độ nhất định (5ppm hay 4.04 µg/L) để tính nồng độ tương đối
cho các peak khác. Bảng 3.6 dưới đây cho thấy các nhóm hợp chất xuất hiện trong
các mẫu rượu chạy phân tích GCMS. Tổng cộng có 115 hợp chất bay hơi phân tích
được chủ yếu được xếp vào 8 nhóm chính: alcohol (30 chất), acid (23 chất), ester (24
chất), aldehyde (8 chất), furan (2 chất), phenol (4 chất), hydrocarbon (11 chất), ketone
(5 chất), các hợp chất khác (8 chất). Các nhóm hợp chất esters, alcohols, acids cũng
là các nhóm chất xuất hiện chủ yếu trong các mẫu rượu truyền thống Cambodia [18],
Trung Quốc [29] [27], Thái Lan [16].
Các hợp chất khác nhau có tần xuất xuất hiện và tỷ lệ khác nhau ở các mẫu
khác nhau. Tuy nhiên có một số các hợp chất điển hình ở các mẫu rượu truyền thống
đáng kể tới như với nhóm acid có 4 hợp chất điển hình là Acetic acid; n-Decanoic
49
acid; Octanoic acid; Pentanoic acid, 2-hydrox.
Bảng 3.5. Các nhóm hợp chất xuất hiện trong các mẫu rượu
Với nhóm alcohol có 4 hợp chất điển hình là 1,6,10-Dodecatrien-3-ol;1-
Butanol,3-methyl-; 1-Propanol, 2-methyl-; Phenylethyl Alcohol;
Với nhóm ester có số hợp chất điển hình nhiều nhất (9 hợp chất) đó là Acetic
acid, 2-phenylethyl; Butanedioic acid, diethyl; Decanoic acid, ethyl ester;
Dodecanoic acid, ethyl ester; Ethyl(s)-(-)-lactate; Ethyl Acetate; Hexadecanoic acid,
ethyl ester; Octanoic acid, ethyl ester; Tetradecanoic acid, ethyl ester; Chỉ một hợp
50
chất Furan điển hình là Furfural và một hợp chất khá là Silane, triethylfluoro-.
Hình 3.6. Các nhóm rượu khác nhau từ 32 mẫu rượu
Ký hiệu: C1-C13: nhóm 1-13
RQ: rượu quê/ RNM: rượu nhà máy Mỗi mẫu lặp lại 2 lần, thông tin cụ thể về mẫu ghi trong phụ lục S6. Chữ số thứ nhât ghi trong dấu ngoặc thể hiện mã kí hiệu mẫu theo file GCMS COM/LAB, chữ số thứ hai sau dấu phẩy là lần chạy mẫu 1 hoặc 2.
Từ 26 mẫu rượu thu thập (21 mẫu rượu quê, 3 mẫu rượu nhà máy, 2 mẫu rượu
màu) và 6 mẫu rượu sử dụng chủng thuần của Trung tâm Vi sinh vật Công nghiệp
51
sau khi phân tích và so sánh bằng thuật toán phân nhóm theo thứ bậc (agglomerative
hierarchical clustering) của phần mềm thống kê ORANGE chúng được chia thành 12
nhóm, được mô tả ở hình 3.5. Mỗi mẫu được lặp lại 2 lần.
Nhóm 1: mẫu rượu trắng nhà máy Vodka.
Nhóm 2: gồm 2 mẫu rượu màu là rượu Táo mèo và rượu Táo mèo- Đông trùng
hạ thảo.
Nhóm 3 và 4: mẫu rượu trắng nhà máy ở Tây Ninh
Nhóm 5 và 6: gồm 6 mẫu rượu trắng sử dụng các chủng thuần của TTVSVCN-
Viện CNTP.
Nhóm 7: rượu quê Lạc Đạo- Hưng Yên
Nhóm 8: rượu quê làng Vân-Bắc Giang
Nhóm 9: gồm 4 mẫu rượu quê Hương Sơn-Hà Tĩnh
Nhóm 10: gồm 2 mẫu Kim Sơn-Ninh Bình, 2 mẫu Gia Viễn-Ninh Bình, 1 mẫu
Xuân Trường-Nam Định, 1 mẫu Hải Hậu-Nam Định, 1 mẫu Bình Định.
Nhóm 11: gồm 3 mẫu là 2 mẫu Hiệp Hòa-Bắc Giang, 1 mẫu Yên Sơn-Tuyên
Quang.
Nhóm 12: gồm 2 mẫu Ý Yên-Nam Định, 1 mẫu Khoái Châu-Hưng Yên, 1 mẫu
Tân Độ-Phú Xuyên.
Như vậy, các nhóm rượu được chia khá rõ ràng như mẫu rượu nhà máy Vodka,
rượu nhà máy Tây Ninh, rượu màu Táo mèo được chia làm 3 nhóm riêng biệt và khác
xa so với rượu truyền thống (rượu quê). Với nhóm rượu sử dụng các chủng thuần
gồm 2 nhóm nhỏ (nhóm 5 và 6) cạnh nhau thì gần với nhóm rượu truyền thống hơn.
Bên cạnh đó, 26 mẫu rượu quê thì chúng lại được chia thành 6 nhóm nhỏ, khá đặc
trưng cho vùng địa lý. Vì vậy có thể thấy rằng, sản phẩm rượu của Việt Nam khá đa
dạng, có hương khác biệt và đặc trưng cho các loại rượu. Nhóm rượu sử dụng chủng
thuần tuy có sự khác biệt nhưng gần với rượu truyền thống, vậy các chủng thuần đã
52
sử dụng là những chủng có tiềm năng về công nghệ.
KẾT LUẬN
1. Đã phân lập được 101 chủng vi nấm từ 15 mẫu bánh men khác nhau thu
thập trên địa bàn Hà Nội và các tỉnh Hải Dương, Ninh Bình, Nam Định, Quảng Nam,
Đà Nẵng, Vĩnh Phúc, Lạng Sơn, Hòa Bình, Bắc Cạn.
2. Dựa trên các đặc điểm hình thái, phổ fingerprinting, phân tích trình tự rDNA
xác định 73 chủng nấm mốc chủ yếu thuộc họ Mucoraceae là Rhizopus oryzae chiếm
27 chủng và tiếp theo là Rhizopus microsporus (26 chủng), Mucor indicus (11 chủng),
Mucor circinelloides (3 chủng), Lichtheimia ramosa (3 chủng), Cunninghamella
echinulata (2 chủng), Cunninghamella bertholletiae (1 chủng). Trong số 16 chủng
nấm men phân lập được thì chủ yếu các chủng thuộc loài S.cerevisiae (14 chủng),
Wickerhamomyces anomalus (2 chủng). Còn giả men Saccharomycopsis fibuligera
(12 chủng).
3. Nhóm R.oryzae thuộc họ Mucoraceae là nhóm có hoạt lực amylase cao nhất
trong tất cả các nhóm.
4. Hầu hết các chủng nấm mốc thuộc họ Mucoraceae đều thủy phân tinh bột
tốt ở 30°C, 35°C, mọc chậm ở 40°C, dường như không mọc ở 45°C và 50°C ngoại
trừ các chủng R.microsporus có khả năng chịu được nhiệt cao ở 45°C, 50°C.
5. Trong 48 giờ trong môi trường có tinh bột hay có cả tinh bột và đường thì
nhóm loài thuộc chi Mucor như Mucor indicus hay Mucor circinelloides dường như
không đóng vai trò thủy phân tinh bột, bên cạnh đó nhóm Rhizopus microsporus và
Rhizopus oryzae thủy phân tinh bột ngay cả trong môi trường đường, trong đó nhóm
Rhizopus oryzae thủy phân nhanh hơn Rhizopus microsporus.
6. Đã phân tích 26 mẫu rượu thu thập và 6 mẫu lên men bằng chủng thuần
khiết và kết quả cho độ cồn và phổ hương sản phẩm rượu từ chủng thuần khiết có độ
cồn cao, hương vị riêng nhưng có sự tương đồng với mẫu truyền thống. Như vậy, các
53
chủng R.oryzae đóng vai trò quan trọng trong lên men rượu truyền thống Việt Nam.
KIẾN NGHỊ
1. Nghiên cứu sâu hơn về quá trình thủy phân tinh bột bởi các chủng nấm mốc
Mucoraceae bằng kỹ thuật sinh học phân tử
2. Xây dựng thêm cơ sở dữ liệu bằng việc bổ sung số lượng mẫu rượu thu thập
và kết quả phân tích.
54
3. Phát triển kết hợp phân tích cảm quan và phân tích GC
TÀI LIỆU THAM KHẢO
Tiếng Việt
1. Đinh Đức Hiền (2014), Nghiên cứu phân loại nấm men Moniliella phân lập
tại Việt Nam, Luận văn Thạc sĩ khoa học, Viện Công nghiệp Thực phẩm.
2. Nguyễn Lê Hoàng (2010), Bài tiểu luận enzyme amylase, Trường Đại học
Kỹ thuật Công nghệ thành phố Hồ Chí Minh.
3. Nguyễn Thị Thảo (2018), Nghiên cứu quy trình sản xuất rượu đặc sản từ
hạt tam giác mạch Hà Giang, Khóa luận tốt nghiệp Đại học, Trường Đại
học khoa học Tự nhiên- ĐHQGHN.
Tiếng Anh
4. Amatayakul T., Somsap N., and Rotsatchakul P. (2012), “Study of volatile
compounds in Thai rice Wine (Sato) produced from wheat”, KKU Res J,
17(6), pp.939–949.
5. De Oliveira A.P.A., Silvestre M.A., Garcia N.F.L. và cộng sự. (2016),
“Production and catalytic properties of amylases from Lichtheimia ramosa
and Thermoascus aurantiacus by solid-state fermentation”, Sci World J,
pp.301-313.
6. Dolatabadi S., de Hoog G.S., Meis J.F. và cộng sự (2014),“Species
boundaries and nomenclature of Rhizopus arrhizus (syn. R. oryzae)”,
Mycoses, 57(3), pp.108–127.
7. Dolatabadi S., Scherlach K., Figge M. và cộng sự. (2016), “Food
preparation with mucoralean fungi: A potential biosafety issue?”, Fungal
Biol, 120(3), pp.393–401.
8. Dung N.T.P., Rombouts F.M., and Nout M.J.R. (2006), “Functionality of
selected strains of moulds and yeasts from Vietnamese rice wine starters”,
Food Microbiol, 23(4), pp.331–340.
9. Dung N.T.P., Rombouts F.M., và Nout M.J.R. (2005), “Development of
defined mixed-culture fungal fermentation starter granulate for controlled
55
production of rice wine”, Innov Food Sci Emerg Technol, 6(4), pp.429–
441.
10. Dung N.T.P., Rombouts F.M., và Nout M.J.R. (2007), “Characteristics of
some traditional Vietnamese starch-based rice wine fermentation starters
(men)”, LWT - Food Sci Technol, 40(1), pp.130–135.
11. Huang Z.R., Guo W.L., Zhou W. Bin (2019), “Microbial communities and
volatile metabolites in different traditional fermentation starters used for
Hong Qu glutinous rice wine”, Food Res Int, 121, pp.593–603.
12. Hussain S.Z. and Maqbool K. (2014), “GC-MS: Principle, Technique and
its application in Food Science”, Int J Curr Sci, 13, pp.116–126.
13. Jung H., Lee S.J., Lim J.H. (2014), “Chemical and sensory profiles of
makgeolli, Korean commercial rice wine, from descriptive, chemical, and
volatile compound analyses”, Food Chem, 152, pp.624–632.
14. Keikhosro K., Zamani Akram J.,(2013), “Mucor indicus: Biology and
industrial application perspectives: A review”, Biotechnology Advances,
31, pp.466–481.
15. Kirk PM, Cannon PF, Minter DW, Stalpers JA (2008). Dictionary of the
Fungi (10th ed.). Wallingford
16. Kurtzman C.P., Vesonder R.F., và Smiley M.J. (1973), “Formation of
extracellular C14-C182 D hydroxy
fatty acids by species of
Saccharomycopsis”, J Appl Microbiol, 26(4), pp.650–652.
17. Li Y.N., Shi G.Y., Wang W. và cộng sự. (2010), “A newly isolated
Rhizopus microsporus var. chinensis capable of secreting amyloytic
enzymes with raw-starch-digesting activity”, J Microbiol Biotechnol,
20(2), pp.383–390.
18. Ly S., Mith H., Tarayre C. (2018), “Impact of microbial composition of
Cambodian traditional dried starters (dombea) on flavor compounds of rice
56
wine: Combining amplicon sequencing with HP-SPME-GCMS”, Front
Microbiol, 9, pp.1–15.
19. Miller G.L.
(1959),“Use of Dinitrosalicylic Acid Reagent
for
Determination of Reducing Sugar”, Anal Chem, 31(3), pp.426–428.
20. Peixoto-Nogueira S.C., Sandrim V.C., Guimarães L.H.S. và cộng
sự.(2008), “Evidence of thermostable amylolytic activity from Rhizopus
microsporus var. rhizopodiformis using wheat bran and corncob as
alternative carbon source”, Bioprocess Biosyst Eng, 31(4), pp.329–334.
21. Restek (2002),“Analyzing Alcoholic Beverages by Gas Chromatography”,
Appl Note, 3, pp.16-18.
22. Tiwari S., Srivasta and R., Singh C. (2015), “Amylases: an Overview With
Special Reference To Alpha Amylase”, Journal of Global Biosciences, 4,
pp. 1886-1901.
23. Thanh V.N., Mai L.T., and Tuan D.A. (2008), “Microbial diversity of
traditional Vietnamese alcohol fermentation starters (banh men) as
determined by PCR-mediated DGGE”, Int J Food Microbiol, 128(2),
pp.268–273.
24. Thanh V.N., Thu Huong N.T., and Quynh Anh N.T. (2005), “Conservation
of the biodiversity of Vietnam traditional alcohol fermentation starters”,
MSA Golden Jubilee International Science Congress (ISC), pp.3–6.
25. Thanh V.N., Thuy N.T., Chi N.T. và cộng sự. (2016), “New insight into
microbial diversity and functions in traditional Vietnamese alcoholic
fermentation”, Int J Food Microbiol, 232, pp.15–21.
26. Walther G., Pawłowska J., Alastruey-Izquierdo A. (2013), “DNA
barcoding in Mucorales: An inventory of biodiversity”, Persoonia Mol
Phylogeny Evol Fungi, 30, pp.11–47.
57
27. Wang P., Mao J., Meng X. và cộng sự. (2014), “Changes in flavour
characteristics and bacterial diversity during the traditional fermentation of
Chinese rice wines from Shaoxing region”, Food Control, 44, pp.58–63.
28. Wiśniewska P., Śliwińska M., Dymerski T. và cộng sự. (2015),
“Application of Gas Chromatography to Analysis of Spirit-Based
Alcoholic Beverages”, Crit Rev Anal Chem, 45(3), pp.201–225.
29. Xu E., Long J., Wu Z. (2015), “Characterization of Volatile Flavor
Compounds in Chinese Rice Wine Fermented from Enzymatic Extruded
Rice”, J Food Sci, 80(7), pp.1476–1489.
30. Yang S., Choi S.J., Kwak J. và cộng sự. (2013), “Aspergillus oryzae strains
isolated from traditional Korean Nuruk: Fermentation properties and
influence on rice wine quality”, Food Sci Biotechnol, 22(2), pp.425–432.
58
PHỤ LỤC
S1. Danh sách các mẫu bánh men đã thu thập
Mã ký
Thời gian
STT
Bánh men
Địa chỉ
Dạng men
hiệu
thu thập
Men Kim Sơn,
Nhà bác Trần Văn Hải, xóm 5, xã Quang
Bánh men trắng
MQ1
1
1/5/2018
Ninh Bình
Thiện, huyện Kim Sơn, tỉnh Ninh bình
đục, đk 5 cm
Men Tuyên
Nhà Ông Hòa, thôn Làng Hản, xã Kim
Bánh men tròn,
MQ2
2
17/6/2018
Quang
Quan, huyện Yên Sơn, tỉnh Tuyên Quang
màu tối, đk 5 cm
Men thuốc bắc,
Quán men rượu Ngọc Minh, 42 Quán
Bánh men trắng
MQ3
3
10/6/2018
Quán Gánh
Gánh
ngà, đk 4.5 cm
CS sx men rượu Đức Ngọ, Thôn Tam
Men viên, màu
4
MQ4
Men Đức Ngọ
10/6/2016
Đồng, xã Thái Thụy, TP. Thái Bình
trắng, đk 3 cm
Nhà Chú Đinh Văn Riễn, xóm 12, xã Hải
Men viên trắng,
5
MQ5
Men Nam Định
20/5/2018
Tây, huyện Hải Hậu, tỉnh Nam Định
đk 3 cm
Nhà Anh Phạm Văn Hậu, Làng vọc, xã
Men dạng viên,
6
MQ6
Men Hà Nam
12/6/2018
Vũ Bản, Huyện Bình Lục, tỉnh Hà Nam
đk 4 cm
Bánh men trắng
Nhà Cô Đặng Thị Xuyến, Thôn Tân Độ,
7
MQ7
Men Tân Độ
vàng, dày, đk 8
22/7/2018
xã Hồng Minh, huyện Phú Xuyên, Hà Nội
cm
Nhà Chú Sông Láng, thôn Trình Viên, xã
Men bánh, hơi
8
MQ8
Men Sông Láng
22/7/2018
Phú Túc, huyện Phú Xuyên, Hà Nội
vàng, đk 6 cm
Men Bánh, màu
Nhà Bác Nguyễn Thị Sáu, thôn Ngọc, xã
9
MQ9
Men Hưng Yên
vàng cám, đk 8.5
22/7/2018
Lạc Đạo, huyện Văn Lâm, tỉnh Hưng Yên
cm
CS Hồng Thắm; 19/27 Giải Phóng, Tổ 6,
Men viên, trắng,
10
MQ10 Men Đức Hùng
Khối 7, Phường Tân Lợi, TP. Buôn Ma
6/5/2018
đk 3cm
Thuột, Tỉnh Đắk Lắk
Cơ sở chế biến men Trung Tiến, thôn
Dạng bột
Men Trung Tiến
11
MQ11
Tam Đông, xã Thụy Hải, huyện Thái
(Túi nhỏ 100
15/7/2018
(Hương Nếp)
Thụy, Thái Bình
gram)
Bánh to, dẹt,
Gia đình Bác Thóc, xóm 14 Xuân Kiên,
12
MQ12
Men Kiên Lao
đường kính 11
5/8/2018
Xuân Trường, Nam Định
cm
Men Bá Dương
Bánh to, trắng
Nhà Bác Canh Giới, làng Bá Dương Nội,
13
MQ13
Nội, Đan
ngà, đường kính
5/8/2018
xã Hồng Hà, huyện Đan Phượng, Hà Nội
Phượng
8 cm
CS men Trường Nguyên. 155/21 Mai Hắc
Dạng bột (gói
14
MQ14 Men Hương Lúa
-
Đế - TP. Buôn Mê Thuột
nhỏ 100g)
15
MQ15 Men Bắc Giang
Bánh tròn, nhỏ
-
-
59
S2. Thông tin các mẫu rượu Lab
Thí
Mã số
Miêu tả tóm tắt
nghiệm
S. cerevisiae BMQ 467, Rhizopus oryzae BMM 111.
LAB1
EXP1
Gạo nếp cái hoa vàng, lên men 10 ngày
S. cerevisiae BMQ 467, Rhizopus arrhizus BMM 131.
LAB2
EXP2
Gạo nếp cái hoa vàng, lên men 10 ngày
S. cerevisiae BMQ 467, Rhizopus arrhizus BMM 1015.
LAB3
EXP3
Gạo nếp cái hoa vàng, lên men 10 ngày
S. cerevisiae BMQ 467, Saccharomycopsis fibulugera BMQ 908,
Rhizopus oryzae BMM 111.
LAB4
EXP4
Gạo nếp cái hoa vàng, lên men 10 ngày
S. cerevisiae BMQ 467, Saccharomycopsis fibulugera BMQ 908,
Rhizopus arrhizus BMM 131.
LAB5
EXP5
Gạo nếp cái hoa vàng, lên men 10 ngày
S. cerevisiae BMQ 467, Saccharomycopsis fibulugera BMQ 908,
Rhizopus arrhizus BMM 1015.
LAB6
EXP6
Gạo nếp cái hoa vàng, lên men 10 ngày
S3. Danh sách các chủng đọc trình tự 10/2018
>MQF4.2
ITS4 VT2503
TAGTTAAAGAGCATTAAAATATCTGCTGGCTGGCAGAACCCCTAGATTAAATGTTTTTTGGTTGGACCAAAAAAGCACGAT
GGCTAGGTAGTTCGTAATTTAATGAAAATTACAAAGAGGCTGTATTTTAGACAATCGGTATAATAATTAAATCTAACCGAA
TTTGTCCATCACCACATAAAATAAATTTTATGTGTGGGTTGGTTATGATACTGAAGCAAGCGTACTCTATAGAAGATCCAT
AGAGTGCAAGCTGCGTTCAAAGACTCGATGATTCACGAATATGCAATTCACACTAGTTATCGCACTTTGCTACGTTCTTCA
TCGATGCGAGAACCAAGAGATCCATTGTTAAAAGTTGTTATTATATTATACTTTCAATTCTGAATTCATGGTATATGGTAA
AGGGTACCAGGCGCCTTCCTTCCCAAAGGAAGAAAGGTAATCCTGATTGGCATCGATCAAACCCCAGAACAGGCCTACCCA
TTATAGCCTATATGTCCTGAGTCTCTCCCGAAGGTCAGTTACGACCTTCATCGCCAGAGGTTCACAGTATAGAAGCAAACA
ATACTGAGAAGTAAATCCCAGTAAAGTGCCAATACATTAGTTAATGATCCTTCCGCAGGTTCACCTACGGAAACCTTGTTA
CGACTTTTACTTC
Rhizopus microsporus
Sequence ID: AB381937.1
Identities 661/661(100%)
>MQF5.3
ITS4 VT2504
GACTTCAGATCATAGTTAAAGATCATTAAAATATCTGCTGGCTAGCAGAACCCCTAGATTATATGTTTTTTGGTTGGACCA
AAAAAGCACGATGGCTAGGTAGTTCGTAATTTAATGAAAATTACAAAGAGGCTGTATTTTAGACAATCGGTATAATAATTA
AATTTAACCGAGCTTGTCCATCACCACATAAAATAAATTTTATGTGTGGGTTGGTTATGATACTGAAGCAAGCGTACTCTA
TAGAAGATCCATAGAGTGCAAGCTGCGTTCAAAGACTCGATGATTCACGAATATGCAATTCACACTAGTTATCGCACTTTG
CTACGTTCTTCATCGATGCGAGAACCAAGAGATCCATTGTTAAAAGTTGTTATTATATTATACTTTCAATTCTGAATTCAT
60
GGTATATGGTAAAGGGTACCAGGCACCTTCCTTCCCAAAGGAAGAAAGGTAATCCTGATTGGCATCGATCAAACCCCAGAA
CAGGCCTACCCATTATAGCCTATATGTCCTGAGTCTCTCCCGAAGGTCAGTTACGACCTTCATCGCCAGAGGTTCACAGTA
TAGAAGCAAACAATACTGAGAAGTAAATCCCAGTAAAGTGCCAATACATTAGTTAATGATCCTTCCGCAGGTTCACCTACG
GAAACCTTGTTACGACTTTTACTTCC
Rhizopus microsporus
Sequence ID: KF800237.1
Identities: 674/674(100%)
>MQF12.1
ITS4 VT2505
AGATCAAGTTTAAAAAGTTATTTGGGAGGCCCAAAAAGCGGACATCAACATGCTTTACCTTTTCAAAATTAAAAAAGTATC
GGCACTCAATCCACGATATGGCCTGACTTTATTTAAAATGTCTCAACTTGTAAGGTTGCTACACTCATATCTATTCAAAAA
AAGAATTTTGAATAAGGGTTGTTTTTGATACTGAAACAGGCGTACTCAATGGAATACCATTGAGTGCAAGATGCGTTCAAA
GACTCGATGATTCACTGAATATGCAATTCACACTAGTTATCGCACTTTGCTACGTTCTTCATCGATGCGAGAACCAAGAGA
TCCATTGTTAAAAGTTGTTTTATAGATTTTTTAGGTCTATGTTACAATATTTTAAACTGAATTCTTTTGGTAAGTAATAAT
CGGGTACCAAGCATCAAGCTTGACTATGACTAGGTTAACATTCCATAGGCCTACCCTTATAGCCTAAAGACATCCCCTTAT
ACGTCATAAATAAAAACAGTTCACAGTAAATAAGATAATTATTGAATTATCAGATTATTTAATGATCCTTCCGCAGGTTCA
CCTACGGAAACCTTGTTACGACTTTTACTTCCT
Mucor indicus
Sequence ID: KP132475.1
Identities: 586/586(100%)
>MQF2.4
ITS4 VT2506
GACTTCAGATCATAGTTTGAAAGTTGCTGGATTATACTCTTGTACTTTACTTCCTGGGCGAACCAAAGAAAAAGATCCTGA
GACCAGCGTAATATTCCTGCCTAGCAAGCCAGACAGAAAATCACACACATTTTAGGTGCTCACTGTAATAAAACAGCGATG
CGACCCATTACCACATAAACAAATGTTATGTGTGGGTTTGTGATGATACTGAAGCAGGCGTACTCTATAGAAAAACCATAG
AGTGCAAGCTGCGTTCAAAGACTCGATGATTCACTGAATATGCAATTCACACTAGTTATCGCACTTTGCTACGTTCTTCAT
CGATGCGAGAACCAAGAGATCCATTGTTAAAAGTTGTTTTTTATTAAACTTTATAATACTGAATTTCTAGGTTTATTATGA
AGGGTGCTCCTGAAACCAGGAGTGGCATCGATCAAACCCCAGATAGGTCTACCCATGACCAGTCTGAGTCTCTCAGCCAAA
TTTTCACAGTGTAGAAGCAATCACTTACCCCAGAGGAAACCCTAAGGTAAGGCGCTTTAACATAATTAATGATCCTTCCGC
AGGTTCACCTACGGAAACCTTGTTACGACTTTTACTTCCTCT
Rhizopus oryzae
Sequence ID: MG669195.1
Identities: 609/611(99,67%)
>MQF2.5
ITS4 VT2507
TCATAGTTTGAAAGTTACTGGATTATACTCTTGTACTTTACTTCCTGGGCGAACCAAAAAAAAAGATCCTGAGACCAGCGT
AATATTCCTGCCTAGCAAGCCAGACAGAAAATCACACACATTTTAGGTGCTCACTGTAATAAAACAGCGATGCGACCCATC
ACCACATAAACAAATGTTATGTGTGGGTTTGTGATGATACTGAAGCAGGCGTACTCTATAGAAAAACCATAGAGTGCAAGC
61
TGCGTTCAAAGACTCGATGATTCACTGAATATGCAATTCACACTAGTTATCGCACTTTGCTACGTTCTTCATCGATGCGAG
AACCAAGAGATCCATTGTTAAAAGTTGTTTTTTATTAAACTTTATAATACTGAATTTCTAGGTTTATTATGAAGGGTACTC
CTGAAACCAGGAGTGGCATCGATCAAACCCCAGATAGGTCTACCCATGACCAGTCTGAGTCTCTCAGCCAAATTTTCACAG
TGTAGAAGCAATCACTTACCCCAGAGGAAACCCTAAGGTAAGGCGCTTTAACATAATTAATGATCCTTCCGCAGGTTCACC
TACGGAAACCTTGTTACGACTTTTACTTCCTCTA
Rhizopus oryzae
Sequence ID: MG669209.1
Identities: 601/601(100%)
>MQF1.3
ITS4 VT2508
ACTTCAGATCATAGTTTGAAAGTTGCTGGATTATACTCTTGTACTTTACTTCCTGGGCGAACCAAAGAAAAAGATCCTGAG
ACCAGCGTAATATTCCTGCCTAGCAAGCCAGACAGAAAATCACACACATTTTAGGTGCTCACTGTAATAAAACAGCGATGC
GACCCATTACCACATAAACAAATGTTATGTGTGGGTTTGTGATGATACTGAAGCAGGCGTACTCTATAGAAAAACCATAGA
GTGCAAGCTGCGTTCAAAGACTCGATGATTCACTGAATATGCAATTCACACTAGTTATCGCACTTTGCTACGTTCTTCATC
GATGCGAGAACCAAGAGATCCATTGTTAAAAGTTGTTTTTTATTAAACTTTATAATACTGAATTTCTAGGTTTATTATGAA
GGGTGCTCCTGAAACCAGGAGTGGCATCGATCAAACCCCAGATAGGTCTACCCATGACCAGTCTGAGTCTCTCAGCCAAAT
TTTCACAGTGTAGAAGCAATCACTTACCCCAGAGGAAACCCTAAGAGGTAAGGCGCTTTAACATAATTAATGATCCTTCCG
CAGGTTCACCTACGGAAACCTTGTTACGACTTTTACTTCCTC
Rhizopus oryzae
Sequence ID: MH864361.1
Identities: 609/609(100%)
>MQF10.5
ITS4 VT2509
CAGATCATAGTTTGAAAGTTACTGGATTATACTCTTGTACTTTACTTCCTGGGCGAACCAAAAAAAAAGATCCTGAGACCA
GCGTAATATTCCTGCCTAGCAAGCCAGACAGAAAATCACACACATTTTAGGTGCTCACTGTAATAAAACAGCGATGCGACC
CATCACCACATAAACAAATGTTATGTGTGGGTTTGTGATGATACTGAAGCAGGCGTACTCTATAGAAAAACCATAGAGTGC
AAGCTGCGTTCAAAGACTCGATGATTCACTGAATATGCAATTCACACTAGTTATCGCACTTTGCTACGTTCTTCATCGATG
CGAGAACCAAGAGATCCATTGTTAAAAGTTGTTTTTTATTAAACTTTATAATACTGAATTTCTAGGTTTATTATGAAGGGT
ACTCCTGAAACCAGGAGTGGCATCGATCAAACCCCAGATAGGTCTACCCATGACCAGTCTGAGTCTCTCAGCCAAATTTTC
ACAGTGTAGAAGCAATCACTTACCCCAGAGGAAACCCTAAGGTAAGGCGCTTTAACATAATTAATGATCCTTCCGCAGGTT CACCTACGGAAACCTTGTTACGACTTTTACTTCCTCT
Rhizopus oryzae
Sequence ID: KT899481.1
Identities: 604/604(100%)
>MQF9.4
ITS4 VT2510
AGATGTGAGTTTGTTTAAGAGAAGACCCAAGTTAGATCCTCTCGCTAGTCCGTAAAGATTAAGACCTAGTTCAAGAAGAGA
CTGATTGACTTGGAATTATGAACTCACTAACCAAGTCGTTGCTCCTCAGGCACTCTAGAGTCTACATCCGGCAAATGACTA
62
AAGCCAATTGCCTAGGACTAAATGTATTTAAGGCCATGACAGCAACTGAATGCCATCAACACAAGCCCATTTCCAGCTCGC
TTAGGTTCAAAGAACCAAGTTGAACTGATTGGTAGTTGCAGATACTGAAACAACTGTGCCTAGTAGATTGACTACTAGGCG
CAAGATGCGTTCGAGAACTCGATGATTCGCTATGAATGCAAGTCGCAATAATTATCGCACTTTGCTACGCTCTTCATCGAT
GCGAGAACCAAGAGATCCATTGCCAAGAGTTGTTTTTAAGTTAACAACTAACTTTTTCGTACATCATGGTTTACACGAGAA
GAATAAACACCTTTGGGGATAGTTAGTACTAGAGCCCCAAAGGCTTGCCTTGCTTGCTTTGACTCGAGACATAGGTCTCCT
GAAAGAAGGGTCCATACGTCTCTTTTCAAGCAGCCTAGATCTTAGTAGTGGCACAAGTCTCCTAAAAGGAGGGTCTCTATG
CCAACAACCAGATCTACAGCACAAGGCAGAGCCAACCAAGTTGACCCGACTTTGCACAAAACTGTGAGGAACTACTAGAGG
GGAAGAGACCCCCAACTAGTGGTTTTTTAGACCTCTCAGTAATGATCCTTCCGCAGGTTCACCTACGGAAACCTTGTTACG
ACTTTTACTTCC
Lichtheimia ramose
Sequence ID: KY828893.1
Identities: 817/820(99%)
>MQF2.2
ITS4 VT2511
ATTTAAAAAAAGTATTATTTGGGAGGCCCCAGCACAGTTTACCGCAAGAGCTTCTCTTTATATTAAAAAAAAGTTCAGGCA
TTCAAACAAGATCAGGCCTTTGTACATTTCAAGAGGTTCGAGATCAGAATAGATCAAGAGACTCTCAGTATTCCTATTCAA
CAAAATGTTGGATAGAGGGTTTGTTTTGATACTGAAACAGGCGTGCTCATTGGAATACCAATGAGCGCAAGTTGCGTTCAA
AGACTCGATGATTCACTGAATATGCAATTCACACTAGTTATCGCACTTTGCTACGTTCTTCATCGATGCGAGAACCAAGAG
ATCCGTTGTTAAAAGTTGTTTTATAGATTTTTTAGGTCTATGTTACAATATTAATTCTGAATTCTTTTGGTAAATAATAAT
AGGATACCAAGCCTAAGCTTGATTATGACTCGGTTAGCATCTCCACCGCCTATCCTTATAGCAGTGGAGCATCCCTCAAGC
GTCAAGTAATAATACATTTCACAGTAAATAGATAATAATGGACAAGCCAAAATTATTGATTATTTAATGATCCTTCCGCAG GTTCACCTACGGAAACCTTGTTACGACTTTTACTTCC
Mucor circinelloides
Sequence ID: KT336541.1
Identities: 602/604(99.69%)
>MQF8.4
ITS4 VT2512
TTTCAGATCAAGTTTAAAAAGTTATTTGGGAGGCCCAAAAAGCGGACATCAACATGCTTTACCTTTTCAAAATTAAAAAAG
TATCGGCACTCAATCCACGATATGGCCTGACTTTATTTAAAATGTCTCAACTTGTAAGGTTGCTACACTCATATCTATTCA
AAAAAAGAATTTTGAATAAGGGTTGTTTTTGATACTGAAACAGGCGTACTCAATGGAATACCATTGAGTGCAAGATGCGTT
CAAAGACTCGATGATTCACTGAATATGCAATTCACACTAGTTATCGCACTTTGCTACGTTCTTCATCGATGCGAGAACCAA
GAGATCCATTGTTAAAAGTTGTTTTATAGATTTTTTAGGTCTATGTTACAATATTTTAAACTGAATTCTTTTGGTAAGTAA
TAATCGGGTACCAAGCATCAAGCTTGACTATGACTAGGTTAACATTCCATAGGCCTACCCTTATAGCCTAAAGACATCCCC
TTATACGTCATAAATAAAAACAGTTCACAGTAAATAAGATAATTATTGAATTATCAGATTATTTAATGATCCTTCCGCAGG
TTCACCTACGGAAACCTTGTTACGACTTTTACTTCCTCTA
Mucor indicus
Sequence ID: KP132475.1
Identities: 590/590(100%)
63
>MQF10.2
ITS4 VT2513
ATCAAGTTTAAAAAGTTATTTGGGAGGCCCAAAAAGCGGACATCAACATGCTTTACCTTTTCAAAATTAAAAAAGTATCGG
CACTCAATCCACGATATGGCCTGACTTTATTTAAAATGTCTCAACTTGTAAGGTTGCTACACTCATATCTATTCAAAAAAA
GAATTTTGAATAAGGGTTGTTTTTGATACTGAAACAGGCGTACTCAATGGAATACCATTGAGTGCAAGATGCGTTCAAAGA
CTCGATGATTCACTGAATATGCAATTCACACTAGTTATCGCACTTTGCTACGTTCTTCATCGATGCGAGAACCAAGAGATC
CATTGTTAAAAGTTGTTTTATAGATTTTTTAGGTCTATGTTACAATATTTTAAACTGAATTCTTTTGGTAAGTAATAATCG
GGTACCAAGCATCAAGCTTGACTATGACTAGGTTAACATTCCATAGGCCTACCCTTATAGCCTAAAGACATCCCCTTATAC
GTCATAAATAAAAACAGTTCACAGTAAATAAGATAATTATTGAATTATCAGATTATTTAATGATCCTTCCGCAGGTTCACC
TACGGAAACCTTGTTACGACTTTTACTTCCTCTA
Mucor indicus
Sequence ID: MH855050.1
Identities: 573/573(100%)
>MQF8.6
ITS4 VT2515
CCAAAAAAATGGAAAAGTGGGCAAAAGAATTCGTAAAGAACTCTTGAGCTTTTTTTCCCATCAGGAGTCAAAATGATTTAT
AACTCTAGATGTAAAAACATTAAAGCCAATTCTATCATAATTCTTTTTTGCAAAAGGATTAGTCAAGAATTTAACCTTAAC
AGATATTTAAGTCGAGGGTAATCGGGCGTCCCACAGTCGCATCATGTCCTTCAATGAAGAAGGCTGACAAAGGCAAGTTAG
GTTCTTTACTATGCTCCTACCTCCTAGCACCGAGCTTATACCATAAAGATATAAGGGCGGGTAGTGATAGAATTCCGTCAG
GTATAGTCAATAAAGACTATAGCACAGCTTACCCAGGACCATTTATAATTTATCTCTGATCTCATTCTCTATAAAAAAATA
GGATTGAGGGAGATGTTTGAATGGTACTGAAACAGATGTACCCTACGGAATACCATAGGGTGCAAGATGCGTTCAAAGATT
TGATGATTCACTATAGGCAGATCACATTAAATATCGCGATTTGCTGCGTTCTTCATCGATACGAAAGCCGAGAGATCCATT
GCTGAAAGTTGTTTTTATATAAATTAATATATTTTTAAAACAACCATAAATTATGGTCAATCGTTTATTCAGTAAATTTAG
TATAAAAAAATTAATAATATGGTTTTTTAGGCCATATTATAAATAAATAAAGAGTAACCCGAAAGTTAACCCTTTAAAAAA
AAACATTGCGCATGTGGTTTGACCCACATTATGGATGAATTAATGGTGAAAAAGGTTTTTTAAAGCCTTATTCCCCACAAA
TAGTTAATGATCCTTCCGCAGGTTCACCTACGGAAACCTTGTTACGACTT
Cunninghamella echinulata
Sequence ID: JX312541.1
Identities: 843/844 (99.8%)
>MQF 12.2
ITS4 VT2522
TGATTTCAGGCCAAGATTTTAAAAAATATAAGAATGGCTATAAACTTAATAGAAAATAAAAATCTATTAAAGCCGACTAGG
TTTTTACTAGATGCAAGATCTGGTAAAAAAAAGTCGAGCCTTATATTTAGGCCGAGAGTGGTTCTTTTTAATAAAAAAAAA
AAAAGAATCACCAGGACCAGTAATAATTTATCTCTTTTTTTTCTATCATCAAGGATAGAGAGAGATTTATTAGGGGTACTG
AAACAGACGTACCTTATGGAATACCATAAGGGGCAAGATGCGTTCAAAGATTTGATGATTCACTATAGGCAGATCACATTA
CATATCGCGATTTGCTGCGTTCTTCATCGATACGAAAGCCGAGAGATCCATTGCTGAAAGTTGTTTTTTTGTTTAATTATA
ATAAAAAACAACCATAGATTTATGGTCTATCAGTTCAGTAAAATTTAGTATAATAAAAGTAATCTTATCCCCTTTACAAGA
GGTGCCCATCATTAATCTCCCCCCCCCTAAAAAGAGAGAGAAAATAATGAACAACTACCCAAAAATCCCTTGATCTAAGGA
TAAACTCAAGGGGCAGCACTAGACTGAACCAGGCACAAGCGTTAAAAAACATTTCCCACACTGGGGANAAGTTTTTTAAGT CAAAAAAAAATACCCTTTTTCAAACTATTCTTTT
Cunninghamella bertholletiae
64
Sequence ID: JN205875.1
Identities: 673/682 (98.68%)
>MQY4.1 NL4 VT2516
TCCTTGACTTACGTCGCAGTCCTCAGTCCCAGCTGGCAGTATTCCCACAGGCTATAATACTTACCGAGGCAAGCTACATTC
CTATGGATTTATCCTGCCACCAAAACTGATGCTGGCCCAGTGAAATGCGAGATTCCCCTACCCACAAGGAGCAGAGGGCAC
AAAACACCATGTCTGATCAAATGCCCTTCCCTTTCAACAATTTCACGTACTTTTTCACTCTCTTTTCAAAGTTCTTTTCAT
CTTTCCATCACTGTACTTGTTCGCTATCGGTCTCTCGCCAATATTTAGCTTTAGATGGAATTTACCACCCACTTAGAGCTG
CATTCCCAAACAACTCGACTCTTCGAAGGCACTTTACAAAGAACCGCACTCCTCGCCACACGGGATTCTCACCCTCTATGA
CGTCCTGTTCCAAGGAACATAGACAAGGAACGGCCCCAAAGTTGCCCTCTCCAAATTACAACTCGGGCACCGAAGGTACCA
GATTTCAAATTTGAGCTTTTGCCGCTTCACTCGCCGTTACTAAGGCAATCCCGGTTGGTTTCTTTTCCTCCGCTTATTGAT
ATGCTTAAGTTCAGCGGGTACTCCTACCTGATTTGAGGTCAAACTTTAAGAACATTGTTCGCCTAGACGCTCTCTTCTTAT
CGATAACGTTCCAATACGCTCAGTATAAAAAAGATTAGCCGCAGTTGGTAAAACCTAAAACGACCGTACTTGCATTATACC
TCAAGCACGCAGAGAAACCTCTCTTTGGAAAAAAAAACATCCAATGAAAAGGCCAGCAATTTCAAGTTAACTCCAAAGAGT
ATCACTCACTACCAAACAGAATGTTTGAGAAGGAAATGACGCTCAAACAGGCATGCCCCCTGGAATACCAAGGGGCGCAAT
GTGCGTTCAAAGATTCGATGATTCACGGAATTCTGCAATTCACATTACGTATCGCATTTCGCTGCGTTCTTCATCGATGCG
AGAACCAAGAGATCCGTTGTTGAAAGTTTTTAATATTTTAAAATTTCCAGTTACGAAAATTCTTGTTTTTGACAAAAATTT
AATGAATAAATAAAATTGTTTGGGTTTGTTACCTCTGGGCCCCGATTGCTCGAATGCCCAAAGAAAA
Saccharomyces cerevisiae
Sequence ID: EU649672.1
Identities: 1117/1120(99.73%)
>MQY11.3 NL4 VT2517
GTCAAAGACGCAGCCCTCGATCCAGACAGGCAATATCAGCAGAAGCTATAACACTCCACCGAAGTGAAGCCACATTCAACT
ACCATTATCTTGCCATCCGAATCGATGCTGGCCCAGTGAAATACGAGTGCACAACTCAAGAAGAGAAGATAATCGTAAAAC
ACCAAGTCTGATCTAATGCCCTTCCCTTTCAACAATTTCACGTACTTTTTCACTCTCTTTTCAAAGTTCTTTTCATCTTTC
CATCACTGTACTTGTTCGCTATCGGTCTCTCGCCAATATTTAGCTTTAGATGGAATTTACCACCCACTTAGAGCTGCATTC
CCAAACAACTCGACTCTTCGATAGCACCTTACATAGGAATGGGCATCTCATCAGACGGGATTCTCACCCTCTATGACGTCC
TGTTCCAAGGAACATAGACAAGAGCCAAACCCAAGGTTACCATCTTCAAATTACAACTCGAACACCGAAGGTGCTAGATTT
CAAATTTGAGCTTTTGCCGCTTCACTCGCCGTTACTAAGGCAATCCCTGTTGGTTTCTTTTCCTCCGCTTATTGATATGCT
TAAGTTCAGCGGGTAGTCCTACCTGATTTGAGGTCAAACTTTTAGTTTAATTGTTAAGCCGAGCCTAAAATACTATTCATC
TGCCTAGCTGATATAACGAGTTGGAAGAACCTAATACATTATTTCAGAAAGACGTATAAATTAGTACACTCTTGCTAAGAC
ATGATTTCAAGTTAACCCTATTTAACAGAGTATCACTCAATACCAAACCCAAAGGTTTGAGAGAGAAATGACGCTCAAACA
GGCATACCCTCTGGAATACCAGAGGGTGCAATGTGCGTTCAAAGATTCGATGATTCACGAAAATCTGCAATTCACAATA
Wickerhamomyces anomalus
Sequence ID: LC120363
Identities: 866/899 (99.6 %)
>MQS14.1 NL4 VT2518
65
TCCTTGCCGAGCGCAGTCCTCAGTCCCAGCAAGTAGATCTCCCCAAGACTATAACACTCCCCGAAGGAAGCCACATTTCAA
GGGGTACTCTACCGCTAAAACTGATATTGGCCCGGTGAAAAACGAGTGCACAGTCCAAGAAGAACTGATAATCATTAAACA
CCAAGTCTGACCTCAAGCCCTTCCCTTTCAGCAATTTCACGTACTTTTTCACTCTCTCTTCAGAGTTCTTTTCATCTTTCC
ATCACTGTACTTGTTCGCTATCGGTCTCTCGCCAATATTTAGCTTTAGATGGAATTTACCACCCACTTAGAGCTGCATTCC
CAAACAACTCGACTCTTCGATAGAATCCCACAAAGAGTAGTATCCAAAATCATACGGGGTTCTCACCCTCTATGACGTCCT
GTTCCAAGGAACATAGATAAAGGACTACTCAAGGAAACTATCTTCAAATTACAACGCGAACACCGAAGGTGCTAGCTTTCA
AATTTGAGCTTTTGCCGCTTCACTCGCCGTTACTAAGGCAATCCCTGTTGGTTTCTTTTCCTCCGCTTATTGATATGCTTA
AGTTCAGCGGGTATCCTTACCTGATTTGAGGTCAAAATTAATGACAAAGTTATAAGGCCTTGATACACGAGTAAGTCCTTC
GCAAAAGGGTATTTAATAAGTTGGTAGAACCTAATATTAAATCCTTAAGCAAATATATGGAAAACTCAATCAATTGCCAAG
TCATTTCAAAGGAGTTAGCAGAAGCTAACACAACCTTCAATACTAAACCCAAAGGTTTAAGAGAGAAATGACGCTCAAACA
GGCATGCTCTATAGAATACTATAGAGCGCAATATGCGTTCAAAGATTCGATGATTCACGAAAATCTGCAATTCACATTACT
TATCGCAATTCGCTGCGTTCTTCATCGATGCGAGAACCAAGAGATCCGTTGCTGAAAGTTTTAAACTTTTAGTTTGTAAAA
TCGACTAGTTGTAATTAAAAAAATACATTTCTCTTAAAAAGAGATCTGAGTTTAAAAAGCTGAATAAGATTTAGCAATCAA
TCTTCATCCTTTCGAATGAAAACCAACAAACTAAACCAAATTCGCAAACAAAAACACTGTGTATAAGAAGTTTATTAAACC
GCGCAGTTAA
Saccharomycopsis fibuligera
Sequence ID: CP012809.1
Identities: 1143/1145(99%)
66
S4. Một số hình ảnh sắc kí đồ chạy máy GCMS
67
68
S5. Danh sách tên chủng phân lập được từ 15 mẫu bánh men
Trình tự đã
PP
đọc
ST
Chủng
Loài
Mẫu bánh men
Nguồn mẫu
định
T
D1/D
IT
tên
S
2
1
MQF 4.2
R.microsporus Men Đức Ngọ
Thái Thụy, Thái Bình
+
Seq
Finge
2
MQF 4.4
R.microsporus Men Đức Ngọ
Thái Thụy,Thái Bình
r
Finge
3
MQF 5.2
R.microsporus Men Nam Định
Hải Hậu, Nam Định
r
Finge
4
MQF 5.6
R.microsporus Men Nam Định
Hải Hậu, Nam Định
r
Finge
5
MQF 6.4
R.microsporus Men Hà Nam
Bình Lục, Hà Nam
r
Finge
6
MQF 6.5
R.microsporus Men Hà Nam
Bình Lục, Hà Nam
r
Finge
7
MQF 7.2
R.microsporus Men Tân Độ
Phú Xuyên, Hà Nội
r
Finge
8
MQF 8.3
R.microsporus Men Sông Láng
Phú Xuyên, Hà Nội
r
Finge
9
MQF 9.5
R.microsporus Men Hưng Yên
Văn Lâm, Hưng Yên
r
Finge
10 MQF 10.3 R.microsporus Men Đức Hùng
TP. Buôn Ma Thuột, Tỉnh Đắk Lắk
r
Finge
11 MQF 11.1 R.microsporus Men Trung Tiến
Thái Thụy, Thái Bình
r
Finge
12 MQF 12.5 R.microsporus Men Kiên Lao
Xuân Trường, Nam Định
r
Finge
13 MQF 14.3 R.microsporus Men Hương Lúa
Mai Hắc Đế - TP. Buôn Mê Thuột
r
Finge
14 MQF 14.7 R.microsporus Men Hương Lúa
Mai Hắc Đế - TP. Buôn Mê Thuột
r
Finge
15 MQF 14.8 R.microsporus Men Hương Lúa
Mai Hắc Đế - TP. Buôn Mê Thuột
r
Finge
16 MQF 15.3 R.microsporus Men Bắc Giang
Trung tâm VSVCN
r
Finge
17 MQF 10.1 R.microsporus Men Đức Hùng
TP. Buôn Ma Thuột, Tỉnh Đắk Lắk
r
Men Bá Dương
Finge
18 MQF 13.1 R.microsporus
Nội
Đan Phượng, Hà Nội
r
19 MQF 1.2
R.microsporus Men Kim Sơn
Kim Sơn, Ninh bình
+
Seq
Finge
20 MQF 4.1
R.microsporus Men Đức Ngọ
Thái Thụy, TP. Thái Bình
r
Finge
21 MQF 4.5
R.microsporus Men Đức Ngọ
Thái Thụy, TP. Thái Bình
r
Finge
22 MQF 5.3
R.microsporus Men Nam Định
Hải Hậu, Nam Định
r
69
Finge
23 MQF 6.3
R.microsporus Men Hà Nam
Bình Lục, Hà Nam
r
Finge
24 MQF 10.4 R.microsporus Men Đức Hùng
TP. Buôn Ma Thuột, Tỉnh Đắk Lắk
r
Finge
25 MQF 11.2 R.microsporus Men Trung Tiến
Thái Thụy, Thái Bình
r
155/21 Mai Hắc Đế - TP. Buôn Mê
Finge
26 MQF 14.1 R.microsporus Men Hương Lúa
Thuột
r
Quán men rượu Ngọc Minh, 42 Quán
Finge
27 MQF 3.1 M. indicus
Men thuốc bắc
Gánh
r
28 MQF 12.1 M. indicus
Men Kiên Lao
Xuân Trường, Nam Định
Seq
+
Finge
29 MQF 12.4 M. indicus
Men Kiên Lao
Xuân Trường, Nam Định
r
30 MQF 2.4
R. oryzae
Men Tuyên Quang
Yên Sơn, tỉnh Tuyên Quang
Seq
Finge
31 MQF 3.2
R. oryzae
Men thuốc bắc
42 Quán Gánh
r
Finge
32 MQF 8.2
R. oryzae
Men Sông Láng
Phú Xuyên, Hà Nội
r
33 MQF 2.5
R. oryzae
Men Tuyên Quang Yên Sơn, tỉnh Tuyên Quang
Seq
+
Finge
34 MQF 9.1
R. oryzae
Men Hưng Yên
Văn Lâm, tỉnh Hưng Yên
r
Finge
35 MQF 9.6
R. oryzae
Men Hưng Yên
Văn Lâm, tỉnh Hưng Yên
r
Finge
36 MQF 12.6 R. oryzae
Men Kiên Lao
Xuân Trường, Nam Định
r
Finge
37 MQF 15.1 R. oryzae
Men Bắc Giang
Trung tâm VSVCN
r
Finge
38 MQF 15.2 R. oryzae
Men Bắc Giang
Trung tâm VSVCN
r
Finge
39 MQF 15.4 R. oryzae
Men Bắc Giang
Trung tâm VSVCN
r
40 MQF 1.3
R. oryzae
Men Kim Sơn
Kim Sơn, Ninh bình
+
Seq
Finge
41 MQF 1.4
R. oryzae
Men Kim Sơn
Kim Sơn, Ninh bình
r
Finge
43 MQF 7.1
R. oryzae
Men Tân Độ
Phú Xuyên, Hà Nội
r
Finge
44 MQF 7.3
R. oryzae
Men Tân Độ
Phú Xuyên, Hà Nội
r
Finge
45 MQF 8.1
R. oryzae
Men Sông Láng
Phú Xuyên, Hà Nội
r
Finge
46 MQF 2.1
R. oryzae
Men Tuyên Quang
Yên Sơn, tỉnh Tuyên Quang
r
Finge
47 MQF 4.3
R. oryzae
Men Đức Ngọ
Thái Thụy, TP. Thái Bình
r
Finge
48 MQF 5.1
R. oryzae
Men Nam Định
Hải Hậu, tỉnh Nam Định
r
70
Finge
49 MQF 5.4
R. oryzae
Men Nam Định
Hải Hậu, tỉnh Nam Định
r
Finge
50 MQF 5.5
R. oryzae
Men Nam Định
Hải Hậu, Nam Định
r
Finge
51 MQF 6.1
R. oryzae
Men Hà Nam
Bình Lục,Hà Nam
r
Finge
52 MQF 6.2
R. oryzae
Men Hà Nam
Bình Lục,Hà Nam
r
53 MQF 10.5 R. oryzae
Men Đức Hùng
TP. Buôn Ma Thuột, Tỉnh Đắk Lắk
+
Seq
Finge
54 MQF 10.6 R. oryzae
Men Đức Hùng
TP. Buôn Ma Thuột, Tỉnh Đắk Lắk
r
Finge
55 MQF 14.4 R. oryzae
Men Hương Lúa
Mai Hắc Đế - TP. Buôn Mê Thuột
r
Finge
56 MQF 14.5 R. oryzae
Men Hương Lúa
Mai Hắc Đế - TP. Buôn Mê Thuột
r
57 MQF 9.4
L. ramosa
Men Hưng Yên
Văn Lâm,Hưng Yên
Seq
+
Finge
58 MQF 11.3
L. ramosa
Men Trung Tiến
Thái Thụy, Thái Bình
r
Finge
59 MQF 14.2
L. ramosa
Men Hương Lúa
Mai Hắc Đế - TP. Buôn Mê Thuột
r
60 MQF 12.2 C. bertholletiae Men Kiên Lao
Xuân Trường, Nam Định
Seq
+
M.
61 MQF 2.2
circinelloides
Men Tuyên Quang
Yên Sơn,Tuyên Quang
Seq
+
M.
Finge
62 MQF 2.3
circinelloides
Men Tuyên Quang Yên Sơn, Tuyên Quang
r
M.
Finge
63 MQF 3.3
circinelloides
Men thuốc bắc
42 Quán Gánh
r
Men Bá Dương
Finge
64 MQF 13.2 M. indicus
Nội
Đan Phượng, Hà Nội
r
Finge
65 MQF 1.1 M. indicus
Men Kim Sơn
Kim Sơn, Ninh bình
r
66 MQF 8.4 M. indicus
Men Sông Láng
Phú Xuyên, Hà Nội
Seq
+
Finge
67 MQF 8.7 M. indicus
Men Sông Láng
Phú Xuyên, Hà Nội
r
Finge
68 MQF 9.3 M. indicus
Men Hưng Yên
Văn Lâm, Hưng Yên
r
Finge
69 MQF 9.7 M. indicus
Men Hưng Yên
Văn Lâm, Hưng Yên
r
70 MQF 10.2 M. indicus
Men Đức Hùng
TP. Buôn Ma Thuột, Tỉnh Đắk Lắk
Seq
+
Finge
71 MQF 10.7 M. indicus
Men Đức Hùng
TP. Buôn Ma Thuột, Tỉnh Đắk Lắk
r
Finge
72 MQF 8.5
C. echinulata
Men Sông Láng
Phú Xuyên, Hà Nội
r
73 MQF 8.6
C. echinulata
Men Sông Láng
Phú Xuyên, Hà Nội
Seq
+
Finge
74 MQY 2.1
S. cerevisiae
Men Tuyên Quang Yên Sơn,Tuyên Quang
r
71
Finge
75 MQY 3.1
S. cerevisiae
Men thuốc bắc
42 Quán Gánh
r
76 MQY 4.1
S. cerevisiae
Men Đức Ngọ
Thái Thụy, TP. Thái Bình
+
Seq
Finge
77 MQY 4.2
S. cerevisiae
Men Đức Ngọ
Thái Thụy, TP. Thái Bình
r
Finge
78 MQY 7.2
S. cerevisiae
Men Tân Độ
Phú Xuyên, Hà Nội
r
Finge
79 MQY 8.1
S. cerevisiae
Men Sông Láng
Phú Xuyên, Hà Nội
r
Finge
80 MQY 8.2
S. cerevisiae
Men Sông Láng
Phú Xuyên, Hà Nội
r
Finge
81 MQY 9.2
S. cerevisiae
Men Hưng Yên
Văn Lâm, Hưng Yên
r
MQY
Finge
82
11.1
S. cerevisiae
Men Trung Tiến
Thái Thụy, Thái Bình
r
Trình tự đã
PP
đọc
STT
Chủng
Loài
Mẫu bánh men
Nguồn mẫu
định
tên
ITS D1/D2
83 MQY 11.2
S. cerevisiae
Men Trung Tiến
Thái Thụy, Thái Bình
Finger
84 MQY 12.1
S. cerevisiae
Men Kiên Lao
Xuân Trường, Nam Định
Finger
85 MQY 12.2
S. cerevisiae
Men Kiên Lao
Xuân Trường, Nam Định
Finger
86 MQY 13.1
S. cerevisiae
Men Bá Dương Nội
Đan Phượng, Hà Nội
Finger
87 MQY 7.1
S. cerevisiae
Men Tân Độ
Phú Xuyên, Hà Nội
Finger
88 MQY 9.3
W. anomalus
Men Hưng Yên
Văn Lâm, Hưng Yên
Finger
89 MQY 11.3
W. anomalus
Men Trung Tiến
Thái Thụy, Thái Bình
Seq
+
90 MQS 8.1
S. fibuligera
Men Sông Láng
Phú Xuyên, Hà Nội
Finger
91 MQS 8.2
S. fibuligera
Men Sông Láng
Phú Xuyên, Hà Nội
Finger
92 MQS 3.2
S. fibuligera
Men thuốc bắc
42 Quán Gánh
Finger
93 MQS 3.1
S. fibuligera
Men thuốc bắc
42 Quán Gánh
Finger
94 MQS 2.2
S. fibuligera
Men Tuyên Quang
Yên Sơn, Tuyên Quang
Finger
95 MQS 2.1
S. fibuligera
Men Tuyên Quang
Yên Sơn, Tuyên Quang
Finger
96 MQS 12.1
S. fibuligera
Men Kiên Lao
Xuân Trường, Nam Định
Finger
97 MQS 12.2
S. fibuligera
Men Kiên Lao
Xuân Trường, Nam Định
Finger
98 MQS 13.2
S. fibuligera
Men Bá Dương Nội
Đan Phượng, Hà Nội
Finger
99 MQS 13.1
S. fibuligera
Men Bá Dương Nội
Đan Phượng, Hà Nội
Finger
100 MQS 9.2
S. fibuligera
Men Hưng Yên
Văn Lâm, Hưng Yên
Finger
101 MQS 14.1
S. fibuligera
Men Hương Lúa
Mai Hắc Đế - TP. Buôn Mê Thuột
Seq
+
72
S6. Thông tin mẫu rượu dùng phân tích GCMS
73