Bé Gi¸o dôc vµ ®µo t¹o
Khoa c«ng nghÖ sinh häc
(cid:70) (cid:9) (cid:71)
KHÓA LUẬN TỐT NGHIỆP
§Ò tµi: Nghiªn cøu, x¸c ®Þnh c©y ng« mang gen kh¸ng
thuèc trõ cá b»ng kÜ thuËt PCR vµ ®¸nh gi¸ ®a d¹ng di
truyÒn tËp ®oµn ng« mang gen kh¸ng thuèc trõ cá
HÀ NỘI - 2008
Khãa luËn tèt nghiÖp Bïi V¨n HiÖu
PhÇn I: Më ®Çu
1.1. §Æt vÊn ®Ò
§Çu nh÷ng n¨m 80 thÕ kû XX xuÊt hiÖn nh÷ng c«ng bè ®Çu tiªn vÒ c©y
chuyÓn gen vµ tõ ®ã më ra mét ra ch©n trêi míi, chøa ®ùng mét t−¬ng lai ®Çy
høa hÑn vÒ c¶i tiÕn c©y trång. NhiÒu gièng c©y trång ®· ®−îc chuyÓn gen ®Ó t¹o
ra c¸c ®Æc tÝnh −u viÖt, gióp c¶i thiÖn n¨ng suÊt, chèng chÞu s©u bÖnh, h¹n, mÆn,
l¹nh, t¨ng chÊt l−îng vµ c¶i thiÖn m«i tr−êng. Tõ ®ã kü thuËt gen trë thµnh c«ng
cô h÷u hiÖu ®−îc øng dông trong c¶i tiÕn gièng c©y trång.
Sù ph¸t triÓn nhanh chãng cña C«ng nghÖ Sinh häc ®· ®−a c¸c thùc vËt
chuyÓn gen vµ c¸c s¶n phÈm cña chóng ®Õn víi thÞ tr−êng tiªu dïng. Vµ kÓ tõ
khi kü thuËt gen thùc vËt ®−îc thiÕt lËp, thö nghiÖm thµnh c«ng th× nh÷ng øng
dông cña nã ®· ®−îc ®Çu t− vµ ®−îc tiÕn hµnh mét c¸ch réng r·i ®Ó gi¶i quyÕt
c¸c vÊn ®Ò cßn tån t¹i cña N«ng nghiÖp. V× vËy thùc vËt chuyÓn gen ®· ®−îc
trång phæ biÕn trªn ®ång ruéng ®Ó lµm t¨ng tÝnh kh¸ng bÖnh, kh¸ng s©u, kh¸ng
thuèc trõ cá trong hÖ thèng canh t¸c. Tõ cuèi n¨m 1997, c¸c c©y trång biÕn ®æi
gen vµ c¸c s¶n phÈm cña chóng ®· ®−îc chÊp nhËn th−¬ng m¹i ho¸ ë mét sè
quèc gia. Ngµy nay viÖc s¶n xuÊt vµ sö dông c©y trång chuyÓn gen ®ang ngµy
mét gia t¨ng, vµ kh¼ng ®Þnh tÇm quan träng trong nÒn s¶n xuÊt n«ng nghiÖp vµ
mét sè nghµnh kh¸c. N¨m 2007 diÖn tÝch trång tiÕp tôc t¨ng 2 con sè, ®¹t 12%
t−¬ng ®−¬ng víi 12,3 triÖu hecta (30 triÖu mÉu. Trong ®ã tæng diÖn tÝch trång
trong 12 n¨m (1996-2007) ®¹t 690 triÖu hÐc-ta (1,7 tû mÉu). Víi møc t¨ng ch−a
tõng thÊy gÊp 67 lÇn tõ 1996-2007, trë thµnh c«ng nghÖ c©y trång ®−îc ¸p dông
nhanh nhÊt trong thêi gian gÇn ®©y.
Ngµy nay, c©y chuyÓn gen ®−îc trång ngµy cµng réng r·i ë rÊt nhiÒu n−íc
trªn thÕ giíi. Nh−ng c©u hái vÒ sù an toµn trong viÖc sö dông c¸c s¶n phÈm cña
c©y chuyÓn gen còng ®ång thêi ®−îc ®Æt ra vµ trë thµnh mét vÊn ®Ò nãng báng
víi hµng lo¹t c¸c vÊn ®Ò liªn quan xoay quanh nã, liÖu chóng ®−îc sö dông d−íi
-2-
Khãa luËn tèt nghiÖp Bïi V¨n HiÖu
d¹ng nµo vµ kh¶ n¨ng rñi ro ®Õn víi søc khoÎ con ng−êi, víi sù ®a d¹ng sinh
häc, tiÒm Èn « nhiÔm m«i tr−êng.... ë ViÖt Nam, ®Õn nay vÉn ®ang trong thêi
gian x©y dùng vµ hoµn thiÖn c¸c quy chÕ vÒ qu¶n lý an toµn sinh häc c¸c c©y
chuyÓn gen vµ kiÓm so¸t c¸c s¶n phÈm biÕn ®æi gen. Tuy nhiªn, ®Ó ®−a nhanh
c¸c c©y chuyÓn gen vµo s¶n xuÊt t¹i ViÖt Nam th× viÖc nghiªn cøu t¹o c©y
chuyÓn gen, trång thö nghiÖm vµ kiÓm so¸t c©y trång biÕn ®æi gen cÇn ph¶i tiÕn
hµnh tr−íc mét b−íc. Trong sè c¸c c©y trång biÕn ®æi gen ®ang thö nghiÖm th×
c©y ng« ®ang rÊt ®−îc quan t©m nhÊt ®Æc biÖt lµ ng« chuyÓn gen kh¸ng thuèc
trõ cá.
§Ó ®¸p øng c¸c chØ tiªu kü thuËt trong viÖc ph¸t hiÖn chÝnh x¸c ng«
chuyÓn gen kh¸ng thuèc trõ cá vµ nhanh chãng sö dông c¸c dßng ng« nµy phôc
vô c«ng t¸c t¹o gièng ng« lai kh¸ng thuèc diÖt cá cña ViÖt Nam. Chóng t«i ®·
thùc hiÖn ®Ò tµi “Nghiªn cøu, x¸c ®Þnh c©y ng« mang gen kh¸ng thuèc trõ cá
b»ng kÜ thuËt PCR vµ ®¸nh gi¸ ®a d¹ng di truyÒn tËp ®oµn ng« mang gen
kh¸ng thuèc trõ cá”.
1.2. Môc ®Ých
– Thu thËp d÷ liÖu vÒ c©y trång biÕn ®æi gen vµ t×m hiÓu mét c¸ch tæng
quan vÒ c©y ng« chuyÓn gen .
– B−íc ®Çu lµm quen víi c¸c kü thuËt nghiªn cøu vÒ c©y chuyÓn gen
– X¸c ®Þnh ®o¹n tr×nh tù ®Æc tr−ng cña promoter CaMV-35S (195bp) cã
trong ng« chuyÓn gen.
– X¸c ®Þnh gen PAT (Phosphinothricin-N-Acetyltransferase) lµ gen kh¸ng
thuèc trõ cá glufosinate cã trong ng« chuyÓn gen b»ng kü thuËt PCR
– §¸nh gi¸ ®Æc ®iÓm h×nh th¸i, chØ tiªu n«ng sinh häc chÝnh vµ ®a d¹ng di
truyÒn ë møc ph©n tö b»ng kÜ thuËt PCR-RAPD cña mét sè dßng ng« thuÇn
mang gen kh¸ng thuèc trõ cá phôc vô cho c«ng t¸c backcross t¹o dßng ng« −u
viÖt mang gen gen kh¸ng thuèc trõ cá.
-3-
Khãa luËn tèt nghiÖp Bïi V¨n HiÖu
PhÇn II: Tæng QUAN Tμi LiÖu
2.1. Giíi thiÖu vÒ c©y ng« 2.1.1. Vµi nÐt s¬ l−îc vÒ c©y ng«
C©y ng« cã tªn khoa häc lµ Zea mays L., thuéc chi Maydeae, hä
Gramineae. Tõ thÕ kû 16 khi Colombus mang h¹t gièng tõ ch©u Mü vÒ th× s¶n
xuÊt ng« ®· lan trµn kh¾p thÕ giíi vµ trë thµnh lo¹i c©y ngò cèc quan träng cung
cÊp l−¬ng thùc cho loµi ng−êi. HiÖn trªn thÕ giíi ®ang tån t¹i hai hÖ thèng ph©n
Wilkes (1967)
Iltis & Doebly (1984)
Nhãm Euchleana
Nhãm Luxuriantes
Z. penrennis (Hitch) Reeves & Mangelsdorf
Z. diploperennis Iltis Doebly & Guzman
Z. mexicana (Schrader) Kuntze
Z. perennis Hitch Reeves & Mangelsdorf
Nßi Guatemala
Nhãm Zea
Z. mays subsp. Parviglumis Iltis & Doebly
Nßi Huchuetenango
Var. Huchuetenangensis Iltis & Doebly
Nßi Balsas
Var. Parviglumis Iltis & Doebly subsp
Mexicana (Schrader) Iltis
Nßi Chalco
Nßi Chalco
Nßi Cao nguyªn trung phÇn
Nßi Cao nguyªn trung phÇn
Nßi Nobogame
Nßi Nobogame
Nhãm Zea
Z. mays L.
Z. mays subsp. mays
lo¹i ®èi víi lo¹i Zea.
Tõ loµi Zea mays L, dùa vµo cÊu tróc néi nhò cña h¹t ®−îc ph©n thµnh
c¸c loµi phô, sau ®ã dùa vµo mµu h¹t vµ mµu lâi ®Ó ph©n c¸c thø (varieta).
Nh÷ng loµi phô chÝnh bao gåm:
- ng« ®¸
Zea mays Zea mays Subsp. indurata Subsp. indentata - ng« r¨ng ngùa
-4-
Khãa luËn tèt nghiÖp Bïi V¨n HiÖu
Zea mays Zea mays Zea mays Zea mays Zea mays Subsp. ceratina - ng« nÕp Subsp. saccharata - ng« nÕp Subsp. everta - ng« bét Subsp. amylacea - ng« bét Subsp. tunecata - ng« bäc
Ng« cã nguån gèc tõ Trung Mü song c©y ng« ®· thÝch nghi nhanh víi
o M¹ch ®Õn vÜ tuyÕn 55P
o P-56P
o P, cßn ë Liªn X« cò vµ Canada tíi vü tuyÕn 58P
P. ë
P (Humlam
o o P-43P Nam b¸n cÇu, ng« ®−îc trång ë New Zealand ®Õn vÜ tuyÕn 42P
nh÷ng ®iÒu kiÖn sinh th¸i rÊt kh¸c nhau. ë B¾c b¸n cÇu, ng« cã thÓ trång ë §an
John, 1942, Necula GH. vµ cs, 1957). Ng« còng lµ c©y trång thÝch øng réng.
o khái xÝch ®¹o th× ®é cao cµng gi¶m. VÝ dô nh− Peru (16P
P nam) ng« trång ®−îc ë
o ®é cao 3900m, ë B¾c Carolia (34P
o P-37P
P b¾c) trång ®−îc ë 1200m, ë Ch©u ¸ nh−
P-48P
o P b¾c) ë ®é cao
o thung lòng Kasmir ë 2000m, cßn ë Ch©u ¢u (kho¶ng 45P
Theo Necula G. H. (1957) ng« cã thÓ trång ë ®é cao 3900m. Tuy nhiªn cµng xa
500-800m.
Trªn ph¹m vi thÕ giíi, c¸c nhµ khoa häc ®· chia sinh th¸i c©y ng« thµnh 4
vïng chÝnh:
– ¤n ®íi
– CËn nhiÖt ®íi
– NhiÖt ®íi cao (trªn ®é cao 2000m so víi mÆt biÓn)
– NhiÖt ®íi thÊp (d−íi 2000m)
Theo ph©n lo¹i nµy, ViÖt Nam n»m trong vïng sinh th¸i nhiÖt ®íi thÊp.
C¸c bé gièng tõ vïng nhiÖt ®íi thÊp biÓu hiÖn sù thÝch øng h¬n c¶ th«ng qua
kh¶ n¨ng chèng chÞu vµ n¨ng suÊt, kÓ c¶ ë c¸c th¶o nguyªn cao phÝa B¾c hoÆc
vô ®«ng ë §ång b»ng B¾c Bé.
2.1.2. Nguån gen vµ ®a d¹ng di truyÒn c©y ng«
Ng« lµ c©y trång ®−îc thu thËp, m« t¶ vµ b¶o tån rÊt tèt tõ c¸c trung t©m
®a d¹ng di truyÒn. Tõ n¨m 1943, quü Rockefeller hîp t¸c víi c¸c n−íc Mü La
tinh ®· thu thËp nguån gen ng« tõ nh÷ng trung t©m ®a d¹ng chÝnh, t¹o c¬ së cho
-5-
Khãa luËn tèt nghiÖp Bïi V¨n HiÖu
c¸c tËp ®oµn ng« ë Mexico, Colombia vµ Brazil. Ngµy nay cã kho¶ng 15.000
mÉu gièng ng« ®· ®−îc thu thËp tõ c¸c n−íc kh¸c nhau trªn thÕ giíi.
ë ViÖt Nam, nguån gen ng« ®−îc b¶o tån t¹i ViÖn nghiªn cøu ng« víi
kho¶ng 400 mÉu gièng thô phÊn tù do vµ 3.000 dßng [10].
TËp ®oµn ng« Mexico – trung t©m xuÊt cña ng« cã sù ®a d¹ng tèi ®a. ë
®©y cã bèn nßi chÝnh ®−îc x¸c lËp ®ã lµ:
A. Nhãm nßi b¶n ®Þa cæ ®¹i: Ng−êi ta cho r»ng nhãm nµy xuÊt ph¸t tõ
ng« bäc nguyªn thuû ë Mexico. C¸c nßi ë nhãm nµy kh¸c nhau bëi sù ph¸t triÓn
®éc lËp ë nh÷ng ®Þa bµn vµ m«i tr−êng kh¸c nhau tuy chóng cïng mét tæ tiªn.
Bèn nßi chÝnh trong nhãm nµy lµ Palomero toluqueno, Arrocillo amarillo,
Chapalote vµ Nal-tel.
B. Nhãm nhËp néi tiÒn Columbus: C¸c nßi cña nhãm nµy ®−îc nhËp vµo
Mexico tõ Trung vµ Nam Mü vµo thêi tiÒn sö. Bèn nßi nµy lµ: Cacahuacintle,
Harinoso de Ocho, Oloton vµ ng« ngät.
C. Nhãm con lai tiÒn sö: Nhãm nµy bao gåm c¸c nßi ®−îc coi lµ t¹o ra tõ
viÖc lai t¹p gi÷a c¸c nßi b¶n ®Þa cæ ®¹i víi c¸c nßi nhËp néi tiÒn Columbus, hoÆc
gi÷a hai nhãm trªn víi Teosinte. HiÖn nay cßn t¸m nßi lµ: Conico, Reventador,
Tablonicillo, Tehua, Tepecintla, Comiteco, Jala vµ Zapalote chico.
D. Nhãm hiÖn ®¹i: Bao gåm c¸c nßi ph¸t triÓn gÇn ®©y vµ ch−a ®¹t ®Õn
tr¹ng th¸i æn ®Þnh, tuy nhiªn cã nh÷ng ®Æc ®iÓm ph©n biÖt x¸c ®Þnh. Cã bèn nßi
®−îc gäi lµ: Chalqueno, Celaya, Conico Norteno vµ Bolita.
Tõ ®©y ta thÊy râ sù biÕn dÞ to lín ®· ®−îc x¶y ra nh− thÕ nµo. §ã lµ
nh÷ng nßi gièng c¬ b¶n s¶n sinh ra nguån gen ng« thÕ giíi vµ sù ®a d¹ng di
truyÒn cña nã.
Sù ®a d¹ng di truyÒn cña ng« ®−îc thÓ hiÖn ë tÊt c¶ c¸c tÝnh tr¹ng cña c©y
b«ng cê vµ b¾p. ë c¸c ®Æc ®iÓm cña c©y, sù biÕn ®éng thÓ hiÖn ë chiÒu cao c©y,
chiÒu cao ®ãng b¾p vµ ®Æc ®iÓm cña l¸ (dµi l¸, chiÒu réng l¸, sè l¸ trªn c©y, sè l¸
-6-
Khãa luËn tèt nghiÖp Bïi V¨n HiÖu
trªn b¾p), mµu th©n vµ d¹ng lãng. Sù biÕn ®éng ë cê thÓ hiÖn ë ®é dµi b«ng cê,
cuèng b«ng cê, ®é nh¸nh dµi, sè nh¸nh cÊp hai vµ ba, ®−êng kÝnh b¾p vµ sè
hµng h¹t. §Æc biÖt sù biÕn ®éng rÊt ®a d¹ng ë néi nhò h¹t, tõ ®©y ta ph©n biÖt
c¸c d¹ng r¨ng ngùa, ®¸ r¾n, bét, ®−êng, nÕp, næ vµ bäc. Sù biÕn ®éng cßn thÓ
hiÖn ë kÝch th−íc h¹t, mµu h¹t vµ chÊt l−îng h¹t.
ë ViÖt Nam ng« lµ c©y trång nhËp néi do vËy sù phong phó vÒ nguån gen
cã h¹n hÑp. Theo c¸c nghiªn cøu ph©n lo¹i ng« ®Þa ph−¬ng ViÖt Nam (GS.TS
Ng« H÷u T×nh, 1995) tõ nh÷ng n¨m 60 ®Õn nay cho thÊy, ng« ViÖt Nam tËp
trung chñ yÕu vµo hai loµi phô lµ ®¸ r¾n vµ nÕp.
Ngµy nay ®Ó ®¸nh gi¸ sù ®a d¹ng di truyÒn cña mét loµi, ng−êi ta kh«ng
chØ dùa vµo c¸c ®Æc ®iÓm thùc vËt häc dÔ nhËn biÕt vµ riªng rÏ mµ cÇn ph©n tÝch
trªn c¬ së nhiÒu tÝnh tr¹ng ®Ó ph©n biÖt c¸c nhãm c¸ch biÖt di truyÒn th«ng qua
kho¶ng c¸ch ¥clit hoÆc kho¶ng c¸ch Mahalanobis... GÇn ®©y c«ng nghÖ sinh
häc ®· gãp phÇn rÊt ®¾c lùc trong viÖc x¸c ®Þnh ®a d¹ng di truyÒn th«ng qua kü
thuËt Isozyme hoÆc “sù ®a h×nh ®é dµi c¸c ph©n ®o¹n c¾t h¹n chÕ” (RFLP –
Restriction Flagment Length Polymorphis), RAPD (§a h×nh c¸c ®o¹n khuÕch
®¹i ngÉu nhiªn)…
2.1.3. §Æc ®iÓm h×nh th¸i c©y ng«
RÔ: Ng« cã hÖ rÔ chïm tiªu biÓu cho bé rÔ c¸c c©y hä hßa th¶o. Ng« cã
ba lo¹i rÔ chÝnh: RÔ mÇm, RÔ ®èt (rÔ phô cè ®Þnh), RÔ ch©n kiÒng, chóng gióp
c©y ng« hót n−íc vµ c¸c chÊt dinh d−ìng tõ ®Êt.
Th©n, l¸: Ng« thuéc hä hßa th¶o, song cã th©n kh¸ ch¾c, cã ®−êng kÝnh
tõ 2-4cm tïy thuéc vµo gièng, ®iÒu kiÖn sinh th¸i vµ ch¨m sãc. Th©n cã chiÒu
cao kho¶ng 1,5-4m. Th©n ng« tr−ëng thµnh bao gåm nhiÒu lãng (dãng) n»m
gi÷a c¸c ®èt vµ kÕt thóc b»ng b«ng cê. L¸ ng« ®−îc mäc tõ c¸c ®èt cña th©n
ng«, bÑ l¸ «m chÆt lÊy th©n vµ l−ìi l¸ (th×a l×a).
-7-
Khãa luËn tèt nghiÖp Bïi V¨n HiÖu
B«ng cê vµ b¾p: Ng« lµ lo¹i c©y cã hoa kh¸c tÝnh cïng gèc. Hai c¬ quan
sinh s¶n ®ùc (b«ng cê) vµ c¸i (b¾p) tuy cïng n»m trªn mét c©y, song ë c¸c vÞ trÝ
kh¸c nhau. Hoa ®ùc th−êng ®−îc gäi lµ b«ng cê n»m ë ®Ønh c©y. Hoa c¸i (b¾p
ng«) ph¸t sinh tõ chåi n¸ch c¸c l¸, song chØ 1-3 chåi kho¶ng gi÷a th©n míi t¹o
thµnh b¾p.
H¹t: H¹t ng« thuéc lo¹i qu¶ dÝnh gåm n¨m phÇn chÝnh: vá h¹t, líp
al¬ron, ph«i, néi nhò vµ ch©n h¹t. Vá h¹t bao quanh h¹t, lµ mét mµng nh½n. Líp
al¬ron n»m d−íi vá h¹t, bao lÊy néi nhò vµ ph«i. Néi nhò lµ phÇn chÝnh cña h¹t
chøa c¸c tÕ bµo dù tr÷ chÊt dinh d−ìng. Néi nhò cã hai phÇn: néi nhò bét vµ néi
nhò sõng. Tû lÖ nµy phôc thuéc vµo chñng ng« vµ c¸c gièng ng« kh¸c nhau.
2.1.4. T×nh h×nh vµ ®Þnh h−íng ph¸t triÓn c©y ng« ë ViÖt Nam
ë ViÖt Nam, ng« lµ c©y l−¬ng thùc quan träng thø hai sau c©y lóa, cã sù
ph¸t triÓn réng kh¾p, liªn tôc vµ ®¹t ®Ønh ®iÓm vµo n¨m 2005. Theo “tæng quan
n«ng nghiÖp n¨m 2005” cña NguyÔn Sinh Cóc (NN vµ PTNT – 1/2006) th× s¶n
xuÊt ng« n¨m 2005 cã tiÕn bé v−ît bËc: DiÖn tÝch ®¹t 1039 ngh×n ha, n¨ng suÊt
®¹t 35,5 t¹/ha vµ s¶n l−îng ®¹t 3,69 triÖu tÊn, ®· lµm thay ®æi tû träng c¬ cÊu
s¶n l−îng thùc tõ 5,7% n¨m 2000 lªn 9% n¨m 2005 [1].
Nh÷ng tiÕn bé vÒ s¶n xuÊt ng« ViÖt nam thÓ hiÖn rÊt râ nÐt trong giai
®o¹n 20 n¨m thùc hiÖn ®−êng lèi ®æi míi cña §¶ng. Trong suÊt 20 n¨m qua
(1985-2004) diÖn tÝch, n¨ng suÊt vµ s¶n l−îng ng« ViÖt Nam t¨ng liªn tôc víi
tèc ®é rÊt cao. Tû lÖ t¨ng tr−ëng b×nh qu©n hµng n¨m trong suèt 20 n¨m vÒ diÖn
tÝch lµ 7,5%/n¨m, n¨ng suÊt 6,7%/n¨m vµ s¶n l−îng lµ 24,5%/n¨m, cao h¬n
nhiÒu 10 n¨m tr−íc ®ã khi ®Êt n−íc ta thèng nhÊt 1975-1985 (c¸c tû lÖ t−¬ng
øng giai ®o¹n nµy lµ 4,2%; 3,9% vµ 10,0%). NÕu chóng ta lÊy sè liÖu tuyÖt ®èi
cña 2 n¨m (1985) vµ sau 20 n¨m ®æi míi (2004) thÊy r»ng diÖn tÝch ng« t¨ng
2,5 lÇn, n¨ng suÊt 2,3 lÇn vµ s¶n l−îng 5,9 lÇn [1].
-8-
Khãa luËn tèt nghiÖp Bïi V¨n HiÖu
Tuy nhiªn, n¨ng suÊt ng« cña ViÖt Nam n¨m 2004 (34,9 t¹/ha) vÉn cßn
thÊp h¬n n¨ng suÊt b×nh trung b×nh thÕ giíi (48,5 t¹/ha), vÉn thÊp h¬n nhiÒu so
víi Mü (100,0 t¹/ha) vµ Trung Quèc (51,1 t¹/ha) song ®· v−ît ®−îc n¨ng suÊt
b×nh qu©n khèi c¸c n−íc ®ang ph¸t triÓn (31,3 t¹/ha). MÆc dÇu vËy, kh¸ch quan
mµ nãi: S¶n xuÊt ng« ViÖt Nam trong thêi kú ®æi míi ®· cã sù ph¸t triÓn v−ît
bËc, toµn diÖn vµ ®¸ng tr©n träng.
2.2. C©y trång biÕn ®æi gen 2.2.1. Kh¸i niÖm vÒ c©y trång biÕn ®æi gen
C©y trång biÕn ®æi gen hoÆc c©y trång c«ng nghÖ sinh häc lµ c¸c c©y
trång ®· ®−îc biÕn ®æi vÒ mÆt di truyÒn nh»m lµm cho c©y trång mang mét sè
®Æc tÝnh quý gi¸ mµ c©y trång tù nhiªn kh«ng cã. C«ng nghÖ nµy cho phÐp c¸c
gen riªng biÖt ®· chän läc ®−îc chuyÓn tõ mét c¬ thÓ nµy sang mét c¬ thÓ kh¸c
còng nh− gi÷a c¸c loµi kh«ng cã liªn quan víi nhau. C¸c tÝnh tr¹ng th−êng ®−îc
chuyÓn vµo c©y trång nh− tÝnh kh¸ng c«n trïng, kh¸ng nÊm bÖnh, kh¸ng vi
khuÈn, kh¸ng thuèc trõ cá, kh¸ng mÆn, cho n¨ng suÊt cao, chÊt l−îng s¶n phÈm
tèt. §©y lµ mét ph−¬ng h−íng quan träng gi¶i quyÕt vÊn ®Ò an toµn l−¬ng thùc
cho nh©n lo¹i gãp phÇn gi¶m thiÓu c¸c lo¹i n«ng d−îc vµ ph©n bãn ho¸ häc, b¶o
vÖ m«i tr−êng sinh th¸i bÒn v÷ng.
Sù biÕn ®æi vÒ mÆt di truyÒn th−êng bao gåm sù chÌn ®o¹n ADN, t¸i tæ
hîp nh÷ng m¶nh ADN nhá h¬n vµo trong hÖ gen cña c©y trång bÞ biÕn ®æi. CÊu
tróc cña gen chÌn ®iÓn h×nh trong GMC (Genetically Modified Crops) ®−îc t¹o
nªn bëi 3 bé phËn:
1. §o¹n promoter (®o¹n khëi ®éng) cã chøc n¨ng ®iÒu khiÓn ho¹t ®éng
cña gen cÊu tróc, nã ®−îc vÝ nh− chiÕc c«ng t¾c bËt/më ®Ó ®äc gen chÌn vµo.
2. Gen ®· ®−îc chÌn (gen ®· bÞ biÕn ®æi) ®©y thùc chÊt lµ mét gen cÊu
tróc m· ho¸ cho ®Æc ®iÓm ®· chän läc riªng biÖt.
3. §o¹n terminator (®o¹n kÕt thóc) cã chøc n¨ng nh− mét tÝn hiÖu dõng
®Ó ®äc gen ®· chÌn .
-9-
Khãa luËn tèt nghiÖp Bïi V¨n HiÖu
Ngoµi ra mét vµi yÕu tè kh¸c cã thÓ cã mÆt trong cÊu tróc cña ®o¹n ADN
chÌn vµ chøc n¨ng cña chóng th−êng lµ ®Ó ®iÒu chØnh vµ æn ®Þnh chøc n¨ng cña
gen hoÆc lµ ®Ó chøng minh sù cã mÆt cña cÊu tróc ADN chÌn trong GMC hoÆc
®Ó cã sù kÕt hîp dÔ dµng cña c¸c thµnh phÇn kh¸c nhau trong cÊu tróc ®o¹n
ADN chÌn. CÊu tróc cña ®o¹n ADN chÌn ph¶i t−¬ng hîp víi hÖ gen cña c¬ thÓ
nhËn ®Ó nã cã sù di truyÒn æn ®Þnh.
2.2.2. Nh÷ng vÊn ®Ò liªn quan ®Õn c©y trång biÕn ®æi gen 2.2.2.1. Lîi Ých cña c©y trång biÕn ®æi gen
Thùc tr¹ng ph¸t triÓn nhanh chãng cña c©y trång biÕn ®æi gen trong
nh÷ng n¨m qua ®· chøng tá chóng cã nh÷ng mÆt m¹nh næi tréi h¬n h¼n nh÷ng
c©y trång kh«ng biÕn ®æi gen. Sau ®©y lµ nh÷ng lîi Ých mµ chóng ®em l¹i cho
con ng−êi trong thêi gian kÓ tõ khi c©y trång biÕn ®æi gen ®Çu tiªn xuÊt hiÖn cho
®Õn nay:
– Lîi Ých trong nghiªn cøu c¬ b¶n: ViÖc sö dông GMC ®· gãp phÇn to lín
trong viÖc ph¸t hiÖn c¸c gen quan träng, x¸c ®Þnh ®−îc chøc n¨ng cña mét gen
bÊt kú.
– Lîi Ých trong c¶i t¹o gièng c©y trång: Nhê cã c«ng nghÖ gen mµ nhiÒu
gièng c©y trång míi ®−îc t¹o ra víi c¸c ®Æc tÝnh kh«ng cã ë c©y trång tù nhiªn
nh− kh¶ n¨ng chèng chÞu c¸c ®iÒu kiÖn ngo¹i c¶nh, chèng chÞu s©u bÖnh, chèng
chÞu thuèc diÖt cá nh»m n©ng cao s¶n l−îng vµ chÊt l−îng c©y trång.
– Lîi Ých trong ch¨n nu«i gia sóc: C«ng nghÖ chuyÓn gen thùc vËt ®· t¹o ra
c¸c lo¹i thøc ¨n gia sóc chøa c¸c kh¸ng thÓ ®Æc hiÖu hay v¨cxin t¸i tæ hîp, lµm
t¨ng søc ®Ò kh¸ng cña vËt nu«i ®èi víi bÖnh tËt, t¹o ra c¸c lo¹i thøc ¨n cã chÊt
l−îng dinh d−ìng cao.
– Lîi Ých trong c«ng nghÖ thùc phÈm: RÊt nhiÒu lo¹i thùc phÈm míi cã chÊt
l−îng dinh d−ìng cao, mÉu m· ®Ñp, thêi gian b¶o qu¶n l©u, hay lµm thay ®æi
hµm l−îng acid bÐo trong dÇu thùc vËt nh»m lµm gi¶m nguy c¬ m¾c bÖnh tim
m¹ch ®· ®−îc t¹o ra nhê c«ng nghÖ chuyÓn gen thùc vËt.
-10-
Khãa luËn tèt nghiÖp Bïi V¨n HiÖu
– Lîi Ých trong c«ng nghÖ d−îc phÈm: Nhê kü thuËt ADN t¸i tæ hîp, ng−êi
ta cã thÓ s¶n xuÊt ra c¸c s¶n phÈm nh− c¸c kh¸ng nguyªn, c¸c protein ng−êi,
hemoglobin, mét sè kh¸ng thÓ ... tõ c©y trång biÕn ®æi gen.
– Lîi Ých vÒ m«i tr−êng: N¨ng suÊt cña c©y trång biÕn ®æi gen cao h¬n rÊt
nhiÒu so víi c¸c c©y trång tù nhiªn do ®ã sù ph¸t triÓn cña GMC sÏ lµm gi¶m
nhu cÇu chuyÓn ®æi ®Êt rõng vµ ®Êt ë thµnh ®Êt n«ng nghiÖp. Lµm gi¶m nhu cÇu
sö dông thuèc trõ s©u, thuèc trõ cá, bãn ®¹m ... nh− vËy sÏ lµm gi¶m « nhiÔm
nguån n−íc vµ nguy c¬ g©y h¹i cho søc khoÎ con ng−êi.
– Lîi Ých vÒ kinh tÕ: GMC ®· vµ ®ang mang l¹i cho ng−êi n«ng d©n nhiÒu
lîi Ých vÒ kinh tÕ, nã lµm gi¶m chi phÝ s¶n xuÊt, gi¶m søc lao ®éng vµ t¨ng gi¸
trÞ s¶n phÈm. N¨m 2007, doanh thu tõ GMC ®¹t 6,9 tû USD vµ dù ®Þnh n¨m
2008 lµ 7,5 tû USD [42].
– Lîi Ých ng−êi tiªu dïng: Nhê cã c«ng nghÖ chuyÓn gen thùc vËt mµ ng−êi
tiªu dïng cã thÓ cã ®−îc c¸c s¶n phÈm thùc phÈm cã lîi h¬n ®èi víi con ng−êi
nh− c¸c s¶n phÈm cã chÊt l−îng dinh d−ìng cao, cã h−¬ng vÞ, cã thêi gian b¶o
qu¶n l©u, hay ®−îc bæ sung mét sè chÊt nh− vitamin A, vitamin E [12, 20].
– Ngoµi nh÷ng lîi Ých to lín kÓ trªn, khi ®−a GMC ra ngoµi m«i tr−êng
ng−êi ta ®Æc biÖt quan t©m ®Õn nh÷ng ¶nh h−ëng cña nã ®èi víi m«i tr−êng vµ
sù c©n b»ng hÖ sinh th¸i... Thùc tÕ ®· cho thÊy c©y trång biÕn ®æi gen cã Ých lîi
tiÒm tµng ®èi víi m«i tr−êng. Chóng gióp b¶o tån c¸c nguån lîi tù nhiªn, sinh
c¶nh vµ c¸c nguån lîi b¶n ®Þa, chóng gãp phÇn gi¶m xãi mßn ®Êt, c¶i thiÖn chÊt
l−îng n−íc, c¶i thiÖn rõng vµ n¬i c− ngô cña ®éng vËt hoang d¹i.
2.2.2.2. Nh÷ng rñi ro cã thÓ cã cña c©y trång biÕn ®æi gen
C©y trång biÕn ®æi gen mang c¸c ®Æc tÝnh ®· ®−îc c¶i biÕn nh»m mang
l¹i nh÷ng lîi Ých tèi ®a cho con ng−êi nh−ng khi ®−a chóng ra m«i tr−êng tù
nhiªn vµ th−¬ng m¹i ho¸ chóng th× kh«ng thÓ kh«ng ®¸nh gi¸ nh÷ng rñi ro cã
thÓ x¶y ra. Nh÷ng rñi ro nµy th−êng ®−îc xem xÐt ë mét sè khÝa c¹nh chÝnh sau:
-11-
Khãa luËn tèt nghiÖp Bïi V¨n HiÖu
– HiÓm ho¹ cá d¹i: Kh¶ n¨ng x¶y ra lµ c¸c gen míi trong GMC cã thÓ
chuyÓn sang c©y hä hµng sèng hoang d· ngoµi tù nhiªn theo ph−¬ng thøc lan
truyÒn h¹t phÊn, còng nh− kh¶ n¨ng tao ra nh÷ng lo¹i cá míi, kh¸ng thuèc trõ
cá hay kh¸ng c«n trïng [5].
– Kh¶ n¨ng kh¸ng s©u: C©y trång kh¸ng s©u cã kh¶ n¨ng tiªu diÖt c¸c loµi
sinh vËt kh«ng ph¶i lµ sinh vËt cÇn diÖt lµm ¶nh h−ëng ®Õn chuçi thøc ¨n tù
nhiªn, ¶nh h−ëng ®Õn sù ®a d¹ng sinh häc.
– Nguy c¬ ph¸t sinh c¸c mÇm bÖnh: Mét nguy c¬ tiÒm tµng kh¸c lµ kh¶
n¨ng t¸i tæ hîp cña mét gen virus s½n cã trong GMC víi c¸c gen tõ mét virus
kh¸c nhiÔm vµo c©y ®ã vµ t¹o ra mét virus míi [5].
– Sù kh¸ng kh¸ng sinh: Do c¸c GMC th−êng ®−îc chuyÓn c¸c gen quy ®Þnh
tÝnh tr¹ng kh¸ng kh¸ng sinh, v× thÕ g©y ra mèi lo l¾ng r»ng liÖu c¸c gen nµy cã
thÓ ®−îc ph¸t t¸n tõ GMC sang c¸c vi sinh vËt c− tró trong ruét ng−êi vµ lµm
chóng t¨ng kh¶ n¨ng ®Ò kh¸ng ®èi víi kh¸ng sinh. Tuy nhiªn ng−êi ta thÊy r»ng
mèi nguy c¬ nµy x¶y ra víi x¸c suÊt v« cïng nhá vµ nÕu cã x¶y ra th× t¸c ®éng
nµy còng kh«ng ®¸ng kÓ v× gen chØ thÞ ®−îc sö dông trong GMC ®−îc øng dông
rÊt Ýt trong thó y vµ y häc [12].
2.2.2.3. VÊn ®Ò an toµn vµ nh÷ng quy ®Þnh vÒ qu¶n lý c©y trång biÕn ®æi gen
MÆc dï GMC ®ang ®−îc th−¬ng m¹i ho¸ cã nhiÒu ®Æc tÝnh −u viÖt h¬n so
víi c¸c c©y trång cïng lo¹i nh−ng do míi xuÊt hiÖn nªn ng−êi ta ch−a ®¸nh gi¸
hÕt ®−îc nh÷ng ¶nh h−ëng bÊt lîi cña chóng. V× vËy yªu cÇu ®Æt ra khi th−¬ng
m¹i hãa GMC vµ s¶n phÈm cña chóng lµ chóng ta ph¶i ®Æt vÊn ®Ò xem xÐt vÒ
møc ®é an toµn cña c¸c s¶n phÈm nµy lªn hµng ®Çu. V× thÕ bÊt kú mét s¶n phÈm
chuyÓn gen nµo tr−íc khi ®−îc ®−a ra thÞ tr−êng ph¶i ®−îc thö nghiÖm toµn
diÖn, ®−îc c¸c nhµ khoa häc vµ gi¸m ®Þnh viªn ®¸nh gi¸ ®éc lËp xem cã an toµn
hay kh«ng vÒ mÆt dinh d−ìng, ®éc tÝnh, kh¶ n¨ng g©y dÞ øng vµ c¸c khÝa c¹nh
khoa häc thùc phÈm kh¸c. Nh÷ng ®¸nh gi¸ vÒ an toµn thùc phÈm nµy dùa trªn
-12-
Khãa luËn tèt nghiÖp Bïi V¨n HiÖu
nh÷ng quy ®Þnh cña tõng quèc gia. Chóng bao gåm: mét h−íng dÉn sö dông s¶n
phÈm, mét th«ng tin chi tiÕt vÒ môc ®Ých sö dông s¶n phÈm, c¸c th«ng tin vÒ
ph©n tö, ho¸ sinh, ®éc tÝnh, dinh d−ìng, kh¶ n¨ng g©y dÞ øng...
Do nh÷ng rñi ro vµ nh÷ng lo ng¹i bÊt th−êng xung quanh qu¸ tr×nh biÕn
®æi di truyÒn mµ viÖc b¾t buéc d¸n nh·n c¸c s¶n phÈm GMC ®· trë thµnh mét
yªu cÇu vµ lµ quy ®Þnh cña nhiÒu quèc gia. ViÖc d¸n nh·n GMC cho phÐp ng−êi
tiªu dïng lùa chän s¶n phÈm theo phong tôc, t«n gi¸o, chÕ ®é ¨n hµng ngµy cña
hä v× nhiÒu t«n gi¸o kh«ng thÝch sö dông c¸c s¶n phÈm ®−îc t¹o ra nhê sù biÕn
®æi di truyÒn.
2.2.3. T×nh h×nh s¶n xuÊt, sö dông c©y trång biÕn ®æi gen trªn thÕ giíi
Sau khi nh÷ng kÕt qu¶ nghiªn cøu ®Çu tiªn vÒ c©y trång biÕn ®æi gen ®−îc
c«ng bè nh÷ng n¨m 80 thÕ kû XX, sù ph¸t triÓn cña c©y tr«ng biÕn ®æi gen cã
nh÷ng b−íc ®ét ph¸ quan träng vÒ nh÷ng kÕt qu¶ nghiªn cøu vµ øng dông chóng
vµo s¶n xuÊt:
N¨m 1994, lÇn ®Çu tiªn FDA (C¬ quan qu¶n lý thùc phÈm vµ d−îc phÈm
Mü) chÊp nhËn thùc phÈm ®−îc t¹o ra b»ng CNSH lµ cµ chua. N¨m 1996, c©y
trång biÕn ®æi gen thùc sù bïng næ víi sù øng dông réng r·i trong s¶n xuÊt.
N¨m 1997, c©y trång biÕn ®æi gen lÇn ®Çu tiªn ®−îc th−¬ng m¹i hãa, diÖn tÝch
c©y trång biÕn ®æi gen th−¬ng m¹i ho¸ ®¹t gÇn 11 triÖu hecta (chñ yÕu lµ Mü,
Achentina, Auxtralia, Canada, Trung Quèc vµ Mehico). N¨m 2000, diÖn tÝch
c©y trång biÕn ®æi gen ®¹t 44,2 triÖu ha trªn 13 n−íc. N¨m 2001, chÌn thµnh
c«ng gen ®¬n tõ Arabidopsis vµo c©y cµ chua ®Ó t¹o ra c©y trång ®Çu tiªn cã thÓ
trång trªn ®Êt vµ n−íc mÆn. N¨m 2002, tæng gi¸ trÞ thÞ tr−êng toµn cÇu cña c©y
trång biÕn ®æi gen −íc tÝnh ®¹t kho¶ng 4,5 tû USD. N¨m 2004, diÖn tÝch c©y
trång biÕn ®æi gen ®¹t con sè 81 triÖu hecta. N¨m 2005 diÖn tÝch c©y biÕn ®æi
gen ®· ®¹t 90 triÖu hecta, diÖn tÝch c©y trång biÕn ®æi gen ®· t¨ng h¬n 50 lÇn
trong thËp kû ®Çu tiªn c©y biÕn ®æi gen ®−îc trång ®¹i trµ, sè n−íc trång c©y
biÕn ®æi gen t¨ng lªn tíi 21 n−íc. N¨m 2007 diÖn tÝch c©y CNSH tiÕp tôc t¨ng 2
-13-
Khãa luËn tèt nghiÖp Bïi V¨n HiÖu
con sè, ®¹t 12% t−¬ng ®−¬ng víi 12,3 triÖu hecta (30 triÖu mÉu). DiÖn tÝch ®Êt
canh t¸c c©y CNSH lªn tíi 114, 3 triÖu hecta [42].
Tæng diÖn tÝch ®Êt trång c©y CNSH tõ n¨m 1996 ®Õn n¨m 2007 ®¹t 690
triÖu hecta (1,7 tû mÉu), t¨ng 67 lÇn so víi n¨m 1996, ®−a CNSH trë thµnh
thµnh tùu ®−îc øng dông nhanh nhÊt trong n«ng nghiÖp. N¨m 2007 còng lµ
n¨m ®Çu tiªn tæng luü kÕ sè n«ng d©n quyÕt ®Þnh canh t¸c c©y trång CNSH v−ît
con sè 50 triÖu ng−êi [42].
H×nh 1: DiÖn tÝch c©y trång CNSH trªn toµn cÇu 1996-2007 (triÖu ha)
Tõ n¨m 1996 ®Õn n¨m 2007, tØ träng diÖn tÝch trång c©y CNSH cña c¸c
n−íc ®ang ph¸t triÓn so víi diÖn tÝch trång trªn toµn thÕ giíi t¨ng ®Òu mçi n¨m.
N¨m 2007, 43% diÖn tÝch c©y trång CNSH trªn toµn cÇu lµ ë c¸c n−íc ®ang ph¸t
triÓn (t¨ng 3% so víi tû träng 40% n¨m 2006), t−¬ng ®−¬ng víi 49,4 triÖu hecta.
Trong kho¶ng thêi gian tõ 2006 ®Õn 2007, diÖn tÝch trång c©y CNSH ë c¸c n−íc
®ang ph¸t triÓn (8,5 triÖu ha hay 21%) t¨ng cao h¬n so víi c¸c n−íc c«ng nghiÖp
(3,8 triÖu ha hay 6%). §¸ng chó ý lµ cã 5 n−íc lín vµ ®ang ph¸t triÓn ®−a c©y
trång CNSH vµo canh t¸c, n»m ë 3 ch©u lôc: Trung Quèc vµ Ên §é ë Ch©u ¸,
Achentina vµ Braxin ë ch©u Mü Latinh, Nam Phi ë ch©u Phi; tæng d©n sè ë c¶ 5
-14-
Khãa luËn tèt nghiÖp Bïi V¨n HiÖu
quèc gia nµy lµ 2,6 tØ ng−êi, chiÕm 40% d©n sè thÕ giíi, trong ®ã cã 1,3 tØ ng−êi
sèng hoµn toµn dùa vµo n«ng nghiÖp.
B¶ng 1: DiÖn tÝch trång c©y CNSH n¨m 2007 ph©n theo n−íc (®/v: triÖu ha)
TT N−íc trång DiÖn tÝch trång Lo¹i c©y biÕn ®æi gen
1* Hoa Kú 2* Achentina* 3* Brazin* 4* Canada* 5* Ên §é* §Ëu t−¬ng, ng«, b«ng, c¶i, ®u ®ñ, cá alfalfa §Ëu t−¬ng, ng«, b«ng §Ëu t−¬ng, ng« C¶i canola, ng«, ®Ëu t−¬ng B«ng
Céng Hoµ SÐc Bå §µo Nha
Slovakia
B«ng, cµ chua, thuèc l¸, ®u ®ñ, h¹t tiªu §Ëu t−¬ng Ng«, ®Ëu t−¬ng, b«ng §Ëu t−¬ng, ng« Ng« B«ng Ng« B«ng, ®Ëu t−¬ng B«ng, cÈm ch−íng Ng«, ®Ëu t−¬ng, c¶i canola Ng« Ng« Ng« Ng« Ng« Ng« Ng« Ng« 57.7 19.1 15.0 7.0 6.2 3.8 2.6 1.8 0.5 0.3 0.1 0.1 0.1 0.1 <0.1 <0.1 <0.1 <0.1 <0.1 <0.1 <0.1 <0.1 <0.1
6* Trung quèc* 7* Paraguay* 8* Nam phi* 9* Urugoay* 10* Philippin* 11* Australia* 12* Spain* 13* Mexico* 14 Colombia Chile 15 16 Ph¸p 17 Honduras 18 19 20 §øc 21 22 Romania 23 PhÇn Lan * 13 n−íc ®−îc coi lµ cã diÖn tÝch trång lín, tõ 50,000 hÐc-ta trë lªn
Trong sè c¸c c©y trång CNSH ®−îc ®−a vµo th−¬ng m¹i ho¸ tõ n¨m 1996
®Õn n¨m 2007 tÝnh tr¹ng chÞu thuèc trõ cá vÉn lµ tÝnh tr¹ng næi tréi. N¨m 2007,
tÝnh tr¹ng chÞu ®−îc thuèc trõ cá ®−îc triÓn khai trªn c©y ®Ëu t−¬ng, ng«, c¶i
canola, cá alfalfa víi diÖn tÝch trång lµ 72,7 triÖu hecta (chiÕm 63% diÖn tÝch
®Êt trång c©y CNSH toµn cÇu). N¨m 2007, Hoa Kú, Achentina, Braxin, Canada,
Ên §é vµ Trung Quèc tiÕp tôc lµ c¸c n−íc ®−a c©y trång CNSH vµo canh t¸c
-15-
Khãa luËn tèt nghiÖp Bïi V¨n HiÖu
nhiÒu nhÊt. Hoa Kú vÉn dÉn ®Çu thÕ giíi víi 57,7 triÖu hecta (chiÕm 50% diÖn
tÝch ®Êt trång c©y CNSH trªn thÕ giíi), do nhu cÇu ngµy cµng t¨ng cña thÞ tr−êng
ng« dïng trong s¶n xuÊt cån ethanol, diÖn tÝch trång ng« CNSH t¨ng tíi 40% -
møc t¨ng nµy ®· phÇn nµo bï l¹i møc gi¶m ®«i chót ®èi víi diÖn tÝch trång ®Ëu
t−¬ng vµ b«ng CNSH. §¸ng chó ý lµ 63% ng« CNSH, 78% b«ng CNSH vµ 37%
c¸c lo¹i c©y CNSH kh¸c ë Hoa Kú lµ c¸c s¶n phÈm mang gien ®én (c¸c s¶n
phÈm tËp hîp nhiÒu ®Æc tÝnh) cã chøa hai hay ba ®Æc tÝnh vµ ®em l¹i nhiÒu lîi
Ých trªn mét c©y trång. Xu thÕ cña t−¬ng lai lµ sö dông nh÷ng lo¹i c©y trång
CNSH mang gien ®én kiÓu nµy nh»m ®¸p øng nhu cÇu cña n«ng d©n vµ ng−êi
tiªu dïng.
Nh− vËy, trªn thÕ giíi t×nh h×nh ph¸t triÓn cña c©y trång biÕn ®æi gen rÊt
m¹nh mÏ, nã ®· ®em l¹i rÊt nhiÒu lîi Ých cho con ng−êi, ®Æc biÖt trong lÜnh vùc
n«ng nghiÖp: c©y trång biÕn ®æi gen cho phÐp t¹o ra nh−ng c©y trång cho n¨ng
suÊt cao, chÊt l−îng tèt, cã kh¶ n¨ng chèng chÞu s©u bÖnh, h¹n, mÆn...
2.2.4. T×nh h×nh s¶n xuÊt vµ sö dông c©y trång biÕn ®æi gen ë ViÖt Nam
HiÖn nay ë n−íc ta lÜnh vùc nghiªn cøu t¹o sinh vËt biÕn ®æi gen, ®Æc biÖt
lµ c©y trång biÕn ®æi gen ®ang ®−îc tiÕp cËn, ®Çu t− vµ triÓn khai nghiªn cøu,
øng dông víi sù chó träng ®Æc biÖt. NhiÒu gen quý cã gi¸ trÞ øng dông nh− n¨ng
suÊt cao, chÊt l−îng tèt, cã kh¶ n¨ng chèng chÞu ®· ®−îc ph©n lËp vµ nghiªn cøu
nh»m chuyÓn vµo c©y trång ®Ó t¹o nªn nh÷ng gièng lý t−ëng. CNSH ViÖt Nam
nãi chung vµ lÜnh vùc c©y trång biÕn ®æi gen nãi riªng ®· cã nh÷ng b−íc ph¸t
triÓn ®¸ng chó ý:
§· thµnh c«ng trong viÖc ph©n lËp ®o¹n promoter ®Æc tr−ng h¹t cña gen
Gluteline lóa vµ thiÕt kÕ c¸c gen Cry Xa21 vµo Plasmid pCAMBIA nh»m lµm
chñ nguån gen cã gi¸ trÞ ®Ó t¹o ra chñng vi khuÈn Agrobacterium cho viÖc
chuyÓn gen vµo thùc vËt. Hoµn thiÖn quy tr×nh chuyÓn gen CryIA(b), CryIA(c)
kh¸ng c«n trïng, gen Chitinase kh¸ng bÖnh nÊm, gen Xa21 kh¸ng bÖnh b¹c l¸
-16-
Khãa luËn tèt nghiÖp Bïi V¨n HiÖu
vi khuÈn vµ gen Bar kh¸ng thuèc diÖt cá th«ng qua vi khuÈn Agrobacterium vµo
c©y lóa gièng C71, gièng DT10 vµ DT13, c©y c¶i dÇu vµ b¾p c¶i.
§èi víi c©y lóa, ®· t¹o ®−îc lóa biÕn ®æi gen gièng Nµng H−¬ng Chî §µo
vµ 2 dßng c©y biÕn ®æi gen GUS A vµ hph.
KÕt qu¶ ®· thu ®−îc nh÷ng c©y trång biÕn ®æi gen vµ l−u gi÷ chóng trong
®iÒu kiÖn invitro vµ trong ®iÒu kiÖn nhµ kÝnh.
2.3. C©y ng« biÕn ®æi gen 2.3.2. T×nh h×nh s¶n xuÊt c©y ng« biÕn ®æi gen trªn thÕ giíi
Trªn thÕ giíi th× diÖn tÝch c©y ng« biÕn ®æi gen lµ lín thø 2 sau ®Ëu t−¬ng
víi diÖn tÝch 25,2 triÖu ha chiÕm 25% diÖn tÝch c©y trång biÕn ®æi gen trªn thÕ
giíi. C©y ng« biÕn ®æi gen ®−îc trång nhiÒu nhÊt ë Mü, Achentina, Brazin,
Canada, China, Nam Phi, Uruguay, Philippin…C©y ng« chñ yÕu ®−îc nghiªn
cøu, s¶n xuÊt vµ sö dông gièng cã tÝnh tr¹ng chèng chÞu thuèc trõ cá, kh¸ng s©u,
chÞu h¹n.
N¨m 2006, thªm mét sè n−íc thuéc liªn minh Ch©u ¢u (EU) lÇn ®Çu tiªn
®−a ng« Bt vµo trång ®¹i trµ. Tæng diÖn tÝch trång ng« Bt ë 5 n−íc (Ph¸p, Céng
Hoµ SÐc, Bå §µo Nha, §øc vµ Slovakia) ®· t¨ng trªn 5 lÇn tõ xÊp xØ 1.500 ha
n¨m 2005 lªn gÇn 8.500 ha n¨m 2006, diÖn tÝch nµy cßn t¨ng lªn rÊt nhiÒu trong
n¨m 2007.
Ng« lµ c©y trång ®−îc c¸c quèc gia trªn thÒ giíi cÊp phÐp sö dông lµm
thùc phÈm vµ thøc ¨n ch¨n nu«i nhiÒu nhÊt víi tæng sè 35 gièng kh¸c nhau, v−ît
h¼n c©y trång ®øng thø 2 lµ b«ng (víi 19 gièng kh¸c nhau). Gièng ng« ®−îc cÊp
phÐp nhiÒu nhÊt lµ ng« kh¸ng s©u bÖnh (MON 810) vµ ng« kh¸ng thuèc trõ cá
(NK603), c¶ hai gièng ng« ®−îc 18 n−íc cÊp phÐp.
N¨m 2006, theo −íc tÝnh cña h·ng ph©n tÝch thÞ tr−êng Cropnosis, thÞ
tr−êng c©y trång biÕn ®æi gen toµn cÇu trÞ gi¸ kho¶ng 6,15 tû ®« la, chiÕm 16%
thÞ tr−êng c©y trång ®−îc b¶o hé trªn toµn cÇu vµ chiÕm 21% thÞ tr−êng h¹t
-17-
Khãa luËn tèt nghiÖp Bïi V¨n HiÖu
gièng toµn cÇu. Trong ®ã gi¸ trÞ cña ng« biÕn ®æi gen chiÕm 39% t−¬ng ®−¬ng
kho¶ng 2,39 tû ®« la.
Do ®Æc tÝnh sinh lý cña c©y ng« nªn tû lÖ ®¹t kÕt qu¶ nghiªn cøu chuyÓn
gen trong c©y ng« trªn thÕ giíi lµ rÊt cao vµ ®¹t ®é an toµn cao nhÊt so víi c¸c
lo¹i c©y trång biÕn ®æi gen trªn thÕ giíi. Nh− vËy, víi viÖc ®−a c©y ng« biÕn ®æi
gen vµo s¶n xuÊt ®· gãp phÇn æn ®Þnh l−¬ng thùc trªn thÕ giíi trong hiÖn t¹i vµ
trong t−¬ng lai.
2.3.3. T×nh h×nh s¶n xuÊt vµ sö dông c©y ng« biÕn ®æi gen t¹i ViÖt Nam
ViÖt Nam lµ mét quèc gia víi nÒn kinh tÕ n«ng nghiÖp chñ yÕu. Ng« lµ
mét trong nh÷ng c©y l−¬ng thùc ®ãng vai trß quan träng. V× vËy, viÖc nghiªn
cøu c©y ng« biÕn ®æi gen ®ang ®−îc ®Çu t− m¹nh mÏ.
2 nghiÖm hai lo¹i b¾p chuyÓn gen trªn diÖn tÝch 1.000 mP
P ®Êt ë Q.12. Hai lo¹i ng«
Vµo ngµy 5/09/2005 thµnh phè Hå ChÝ Minh ®· tiÕn hµnh trång thö
chuyÓn gen nãi trªn lµ hai lo¹i ng« ®· ®−îc chuyÓn gen kh¸ng thuèc diÖt cá vµ
kh¸ng s©u [41].
KÕt qu¶ tõ viÖc trång thö nghiÖm b¾p chuyÓn gen sÏ ®−îc so s¸nh víi c¸c
gièng b¾p th«ng th−êng hiÖn ®ang ®−îc trång t¹i thµnh phè Hå ChÝ Minh. Trªn
c¬ së ®ã, c¸c nhµ khoa häc sÏ ®Ò xuÊt nªn hay kh«ng nªn øng dông trång ng«
chuyÓn gen ë ViÖt Nam.
§Æc biÖt míi ®©y, ®Ò tµi/dù ¸n t¹o ng« biÕn ®æi gen kh¸ng s©u vµ kh¸ng
thuèc diÖt cá ®−îc nghiªn cøu t¹i viÖn Di TruyÒn N«ng NghiÖp do TS. NguyÔn
V¨n §ång chñ nhiÖm ®Ò tµi, môc tiªu lµ t¹o dßng ng« kh¸ng s©u vµ kh¸ng thuèc
diÖt cá cã n¨ng suÊt cao vµ thÝch nghi tèt víi c¸c vïng sinh th¸i kh¸c nhau. §©y
lµ ®Ò tµi/dù ¸n thuéc ch−¬ng tr×nh träng ®iÓm “Ph¸t triÓn øng dông c«ng nghÖ
sinh häc trong lÜnh vùc N«ng nghiÖp” thùc hiÖn tõ th¸ng 10 n¨m 2006.
2.4. Nh÷ng vÊn ®Ò liªn quan ®Õn c©y trång kh¸ng thuèc trõ cá vµ mét sè dßng ng« mang gen kh¸ng thuèc trõ cá 2.4.1. Mét sè vÊn ®Ò liªn quan ®Õn c©y trång kh¸ng thuèc trõ cá
-18-
Khãa luËn tèt nghiÖp Bïi V¨n HiÖu
Khi ®−îc hái, bÊt cø ng−êi n«ng d©n nµo còng tr¶ lêi r»ng cá d¹i lu«n lµ
mét vÊn ®Ò g©y lo l¾ng cho hä. Cá d¹i kh«ng chØ c¹nh tranh víi c©y trång ®Ó lÊy
n−íc, chÊt dinh d−ìng, ¸nh n¾ng mÆt trêi, kho¶ng kh«ng ®Ó mäc mµ cßn lµ n¬i
c− tró cho c«n trïng vµ c¸c lo¹i s©u bä g©y bÖnh, g©y t¾c nghÏn hÖ thèng t−íi
tiªu, lµm gi¶m sót chÊt l−îng mïa mµng, vµ cßn ®em theo c¶ h¹t gièng cá vµo
c©y trång ®−îc thu ho¹ch.
Th«ng th−êng, n«ng d©n sÏ cµy bõa tr−íc khi trång trät nh»m lµm gi¶m
sè l−îng cá d¹i trªn c¸nh ®ång. Sau ®ã hä phun thuèc diÖt cá theo diÖn réng ®Ó
lµm cho cá d¹i kh«ng thÓ mäc ®−îc ngay tr−íc khi geo h¹t. BiÖn ph¸p diÖt cá
nµy rÊt tèn kÐm vµ viÖc cµy xíi ®Êt sÏ khiÕn giã vµ n−íc lµm xãi mßn líp ®Êt
phÝa trªn bÒ mÆt g©y hËu qu¶ nghiªm träng kÐo dµi cho m«i tr−êng. Ngoµi ra,
mét sè thuèc diÖt cá l¹i tån t¹i dai d¼ng trong m«i tr−êng. Sù t¹o thµnh c¸c c©y
trång kh¸ng thuèc diÖt cá lµ mét c¸ch ®Ó kh¾c phôc c¸c yÕu ®iÓm ®ã.
Mét sè c¶i biÕn sinh häc kh¸c nhau cã thÓ lµm cho c©y trång trë nªn
kh¸ng thuèc diÖt cá cã thÓ nªu ra lµ:
– T¹o ra mét lo¹i protein míi gi¶i ®éc thuèc diÖt cá.
– Thay ®æi protein môc tiªu cña thuèc diÖt cá do vËy mµ protein nµy sÏ
kh«ng bÞ t¸c ®éng bëi thuèc diÖt cá.
– S¶n xuÊt qu¸ møc protein môc tiªu nh¹y c¶m thuèc diÖt cá sao cho vÉn cã
d− ®Ó duy tr× c¸c chøc n¨ng tÕ bµo bÊt chÊp sù cã mÆt cña thuèc diÖt cá.
– Cho c©y kh¶ n¨ng bÊt ho¹t vÒ mÆt chuyÓn ho¸ thuèc diÖt cá.
Ba c¸ch ®Çu tiªn lµ nh÷ng c¸ch phæ biÕn nhÊt mµ c¸c nhµ khoa häc dïng
®Ó ph¸t triÓn lo¹i c©y trång chÞu ®−îc thuèc diÖt cá (b¶ng 2).
Trong sè c¸c c©y trång CNSH ®−îc ®−a vµo th−¬ng m¹i hãa tõ n¨m 1996
®Õn n¨m 2007 tÝnh tr¹ng chÞu thuèc trõ cá vÉn lµ tÝnh tr¹ng næi tréi. N¨m 2007,
tÝnh tr¹ng chÞu ®−îc thuèc trõ cá ®−îc triÓn khai trªn c©y ®Ëu t−¬ng, ng«, c¶i
canola, cá alfalfa víi diÖn tÝch trång lµ 72,7 triÖu hecta (chiÕm 63% diÖn tÝch ®Êt
trång c©y CNSH toµn cÇu). C¸c gièng phæ biÕn nhÊt lµ chÞu ®−îc thuèc
-19-
Khãa luËn tèt nghiÖp Bïi V¨n HiÖu
glyphosate vµ glufosinate [42]. B¶ng d−íi ®©y cho thÊy c¸c n−íc ®· chuÈn y c¸c
lo¹i c©y trång chÞu ®−îc thuèc diÖt cá chÝnh dïng lµm thùc phÈm
B¶ng 2: Mét sè vÝ dô vÒ sù kh¸ng thuèc diÖt cá
Thuèc diÖt cá C¬ chÕ ph¸t triÓn tÝnh kh¸ng thuèc diÖt cá
TÝnh kh¸ng thuèc lµ do sù thay ®æi gen psbA m· ho¸ Triazin
cho ®Ých cña thuèc diÖt cá, protein lôc n¹p D-1.
C¸c gen m· ho¸ c¸c d¹ng kh¸ng cña enzym axetolactat Sulfonylure
synthetaza ®· ®−îc ®−a vµo lóa, c©y d−¬ng, c©y lanh,
c©y c¶i dÇu
C¸c gièng cã c¸c d¹ng enzym axetolactat synthetaza Imidazolimon
kh¸ng ®· ®−îc chän läc trong nu«i cÊy m«.
C¸c thuèc diÖt cá nµy k×m h·m enzym axetyl coenzym Aryloxphenoxypropio
A carboxylaza. Sù kh¸ng ®−îc chän läc trong nu«i cÊy nat
m«, cã ®−îc lµ do enzym thay ®æi kh«ng nh¹y c¶m xyclohexanedion
thuèc diÖt cá hoÆc ph©n huû thuèc diÖt cá.
TÝnh kh¸ng do s¶n xuÊt qu¸ møc EPSPS, ®Ých cña thuèc
diÖt cá nµy. TÝnh kh¸ng thuèc ®−îc c¶i biÕn b»ng biÕn Glyphosat
n¹p ®Æc tr−ng víi gen EPSPS kh¸ng glyphosat vµ thuèc
l¸ víi gen glyphosat oxidoreductaza m· ho¸ enzym ph©n
huû glyphosat.
C©y b«ng vµ thuèc l¸ cã tÝnh kh¸ng ®−îc t¹o thµnh b»ng
tfdA biÕn n¹p víi gen tõ Alcaligenes m· ho¸ Axit
dioxygenaza ph©n huû chÊt diÖt cá nµy. phenoxycarboxylic
H¬n 20 lo¹i c©y kh¸c nhau ®· ®−îc biÕn n¹p víi gen bar (nh− 2,4-D vµ 2,4,5-T)
tõ Streptomyces hygroscopicus hoÆc gen pat tõ S.
Viridochromogenes. Phosphinothrixin axetyltransferaza Glufosinat
mµ c¸c gen nµy m· ho¸ khö ®éc thuèc diÖt cá nµy. (phosphinothrixin)
-20-
Khãa luËn tèt nghiÖp Bïi V¨n HiÖu
C©y trång N−íc
Canola ¤xtralia, Cana®a, NhËt b¶n, Hoa kú, Achentina
B«ng Achentina, ¤xtralia, Cana®a, NhËt B¶n, Hoa kú
Ng«
Achentina, ¤xtralia, Cana®a, Liªn minh Ch©u ©u, NhËt B¶n, Thuþ sü, Anh, Hoa kú
Lóa Hoa kú
§Ëu t−¬ng
Achentina, ¤xtralia, Braxin, Cana®a, NhËt B¶n, Hµn Quèc, Mªxic«, Hµ Lan, Nga, Nam Phi, Thuþ sü, Hoa kú, Uruguay
¤xtralia, Cana®a, NhËt B¶n, Hoa kú
Cñ c¶i ®−êng
2.4.2. Mét sè gen kh¸ng thuèc trõ cá Phosphinothricin-N-acetyltransferase (PAT), Bar
(cid:153) Gen Phosphinothricin-N-acetyltransferase (PAT)
Gen Phosphinothricin-N-acetyltransferase (PAT) lµ mét trong nh÷ng gen
kh¸ng thuèc trõ cá ®· ®−îc chuyÓn vµo mét sè c©y trång nh− ng« vµ ®Ëu t−¬ng.
Gen nµy chèng chÞu ®−îc víi thuèc trõ cá glufosinate, ®−îc ph©n lËp tõ mét lo¹i
x¹ khuÈn ®Êt Streptomycesviridochromogenes. Gen PAT cho phÐp s¶n sinh ra
enzyme phosphinothricine N-acetyltransferase (PAT), enzym nµy cã kh¶ n¨ng
chèng chÞu ®−îc glufosinate.
(cid:153) Gen Bar
Gen Bar lµ mét trong c¸c gen kh¸ng thuèc trõ cá ammonium-glufosinate
(hay phosphinothricin). Ammonium-glufosinate lµ thµnh phÇn ho¹t tÝnh cña
thuèc diÖt cá Basta, Finale, Buster, Harvest vµ Liberty, ®©y lµ lo¹i thuèc trõ cá
cã hÖ thèng ph©n lo¹i râ nÐt mµ nã ®· ®−îc sö dông réng r·i ®Ó kiÓm so¸t kh«ng
chän läc ®èi víi c¸c loµi cá d¹i 1 n¨m vµ l©u n¨m, lµ chÊt diÖt cá cã phæ réng vµ
®−îc sö dông ®Ó kiÓm so¸t vïng cá d¹i réng lín trong qu¸ tr×nh canh t¸c.
Glufosinate lµ hîp chÊt tù nhiªn ®−îc ph©n lËp tõ 2 loµi nÊm Streptomyces, øc
-21-
Khãa luËn tèt nghiÖp Bïi V¨n HiÖu
chÕ ho¹t tÝnh cña enzym tæng hîp glutamin, enzym cÇn thiÕt cho sù t¹o thµnh
glutamin vµ ®éc tÝnh ammonia. ViÖc sö dông glufosinate dÉn ®Õn lµm gi¶m hµm
l−îng glutamin vµ lµm t¨ng ammonia trong m« thùc vËt. §iÒu nµy lµm cho qu¸
tr×nh quang hîp ngõng vµ c©y chÕt sau vµi ngµy.
Gen Bar m· ho¸ cho enzym phosphinothricin- N- acetyltransferase (PAT)
®−îc ph©n lËp tõ chñng Streptomyces hygroscopicus HP632. Ngoµi viÖc cung
cÊp tÝnh tr¹ng kh¸ng thuèc trõ cá, gen m· ho¸ enzym PAT cßn ®−îc sö dông
nh− marker chän läc ®Ó x¸c ®Þnh c¸c c©y ®· chuyÓn gen trong suèt qu¸ tr×nh t¸i
sinh nu«i cÊy m«. lµm cho thµnh phÇn ho¹t tÝnh trong thuèc trõ cá glufosinate lµ
phosphinothricin kh«ng ho¹t ®éng, cho phÐp c¸c c©y trång sèng sãt trong khi
mµ øng dông kh¸c cña glufosinate cã thÓ g©y chÕt.
2.4.3. Mét sè dßng ng« mang gen kh¸ng thuèc diÖt cá
(cid:153) Event Bt16
Ph−¬ng ph¸p chuyÓn n¹p: Sö dông sóng b¾n gen.
Dßng Bt16 ®−îc c¶i biÕn di truyÒn ®Ó kh¸ng thuèc trõ cá ammonium-
glufosinate (hay phosphinothricin), thμnh phÇn ho¹t tÝnh cña thuèc diÖt cá
Basta, Finale, Buster, Harvest vμ Liberty. Ammonium-glufosinate lμ mét chÊt
diÖt cá cã phæ réng, kh«ng chän läc. Nã ®−îc sö dông ®Ó kiÓm so¸t cá d¹i sau
khi c©y mäc hoÆc kiÓm so¸t th¶m thùc vËt mäc trªn ®Êt mμ chóng kh«ng sö
dông cho môc ®Ých gieo trång. Nã cã thÓ bÞ vi khuÈn ph©n huû ë møc ®é cao,
kh«ng cã ho¹t tÝnh d− thõa, vμ møc ®é ®éc tÝnh ®èi víi con ng−êi vμ ®éng vËt
rÊt thÊp. Kh¶ n¨ng chèng chÞu glufosinate trong dßng nμy lμ do gen bar, gen
nμy m· ho¸ cho enzym phosphinothricin-N-acetyltransferase (PAT) mμ cho
phÐp c¸c c©y trång nμy sèng sãt trong khi mμ øng dông kh¸c cña glufosinate cã
thÓ g©y chÕt.
-22-
Khãa luËn tèt nghiÖp Bïi V¨n HiÖu
H×nh 2: CÊu tróc pDPG165 sö dông trong biÕn n¹p event Bt16
(cid:153) Event GA21
Ph−¬ng ph¸p chuyÓn n¹p: Sö dông sóng b¾n gen.
Dßng GA21 lμ ng« Roundup Ready, chèng chÞu thuèc trõ cá glyphosate.
Glyphosate lμ 1 lo¹i thuèc trõ cá ®−îc biÕt sau nμy, ®©y lμ lo¹i thuèc trõ cá cã
hÖ thèng ph©n lo¹i râ nÐt mμ nã ®· ®−îc sö dông réng r·i ®Ó kiÓm so¸t kh«ng
chän läc ®èi víi c¸c loμi cá d¹i 1 n¨m vμ l©u n¨m. Dßng GA21 cã kh¶ n¨ng
kh¸ng thuèc trõ cá nhê chuyÓn gen EPSPS néi sinh cña ng« vμo genome cña
c©y, enzym m· ho¸ cña gen nμy kh«ng nh¹y víi sù khö ho¹t tÝnh bëi
glyphosate.
H×nh 3: §o¹n ADN cña cÊu tróc pDPG434 sö dông trong biÕn n¹p ®Ó t¹o
ra event GA21
(cid:153) Event T14, T25
Ph−¬ng ph¸p chuyÓn n¹p: ChuyÓn ADN trùc tiÕp vμo genome cña c©y.
T14 vμ T25 ®· ®−îc c¶i biÕn di truyÒn ®Ó chèng chÞu ammonium
glufosinate (phosphinothricin), thμnh phÇn ho¹t tÝnh cña c¸c lo¹i thuèc trõ cá
cña c¸c h·ng Basta, Finale, Buster, Harvest vμ Liberty. TÝnh kh¸ng thuèc trõ cá
ammonium glufosinate cã ®−îc lμ do gen PAT.
-23-
Khãa luËn tèt nghiÖp Bïi V¨n HiÖu
H×nh 4: Plasmid p35S/Ac ®· ®−îc sö dông ®Ó t¹o ra event T14, T25
(cid:153) Event TC1507
Ph−¬ng ph¸p biÕn n¹p: ChuyÓn n¹p nhê sóng b¾n gen.
TC1507 ®−îc c¶i tiÕn di truyÒn ®Ó kh¸ng c«n trïng vμ thuèc trõ cá
glufosinate. Dßng nμy chøa gen cry1F - lμ protein cry1F cña c«n trïng cã nguån
gèc tõ B. thuringiensis var. aizawai. Protein nμy cã hiÖu qu¶ trong viÖc kiÓm
so¸t Êu trïng cña nhiÒu loμi s©u bä phæ biÕn ë ng« ch¼ng h¹n nh− s©u ®ôc th©n
ng« Ch©u ¢u, s©u ®ôc th©n ng« T©y B¾c, s©u ngμi ®en, s©u c¾n giÐ. Dßng
TC1507 cã kh¶ n¨ng chèng chÞu ammonium glufosinate lμ do chuyÓn gen PAT
vμo genome cña dßng nμy.
H×nh 5: Plasmid PHI8999A ®· ®−îc sö dông ®Ó t¹o ra event TC1507
2.5. C¸c ph−¬ng ph¸p ph¸t hiÖn c©y trång biÕn ®æi gen
ViÖc nhËn biÕt GMC cã rÊt nhiÒu øng dông nh− ®Ó ®¸nh gi¸ møc ®é s¹ch
cña C©y gièng hay ®èi víi viÖc b¾t buéc d¸n nh·n thùc phÈm ë mét sè quèc gia.
Cã rÊt nhiÒu kü thuËt ®· vµ ®ang ®−îc ph¸t triÓn ®Ó ®¸p øng nhu cÇu nµy. NhËn
biÕt GMC vµ dÉn xuÊt cña nã cã thÓ ®−îc thùc hiÖn nhê sù nhËn biÕt ph©n tö mµ
nh÷ng ph©n tö nµy cã nguån gèc tõ gen ®−îc chÌn [13, 14]. Cã 3 ph−¬ng ph¸p
®Ó x¸c ®Þnh GMC ®ã lµ:
-24-
Khãa luËn tèt nghiÖp Bïi V¨n HiÖu
1. Ph−¬ng ph¸p khuÕch ®¹i dùa trªn c¬ së nucleotit:
Bao gåm kü thuËt PCR (Polymerase Chain Reaction), ph¶n øng LCP
(Ligase Chain Reaction), khuÕch ®¹i dùa trªn tr×nh tù acid nucleic (NASBA),
c¸c kü thuËt RFLP, AFLP, RAPD...
- Dùa trªn c¬ së ARN: Nhê vµo sù liªn kÕt ®Æc hiÖu gi÷a ph©n tö ARN vµ
ph©n tö ADN hoÆc ARN tæng hîp (gäi lµ primer). Th−êng th× sù liªn kÕt gi÷a
ARN vµ primer sÏ dÉn ®Õn sù chuyÓn ho¸ ph©n tö ARN thµnh ADN th«ng qua
qu¸ tr×nh sao chÐp ng−îc. Cuèi cïng ADN cã thÓ ®−îc nh©n lªn nhê kü thuËt
PCR. HoÆc ARN ®−îc phiªn m· thµnh hµng tr¨m b¶n coppy nh− lµ mét mÉu
chuÈn trong kü thuËt NASBA [13].
- Dùa trªn c¬ së ADN: Chñ yÕu lµ nhê vµo sù nhËn ®«i cña ADN ®Æc
hiÖu víi kü thuËt PCR. §©y lµ kü thuËt ®−îc sö dông phæ biÕn ë c¸c phßng thÝ
nghiÖm bëi ®ã lµ mét ph−¬ng ph¸p nh¹y vµ cã tÝnh ®Æc hiÖu cao, cã thÓ ph¸t
hiÖn ®−îc ADN ngay ë hµm l−îng rÊt thÊp. Kü thuËt PCR kh«ng nh÷ng ®−îc sö
dông ®Ó x¸c ®Þnh GMC mµ cßn ®−îc sö dông vµo môc ®Ých ®Þnh l−îng.
2. Ph−¬ng ph¸p dùa trªn c¬ së protein:
Bao gåm ®iÖn di SDS mét chiÒu, ®iÖn di SDS hai chiÒu, ph©n tÝch
Western-blot, kü thuËt ELISA (Enzym Linked Immunosorbent Assays). Lµ
ph−¬ng ph¸p nhê vµo sù liªn kÕt ®Æc hiÖu gi÷a protein vµ kh¸ng thÓ. Kh¸ng thÓ
chÝnh lµ t¸c nh©n b¶o vÖ c¬ thÓ chèng l¹i sù x©m nhËp cña vi khuÈn vµ virus, khi
kh¸ng thÓ nhËn ra ph©n tö l¹ th× nã sÏ liªn kÕt víi ph©n tö nµy vµ trong c¸c ph©n
tÝch nhËn biÕt GMC th× sù phøc t¹p cña mèi liªn kÕt lÇn l−ît ®−îc nhËn biÕt nhê
ph¶n øng h×nh thµnh s¾c tè. §©y chÝnh lµ kü thuËt ELISA. Tuy nhiªn kh¸ng thÓ
cã thÓ kh«ng ®−îc sinh ra nÕu kh«ng nhËn ®−îc protein s¹ch. Protein nµy ph¶i
®−îc lµm s¹ch ngay tõ b¶n th©n GMC hoÆc cã thÓ ®−îc tæng hîp trong th− viÖn
nÕu nh− biÕt thµnh phÇn cña acid amin cña protein. Ph−¬ng ph¸p nµy thÝch hîp
víi viÖc ph©n tÝch ®èi víi nguyªn liÖu th« [13, 19].
-25-
Khãa luËn tèt nghiÖp Bïi V¨n HiÖu
3. Ph−¬ng ph¸p dùa trªn sù ph¸t hiÖn ho¹t tÝnh cña enzym:
Ph−¬ng ph¸p nµy kh«ng thÝch hîp víi c¸c thùc phÈm ®· qua chÕ biÕn bëi
v× lóc nµy protein ®· bÞ biÕn tÝnh [17].
Cho ®Õn nay c¸c ph−¬ng ph¸p chÝnh ®Ó ph¸t hiÖn GMC vµ c¸c dÉn suÊt
cña nã chñ yÕu dùa trªn sù ph¸t hiÖn ADN, trong khi chØ cã mét vµi ph−¬ng
ph¸p ®−îc ph¸t triÓn ®Ó ph¸t hiÖn ARN hoÆc protein.
2.6. T×nh h×nh nghiªn cøu sö dông PCR ®Ó x¸c ®Þnh c©y trång biÕn ®æi gen
RÊt nhiÒu nghiªn cøu sö dông kü thuËt PCR ®Ó x¸c ®Þnh GMC ®· ®−îc
tiÕn hµnh. Kü thuËt PCR còng ®· ®−îc øng dông rÊt nhiÒu ®Ó ph¸t hiÖn ng« GM
vµ ®Ëu t−¬ng GM. §Ó nhËn biÕt ®Ëu t−¬ng Roundup Ready GM vµ ng« Bt 176,
c¸c nhµ khoa häc §µi Loan ®· sö dông c¸c cÆp måi 35S, NOS, EPSPS vµ LE ®Ó
ph¸t hiÖn ®o¹n promoter 35S, ®o¹n terminator NOS, vïng gen cÊu tróc EPSPS
(enolpyruvyl Shikinate-3-phosphate Synthase) cña ®Ëu t−¬ng Roundup Ready vµ
gen lectin. Sö dông c¸c cÆp måi Cry IA(b), CDPK-cry, IVR ®Ó nhËn biÕt gen
Delta-Endotoxin (®o¹n 184 bp vµ 211bp) vµ gen Invertase trong ng« Bt 176.
Còng víi 2 ®èi t−îng nghiªn cøu trªn vµ sö dông c¸c cÆp måi 35S1/2,
SPA/B, LE1/2, Cry1/2, IVR1/2, mét nghiªn cøu kh¸c cña c¸c nhµ khoa häc Anh
vÒ kh¶ n¨ng nhËn biÕt ng« GM vµ ®Ëu t−¬ng GM trong thùc phÈm nhê PCR
còng ®· ®−îc chÊp nhËn [15]. Mét øng dông kh¸c cña PCR lµ ®Þnh l−îng GMC
còng ®· ®−îc c¸c nhµ khoa häc Argentina nghiªn cøu thö nghiÖm trªn ®èi t−îng
lµ ng« Bt 176. ë nghiªn cøu nµy, c¸c mÉu ng« GM ®−îc trén lÉn víi ng« kh«ng
biÕn ®æi gen ë c¸c tû lÖ kh¸c nhau (0,5%, 1%, 2%, 5%, 20%) vµ nghiªn cøu nµy
cho thÊy ë hµm l−îng GMC lín h¬n 5% cho ph¶n øng d−¬ng tÝnh [14].
2.7. §a d¹ng di truyÒn
C¸c c¸ thÓ trong mét quÇn thÓ th−êng cã bé gen (genom) kh¸c nhau. Sù
®a d¹ng vÒ bé gen cã ®−îc lµ do c¸c c¸ thÓ cã c¸c gen kh¸c nhau, dï chØ lµ rÊt
Ýt. Nh÷ng alen kh¸c nhau cña mét gen cã thÓ ¶nh h−ëng ®Õn sù ph¸t triÓn vµ ®Æc
®iÓm sinh lý cña mçi c¸ thÓ theo c¸ch kh¸c nhau. Nh÷ng c©y trång ®−îc lai
-26-
Khãa luËn tèt nghiÖp Bïi V¨n HiÖu
ghÐp hay nh÷ng ®éng vËt ®−îc lai t¹o ph¸t huy nh÷ng gen cña m×nh ®Ó h×nh
thµnh nh÷ng gièng c©y con cho n¨ng suÊt cao, cã kh¶ n¨ng chèng chÞu s©u
bÖnh, cá d¹i tèt.
Trong qu¸ tr×nh sinh s¶n h÷u tÝch, kiÓu gen cña c¸c c¸ thÓ trong quÇn thÓ
sÏ t¨ng lªn do kÕt qu¶ t¸i tæ hîp hoÆc do ®ét biÕn.
C¸c gen ®a h×nh lµ nguyªn nh©n dÉn ®Õn sùu tån t¹i c¸c kÓu gen dÞ hîp
trong quÇn thÓ. Sù kh¸c biÖt vÒ kiÓu gen cña c¸c c¸ thÓ trong quÇn thÓ nµy thÝch
nghi h¬n so víi nh÷ng thay ®æi cña m«i tr−êng.
2.7.1. ý nghÜa cña viÖc nghiªn cøu ®a d¹ng di truyÒn
§a d¹ng sinh häc rÊt cÇn thiÕt cho sù tån t¹i cña c¸c loµi, c¸c quÇn x· tù
nhiªn vµ rÊt quan träng ®èi víi con ng−êi. Sù ®a d¹ng di truyÒn lµ cÇn thiÕt cho
tÊt c¶ c¸c sinh vËt ®Ó duy tr× kh¶ n¨ng sinh s¶n, kh¶ n¨ng ®Ò kh¸ng víi c¸c lo¹i
dÞch bÖnh vµ kh¶ n¨ng thÝch nghi víi nh÷ng thay ®æi cña m«i tr−êng sèng. Sù ®a
d¹ng di truyÒn ë c©y trång vµ vËt nu«i cã gi¸ trÞ ®Æc bÖt trong chän t¹o gièng
c©y trång, vËt nu«i míi phôc vô cho lîi Ých cña con ng−êi.
2.7.2. Mét sè ph−¬ng ph¸p nghiªn cøu ®a d¹ng di truyÒn 2.7.2.1. Ph−¬ng ph¸p sö dông c¸c chØ tiªu h×nh th¸i.
C¸c chØ tiªu h×nh th¸i trong ph©n lo¹i sinh vËt ®−îc sö dông tõ rÊt sím.
Tuy nhiªn, nh÷ng ®Æc tÝnh h×nh th¸i ®−îc sö dông nh− lµ mét chØ thÞ di truyÒn lµ
nh÷ng tÝnh tr¹ng do mét locus gen quy ®Þnh vµ sù thÓ hiÖn cña chóng kh«ng bÞ
¶nh h−ëng cña nh©n tè m«i tr−êng. Trong tr−êng hîp nµy dÊu chØ tiªu h×nh th¸i
®−îc sö dông nh− mét chØ thÞ di truyÒn.
ViÖc sö dông c¸c chØ tiªu h×nh th¸i trong ph©n tÝch ®a d¹ng di truyÒn cã
nh÷ng h¹n chÕ:
– Sè l−îng c¸c chØ tiªu h×nh th¸i cã h¹n
– Chóng bÞ ¶nh h−ëng bëi qu¸ tr×nh t−¬ng t¸c gen vµ c¸c nh©n tè m«i
tr−êng (Staub J.E. vµ Crubaugh., 1995).
-27-
Khãa luËn tèt nghiÖp Bïi V¨n HiÖu
– C¸c chØ tiªu h×nh th¸i thÓ hiÖn nh÷ng giai ®o¹n nhÊt ®Þnh cña qu¸ tr×nh
ph¸t triÓn c¸ thÓ (Paterson., 1996).
2.7.2.2. Ph−¬ng ph¸p sö dông c¸c chØ thÞ ph©n tö
(cid:153) ChØ thÞ RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism):
Ph−¬ng ph¸p RFLP (§a h×nh chiÒu dµi c¸c ®o¹n ADN c¾t giíi h¹n) do
Botstein vµ cs, ph¸t minh n¨m 1980. Nguyªn lý cña ph−¬ng ph¸p nµy lµ: ADN
cña bé gen sau khi ®−îc xö lý b»ng enzym giíi h¹n sÏ bÞ c¾t thµnh nh÷ng ®o¹n
cã kÝch th−íc kh¸c nhau. Sau khi ®iÖn di, c¸c ®o¹n nµy ph©n bè ë nh÷ng vÞ trÝ
kh¸c nhau trªn gel, qua biÕn tÝnh c¸c ®o¹n nµy sÏ trë thµnh sîi ®¬n vµ ®−îc
chuyÓn lªn mµng celulose hoÆc nylon víi vÞ trÝ kh«ng thay ®æi. Trong qu¸ tr×nh
lai ADN tiÕp theo trªn mÉu dß (thùc chÊt lµ mét ®o¹n ADN) sÏ b¾t cÆp víi
nh÷ng ®o¹n cã tr×nh tù nucleotic t−¬ng ®ång víi nã trªn mµng lai – kü thuËt lai
Southern. Khi ph©n tÝch ®a h×nh di truyÒn, sù ®a d¹ng cña c¸c c¸ thÓ ®−îc thÓ
hiÖn qua sù kh¸c nhau cña c¸c b¨ng lai trªn mµng lai.
(cid:153) ChØ thÞ PCR (Polymerase Chain Reaction):
Ph¶n øng PCR dùa trªn nguyªn t¾c tæng hîp ADN nhê enzym ADN
Polymerase chÞu nhiÖt (Taq, Pfu…) víi sù cã mÆt cña ®o¹n ADN khu«n mÉu,
2+ P
ADN måi, c¸c nucleotit (dNTP) gåm dATP, dCTP, dGTP, dTTP vμ ion MgP
ho¹t ®éng nh− mét chÊt xóc t¸c.
Ph¶n øng PCR gåm c¸c giai ®o¹n sau:
o ®Õn kho¶ng 90-98P PC, nhiÖt ®é nµy th−êng lín h¬n Tm cña ph©n tö ADN, do ®ã
– Giai ®o¹n biÕn tÝnh (Denaturation): Hçn hîp ph¶n øng ®−îc lµm nãng
c¸c ph©n tö ADN m¹ch kÐp ®−îc t¸ch nhau ra hoµn toµn t¹o nªn sîi ®¬n dïng
lµm khu«n cho c¸c ®o¹n måi vµ taq ADN polymerase ho¹t ®éng. Giai ®o¹n nµy
th−êng kÐo dµi trong vßng 30 gi©y ®Õn 1 phót.
– Giai ®o¹n g¾n måi (Annealing): NhiÖt ®é cña giai ®o¹n nµy ph¶i thÝch
hîp cho qu¸ tr×nh b¾t cÆp bæ sung cña måi víi chuçi ADN khu«n, nã nhá h¬n
-28-
Khãa luËn tèt nghiÖp Bïi V¨n HiÖu
o PC. T¹i ®©y, c¸c ®o¹n måi sÏ g¾n bæ sung víi
Tm cña 2 ®o¹n måi kho¶ng 2-3P
tr×nh tù bæ trî trªn c¸c ph©n tö ADN khu«n. Thêi gian cña giai ®o¹n nµy th−êng
kÐo dµi tõ 30 gi©y ®Õn 1 phót.
– Giai ®o¹n tæng hîp (Extention): NhiÖt ®é ë giai ®o¹n nµy ®−îc t¨ng lªn
®Õn nhiÖt ®é thÝch hîp cho ADN polymerase ho¹t ®éng tæng hîp nªn sîi míi tõ
o lµ kho¶ng 72P
PC. Thêi gian cña giai ®o¹n nµy phô thuéc vµo ®é dµi cña chuçi
phøc hîp måi-khu«n. §èi víi Taq ADN polymerse th× nhiÖt ®é ho¹t ®éng tèi −u
ADN, th−êng kÐo dµi tõ 30 gi©y ®Õn vµi phót.
Mét chu kú ph¶n øng víi 3 giai ®o¹n trªn sÏ ®−îc lÆp l¹i nhiÒu lÇn vµ mçi
o th−êng lµ 20-40 chu kú. Sau khi chu kú cuèi cïng kÕt thóc, gi÷ nhiÖt ®é ë 72P
PC
lÇn lÆp l¹i lµm t¨ng gÊp ®«i l−îng mÉu cña lÇn tr−íc. Sè chu kú ph¶n øng
o ®¬n ADN xo¾n l¹i t¹o s¶n phÈm PCR. Cuèi cïng, nhiÖt ®é ®−îc h¹ xuèng 4P
PC
trong kho¶ng 5-10 phót ®Ó tÊt c¶ c¸c sîi ADN ®−îc tæng hîp xong vµ c¸c sîi
®Ó b¶o qu¶n.
Kü thuËt PCR ®−îc øng dông vµo nhiÒu lÜnh vùc kh¸c nhau nh−: s¶n xuÊt
mÉu dß, ph©n lËp gen, nh©n béi ARN, nhËn d¹ng ë møc ®é ph©n tö, x¸c ®Þnh vµ
chÈm ®o¸n bÖnh... Tuú theo b¶n chÊt cña nh÷ng ®o¹n måi sö dông mμ cã nh÷ng
hÖ thèng chØ thÞ ®Æc tr−ng gåm chØ thÞ RAPD, SSR, AFLP…
-29-
Khãa luËn tèt nghiÖp Bïi V¨n HiÖu
H×nh 6: C¸c giai ®o¹n cña mét chu kú PCR
(cid:153) ChØ thÞ RAPD (Random Amplified Polymorphism ADN)
RAPD (§a h×nh c¸c ®o¹n khuÕch ®¹i ngÉu nhiªn) ®−îc ®Þnh nghÜa lµ sù
®a h×nh c¸c ®o¹n ADN ®−îc khuÕch ®¹i ngÉu nhiªn. PCR_RAPD thùc hiÖn dùa
trªn c¬ së sù b¾t cÆp ngÉu nhiªn cña c¸c måi ®¬n ng¾n (10 nucleotide) víi m¹ch
khu«n. C¸c ®o¹n måi oligonucleotide nÕu b¾t cÆp ngÉu nhiªn víi c¶ hai m¹ch
®èi diÖn cña m¹ch khu«n ADN trong kho¶ng c¸ch cã thÓ khuÕch ®¹i ®−îc (d−íi
3000bp) sÏ cho ra nh÷ng ®o¹n ADN cã kÝch th−íc kh¸c nhau sau khi khuÕch
®¹i. S¶n phÈm thu ®−îc lµ tËp hîp ®a d¹ng c¸c dßng ®o¹n ADN ®Æc tr−ng cho
mçi loµi thËm trÝ cho mçi c¸ thÓ. William vµ céng sù (1990).
10
Theo lý thuyÕt 1 måi ngÉu nhiªn gåm 10 nucleotid th× x¸c suÊt b¾t gÆp
P = 1/1.048.576, nghÜa lµ mét ®o¹n ADN khu«n cã 1.048.576 cÆp
b»ng 1/4P
nucleotic cã mét tr×nh tù b¾t cÆp víi måi. Nh− vËy, víi mét ®o¹n måi ngÉu
nhiªn cã thÓ cã 524 vÞ trÝ b¾t cÆp måi, nghÜa lµ cã thÓ cã 262 ®o¹n ADN ®−îc
nh©n béi. Trong thùc tÕ sè l−îng c¸c ®o¹n ®−îc nh©n béi nhá h¬n nhiÒu v× nã
phô thuéc vµo ®é dµi ®o¹n ®−îc nh©n béi vµ sù s¾p xÕp c¸c tr×nh tù b¾t cÆp víi
måi trªn ADN cña bé gen.
Nguyªn t¾c ph¶n øng RAPD còng nh− nguyªn t¾c ph¶n øng PCR th«ng
th−êng. Tuy nhiªn, v× sö dông måi ngÉu nhiªn nªn nhiÖt ®é b¾t cÆp cña måi thÊp
o 30P
PC-36P
o PC. ChÝnh v× yÕu tè ®Æc hiÖu thÊp nªn kÕt qu¶ RAPD th−êng cã ®é lÆp
®Ó t¹o ®iÒu kiÖn b¾t cÆp kh«ng nghiªm ngÆt. NhiÖt ®é b¾t cÆp cña ph¶n øng lµ
l¹i kh«ng cao vµ khã tèi −u ph¶n øng. §©y chÝnh lµ trë ng¹i lín nhÊt cña RAPD
2+
v× kÕt qu¶ phô thuéc rÊt nhiÒu yÕu tè nh− thµnh phÇn ph¶n øng PCR (®Æc biÖt lµ
P vµ chÊt l−îng ADN b¶n mÉu), c¸c thiÕt bÞ còng nh− thao t¸c
thµnh phÇn MgP
thÝ nghiÖm.
Khi ph©n tÝch ®a h×nh di truyÒn b»ng ph−¬ng ph¸p RAPD, nÕu 2 c¸ thÓ cã
bé gen hoµn toµn gièng nhau th× khi tiÕn hµnh ph¶n øng PCR_RAPD víi bÊt kú
måi nµo còng cho b¨ng ADN gièng nhau. NÕu chóng Ýt nhiÒu cã sù kh¸c nhau
-30-
Khãa luËn tèt nghiÖp Bïi V¨n HiÖu
vÒ bé gen th× víi mét sè måi sÏ cho nh÷ng b¨ng kh¸c nhau gi÷a chóng. Sù kh¸c
nhau nµy thÓ hiÖn sùu ®a h×nh di truyÒn cña c¸c c¸ thÓ cÇn nghiªn cøu. Do ®ã,
nã ®−îc sö dông réng r·i trong c¸c phßng thÝ nghiÖm vÒ di truyÒn ph©n tö.
(cid:153) ChØ thÞ SSR (Microsatellite hay Simple Sequence Repeates)
ChØ thÞ vi vÖ tinh, lμ nh÷ng ®o¹n ADN lÆp l¹i mét c¸ch cã trËt tù, gåm
nh÷ng ®¬n vÞ lÆp l¹i gåm tõ 1 ®Õn 6 nucleotit, theo kiÓu lÆp l¹i ng¾n. B¶n chÊt
®a h×nh cña SSR cã thÓ ®−îc sinh ra do sù nh©n béi tõ ADN tæng sè cña hÖ gen
nhê sö dông 2 ®o¹n måi bæ trî víi tr×nh tù gÇn kÒ hai ®Çu cña vïng lÆp l¹i. Gi¸
trÞ cña SSR lμ ë chç nã sinh ra ®a h×nh tõ rÊt nhiÒu vïng t−¬ng øng, bao phñ
réng kh¾p hÖ gen vμ cã b¶n chÊt ®ång tréi, dÔ dμng ph¸t hiÖn b»ng PCR. Nh÷ng
chuçi ®a h×nh ®¬n gi¶n nμy ®· ®−îc øng dông trong viÖc lËp b¶n ®å ë c¶ hai ®èi
t−îng ®éng vËt vμ thùc vËt. ë ng−êi, SSR ®−îc gäi lμ thÕ hÖ thø hai cña c¸c chØ
thÞ ph©n tö. ë thùc vËt, tÇn sè vμ sè l−îng SSR ®· ®−îc x¸c ®Þnh trªn c¸c c©y
rõng nhiÖt ®íi, c©y b¾p c¶i, lóa m×, vμ 34 gièng c©y trång kh¸c [38].
2.7.3. T×nh h×nh nghiªn cøu ®a d¹ng di truyÒn dùa vµo chØ thÞ RAPD
Còng nh− mét sè ph−¬ng ph¸p sinh häc ph©n tö kh¸c, PCR_RAPD ®·
®−îc øng dông thµnh c«ng vµo nghiªn cøu mèi quan hÖ di truyÒn thùc vËt. Bªn
c¹nh c©y ng«, ®· cã rÊt nhiÒu ®èi t−îng ®−îc nghiªn cøu sö dông ph−¬ng ph¸p
nµy. Kaudun SS vµ CS., dùa trªn kü thuËt PCR_RAPD ®Ó nghiªn cøu 27 dßng
chÌ cã nguån gèc kh¸c nhau tõ Hµn Quèc, NhËt B¶n, §µi Loan. KÕt qu¶ thu
®−îc víi 50 måi ngÉu nhiªn , trong ®ã 17 måi cho 58 b¨ng ®a h×nh. Orozeo vµ
CS, (1994) ®· øng dông kü thuËt RAPD ®Ó kh¶o s¸t mèi quan hÖ di truyÒn vµ
tiÕn hãa cña c¸c gièng cµ phª ®−îc lai t¹o tõ c¸c loµi bè, mÑ ë c¸c vïng sinh
th¸i kh¸c nhau lµm c¬ së cho viÖc ghÐp cÆp lai víi môc ®Ých t¹o con lai cã ®Æc
®iÓm quý ®Ó lai t¹o gièng cµ phª míi... Cßn ë ViÖt Nam, kü thuËt PCR_RAPD
®−îc ¸p dông kh¸ nhiÒu trong ph©n tÝch di truyÒn cña thùc vËt.
-31-
Khãa luËn tèt nghiÖp Bïi V¨n HiÖu
– NguyÔn V¨n §ång, ViÖn Di truyÒn N«ng nghiÖp, ®· dïng 15 måi RAPD
®Ó ph©n tÝch ®a h×nh di truyÒn 19 dßng lóa, thu ®−îc 97 b¨ng ®a h×nh vµ hÖ sè
t−¬ng ®ång tõ 0,67 ®Õn 1,0 [12].
– NguyÔn ThÞ Dung, ViÖn c«ng nghÖ sinh häc ®· ph©n tÝch mèi t−¬ng ®ång
di truyÒn cña 11 c©y v¶i ë c¸c ®é tuæi kh¸c nhau dùa trªn c¬ së ph©n tÝch ®a
h×nh ADN b»ng ph−¬ng ph¸p PCR_RAPD víi 5 måi ngÉu nhiªn [12].
– NguyÔn V¨n Khiªm vµ CS., ViÖn Di truyÒn N«ng nghiÖp, ®· dïng 17
®o¹n måi RAPD ®Ó ®¸nh gi¸ mèi quan hÖ di truyÒn cña 20 mÉu kh¸c nhau
thuéc loµi Boswellia sacra flueck [12].
PCR_RAPD ®−îc øng dông thµnh c«ng vµo ph©n tÝch ®a h×nh di truyÒn ë
ng« (tuy cßn h¹n chÕ vÒ sè l−îng c¸c nghiªn cøu) vµ ®· thu ®−îc mét sè kÕt qu¶
sau:
– L.L.B.Lanza et al (1997) ®· øng dông kü thuËt RAPD ®Ó x¸c ®Þnh kho¶ng
c¸ch di truyÒn vµ dù ®o¸n cÆp lai ®¬n −u tó cña c¸c dßng ng« tù phèi ®−îc t¹o ra
tõ nguån BR106 vµ BR105 [1].
– Bïi M¹nh C−êng vµ CS, ViÖn nghiªn cøu ng« ®· sö dông chØ thÞ RAPD
víi 60 måi ngÉu nhiªn 29 dßng thuÇn ®Ó nghiªn cøu ®a d¹ng di truyÒn cña tËp
®oµn gièng ng« lai [12].
– KhuÊt H÷u Trung vµ CS, ViÖn Di truyÒn n«ng nghiÖp ®· sö dông 20 måi
ngÉu nhiªn ®Ó nghiªn cøu ®a d¹ng di truyÒn cña 14 dßng ng« mang gen kh¸ng
s©u. KÕt qu¶ lµ 9 måi cho b¨ng ®a h×nh.
Nh÷ng kÕt qu¶ trªn phÇn nµo cho thÊy sù h÷u Ých cña PCR_RAPD trong
nghiªn cøu ®a h×nh di truyÒn ë sinh vËt nãi chung vµ ë ng« nãi riªng.
-32-
Khãa luËn tèt nghiÖp Bïi V¨n HiÖu
PhÇn III. VËt LiÖu Vμ PH¦¥NG Ph¸p NGHI£N Cøu
3.1. VËt liÖu nghiªn cøu
VËt liÖu nghiªn cøu lµ mét 180 dßng ng« ®−îc t¹o ra tõ 2 dßng ng« mang
gen kh¸ng thuèc trõ cá thu thËp tõ Achentina ký hiÖu CG3 vµ CG4;
CÆp måi 35S1/35S2 sö dông trong ph¶n øng PCR ®Ó khuyÕch ®¹i ®o¹n
tr×nh tù ®Æc tr−ng cña promoter CaMV-35S (195bp) cã trong ng« chuyÓn gen;
CÆp måi PA01/CM03 dïng ®Ó khuyÕch ®¹i ®o¹n 231 bp cña gen PAT
(phosphinothricin-N-acetyltransferase), lµ gen kh¸ng thuèc trõ cá cã trong c©y
ng« chuyÓn gen;
20 måi kh¸c nhau sö dông trong c¸c ph¶n øng PCR-RAPD cã ®é dµi tõ 8-
10 nucleotit thuéc nhãm OPA, OPM, BIO vµ nhãm S cña h·ng Operon
Technology vµ h·ng Bioneer.
B¶ng 3: Tr×nh tù nucleotic cña c¸c cÆp måi dïng trong ph¶n øng PCR
KÝch th−íc
®o¹n
Tªn cÆp måi
Tr×nh tù
Gen ®Ých
khuÕch ®¹i
5′-CTCCTACAAATGCCATCA- 3′
Promoter
195 bp
35S1/35S2
CaMV 35s
5′-GATAGTGGGATTGTGCGTCA- 3′
5′-AGATCATCAATCCACTCTTGTGGTG- 3′
PA01/CM03
PAT
231bp
5′-CCTTCGCAAGACCCTTCCTCTATA- 3′
-33-
Khãa luËn tèt nghiÖp Bïi V¨n HiÖu
B¶ng 4: Tr×nh tù nucleotic cña c¸c primer ®−îc sö dông trong c¸c ph¶n øng PCR_RAPD
STT Primer
Tr×nh tù nucleotit
STT Primer
Tr×nh tù nucleotit
1 OPA1 CAGGCCCTTC S201 11 GGGCCACTCA
2 OPA9 GGGTAACGCC S202 12 GGAGAGACTC
3 OPA10 GTGATCGCAG S208 13 AACGGCGACA
4 OPA12 TCGGCGATAC S211 14 TTCCCCGCGA
5 OPA15 TTCCGAACCC S216 15 GGTGAACGCT
6 OPA18 AGGTGACCGT S256 16 CTGCGCTGGA
17 7 OPA10 GTGATCGCAG BIO3 GAAACGGGTG
8 OPM9 GTCTTGCGGA 18 BIO12 CAATCGCCGT
9 OPM12 GGGACGTTGG 19 BIO16 CTGAGACGGA
10 OPM18 CACCATCCGT 20 BIO27 TGACGCGCTC
C¸c ho¸ chÊt sinh häc ph©n tö cÇn thiÕt: c¸c ho¸ chÊt t¸ch chiÕt ADN, ho¸
chÊt lµm PCR, ho¸ chÊt ch¹y gel agarose.
+ Ho¸ chÊt t¸ch chiÕt AND: Ho¸ chÊt t¸ch chiÕt ADN bao gåm c¸c lo¹i
nh−: Tris HCl, EDTA, SDS, NaCl, CTAB, Chloroform, Isopropanol, Isoamyl
alcohol, Ethanol cña c¸c h·ng Sigma, Merck, Prolabo, ICN, Labscan.
– §Öm t¸ch chiÕt ADN cña mÉu l¸ c©y chuyÓn gen:
200 mM Tris-HCl pH8 250 mM NaCl 25 mM EDTA 0,5% SDS (Sodium Dodecyl Sulfate)
– §Öm TE:
10 mM Tris-HCl pH8 1 mM EDTA
– Phenol : chloroform : isoamyl acohol 70% (25:24:1)
– Ethanol 100% (hoÆc Isopropanol) vµ Ethanol 70%
-34-
Khãa luËn tèt nghiÖp Bïi V¨n HiÖu
+ Ho¸ chÊt dïng ®Ó ch¹y ph¶n øng PCR:
– §Öm PCR 1X (10 mM Tris-HCl pH8, 1,5 mM MgCl2 , 5 mM KCl) hoÆc
®Öm PCR 1X cña Quiagen hoÆc Invitrogen. – MgCl2 cña Fermentas, Invitrogen. – dNTPs (dATP, dGTP, dCT, dTTP (hoÆc dUTP)) cña Fermentas,
Invitrogen.
– Måi, Marker 1 kb, Marker 100 bp, Marker λ/HindIII cña h·ng Fermentas,
Invitrogen.
– Taq polymerase cña Fermentas, Hot- Start Quiagen hoÆc Platin tõ
Invitrogen
+ Ho¸ chÊt ch¹y ®iÖn di: §iÖn di gel agarose gåm c¸c ho¸ chÊt: TAE 1X, ChÊt nhuém Bromophenol blue (hoÆc Xylene cyanol hoÆc hçn hîp c¶ 2 chÊt nµy), Ethidium bromide, agarose.
+ C¸c thiÕt bÞ:
– M¸y PCR (h·ng Eppendorf) – M¸y ly t©m l¹nh (Eppendorf 5810-R vµ 2K15 Sigma) – M¸y ®iÖn di ngang BIO-RAD GT (Anh) – M¸y soi gel (T2201, Sigma), mÆt n¹ ch¾n tia UV (Sigma) – ThiÕt bÞ Votex (Genie 2 vµ MS1 Minishaker). – Nåi hÊp thanh trïng (05MB1-160T-3 -Nga) – C©n ®iÖn tö Sartorious (§øc) – Lß vi sãng. – Tñ sÊy (Memmert) – Micropipet, èng Eppendorf, b×nh tam gi¸c
3.2. Ph−¬ng ph¸p nghiªn cøu
3.2.1. Ph−¬ng ph¸p bè trÝ thÝ nghiÖm ®ång ruéng
C¸c dßng ng« nghiªn cøu ®−îc gieo 3 hµng dµi 5m, kho¶ng c¸ch gieo lµ
70cm x 25cm x 1 c©y/hèc t¹i khu ruéng thÝ nghiÖm ®−îc c¸ch li vµ kiÓm so¸t
chÆt chÏ. ViÖc ®¸nh gi¸ c¸c ®Æc ®iÓm n«ng sinh häc vµ c¸c ®Æc ®iÓm h×nh th¸i
®−îc tiÕn hµnh qua c¸c thÝ nghiÖm so s¸nh, ph−¬ng ph¸p ch¨m sãc c¸c thÝ
nghiÖm theo quy tr×nh cña ViÖn nghiªn cøu Ng«.
-35-
Khãa luËn tèt nghiÖp Bïi V¨n HiÖu
+ Thêi gian sinh tr−ëng: Theo dâi ngµy gieo ®Õn
– Ngµy tung phÊn: khi cã 75% sè c©y tung phÊn – Ngµy phun r©u: Khi cã 75% sè c©y phun r©u – Ngµy chÝn sinh lý: Khi ch©n h¹t cã ®iÓm ®en ë 100% sè b¾p
+ §Æc ®iÓm h×nh th¸i c©y:
– ChiÒu cao c©y (cm): Chän 10 c©y ngÉu nhiªn, ®o tõ mÆt ®Êt ®Õn ®èt mang
nh¸nh cê ®Çu tiªn.
– ChiÒu cao ®ãng b¾p (cm): Trªn 10 c©y ®· ®−îc ®o chiÒu cao c©y, chiÒu
cao ®ãng b¾p ®−îc ®o tõ mÆt ®Êt ®Õn ®èt mang b¾p trªn cïng
– Sè l¸ thËt: l¸ thø 5 vµ l¸ thø 10 ®−îc ®¸nh dÊu ®Ó tiÖn cho viÖc ®Õm sè l¸
cuèi cïng.
– ChiÒu dµi b«ng cê (chiÒu dµi trôc chÝnh) (cm): §−îc ®o tõ ®èt cã nh¸nh
cê ®Çu tiªn ®Õn hÕt b«ng cê.
– Mµu cê: X¸c ®Þnh mµu s¾c cña r©u lóc r©u dµi 3 cm. – Mµu d¹ng cña h¹t vµ lâi: X¸c ®Þnh mµu, d¹ng cña h¹t vµ lâi lóc kh«.
PC ®Ó lµm nguyªn liÖu cho t¸ch chiÕt ADN.
3.2.2. Ph−¬ng ph¸p t¸ch chiÕt ADN 3.2.2.1. Ph−¬ng ph¸p thu mÉu
C©y ng« chuyÓn gen ®−îc trång trong ®iÒu kiÖn nhµ kÝnh ®−îc kiÓm so¸t chÆt chÏ, khi c©y mäc cao 15 – 25 cm, thu kho¶ng 2,5- 3 g mÉu l¸, mÉu ®−îc 0 röa s¹ch, gi÷ ë - 80P 3.2.2.2. Ph−¬ng ph¸p t¸ch chiÕt AND tæng sè
0 1. ñ s½n dung dÞch ®Öm chiÕt CTAB vµ SDS ë 60P
PC trong b×nh æn nhiÖt (30
Trong nghiªn cøu nµy, chóng t«i ®· lùa chän ph−¬ng ph¸p cã sö dông CTAB cña Hugo vµ cs. (1995) cã c¶i tiÕn ®Ó tiÕn hµnh t¸ch chiÕt ADN tæng sè tõ 180 dßng ng« nghiªn cøu.
phót).
0
PC).
2. L¸ ®−îc c¾t nhá cho vµo cèi, nghiÒn cïng nit¬ láng ®Õn khi thµnh bét mÞn
(mÉu ng«, chµy, cèi ®−îc gi÷ tr−íc ë - 20P
3. ChuyÓn bét nghiÒn tõ l¸ sang èng Eppendorf 2 ml, bæ sung 800 ml CTAB
0
PC trong 40 phót, cã l¾c nhÑ trong qu¸ tr×nh ñ
buffer vµ 56 ml SDS 10%.
4. ñ ë 65P 5. §Ó nguéi ë nhiÖt ®é phßng.
-36-
0 PC) 11000 vßng/phót trong 15 phót.
0 PC) 11000 vßng/phót trong 15 phót.
Khãa luËn tèt nghiÖp Bïi V¨n HiÖu
6. Bæ sung 800 ml Chloroform : isoamyl alcohol (24:1), l¾c ®Òu 7. Ly t©m trong m¸y ly t©m l¹nh (4P 8. Thu dÞch næi phÝa trªn èng chuyÓn sang èng Eppendorf míi. 9. Bæ sung 800 ml Chloroform : isoamyl alcohol (24:1), l¾c ®Òu. 10. Ly t©m trong m¸y ly t©m l¹nh (4P 11. Thu dÞch næi chuyÓn sang «ng Eppendorf míi, bæ sung b»ng isopropanol
0
PC víi 12000 vßng/phót trong 15 phót, thu tña.
0
theo tû lÖ 1:1.
12. §Ó trong tñ l¹nh s©u 1,5- 2 h. 13. Ly t©m ë 4P 14. Röa tña b»ng cån 70% vµ ly t©m ë 4 P PC víi 11000 vßng/phót trong 10 phót 15. Lµm kh« ADN, hoµ tan ADN b»ng 200μl dung dÞch TE 0,1X hoÆc n−íc
PC trong 3 giê.
0 16. Lo¹i ARN Thªm 2μl RNase 10mg/ml , ñ 37P
®· khö trïng vµ ®Ò ion.
C¸c b−íc tiÕp theo lµm t−¬ng tù tõ b−íc 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15. §Ó kiÓm tra nång ®é, tÝnh toµn vÑn cña ADN t¸ch ®−îc chóng t«i sö dông
ph−¬ng ph¸p ®iÖn di trªn gel agarose 1% . 3.2.3. Ph−¬ng ph¸p kiÓm tra sù cã mÆt cña ®o¹n Promoter 35S vµ gen PAT trong c©y ng« kh¸ng thuèc diÖt cá
Sau khi kiÓm tra hµm l−îng ADN ng«, chóng t«i tiÕn hµnh pha lo·ng c¸c mÉu ADN ng« tæng sè cã nång ®é cao ®Ó ®¹t ®−îc hµm l−îng cuèi cïng lµ 50ng/μl ®©y lµ nång ®é thÝch hîp ®Ó lµm ph¶n øng PCR.
C¸c ph¶n øng PCR ®−îc thùc hiÖn trong thiÕt bÞ Eppendorf Mastercycler
gradient (96 giÕng), víi thÓ tÝch cuèi cïng lµ 15 μl/ph¶n øng.
P
– Thµnh phÇn ph¶n øng cho mét mÉu ADN:
1,5 μl 1 μl 0,6 μl 0,6 μl ®èi víi måi 35S1/35S2 1,2 μl ®èi víi måi PA01/CM03 0,2 μl 1 μl
Buffer 2+ MgP dNTPs 10 mM Måi xu«i vµ måi ng−îc Taq DNA polymerse ADN Bæ sung n−íc cÊt khö trïng ®· lo¹i ion tíi thÓ tÝch cuèi cïng lµ 15 μl
-37-
Khãa luËn tèt nghiÖp Bïi V¨n HiÖu
0 CÆp måi 35S1/35S2: BiÕn tÝnh ë 94P
PC trong 5 phót (t¸ch m¹ch ADN
0 khu«n), ch¹y 40 chu kú lÆp l¹i víi 94P
0 PC trong 30 gi©y, 58P
PC trong 30 gi©y (g¾n
0 måi), 72P
0 PC trong 30 gi©y (kÐo dµi), cuèi cïng ph¶n øng ®−îc gi÷ ë 72P
PC trong 6
– Ph¶n øng ®−îc ch¹y víi chu tr×nh nhiÖt cña tõng cÆp måi nh− sau:
0 CÆp måi PA01/CM03: BiÕn tÝnh ë 95P
PC trong 5 phót (t¸ch m¹ch ADN
0 khu«n), ch¹y 40 chu kú lÆp l¹i víi 95P
0 PC trong 20 gi©y, 60P
PC trong 40 gi©y (g¾n
0 måi), 72P
0 PC trong 1 phót (kÐo dµi), cuèi cïng ph¶n øng ®−îc gi÷ ë 72P
PC trong 5
phót (hoµn thµnh chuçi ph¶n øng).
phót (hoµn thµnh chuçi ph¶n øng).
S¶n phÈm sau khi thùc hiÖn ph¶n øng PCR ®em ®i ®iÖn di trªn gel agarose
1% (0,4 g agarose, 40ml dung dÞch TAE 1X, 2,5μl Ethidium bromide) víi
marker chuÈn ADN 1kb.
-38-
Khãa luËn tèt nghiÖp Bïi V¨n HiÖu
3.2.4. Ph−¬ng ph¸p PCR_RAPD
P
Thµnh phÇn cña hçn hîp ph¶n øng PCR_RAPD gåm:
1,5 μl 1 μl 0,6 μl 1,2 μl 0,2 μl 1 μl
Buffer 2+ MgP dNTPs 10 mM Måi RAPD Taq DNA polymerse ADN Bæ sung n−íc cÊt khö trïng ®· lo¹i ion tíi thÓ tÝch cuèi cïng lµ 15 μl
Ph¶n øng ®−îc ch¹y víi chu tr×nh nhiÖt cña tõng måi nh− sau:
3.2.5. Ph−¬ng ph¸p ®iÖn di trªn gel Agarose
Khi tiÕn hµnh ®iÖn di th× cÇn ph¶i lµm hiÖn h×nh c¸c ph©n tö ADN trªn
gel. §èi víi gel Agarose th× ta dïng thuèc nhuém ethidium bromide. ChÊt nµy
sÏ g¾n xen vµo gi÷a c¸c base cña ph©n tö ADN vµ ph¸t huúnh quang khi chiÕu
tia tö ngo¹i.
PC), bæ sung 2,5 μl EtBr.
C¸ch tiÕn hµnh:
– C©n 0,4g agarose cho vµo b×nh tam gi¸c. – LÊy 40ml dung dÞch TAE 1X cho vµo b×nh tam gi¸c trªn. – §un ®Õn khi agarose tan hÕt vµo dung dÞch. o – §Ó nguéi (kho¶ng 65P – §Æt l−îc vµo khay, ®æ gel vµo ®Ó nguéi ®Õn khi gel ®«ng l¹i th× chuyÓn khay chøa b¶n gel vµo m¸y ®iÖn di vµ cho ®Öm ch¹y TAE 1X vµo buång ®iÖn di sao cho ®Öm ngËp b¶n gel kho¶ng 0,5-1 cm.
-39-
Khãa luËn tèt nghiÖp Bïi V¨n HiÖu
– Tra mÉu: MÉu ®−îc nhuém víi Xanhmetylen (loading dye), tra vµo giÕng. – Maker ®−îc tra vµo mét trong sè c¸c giÕng ®Ó cã thÓ x¸c ®Þnh chiÒu dµi
c¸c mÉu.
– Ch¹y ®iÖn di: Sau khi tra mÉu ®iÖn di xong, m¸y ®iÖn di ®−îc kÕt nèi víi
bé nguån. §Æt 50V, 90mA. Thêi gian ch¹y kho¶ng 20 -30 phót.
– Quan s¸t: Gel ®−îc soi d−íi ®Ìn tö ngo¹i, ADN sÏ ®−îc ph¸t s¸ng nhê
liªn kÕt víi EtBr. – Chôp ¶nh.
3.2.6. C¸c ph−¬ng ph¸p tÝnh to¸n vµ sö lý sè liÖu
(cid:153) Ph−¬ng ph¸p ph©n tÝch vµ xö lý sè liÖu: C¸c sè liÖu thu thËp ®−îc xö lý
theo ph−¬ng ph¸p thèng kª sinh häc trªn nÒn Excel version 5.0
(cid:153) Ph©n tÝch kÕt qu¶ PCR_RAPD b»ng NTSYSpc 2.1: C¬ së d÷ liÖu cña NTSYSpc lµ ch−¬ng tr×nh m¸y tÝnh ®Ó tù ®éng thiÕt lËp nªn s¬ ®å c©y biÓu hiÖn mèi quan hÖ hay ®é t−¬ng ®ång di truyÒn gi÷a chóng víi nhau. C¬ së d÷ liÖu cña ch−¬ng tr×nh nµy dùa vµo hÖ m· nhÞ ph©n (0,1) ®Ó ®¸nh gi¸ sù v¾ng mÆt (ghi 0) hoÆc sù cã mÆt (ghi 1) cña c¸c b¨ng ®a h×nh ADN theo thang ADN chuÈn (ADN marker). D÷ liÖu nµy còng cho phÐp thiÕt lËp ma trËn t−¬ng ®ång (Similar matrix) hoÆc ma trËn kho¶ng c¸ch (Distance matrix). ViÖc tÝnh to¸n ma trËn t−¬ng ®ång ®−îc dùa theo c«ng thøc:
2nBijB JBij B= nBi B+nBjB
Trong ®ã nBijB lµ sè b¨ng ADN cã ë c¶ hai mÉu i vµ j nBiB vµ nj lµ tæng sè b¨ng RAPD cña tõng c¸ thÓ i vµ j t−¬ng øng JBijB lµ hÖ sè t−¬ng dång gi÷a hai mÉu i vµ j Tr×nh tù tiÕn hµnh ph©n tÝch kÕt qu¶ PCR_RAPD b»ng NTSYS
– KÕt qu¶ PCR_RAPD ®−îc nhËp vµo ch−¬ng tr×nh excel theo nguyªn t¾c
lµ nÕu kh«ng xuÊt hiÖn b¨ng ghi "0", nÕu xuÊt hiÖn ghi b¨ng "1".
– Sè liÖu ®−îc xö lý tiÕp trong ch−¬ng tr×nh Notepad. – Ma trËn t−¬ng ®ång vµ s¬ ®å h×nh c©y ®−îc x©y dùng sau khi xö lý trong
NTSYSpc 2.1
-40-
Khãa luËn tèt nghiÖp Bïi V¨n HiÖu
IV. KÕt Qu¶ Vμ Th¶o LuËn
4.1. KÕt qu¶ t¸ch chiÕt ADN
T¸ch chiÕt axit nucleic lμ c«ng viÖc ®Çu tiªn ®ãng vai trß quan träng trong
c«ng nghÖ ADN. Nhê tiÕn bé vμ sù ®æi míi c«ng nghÖ mμ t¸ch chiÕt axit
nucleic ngμy nay ®· trë nªn ®¬n gi¶n. HiÖn nay cã rÊt nhiÒu ph−¬ng ph¸p t¸ch
chiÕt ADN tæng sè cña mÉu thùc vËt. Tuy nhiªn ®èi víi tõng ®èi t−îng mÉu thùc
vËt nhÊt ®Þnh cÇn cã ph−¬ng ph¸p riªng. Do vËy, viÖc lùa chän vμ c¶i tiÕn
ph−¬ng ph¸p cho phï hîp víi ®èi t−îng cña m×nh lμ ®iÒu rÊt cÇn thiÕt vμ quan
träng.
Trong nghiªn cøu nμy, chóng t«i ®· lùa chän ph−¬ng ph¸p cã sö dông
CTAB cña Hugo vµ CS (1995) cã c¶i tiÕn ®Ó tiÕn hμnh t¸ch chiÕt ADN tæng sè
tõ 180 mÉu ng« nghiªn cøu. MÉu ADN sau khi t¸ch chiÕt ®−îc kiÓm tra nång ®é
vµ tÝnh toµn vÑn cña chóng trªn gel agarose 1%, ch¹y trong 30 phót ë hiÖu ®iÖn
thÕ 50V. Sau ®ã kÕt qu¶ ®−îc quan s¸t trªn m¸y soi UV vµ chôp l−u l¹i ¶nh
(h×nh 7).
H×nh 7: KÕt qu¶ kiÓm tra ADN tæng sè cña 34/180 mÉu ng« nghiªn cøu
Qua ph©n tÝch ¶nh ®iÖn di cho thÊy nång ®é ADN cña c¸c mÉu t−¬ng ®èi
lµ ®ång ®Òu vµ kh«ng bÞ ®øt g·y. MÆt kh¸c kh«ng thÊy xuÊt hiÖn c¸c vÕt s¸ng
-41-
Khãa luËn tèt nghiÖp Bïi V¨n HiÖu
ARN phÝa d−íi, ®iÒu ®ã chøng tá ARN ®· ®−îc lo¹i bá hoµn toµn khái dÞch
chiÕt ADN.
4.2. KÕt qu¶ nhËn biÕt ®o¹n Promoter 35S cã trong c©y ng« kh¸ng thuèc diÖt cá
Sau khi t¸ch chiÕt vµ kiÓm tra nång ®é ADN chóng t«i kiÓm tra sù cã mÆt
cña Promoter 35S víi cÆp måi 35S1/35S2 b»ng ph−¬ng ph¸p PCR (Víi cÆp måi
35S1/35S2 x¸c ®Þnh ®−îc tr×nh tù ®Æc tr−ng cña promoter 35S cã ®é dµi 195 bp).
KÕt qu¶ ch¹y ®iÖn di s¶n phÈm PCR cho thÊy: cã 14/180 mÉu ADN
(14/180 dßng ng« nghiªn cøu) cho kÕt qu¶ d−¬ng tÝnh ®ã lµ c¸c mÉu: CG3-D1,
CG4-D1, CG3-D2, CG3-D3, CG3-D4, CG3-D5, CG3-D6, CG3-D7, CG3-D8,
CG3-D9, CG4-D2, CG3-D10, CG3-D11vµ CG3-D12 (14 mÉu ®−îc kiÓm tra l¹i
vµ ch¹y chung trªn mét b¶n gel - h×nh 8). C¸c mÉu nµy ®Òu xuÊt hiÖn b¨ng cã
kÝch th−íc 195 bp gièng nh− mÉu d−¬ng tÝnh chuÈn (ADN cña plasmid
pART27, plasmid nµy cã chøa promoter CaMV 35S).
M1 kb: Marker chuÈn 1kb
§C (-): MÉu ®èi chøng ©m tÝnh (HB2BO)
§C (+): MÉu ®èi chøng d−¬ng tÝnh
H×nh 8: KÕt qu¶ s¶n phÈm PCR víi cÆp måi 35S1/35S2 cña 14 mÉu ng«
-42-
Khãa luËn tèt nghiÖp Bïi V¨n HiÖu
4.4. KÕt qu¶ nhËn biÕt sù cã mÆt cña gen PAT kh¸ng thuèc diÖt cá
14 mÉu d−¬ng tÝnh víi cÆp måi 35S1/35S2 tiÕp tôc ®−îc kiÓm tra víi cÆp
måi PA01/CM03 ®Ó x¸c ®Þnh ®o¹n tr×nh tù ®Æc tr−ng cã ®é dµi 231 bp cña gen
kh¸ng thuèc diÖt cá PAT.
Gen PAT (Phospinotricin acetyltransferase) lµ mét trong nh÷ng gen
kh¸ng thuèc trõ cá còng ®· ®−îc chÌn vµo mét sè gièng c©y trång nh− ng«, ®Ëu
t−¬ng vµ mét sè gièng c©y trång kh¸c. Ng−êi ta ®· chøng minh r»ng gen PAT
cã mÆt trong ng« chuyÓn gen T25, gièng ng« nµy ®· ®−îc ph¸t triÓn ®Ó chèng
chÞu thuèc trõ cá Ammonium glufosinate. Gen nµy ®· ®−îc ph¸t hiÖn nhê cÆp
måi 2F/2R khuyÕch ®¹i ®o¹n 262bp th«ng qua PCR multipex (Hugo
R.Permingeat & CS, in press). Vµ mét cÆp måi kh¸c còng ®· ®−îc thiÕt kÕ ®Ó
khuyÕch ®¹i tr×nh tù 231 bp trªn vïng gen cÊu tróc cña gen PAT, ®ã lµ primers
PA01/CM03 vµ chóng t«i còng sö dông cÆp måi nµy ®Ó khuÕch ®¹i ®o¹n tr×nh tù
dµi 231 bp trªn vïng gen cÊu tróc cña gen PAT ë c¸c mÉu ng« thÝ nghiÖm.
S¶n phÈm PCR ®−îc kiÓm tra trªn gel agarose 1% cã ethidium bromide
víi ®Öm TAE 1X, ch¹y ®iÖn di trong 30 phót ë dßng ®iÖn 50V. Sö dông marker
chuÈn ADN 1Kb ®Ó so s¸nh vµ kÕt qu¶ ®−îc quan s¸t trùc tiÕp trªn m¸y soi UV,
chôp ¶nh l−u trong m¸y tÝnh.
KÕt qu¶ kiÓm tra víi cÆp måi PA01/CM03 cho thÊy cã sù xuÊt hiÖn 7
b¨ng kÝch th−íc 231 bp ®ã lµ c¸c mÉu CG3-D1, CG4-D1, CG3-D2, CG3-D3,
CG3-D5, CG3-D8, CG4-D2, (h×nh 14). 7 mÉu d−¬ng tÝnh víi cÆp måi
35S1/35S2 nh−ng ©m tÝnh víi cÆp måi PA01/CM03 (CG3-D4, CG-D6, CG3-D7,
CG3-D9, CG3-D10, CG3-D11, CG3-D12) ®ang tiÕp tôc ®−îc kiÓm tra víi c¸c
cÆp måi kh¸c ®Ó x¸c ®Þnh kh¶ n¨ng kh¸ng víi nhãm thuèc trõ cá nµo, tr−íc khi
bè trÝ thÝ nghiÖm phun thuèc diÖt cá.
Nh÷ng mÉu c©y ng« d−¬ng tÝnh víi cÆp måi PA01/CM03 (cã gen PAT)
sÏ ®−îc kiÓm tra kh¶ n¨ng kh¸ng thuèc diÖt cá ë ngoµi ®ång ruéng b»ng ph−¬ng
ph¸p thÝ nghiÖm phun thuèc diÖt cá Ammonium glufosinate ®Ó kiÓm tra sù biÓu
-43-
Khãa luËn tèt nghiÖp Bïi V¨n HiÖu
hiÖn cña gen PAT vµ chän läc nh÷ng dßng ng« kh¸ng thuèc trõ cá phôc vô thÝ
nghiÖm lai backross.
M1kb: Marker chuÈn 1kb
§C (–): MÉu ®èi chøng ©m tÝnh (HB2BO)
H×nh 9: KÕt qu¶ s¶n phÈm PCR víi cÆp måi PA01/CM03 ph¸t hiÖn gen PAT cña c¸c mÉu ng«
4.5. KÕt qu¶ ®¸nh gi¸ ®a ®¹ng di truyÒn cña c¸c dßng ng« thuÇn mang gen kh¸ng thuèc diÖt cá ®−îc t¹o ra tõ nguån vËt liÖu ban ®Çu
Tõ c¸c nguån vËt liÖu thu thËp, chóng t«i ®· x¸c ®Þnh ®−îc nguån vËt liÖu
CG4 lµ dßng thuÇn di truyÒn æn ®Þnh qua c¸c thÕ hÖ. Nguån vËt liÖu CG3 di
truyÒn ch−a æn ®Þnh cã thÓ lµ gièng lai hoÆc vËt liÖu ®−îc chuyÓn gen ch−a
thuÇn. §èi víi nguån vËt liÖu CG4 lµ dßng thuÇn võa mang gen kh¸ng s©u võa
mang gen kh¸ng thuèc diÖt cá, chóng t«i tiÕp tôc tù thô vµ sib ®Ó gi÷ dßng. §èi
víi nguån vËt liÖu ch−a thuÇn, chóng t«i tiÕn hµnh tù thô x¸c ®Þnh c¸c vËt liÖu
mang gen kh¸ng thuèc diÖt cá b»ng kü thuËt PCR ë giai ®o¹n sím cña c©y con ë
mçi thÕ hÖ. TÊt c¶ c¸c c©y mang gen kh¸ng thuèc diÖt cá tiÕp tôc ®−îc tù thô vµ
kiÓm tra sù cã mÆt cña gen kh¸ng thuèc diÖt cá ë c¸c thÕ hÖ tiÕp theo, ®Ó t¹o
dßng thuÇn mang gen kh¸ng thuèc diÖt cá. Sau 4 thÕ hÖ tù thô, trong tæng sè
-44-
Khãa luËn tèt nghiÖp Bïi V¨n HiÖu
180 dßng thu ®−îc cã 14 dßng cã kh¶ n¨ng kh¸ng thuèc trõ cá (b¶ng 5) ®· ®−îc
®¸nh gi¸ mét sè ®Æc ®iÓm n«ng sinh häc chÝnh vµ ®¸nh gi¸ ®a d¹ng di truyÒn
phôc vô c«ng t¸c backcross (lai ng−îc) nh»m t¹o ra c¸c dßng ng« thuÇn mang
gen kh¸ng thuèc diÖt cá cã ®Æc ®iÓm n«ng sinh häc tèt, cã triÓn väng trong c«ng
t¸c t¹o gièng ng« lai kh¸ng thuèc diÖt cá.
B¶ng 5: C¸c dßng gièng ng« thuÇn kh¸ng thuèc diÖt cá ®−îc t¹o ra tõ c¸c nguån vËt liÖu ban ®Çu
TT Tªn dßng §Æc tÝnh Nguån gèc thu nhËp
Tõ nguån CG3 1 CG3-D1 Kh¸ng thuèc diÖt cá
2 CG4-D1 Kh¸ng s©u vµ kh¸ng thuèc diÖt cá Tõ nguån CG4
Tõ nguån CG3 3 CG3-D2 Kh¸ng thuèc diÖt cá
Tõ nguån CG3 4 CG3-D3 Kh¸ng thuèc diÖt cá
Tõ nguån CG3 5 CG3-D4 Kh¸ng thuèc diÖt cá
Tõ nguån CG3 6 CG3-D5 Kh¸ng thuèc diÖt cá
Tõ nguån CG3 7 CG3-D6 Kh¸ng thuèc diÖt cá
Tõ nguån CG3 8 CG3-D7 Kh¸ng thuèc diÖt cá
Tõ nguån CG3 9 CG3-D8 Kh¸ng thuèc diÖt cá
Tõ nguån CG3 10 CG3-D9 Kh¸ng thuèc diÖt cá
11 CG4-D2 Kh¸ng s©u vµ kh¸ng thuèc diÖt cá Tõ nguån CG4
Tõ nguån CG3 12 CG3-D10 Kh¸ng thuèc diÖt cá
Tõ nguån CG3 13 CG3-D11 Kh¸ng thuèc diÖt cá
Tõ nguån CG3 14 CG3-D12 Kh¸ng thuèc diÖt cá
-45-
Khãa luËn tèt nghiÖp Bïi V¨n HiÖu
4.5.1. §a d¹ng di truyÒn ë møc h×nh th¸i vµ mét sè ®Æc ®iÓm n«ng sinh häc chÝnh cña c¸c dßng ng« mang gen kh¸ng thuèc diÖt cá
14 dßng nghiªn cøu®−îc bè trÝ theo khèi ngÉu nhiªn trong ®iÒu kiÖn
kiÓm so¸t chÆt chÏ, mçi dßng gieo thµnh 3 hµng dµi 5m, kho¶ng c¸ch gieo lµ
70cm x 25 cm x 1c©y/hèc. C¸c ®Æc ®iÓm h×nh th¸i vµ n«ng sinh häc chÝnh ®−îc
tiÕn hµnh ®¸nh gi¸ qua c¸c thÝ nghiÖm so s¸nh, kÕt qu¶ chØ ra ë b¶ng 6.
B¶ng 6: Mét sè ®Æc ®iÓm h×nh th¸i vµ ®Æc ®iÓm n«ng sinh häc chÝnh cña c¸c dßng gièng ng« kh¸ng thuèc diÖt cá (vô Thu §«ng 2007)
§Æc ®iÓm kh¸c
Sè l¸ TB
Mµu cê
Mµu r©u
Tªn dßng
Dµi cê TB (cm)
Mµu d¹ng h¹t
Cao c©y TB (cm)
Cao b¾p TB (cm)
Thêi gian sinh tr−ëng (ngµy)
CG3-D1
110
104,8
50,3
16
26,6
Hång
Tr¾ng xanh
§V, LT, RN
C©y yÕu, l¸ th−a, b¾p nhá, kÕt h¹t kÐm
CG4-D1
115
89,2
43,3
16
14,1
N©u
Hång §V, L§
C©y yÕu, l¸ th−a, b¾p nhá
91,8
53,0
24,3
Hång §V, LT
CG3-D2
110
16
C©y yÕu, l¸ th−a, b¾p nhá
Tr¾ng xanh
102,2
38,2
27,4
Tr¾ng
Hång §V, LT C©y yÕu, b¾p nhá
CG3-D3
110
17
86,6
44,9
21,6
Hång
CG3-D4
110
16
§V. LT. BRN
Tr¾ng xanh
C©y yÕu, b¾p nhá, Ýt h¹t
CG3-D5
110
105,2
46,4
16
27,0
Hång §V, LT
C©y yÕu, l¸ th−a, b¾p nhá
Tr¾ng xanh
102,6
51,2
24,8
Tr¾ng
Hång §V, LT
CG3-D6
110
16
C©y yÕu, l¸ th−a, b¾p nhá
112,1
56,6
33,4
Tr¾ng
Hång §V, LT C©y yÕu, b¾p nhá
CG3-D7
110
17
111,3
48,8
31,8
Tr¾ng
Hång §V, LT C©y yÕu, b¾p nhá
CG3-D8
110
17
Hång §V, LT
CG3-D9
110
98,6
57,8
28,4
17
C©y yÕu, b¾p nhá, kÕt h¹t kÐm
Tr¾ng xanh
CG4-D2
115
86,2
51,0
16
13,2
N©u
Hång §V, L§
C©y yÕu, l¸ th−a, b¾p nhá
Hång §V, LT
CG3-D10
110
108,4
54,0
26,0
17
C©y yÕu, b¾p nhá, kÕt h¹t kÐm
Tr¾ng xanh
24,3
CG3-D11
110
102,6
52,2
Hång §V, LT C©y yÕu, b¾p nhá
17
Tr¾ng xanh
CG3-D12
110
112,4
48,6
32,0
Tr¾ng
Hång §V, LT C©y yÕu, b¾p nhá
17
§V: ®¸ vµng; LT: lâi tr¾ng; L§: lâi ®á; BRN: b¸n r¨ng ngùa
-46-
Khãa luËn tèt nghiÖp Bïi V¨n HiÖu
Nh×n chung c¸c dßng ng« nghiªn cøu cã thêi gian sinh tr−ëng tõ 110-115
ngµy ë (vô Thu §«ng 2007), c¸c dßng ng« nghiªn cøu cã chiÒu cao trung b×nh
thÊp dao ®éng tõ 86,2-112,4cm, 16-17 l¸, c©y yÕu b¾p nhá, kh¨ n¨ng kÕt h¹t
kÐm. C¸c dßng ng« nµy kh«ng thÓ sö dông trùc tiÕp vµo c¸c thÝ nghiÖm t¹o
gièng lai.
4.5.2. KÕt qu¶ ph©n tÝch ®a h×nh ADN b»ng kü thuËt PCR-RAPD cña c¸c dßng ng« mang gen kh¸ng thuèc diÖt cá
§Ó tiÕn hµnh ph©n tÝch vµ ®¸nh gi¸ møc ®é ®a h×nh di truyÒn cña c¸c
dßng, s¶n phÈm PCR ®−îc ®iÖn di trªn gen agarose 1%. D−íi ®©y lµ kÕt qu¶
ph©n tÝch PCR-RAPD víi mét sè måi ®Æc tr−ng.
+ Måi OPA12
H×nh 10: KÕt qu¶ ®iÖn di s¶n phÈm PCR_RAPD víi ®o¹n måi OPA12 C¸c giÕng tõ 1-14 t−¬ng øng víi thø tù c¸c dßng ng«
KÕt qu¶ ®iÖn di s¶n phÈm PCR_RAPD (h×nh 10) cña 14 dßng ng« víi måi
OPA12 cã 11 lo¹i b¨ng víi kÝch th−íc kh¸c nhau tõ 400-2000bp ®−îc nh©n lªn
(b¶ng 7). Trong ®ã, mÉu sè 5 (CG3-D4) cã sè b¨ng ADN ®−îc nh©n b¶n nhiÒu
nhÊt 9 b¨ng, cßn mÉu sè 3 (CG3-D2) chØ cã 2 b¨ng ®−îc nh©n b¶n. MÉu sè 3
(CG3-D2) xuÊt hiÖn 2 b¨ng c¸ biÖt kÝch th−íc kho¶ng 400 bp, 1600 bp vµ 4
b¨ng v¾ng mÆt (duy nhÊt) ë c¸c vÞ trÝ 1000 bp, 1100 bp, 1400 bp vµ 1500 bp.
-47-
Khãa luËn tèt nghiÖp Bïi V¨n HiÖu
TÝnh ®a h×nh ®−îc thÓ hiÖn ë sù xuÊt hiÖn hay kh«ng xuÊt hiÖn b¨ng ADN khi
so s¸nh gi÷a c¸c dßng víi nhau. ë måi OPA12 c¶ 11 b¨ng ®Òu cho ®a h×nh.
B¶ng 7: C¸c b¨ng ADN ®−îc nh©n b¶n ngÉu nhiªn trong ph¶n øng PCR_RAPD víi måi OPA12
TT
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11
1 0 1 0 1 1 0 0 1 1 1 1 Tæng 7 Thø tù c¸c dßng 9 6 1 0 1 1 0 0 1 1 1 0 0 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 8 7 10 1 1 0 1 1 0 0 1 1 1 1 8 8 0 1 0 1 1 0 0 1 1 1 1 7 5 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 1 9 4 0 1 0 1 0 0 0 1 0 1 1 5 3 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 2 2 0 1 0 1 0 0 0 1 1 1 1 6 14 0 1 0 1 1 1 0 1 0 1 1 7 11 12 13 7 0 0 0 0 1 1 1 1 0 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 0 0 0 0 1 1 1 1 0 0 1 0 1 0 1 1 1 1 1 1 7 6 7 7 (sè 1 lµ ®o¹n ADN ®−îc nh©n, Sè 0 lµ ®o¹n ADN kh«ng ®−îc nh©n)
+ Måi OPM12
H×nh 11: KÕt qu¶ ®iÖn di s¶n phÈm PCR_RAPD víi ®o¹n måi OPM12
-48-
Khãa luËn tèt nghiÖp Bïi V¨n HiÖu
KÕt qu¶ ®iÖn di s¶n phÈm PCR_RAPD cña c¸c dßng ng« víi måi OPM12
cã 5 lo¹i b¨ng víi kÝch th−íc kh¸c nhau tõ 200-700bp ®−îc nh©n lªn. Trong ®ã,
mÉu sè 5 (CG3-D4) vµ mÉu sè 6 (CG3-D5) cã sè b¨ng ADN ®−îc nh©n b¶n
nhiÒu nhÊt 3 ph©n ®o¹n cßn mÉu sè 3 (CG3-D2) vµ mÉu sè 8 (CG3-D7) kh«ng
cã b¨ng nµo ®−îc nh©n b¶n. MÉu sè 5 (CG3-D4) xuÊt hiÖn b¨ng c¸ biÖt kÝch
th−íc kho¶ng 700 bp. ë måi OPM12 c¶ 5 b¨ng nh©n lªn ®Òu cho ®a h×nh.
B¶ng 8: C¸c b¨ng ADN ®−îc nh©n b¶n ngÉu nhiªn trong ph¶n øng PCR_RAPD víi måi OPM12
1 2 3 4 5 Tæng
TT
11 0 0 1 0 0 1
12 0 0 1 0 1 2
10 0 1 1 0 0 2
4 0 0 0 1 0 1
5 1 1 1 0 0 3
2 0 0 1 0 1 2
8 0 0 0 0 0 0
13 0 0 0 1 1 2
14 0 0 1 0 0 1
7 1 0 0 0 0 1 1 0 0 1 1 2 2 (Sè 1 lµ ®o¹n ADN ®−îc nh©n, Sè 0 lµ sè ®o¹n ADN kh«ng ®−îc nh©n)
Thø tù c¸c dßng 9 6 0 0 0 0 1 1 0 1 0 1 1 3 3 0 0 0 0 0 0
+ Måi S208
H×nh 12: KÕt qu¶ ®iÖn di s¶n phÈm PCR_RAPD víi ®o¹n måi S208
KÕt qu¶ ®iÖn di s¶n phÈm PCR_RAPD cña c¸c dßng ng« víi måi S208 cã
7 lo¹i b¨ng víi kÝch th−íc kh¸c nhau tõ 100-1700bp ®−îc nh©n lªn. Trong ®ã,
-49-
Khãa luËn tèt nghiÖp Bïi V¨n HiÖu
mÉu sè 11 (CG4-D2) cã sè b¨ng ADN ®−îc nh©n b¶n nhiÒu nhÊt 6 b¨ng cßn
mÉu sè 1 (CG3-D1) chØ cã 2 b¨ng ®−îc nh©n b¶n. ë måi S208 cã 5 b¨ng ®a
h×nh vµ 2 b¨ng ®¬n h×nh ®−îc nh©n lªn. MÉu sè 9 (CG3-D8) xuÊt hiÖn b¨ng c¸
biÖt kÝch th−íc kho¶ng 1700 bp.
B¶ng 9: C¸c b¨ng ADN ®−îc nh©n b¶n ngÉu nhiªn trong ph¶n øng PCR_RAPD víi måi S208
1 2 3 4 5 6 7 Tæng
TT
11 0 1 1 1 1 1 1 6
10 0 0 0 1 1 0 1 3
2 0 1 0 1 1 0 0 3
3 0 1 1 1 1 0 1 5
4 0 1 0 1 1 0 1 4
5 0 0 0 1 1 0 1 3
8 0 1 0 1 1 1 1 5
1 0 0 0 1 1 0 0 2
13 0 0 0 1 1 0 1 3
14 0 0 1 0 0 0 0 1
7 12 0 0 1 0 0 0 1 1 1 1 0 0 1 1 3 4 (Sè 1 lµ ®o¹n ADN ®−îc nh©n, Sè 0 lµ ®o¹n ADN kh«ng ®−îc nh©n)
Thø tù c¸c dßng 9 6 1 0 0 1 0 0 1 1 1 1 0 0 1 1 4 4
B¶ng 10: Thèng kª c¸c måi xuÊt hiÖn b¨ng ®a h×nh
Tªn måi
TT 1 OPA12 2 S202 3 OPA15 4 S201 5 OPM12 6 OPM9 7 OPA18 8 BIO12 9 S208 OPM18 10 Sè måi ®a h×nh lµ 10 §¬n h×nh 0 0 1 2 0 0 0 0 2 0 5 §a h×nh 11 3 6 0 5 2 8 4 5 6 46 B¨ng c¸ biÖt 2 0 1 0 1 0 0 0 1 0 5
KÕt qu¶ ph©n tÝch PCR_RAPD cña 14 dßng ng« víi tæng 20 måi thuéc
nhãm OPA, OPM, BIO vµ nhãm S cho thÊy cã 10 måi cho b¨ng ®a h×nh râ nhÊt
-50-
Khãa luËn tèt nghiÖp Bïi V¨n HiÖu
®ã lµ c¸c måi: OPA12, S202, OPA15, S201, OPM12, OPM9, OPA18, BIO12,
S208 vµ OPM18 (b¶ng 10). Thèng kª kÕt qu¶ ph©n tÝch tÝnh ®a h×nh b»ng kü
thuËt PCR_RAPD víi 10 måi chØ ra ë b¶ng 11.
B¶ng 11: KÕt qu¶ PCR-RAPD cña c¸c dßng ng« víi 10 måi cho b¨ng ®a h×nh
Sè b¨ng ADN thu ®−îc trªn tõng måi
T T
S202 OPA15
CG3-D1
CG4-D1
CG3-D2
CG3-D3
CG3-D4
CG3-D5
CG3-D6
CG3-D7
1 2 3 4 5 6 7 8 9 CG3-D8 10 CG3-D9 11 CG4-D2 12 CG3-D10 13 CG3-D11 14 CG3-D12
Tæng
Tªn dßng OPA12 7 6 2 5 9 7 7 7 8 8 7 6 7 7 93
0 1 0 0 0 1 0 0 0 3 0 3 2 1 11
S201 OPM12 OPM9 OPA18 BIO12 S208 OPM18 4 8 4 6 7 7 6 7 0 6 6 6 7 6 80
2 2 0 1 3 3 2 0 1 2 1 2 2 1 22
0 1 0 0 1 1 1 0 0 2 2 1 1 0 10
2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 28
3 4 3 1 2 0 2 3 2 3 2 4 3 2 34
2 3 5 4 3 4 4 5 4 3 6 3 3 3 52
0 6 1 1 3 2 0 0 3 5 4 4 3 2 34
Tæng 25 38 19 25 35 32 31 31 27 39 33 33 32 27 427
5 5 2 5 5 5 7 7 7 5 3 2 2 3 63
C¸c sè liÖu thu ®−îc ë b¶ng 11 cho thÊy: Víi 140 ph¶n øng PCR nh©n lªn
®−îc tæng sè 427 b¨ng thuéc 56 lo¹i b¨ng cã kÝch cì kh¸c nhau. Trong ®ã, cã
51 b¨ng cho ®a h×nh chiÕm 91,07%, 5 b¨ng ®¬n h×nh chiÕm 8,93%. KÝch th−íc
b¨ng cã chiÒu dµi nhá nhÊt kho¶ng 200 bp vµ b¨ng cã kÝch th−íc lín nhÊt
kho¶ng 4000bp. XuÊt hiÖn 5 b¨ng c¸ biÖt trong ®ã cã 2 b¨ng chØ xuÊt hiÖn duy
nhÊt ë mét mÉu vµ 3 b¨ng khuyÕt ë 1 mÉu duy nhÊt cßn xuÊt hiÖn ë c¶ 13 dßng
cßn l¹i. Måi OPA12 nh©n lªn ®−îc tæng sè b¨ng nhiÒu nhÊt lµ 93 b¨ng vµ mÉu
sè 3 (CG3-D2) xuÊt hiÖn 2 b¨ng c¸ biÖt kÝch th−íc kho¶ng 400 bp, 1600 bp vµ 4
b¨ng v¾ng mÆt (duy nhÊt) ë c¸c vÞ trÝ 1000 bp, 1100 bp, 1400 bp vµ 1500 bp;
-51-
Khãa luËn tèt nghiÖp Bïi V¨n HiÖu
Måi OPM18 nh©n lªn ®−îc 80 b¨ng; Måi OPA15 nh©n lªn ®−îc 63 b¨ng vµ
mÉu CG3-D12 xuÊt hiÖn b¨ng c¸ biÖt kÝch th−íc kho¶ng 2100 bp; Måi S208
nh©n lªn ®−îc 52 b¨ng vµ mÉu CG3-D8 xuÊt hiÖn b¨ng c¸ biÖt kÝch th−íc
kho¶ng 1700 bp; Måi BIO12, OPM18 cïng nh©n lªn ®−îc 34 b¨ng; Måi S201
nh©n lªn ®−îc 28 b¨ng; Måi OPM12 nh©n lªn ®−îc 22 b¨ng vµ mÉu sè 5 (CG3-
D4) xuÊt hiÖn b¨ng c¸ biÖt kÝch th−íc kho¶ng 700 bp; Måi S202 nh©n lªn ®−îc
11 b¨ng; Måi OPM9 nh©n lªn ®−îc 10 b¨ng. Sè b¨ng nh©n lªn trung b×nh cho
c¶ 10 måi lµ 42,7 b¨ng/måi
4.5.3. Mèi quan hÖ gi÷a c¸c dßng ng« kh¸ng thuèc diÖt cá dùa trªn ph©n tÝch RAPD
Sè liÖu thu ®−îc tõ 10 måi RAPD ®−îc thèng kª vµ ph©n tÝch b»ng
phÇn mÒm NTSYSpc 2.02, tõ ®ã chóng t«i thiÕt lËp ®−îc b¶ng hÖ sè t−¬ng
®ång di truyÒn (b¶ng 12) vµ s¬ ®å h×nh c©y quan hÖ di truyÒn cña 14 dßng ng«
kh¸ng thuèc diÖt cá (h×nh 13).
B¶ng 12: HÖ sè t−¬ng ®ång di truyÒn cña c¸c dßng ng« kh¸ng thuèc diÖt cá
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 1 1.00 2 0.57 1.00 3 0.41 0.42 1.00 4 0.51 0.53 0.51 1.00 5 0.57 0.62 0.42 0.50 1.00 6 0.54 0.66 0.41 0.72 0.55 1.00 7 0.69 0.60 0.47 0.64 0.69 0.70 1.00 8 0.64 0.60 0.51 0.64 0.65 0.57 U0.77U 1.00 9 0.57 0.47 U0.35U 0.48 0.63 0.43 0.56 0.56 1.00 10 0.52 0.63 0.41 0.42 0.72 0.47 0.55 0.59 0.57 1.00 11 0.56 0.65 0.48 0.52 0.65 0.54 0.56 0.60 0.50 0.63 1.00 12 0.52 0.65 0.48 0.41 0.58 0.51 0.56 0.48 0.39 0.71 0.60 1.00 13 0.50 0.59 0.50 0.54 0.67 0.56 0.61 0.57 0.43 0.65 0.58 0.75 1.00 14 0.57 0.51 0.48 0.52 0.63 0.55 0.61 0.61 0.50 0.60 0.57 0.66 0.68 1.00
-52-
Khãa luËn tèt nghiÖp Bïi V¨n HiÖu
H×nh 13. S¬ ®å h×nh c©y vÒ mèi quan hÖ di truyÒn cña 14 dßng ng« kh¸ng thuèc diÖt cá
Qua b¶ng 12 vµ h×nh 13 cho thÊy hÖ sè t−¬ng ®ång di truyÒn cña 14 dßng
ng« kh¸ng thuèc diÖt cá ë tõng cÆp dao ®éng tõ 0,35 ®Õn 0,77. Hai dßng sè 7
(CG3-D6) vµ sè 8 (CG3-D7) cã hÖ sè t−¬ng ®ång di truyÒn cao nhÊt lµ 0,77.
Dßng sè 2 (CG4-D1) vµ sè 11 (CG4-D2) cã cïng nguån gèc tõ dßng thuÇn CG4
cã hÖ sè t−¬ng ®ång kh¸ cao lµ 0,65 (phï hîp víi c¸c nghiªn cøu ®¸nh gi¸ vÒ
h×nh th¸i). Dßng sè 3 (CG3-D2) cã nguån gèc tõ nguån vËt liÖu CG3 vµ dßng
sè 11 (CG4-D1) cã nguån gèc tõ CG4 cã hÖ sè t−¬ng ®ång thÊp nhÊt lµ 0,35.
HÖ sè t−¬ng ®ång di truyÒn gi÷a c¸c cÆp dßng dao ®éng tõ 0,35 ®Õn 0,77
chøng tá c¸c dßng ng« t¹o ra tõ c¸c nguån vËt liÖu ban ®Çu rÊt ®a d¹ng vµ phong
phó. Qua kÕt qu¶ sö lý sè liÖu cho thÊy ë møc t−¬ng ®ång 55% cã thÓ chia 14
dßng ng« kh¸ng thuèc trõ cá thµnh 4 nhãm −u thÕ lai:
Nhãm 1 gåm 5 dßng: dßng sè 1 (CG3-D1), sè 4 (CG3-D3), sè 6 (CG3-
D5), sè 7(CG3-D6) vµ dßng sè 8 (CG3-D7) ®−îc chia lµm 2 nhãm phô:
Nhãm 1.1: gåm 3 dßng sè 1, sè 7 vµ sè 8. C¶ 3 dßng ®Òu cã nguån gèc tõ
nguån vËt liÖu ban ®Çu lµ CG3. HÖ sè t−¬ng ®ång cña tõng cÆp dßng trong nhãm
-53-
Khãa luËn tèt nghiÖp Bïi V¨n HiÖu
rÊt cao dao ®éng tõ 0,64-0,77. Trong ®ã hai dßng sè 7 vµ sè 8 cã hÖ sè t−¬ng
®ång di truyÒn cao nhÊt lµ 0,77
Nhãm 1.2 gåm cã 2 dßng sè 4 vµ dßng sè 6 cã nguån gèc tõ nguån vËt
liÖu ban ®Çu lµ CG3 cã hÖ sè t−¬ng ®ång rÊt cao lµ 0,72
Nhãm 2 gåm 7 dßng: dßng sè 2 (CG4-D1), sè 11 (CG4-D2), sè 5 (CG3-
D4), sè 10 (CG3-D9), sè 12 (CG3-D10), sè 13 (CG3-D11) vµ dßng sè 14 (CG3-
D12) trong ®ã dßng sè 2 vµ dßng sè 11 cã nguån gèc tõ CG4, c¸c dßng cßn l¹i
cã nguån gèc tõ CG3, vµ ®−îc chia lµm 3 nhãm phô:
Nhãm 2.1: gåm cã dßng sè 2 vµ dßng sè 11 cã hÖ sè t−¬ng ®ång kh¸ cao
lµ 0,65
Nhãm 2.2: gåm cã dßng sè 5 vµ dßng sè 10 cã hÖ sè t−¬ng ®ång rÊt cao
lµ 0,72
Nhãm 2.3: gåm cã 3 dßng sè 12 , dßng sè 13 vµ sè 14 cã hÖ sè t−¬ng
®ång tõng cÆp rÊt cao dao ®éng tõ 0,66-0,75.
Nhãm 3: chØ cã duy nhÊt dßng sè 9 (CG3-D8) cã hÖ sè t−¬ng ®ång víi
c¸c dßng cßn l¹i dao ®éng tõ 0,35-0,63, trong ®ã hÖ sè t−¬ng ®ång thÊp nhÊt lµ
0,35 gi÷a dßng sè 9 vµ dßng sè 3.
Nhãm 4: chØ cã duy nhÊt dßng sè 3 (CG3-D2) cã hÖ sè t−¬ng ®ång víi
c¸c dßng cßn l¹i rÊt thÊp dao ®éng tõ 0,35-0,51.
Nh− vËy, trªn c¬ së ph©n tÝch ®a dang di truyÒn ë møc ®é ph©n tö ADN
b»ng kü thuËt PCR_RAPD kÕt hîp víi ph©n tÝch vÒ h×nh th¸i cho thÊy sù kh¸c
nhau vÒ ®Æc ®iÓm h×nh th¸i vμ sù kh¸c biÖt di truyÒn gi÷a c¸c dßng ng«. C¸c
dßng cã cïng nguån gèc th−êng cã quan hÖ gÇn gòi víi nhau vμ ë cïng mét
nhãm. Nh÷ng dßng cã hÖ sè t−¬ng ®ång di truyÒn thÊp lµ nh÷ng dßng cã nguån
gèc kh¸c nhau.
Dùa trªn kÕt qu¶ ph©n tÝch ®a d¹ng di truyÒn vÒ h×nh th¸i vµ ph©n tö ®Ó
thiÕt kÕ s¬ ®å lai backcross nh»m t¹o ra ®−îc c¸c dßng ng« −u viÖt mang gen
kh¸ng thuèc trõ cá phôc vô c«ng t¸c t¹o gièng ng« lai kh¸ng thuèc trõ cá.
-54-
Khãa luËn tèt nghiÖp Bïi V¨n HiÖu
PhÇn V. KÕt LuËn Vμ KiÕn NghÞ
5.1. KÕt luËn
– §· t¸ch chiÕt ®−îc 180 mÉu ADN cña 180 dßng ng«.
– §· x¸c ®Þnh ®−îc sù cã mÆt promoter 35S cã kÝch th−íc 195bp cña
14/180 dßng ng« ë thÕ hÖ thø 4 ®−îc t¹o ra b»ng c¸ch tù thô c−ìng bøc tõ 2
nguån vËt liÖu CG3 (mang gen kh¸ng thuèc trõ cá) vµ CG4 (mang gen kh¸ng
s©u vµ kh¸ng thuèc trõ cá).
– §· x¸c ®Þnh ®−îc sù cã mÆt cña gen PAT (®o¹n tr×nh tù ®Æc tr−ng cã ®é
dµi 231 bp) cña dßng ng«.
– §· ®¸nh gi¸ ®−îc mét sè ®Æc ®iÓm h×nh th¸i, chØ tiªu n«ng sinh häc chÝnh
vµ ®a d¹ng di truyÒn ë møc ph©n tö b»ng kÜ thuËt PCR-RAPD cña 14 dßng ng«
nghiªn cøu phôc vô cho c«ng t¸c backcross t¹o dßng ng« −u viÖt mang gen gen
kh¸ng thuèc trõ cá.
5.1. KiÕn nghÞ
Trong c¸c vô tiÕp theo:
– TiÕp tôc kiÓm tra sù cã mÆt cña c¸c gen kh¸ng thuèc trõ cá kh¸c cña 7
dßng ng« ph¸t hiÖn cã promoter 35S (nh−ng kh«ng cã gen PAT).
– KiÓm tra kh¶ n¨ng kh¸ng thuèc trõ cá cña 7 dßng ng« mang gen PAT
b»ng ph−¬ng ph¸p phun thuèc trõ cá nhãm glufosinate ë ngoµi ®ång ruéng.
– Gi÷ nguån vËt liÖu lµ dßng thuÇn, tiÕp tôc nghiªn cøu t¹o c¸c dßng ng«
thuÇn mang gen kh¸ng thuèc trõ cá phôc vô c«ng t¸c backcross (lai ng−îc) ®Ó
chuyÓn gen kh¸ng thuèc trõ cá sang c¸c dßng ng« −u viÖt nh»m t¹o ra dßng
dßng ng« mang gen kh¸ng thuèc trõ cá cã c¸c ®Æc ®iÓm n«ng sinh häc tèt, phôc
vô c«ng t¸c t¹o gièng ng« lai kh¸ng thuèc trõ cá.
-55-
Khãa luËn tèt nghiÖp Bïi V¨n HiÖu
VI. Tμi LiÖu THAM Kh¶o
6.1. Tµi liÖu tiÕng ViÖt
1. Bïi M¹nh C−êng (2007). C«ng nghÖ sinh häc trong chän t¹o gièng Ng«.
NXB N«ng nghiÖp.
2. Bïi M¹nh C−êng, TrÇn Hång Uy, P. W. J. Taylor, R. Ford, NguyÔn ThÞ
Thanh, Lª Quý Kha (2000). Nghiªn cøu ®a d¹ng di truyÒn cña mét sè
dßng ng« ®−êng b»ng ph−¬ng ph¸p RAPD marker. T¹p chÝ Di truyÒn häc
vµ øng dông, sè 1/2000, tr. 16-22.
3. NguyÔn Thuý §iÖp (2003). XÐt nghiÖm ADN c©y trång vµ s¶n phÈm biÕn
®æi gen. LuËn v¨n th¹c sÜ C«ng nghÖ Sinh häc.
4. Phan Xu©n Hµo, Bïi M¹nh C−êng, NguyÔn v¨n tr−êng, §µo BÝch Th¶o.
Ph©n tÝch ®a d¹ng di truyÒn cña c¸c dßng thuÇn vµ mèi quan hÖ gi÷a c¸c
hÖ sè di truyÒn víi n¨ng suÊt c¸c tæ hîp lai ë ng« ®−îc thÓ hiÖn th«ng qua
chØ thÞ SSR. T¹p chÝ N«ng nghiÖp vµ Ph¸t triÓn N«ng th«n, sè 6/2005, tr.
22-25.
5. Th¹ch Mai Hoµng (2000). T¸c ®éng cña c©y trång biÕn ®æi gen tíi m«i
tr−êng. T¹p chÝ Sinh häc ngµy nay, sè 28, tr. 17-19.
6. NguyÔn ThÞ Lang (2002). Ph−¬ng ph¸p c¬ b¶n trong nghiªn cøu c«ng
nghÖ sinh häc. NXB N«ng nghiÖp.
7. Ph¹m B×nh QuyÒn, NguyÔn NghÜa Th×n (1999). §a d¹ng sinh häc. NXB
§H Quèc gia HN.
8. KhuÊt H÷u Thanh (2006). Kü thuËt gen: nguyªn lý vµ øng dông. NXB
KHKT.
9. NguyÔn Quang Th¹ch (2005). Gi¸o tr×nh CNSH N«ng nghiÖp. NXB N«ng
nghiÖp.
-56-
Khãa luËn tèt nghiÖp Bïi V¨n HiÖu
10. Ng« H÷u T×nh, TrÇn Hång Uy, Bïi M¹nh C−êng, Vâ §×nh Long, Lª Quý
Kha, NguyÔn ThÕ Hïng (1997). C©y ng«, nguån gèc, ®a d¹ng di truyÒn
vµ qu¸ tr×nh ph¸t triÓn. NXB N«ng nghiÖp.
11. KhuÊt H÷u Trung vµ cs (2007). Nghiªn cøu ®a d¹ng di truyÒn tËp ®oµn
lan KiÕm ë møc ®é ph©n tö b»ng kü thuËt PCR_RAPD. T¹p chÝ N«ng
nghiÖp vµ ph¸t triÓn n«ng th«n, sè 14/2007, tr. 26-30.
12. Trung t©m Th«ng tin t− liÖu khoa häc vµ c«ng nghÖ Quèc gia. C©y trång
biÕn ®æi gen - T×nh h×nh nghiªn cøu øng dông vµ c¸c quan ®iÓm ph¸t
triÓn. Sè 4/2003.
6.2. Tµi liÖu tiÕng Anh
13. Arne Holst-Jensen (2001). GMO detection methods and vatidation.
National Veterinary Institute, Section of Food & Feed Microbiology,
Ullevaalsveien 68, P.O.Box 8156 Dep. 0033 Oslo, Norway.
14. Bertheau Y., Diolez A., Kobilinsky A., Magin K. (2002). Detection
methods and performance criteria for gennetically modified organisms. J
AOAC Int 2002 May-Jun, 85 (3), pp. 801-808.
15. Brodmann P. D., Ilg EC, Berthoud H., Herrmann A (2002). Real-Time
quantitative polymerase chain reaction methods for four genetically
modified maize varieties and maize DNA content in food. J AOAC Int
2002 May-Jun, 85 (3), pp. 646-653.
16. Devos K. M., and Gale M. D. (1992) - The use of Random Amplified
Polymorphic DNA markers in Wheat. Theor. Appl. Genet 84, pp. 567-
572
17. Hsu Y. L., Lih C., Daniel Y. C. S. (2000). Detection of genetically
modifiedsoybeans and maize by the polymerase chain reaction method.
Journal of Food and Drug Analysis, 8 (3), pp. 200-207.
18. Huebner P., Studer E., Luethy J. (1999). Quantitation of genetically
modified organisms in food. Nature Biotechnol, 17, pp. 1137-1138.
-57-
Khãa luËn tèt nghiÖp Bïi V¨n HiÖu
19. Jaroslava Ovesna, Lenka Dïdicovµ, Jiri Hor¸cek, Eva Sadilov¸, Ladislav
Kucera, Ludmila MÐskov¸ (2002). Comparison of different PCR-based
protocols for detection of Roundup Ready soybean. Czech J.Genet.Plant
Breed, 38(1)/2002, pp. 55-63.
20. Javed Akhter Mohammed Qutub, Norman Burnham, Mohammed Akhtar
(2001). Genetically modified foods :health and safety issues. Annals of
Saudi Medicine, 21 (3-4), pp. 161-164.
21. Keatley K. L., (2000). Controversy over genetically modified organisms:
the governing laws and regulation. Qual Assur 2000 Jan-Mar, 8(1), pp.
33-36.
22. Love J., M. Knight A. M., Mcaleer M. A., and Todd J. A. (1990).
Towards construction of a high resolution map of the mouse genome
using PCRanalyzed microsatellite. Nucl. Acid. Res. 18 (14), pp. 4123 –
4130.
23. Markus L., Anke B., Fabrice E., Lothar K., Heinz S., Guy V., D., E.,
(2000). Validation of a method based on Polymerase chain reaction for
the detection of genetically modified organisms in various processed
foodstuffs. Eur Food Res. Technol 2001, 212, pp. 497-504.
24. Martens (2000). Safety evaluation of genetically modified foods. Int Arch
Environ Health 2000, 73 (Suppl), pp. 14-18.
25. Matsuoka T., H. Kunbara, H. Akiyama, H. Miura, Y. Goda, Y. Kusakabe,
K. Isshiki, M. Toyoda, A. Hino (2001). A multiplex PCR method of
detecting recombinant DNAs from five lines of genetically modified
maize. J. Food Hyg. Soc. Japan, 42, pp. 24-32.
26. McCough S., R. Chen X., Panaud O., Ternykh S., Xu Y., Cho Y., G.
Huang N., Ishii T., and Blair M. (1997). Microsatellite markers
development mapping and application in rice genetics. and breeding,
Plant Mol. Biol. 35, pp. 89 – 99.
-58-
Khãa luËn tèt nghiÖp Bïi V¨n HiÖu
27. Melody, M. Aguiba (2003). Congress bills press for labeling of GM
products. Manila Bulletin, 8-Mar-2003.
28. Meyer R, F. Chardonnens, P. Hubner, J. Luthy (1996). Polymerase chain
reaction (PCR) in the quality and safety assurance of food: detection of
soya in processed meat products. Z. Lebensm. Unters. Forsch , 203, pp.
339-344.
29. Mitten D. H., MacDonald R, Klonus D (1999). Regulation of foods
derived from genetically engineered crops. Curr. Opin. Biotechnol, 10,
pp. 298-302.
30. Morgante M., and Olivieri A. M. (1993). PCR-amplified microsatellites
as markers in plant genetics. Plant J.1, pp. 175 – 182.
31. Moseley B. E., (1999). The safety and social acceptance of novel foods.
Int J. Food Microbiol 1999, 50, pp. 25-31.
32. Nobuaki S., Keiko M., Sachiko O., Wataru H., Makoto K., Shigeru U.,
and Kousaku M. (1998). Safety assessment of genetically engineered
food: Detection and monitoring of Glyphosate-tolerant Soybeans Biosci.
Biotechnol. Biochem 1998, 62(7), pp. 1461-1464.
33. Obara-Okeyo P. & S. Kako, 1998. Genetic diversity and identification of
cymbidium cultivars as measured by random amplified polymorphic
DNA (RAPD) markers. Euphytica 99, pp. 95-1001.
34. Ramon D (2000). Genetically modified foods: a case of information or
misinformation. Int Microbiol 2000, 3, pp. 1-2.
35. Stewart C., Richards H., and Halthill M. (2000). Transgenic plants and
biosafety: science, misconceptions and public perceptions. Biotechniques,
29/2000, pp. 832-843.
36. Studer E., C. Rhyner, J. Luthy, P. Hubner (1998). Quantitative
competitive PCR for the detection of genetically modified soybeans and
maize. Z. Lebensm. Unters. Forsch , 207(A), pp. 207-213.
-59-
Khãa luËn tèt nghiÖp Bïi V¨n HiÖu
37. Vos P., Hoggers R., Becker M., rejain M., Lee T., Hornes M., Friejtera
P.J., Peleman J., Kuiper M. and Zabeau M. (1995). AFLP: a new
technique for DNA fingerprinting. Nucl. Acid. Res. 23, pp. 4407 – 4414.
6.3. Website
38. http://Twww.agbiotech.com.vn/T
39. http://www.cast-science.org/
40. http:// www.gmo.gov.vn
41. http://www.isaaa.org
42. http://www.ncst.ac.vn/index.asp
43. http://www.sciencedirect.com
44. http:// www.sinhhocvietnam.com
45. Hhttp://www.vast.ac.vn/H
46. http://www.worldwatch.org/pubs/vs/2002/economy.html
-60-