Bản đồ promoter hoạt động của genome người

Chia sẻ: Nguyen Phuonganh | Ngày: | Loại File: PDF | Số trang:5

Thêm vào BST

Báo xấu

136
lượt xem 14
download

Download Vui lòng tải xuống để xem tài liệu đầy đủ

Bất kỳ gene mã hóa protein nào trong tế bào eukaryote đều bắt đầu phiên mã của nó bằng cách lắp ghép phức hệ tiền khởi động RNA polymerase II (PIC - preinitiation complex ) vào promoter. Các promoter, cùng với enhancer, silencer và insulator tạo thành tổ hợp mã đặc hiệu trong hầu hết các mô hình biểu hiện gene.

Chủ đề:

Bình luận(0) Đăng nhập để gửi bình luận!

Lưu

Nội dung Text: Bản đồ promoter hoạt động của genome người

Bản đồ promoter hoạt động của genome người Bất kỳ gene mã hóa protein nào trong tế bào eukaryote đều bắt đầu phiên mã của nó bằng cách lắp ghép phức hệ tiền khởi động RNA polymerase II (PIC -
preinitiation complex ) vào promoter. Các promoter, cùng với enhancer, silencer và insulator tạo thành tổ hợp mã đặc hiệu trong hầu hết các mô hình biểu hiện gene. Số promoter trùng với gene trên EnsEMBL (trên) hoặc promoter
đã chú thích trên Tuy nhiên, khả năng DBTSS phân tích logic quá (dưới) trình điều khiển sự mã hóa trong genome người hiện bị giới hạn do không có thông tin promoter chính xác của hầu hết các gene. Trong nghiên cứu này, Kim và cộng sự đã xác định bản đồ promoter hoạt động trên quy mô toàn bộ genome của nguyên bào sợi (fibroblast cell) người. Để đạt được kết quả trên, họ chọn cách tiếp cận thực nghiệm để xác định vị vị trí gắn của PIC
trên toàn bộ genome. Bản đồ này chỉ ra10.567 promoter hoạt động tương ứng với 6.763 gene đã biết và ít nhất 1.196 đơn vị phiên mã chưa được chú thích. Từ đó cho thấy các cụm promoter (multi promoter) được sử dụng phổ biến khi phiên mã và tính chất phân tán xuyên suốt bộ gene của các nhóm promoter hoạt động . Ngoài ra, khi xem xét phổ biểu hiện trên quy mô toàn bộ genome họ cũng tìm ra bốn nhóm promoter phổ quát mà chúng quy định tòan
bộ transcriptome (phổ phiên mã) của tế bào. Các kết quả này cung cấp một cái nhìn tổng thể mối liên hệ chức năng giữa bộ máy phiên mã, cấu trúc nhiễm sắc chất và sự biểu hiện gene của tế bào người.