Đa hình gen IL-1RN ở người Việt Nam: Nghiên cứu và phân tích

CÁC ĐA HÌNH CA GEN IL-1RN  NGƯI VIT NAM

Hà Mai Dung

, Tng Th Hng

TÓM TT

Đt vn ñ: Đa hình ca các gen trong ñó có IL-1RN ñưc xem góp phn vào cơ

ch bnh sinh ca nhiu bnh lý. Nhng dân tc khác nhau cho thy kiu ña hình gen

khác nhau; ñiu này ñưa ñn nhu cu nghiên cu các ña hình gen này trên ngưi bình

thưng  các dân tc riêng bit.

Mc tiêu nghiên cu: Nghiên cu ñc ñim và tn sut các ña hình ca gen IL-

1RN trên ngưi Vit; so sánh vi hai nhóm dân tc Đông Á và Phương Tây; xem xét

mi liên quan gia các ña hình này vi nhim H. pylori trên ngưi Vit.

Đi tưng và phương pháp nghiên cu: 130 sinh viên kho mnh ngưi Kinh

tham gia nghiên cu và cho máu. DNA ly trích t máu toàn phn. Genotyping gen IL-

1RN bng PCR. Tình trng nhim H. pylori ñưc xác ñnh bng in house ELISA test

kit. SPSS and GraphPad InStat 3 ñưc dùng ñ phân tích kt qu.

Kt qu: Các ña hình ca gen IL-1RN như sau: genotype 1/1 (90%), 1/2 (7,7%),

2/2 (2,3%). Tn sut allele 2: 8,6%, ging vi nhóm các nưc Đông Á. Ngưi mang

genotype 2/2 cho thy 9 ln d nhim H. pylori hơn ngưi mang genotype 1/1.

Kt lun: Kiu gen IL-1RN  ngưi Vit ging các nưc Đông Á. IL-1RN allele 2

có th có liên quan ñn tăng nguy cơ nhim H. pylori trên ngưi Vit.

T khóa: Đa hình gen IL-1RN, Ngưi Vit, Helicobacter pylori

ABSTRACT

IL-1RN POLYMORPHISMS IN VIETNAMESE

Ha Mai Dung*, Tong Thi Hang*

Background: Polymorphisms of genes including IL-1RN have been proved to

play a role in pathogenesis of many diseases. Different ethnic groups have showed

different patterns of genetic polymorphisms; this finding requires studying a pattern

of genetic polymorphism in a specific population.

Aims: Studying characteristics and prevalence of IL-1RN polymorphisms in

Vietnamese; doing comparison between Vietnamese and the two groups: East-Asia

and Western countries in this gene; examining the correlation between IL-1RN

polymorphisms and Helicobacter pylori infection in Vietnamese.

Methods: 130 healthy Vietnamese Kinh students participated in the study and

donated their blood. DNA was isolated from the whole blood. IL-1RN genotyping was

conducted using PCR. H. pylori infection was evaluated using in house ELISA test kit.

SPSS and GraphPad InStat 3 were used for analyzing.

Trưng Đi Hc Quc t - Đi Hc Quc Gia TPHCM

Đa ch liên h: TS BS Hà Mai Dung. Đin thoi: 0937957058

Email: hmdung@hcmiu.edu.vn, mdungha@yahoo.com.au

Results: Polymorphisms of IL-1RN have been showed: Genotype 1/1 (90%), 1/2

(7,7%) and 2/2 (2,3%). Allele 2 rate being 8,6% was similar to East-Asian group.

Carriers of genotype 2/2 were 9 times more likely to get infection with H. pylori than

carriers of genotype 1/1.

Conclusion: The pattern of IL-1RN polymorphisms in Vietnamese was similar to

East-Asian group. IL-1RN allele 2 may increases the risk of H. pylori infection in

Vietnamese.

Keywords: IL-1RN polymorphisms, Vietnamese, Helicobacter pylori

ĐT VN Đ

Helicobacter pylori nhim hơn phân na dân s th gii và gây ra nhiu bnh

cnh khác nhau t viêm loét d dày tá tràng cho ñn ung thư d dày

[14]

. Năm 1994, t

chc quc t v nghiên cu ung thư (International Agency for Research on Cancer:

IARC) ñã xp H. pylori vào nhóm 1 ca các yu t gây ung thư

[13]

. Tuy nhiên có th

thy rõ mt ñiu là mc dù t l nhim H. pylori cao nhưng t l ung thư d dày trên

ngưi nhim H. pylori thì không cao (<3%); như vy ngoài yu t nhim khun còn

có nhng yu t khác góp phn vào cơ ch bnh sinh ca ung thư d dày.

Gn ñây yu t di truyn ca ngưi bnh ñưc nghiên cu nhiu như là mt tác

nhân góp phn vào cơ ch bnh sinh ca nhiu bnh lý khác nhau trong ñó có nhim

khun H. pylori và ung thư d dày. M ñu cho các nghiên cu v vai trò ca yu t

di truyn trong ung thư d dày là nghiên cu ca El-Omar và cng s vào năm 2000.

Trong nghiên cu này, El-Omar ñã cho thy mi liên quan gia mang mt s ña hình

ñc bit ca gen IL-1RN, các ñim gen IL-1B-511 và TNFA-308 và nguy cơ ung thư

d dày. Đi vi gen IL-1RN, ngưi mang genotype IL-1RN 2/2 s tăng nguy cơ b ung

thư d dày hơn nhng ngưi khác

[5,19]

. Nu như nhng nghiên cu v mi liên quan

gia yu t di truyn và ung thư d dày sau ñó ñưc nghiên cu rt rng rãi, thì nhng

báo cáo v mi liên quan gia yu t di truyn và nhim H. pylori hu như rt ít,

không ñáng k và chưa có báo cáo nào nêu lên mi liên quan gia nhim H. pylori và

các ña hình ca gen IL-1RN.

IL-1RN vit t!t ca gen Interleukin 1 receptor antagonist, là mt gen ñi vn vi

gen IL-1B (Interleukin-1β). Gen IL-1B mã hóa cytokine Interleukin-1B, là mt trong

nhng cytokine quan tr"ng ca phn ng tin viêm. Hot ñng ñi vn ca IL-1RN

xy ra do IL-1RN tranh dành receptors vi IL-1B d#n ñn giãm hot ñng ca IL-1B.

Đa hình IL-1RN allele 2 ñưc cho là nh hưng ñn hot ñng ca gen IL-1RN thông

qua cơ ch gene splicing

[1, 25]

Khi càng có nhiu nghiên cu thc hin trong lĩnh vc di truyn và bnh lý thì

ngưi ta phát hin ra r%ng nhng nghiên cu  nhng dân tc, quc gia khác nhau cho

ra nhng kt qu không ging nhau. Và mt trong nhng nguyên nhân ñưc tìm ra là

kiu m#u di truyn ca các dân tc khác nhau là khác nhau. Chính vì ñiu này, nhu

cu nghiên cu ñc ñim ca các gen gây bnh  nhng quc gia dân tc khác nhau là

cn thit.

MC TIÊU NGHIÊN CU

Nghiên cu các kiu ña hình khác nhau ca gen IL-1RN trên ngưi Vit Nam, qua

ñó so sánh vi mt s quc gia khác. Đ&ng thi ñánh giá mi tương quan gia các ña

hình ca gen IL-1RN và nhim khun H. pylori trên ngưi Vit.

ĐI TƯNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CU

Đi tưng nghiên cu

Mt trăm ba mươi sinh viên kho' mnh thuc dân tc Kinh ñang theo h"c ti

trưng Đi H"c Quc T-Đi H"c Quc Gia TPHCM ñưc thông báo v ñ tài nghiên

cu, t nguyn ký giy tham gia nghiên cu, ñin thông tin cá nhân và cho máu. M(i

ñi tưng tham gia nghiên cu cho 3ml máu toàn phn vi chng ñông b%ng EDTA

dành cho ly trích DNA và 2ml máu ñông dành cho ly trích huyt thanh ñ ñánh giá

tình trng nhim H. pylori. Tt c m#u máu ñưc thu thp trong tháng 9/2009. Các

m#u máu toàn phn và huyt thanh sau khi ly trích ñưc bo qun  -20

C cho ñn lúc

th) nghim.

Phương pháp nghiên cu

Ly trích DNA: DNA ñưc ly trích t máu toàn phn b%ng cách s) d*ng b kít

Qiagen Blood minikit và thc hin theo hưng d#n ca nhà sn xut.

Xác ñnh các ña hình ca IL-1RN: B%ng k+ thut PCR vi PCR master Mix

kit ca công ty Qiagen và cp m&i IL-1RNF: CTC AGC AAC ACT CCT AT và IL-

1RNR: TCC TGG TCT GCA GGT AA

(24)

. Điu kin phn ng PCR: Bin tính chu(i

DNA  94

C trong 4 phút; sau ñó thc hin 35 chu kỳ nhit vi 94

C 30 giây, 56

30 giây, 72

C 45 giây; sau cùng là 72

C trong 5 phút. Sn phm PCR ñưc xác ñnh

b%ng cách chy ñin di vi agarose 2% và có chy kèm vi 100 base pair DNA ladder

ñ so sánh. Sau ñó bn thch ñưc nhum vi Ethidium bromide và ñ"c kt qu b%ng

h thng Gel Doc. Các ña hình ca IL-1RN là s ln lp li khác nhau (VNTR:

Variable Number Tandem Repeat) ca chu(i 86 nucleotides ti v trí intron2, 2q14.2

ca gen IL-1RN (hình 1).

Đánh giá tình trng nhim H. pylori: b%ng in house ELISA test kít do Vin

V sinh Dch T Trung ương Hà Ni phi hp vi vin Karolinska ca Th*y Đin ch

to và b kít này ñã ñưc chun hóa trên ngưi Vit ñ có ñưc ñ nhy cm (94,1%)

và ñ chuyên bit (97,8%) tt nht

(10, 11)

Qun lý và phân tích d liu b%ng Phn mm SPSS phiên bn 17. Phn mm

GraphPad InStat 3 dùng ñ xác ñnh Fisher Exact test và OR (Odd Ratio) ñ xác ñnh

mi liên quan gia các ña hình ca gen IL-1RN và nhim H. pylori.

KT QU

Đc ñim mu nghiên cu

M#u bao g&m 130 sinh viên tui t 18 ñn 27, tui trung bình là 20; bao g&m 53

nam và 77 n. Hu ht nhng ngưi tham gia nghiên cu là ngưi min Nam (92,3%)

bao g&m thành ph H& Chí Minh (55,4%), min Đông Nam b (25,4%) và min tây

Nam b (11,5%). S lưng m#u có ngu&n gc t min Trung và min B!c rt nh-

(5,4% và 2,3%).

Tn sut các ña hình ca gen IL-1RN

Ch có 3 loi genotype IL-1RN1/1, IL-1RN1/2 và IL-1RN2/2 ñưc quan sát thy

trên m#u vi tn sut cao nht là genotype IL-1RN1/1 (90%), genotype IL-1RN1/2 và

IL-1RN2/2 chim tn sut rt thp (7,7% và 2,3%) (bng 1).

Không có s khác bit có ý nghĩa gia các khu vc thưng trú khác nhau lên trên

tn sut các ña hình ca gen IL-1RN vi giá tr p=0,5 (χ2 test) (bng 1); gii tính cũng

không có nh hưng lên tn sut các ña hình ca gen này vi p=0,4 (χ2 test) (bng 2).

Bng 1: Tn sut các ña hình ca gen IL-1RN theo khu vc thưng trú

Các ña hình ca gen IL-

1RN

S lưng (phn trăm)

Tng

cng

Nơi

thưng

trú 1/1 1/2 2/2

HCM

66(91,7) 4(5,6) 2(2,8)

Đông

Nam

B

30(90,9) 3(9,1) 0(0,0)

Tây

Nam

B

12(80,0) 2(13,3)

1(6,7)

Min

Trung

7(100) 0(0,0) 0(0,0)

Min

B!c

2(66,7) 1(33,3)

0(0,0)

Tng

cng

117(90,0)

10(7,7)

3(2,3)

130

Bng 2: Tn sut các ña hình ca gen IL-1RN theo gii tính

Các ña hình ca gen IL-

1RN

S lưng (phn trăm)

Tng

cng

Gii

tính

1/1 1/2 2/2

Nam 46(86,8) 6(11,3) 1(1,9) 53

N 71(92,2) 4(5,2) 2(2,6) 77

Tng

cng

117(90) 10(7,7) 3(2,3) 130

Mi liên h gia các ña hình ca gen IL-1RN vi nhim H. pylori

Mc dù mi liên quan gia genotype IL-1RN2/2 và IL-1RN allele 2 vi nhim H.

pylori không có ý nghĩa thng kê (p=0,09 và p=0,2), nhưng có th quan sát thy ngưi

mang genotype IL-1RN2/2 d nhim H. pylori 9 ln nhiu hơn ngưi mang genotype

IL-1RN1/1 [OR=9,0(0,5-179,1); p=0,09]. Cũng tương t, ngưi mang IL-1RN allele 2

d nhim H. pylori 2,2 ln nhiu hơn ngưi mang IL-1RN allele 1 [OR=2,2(0,8-6,2);

p=0,2] (bng 3).

Bng 3: Mi liên quan gia các genotypes và alleles ca IL-1RN và nhim khu n H.

pylori

Các genotypes và

alleles ca IL-1RN

H. pylori (-)

S lưng (%)

H. pylori (+)

S lưng (%) OR(95%CI)

P value (Two-

sided Fisher’s

Exact test)

1/1 66(91,7) 51(87,9) 1

1/2 6(8,3) 4(6,9) 0,9(0,2-3,2) 1

2/2 0(0,0) 3(5,2) 9,0(0,5-179,1) 0,09

allele 1 138(95,8) 106(91,4) 1

allele 2 6(4,2) 10(8,6) 2,2(0,8-6,2) 0,2

So sánh tn su t IL-1RN allele 2 ca ngưi Vit vi các nưc thuc Đông Á và

các nưc Phương Tây

Kho sát tn sut IL-1RN allele 2  hai nhóm nưc Đông Á và Phương Tây thy

có mt s khác bit rõ rt (bng 4 và hình 3). Tn sut này  các nưc Phương Tây

trung bình là 26,5%; ln hơn h/n so vi tn sut trung bình  các nưc Đông Á là

6,3% (p<0,001, T test). Tn sut IL-1RN allele 2 ca Vit Nam là 8,6%, ging vi

nhóm các nưc Đông Á (bng 4 và hình 3).

Các đa hình của gen IL-1RN ở người Việt Nam

Trong đề tài này nhằm nghiên cứu đặc điểm và tần suất các đa hình của gen IL1RN trên người Việt; so sánh với hai nhóm dân tộc Đông Á và Phương Tây; xem xét mối liên quan giữa các đa hình này với nhiễm H. pylori trên người Việt.

Chủ đề:

Tài liệu liên quan

Tài liêu mới

AI tóm tắt

Giới thiệu tài liệu

Đối tượng sử dụng

Từ khoá chính

Nội dung tóm tắt

Hỗ trợ

Phương thức thanh toán

Theo dõi chúng tôi