Giới thiệu tài liệu
Đó là một ghi chú hoặc hướng dẫn về điều hành Molecular Dynamics (MD) và những ứng dụng của nó trong việc tạo ra bản vẽ cho một protein. Nội dung gồm có thông tin về: Mã lúc đầu giới thiệu về MD, mô hình quan hệ giữa các từ hoà, khả năng tính toán bằng cách sử dụng phương pháp simulación máy tính để hiểu hệ sinh thái và dự đoán việc làm của chúng. Tham gia các công cụ phần mềm cho MD simulation như VMD (Visual Molecular Dynamics) và ReaxFF (Reactive Force Field).
Đối tượng sử dụng
Nhóm sinh viên, nhà nghiên cứu về sinh học, công ty hoạch định chính sách trong ngành dược phẩm và y tế
Nội dung tóm tắt
Tài liệu này chủ yếu trình bày về Molecular Dynamics (MD), một phương pháp simulación máy tính để làm việc với các hệ sinh thái và dự đoán những sự kiện xảy ra trong chúng. Nó giới thiệu các loại từ hoà quan trọng giữa các từ, gồm Van der Waals forces, electrostatic interactions và hydrogen bonding. Tiếp theo, nó đề cập đến cấu trúc của protein và quy mô của những cấu trúc phân cấp (primary, secondary, tertiary, quaternary). Nó còn chỉ ra vai trò của side chains trong việc định hình cấu trúc và hoạt động của protein. Cuối cùng, nó luật khoá cho rằng simulación máy tính là một yếu tố quan trọng để hiểu hệ sinh thái và dự đoán việc làm của chúng. Tài liệu cũng cho biết những công cụ phần mềm sử dụng trong MD simulations như VMD (Visual Molecular Dynamics) và ReaxFF (Reactive Force Field).
