Bài giảng Vật lí y sinh: Buổi 4 - Trần Thị Minh Thư

Bản báo cáo này thảo luận về quan hệ giữa phénomena cơ học thống kê và tính chất nhiệt động, giải thích rằng để tính các đại lượng vĩ mô từ các đại lượng vi mô, cần phải tính tích phân trên không gian pha. Nó cũng thảo luận về tập hợp, rời rạc quỹ đạo pha, mô phỏng MD là những phương pháp được sử dụng để ước lượng gần đúng các đại lượng nhiệt động, và thách thức cho mô phỏng hệ sinh học.

Đối tượng yêu cầu là những người đang hoặc sẽ hoạt động trong lĩnh vực nghiên cứu học phân tử, chủ yếu đó là sinh viên khoa học, nhà nghiên cứu thuyết minh, các người làm việc trong lĩnh vực quản lý năng lượng và hóa đơn chính phí.

Bản báo cáo này chủ yếu thảo luận về quan hệ giữa phénomena cơ học thống kê (statistical mechanics) và tính chất nhiệt động (thermodynamic properties). Nó giải thích rằng, để tính các đại lượng vĩ mô từ các đại lượng vi mô, ta cần phải tính tích phân trên toàn bộ không gian pha. Nó cũng giải thích rằng tập hợp (ensemble) là một khái niệm quan trọng để chú trọng và hạn chế số lượng bản sao của hệ, từ đó có thể tạo ra những mẫu rời rạc (sampling) cho phép ước lượng gần đúng các đại lượng nhiệt động. Nó giải thích rằng có hai loại mẫu rời rạc quỹ đạo pha (canonical ensemble) và mô phỏng MD, cả hai đều sử dụng phương trình chuyển động của hạt để tạo ra những loại bản sao khác nhau và tính đại lượng nhiệt động. Ngoài ra, bản báo cáo cũng giải thích rằng thách thức cho mô phỏng hệ sinh học là việc tính toán quan sát hàng trăm nghìn nguyên tử, thường trong các tương tác tinh tế, khó khăn để đơn giản hóa.