Cấu trúc SRP RNA
SRP RNA nằm trong phức SRP
(gồm nhiều tiểu phần protein
kiên kết với 1 phân tửRNA).
Phân tửSRP RNA dài khoảng 300
nucleotides có trình tựbổsung
với rRNA.
SRP RNA gồm 2 vùng: vùng Alu
và vùng S.
Chứcnăng SRP
Phức SRP có 3 domains quy định 3
chứcnăng khác nhau
•tương tác với tín hiệu trên protein
•tương tác với thụthểcủa SRP
•tương tác với tiểu phần lớn
ribosome làm dừng tạm thời dịch
mã.
Chứcnăng SRP
Vận chuyển chuỗi peptide đang
được tổng hợpđến bềmặt lưới
nội chất.
Ngăn cản tổng hợp protein hoàn
chỉnh nếu thiếu lưới nội chất.
GTPase
Tín hiệu vận chuyển là đoạn peptide
chứađoan kỵnước (có vai trò trong
tương tác giữa tín hiệu vận chuyển và
thụquan SRP).
ThụthểSRP là docking
protein, gồm chuỗi
polypeptide αnằm trên
lưới nội chất và βnằm
xuyên lưới nội chất.
Sựtiến hoá
của SRP RNA
So sánh giữađại diện 3
lãnh giới về
oCấu trúc SRP RNA
oCác protein gắn vào RNA
trong phức
oSRP receptor
SRP RNA của Eukaryota, Archaea, Bacteria
tmRNA
Cấu trúc tmRNA
tmRNA dài khoảng 260-
430 nucleotide, gồm 2
domains.
Domain giống nhưtRNA
được gắn với acid amin
(alanine) tại vịtrí đầu 3'
CCA.
Domain giống mRNA:
phần nằm bên trong giãn
ra đểdịch mã gọi là khung
đọc mởngắn (short ORF).
tmRNA của T. thermophilus với domain tRNA-
like màu tím và khung đọc mởngắn (short
ORF)-màu đen