Đồ Án Tốt Nghiệp
BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO
TRƯỜNG ĐẠI HỌC CÔNG NGHỆ TP. HỒ CHÍ MINH
ĐỒ ÁN TỐT NGHIỆP
SÀNG LỌC VÀ ĐỊNH DANH CÁC CHỦNG VI KHUẨN QUANG HỢP CÓ KHẢ
NĂNG HẤP THU MUỐI VÀ ĐỊNH HƯỚNG ỨNG DỤNG GIẢM NHIỄM MẶN
Ngành : Công nghệ sinh học
Chuyên ngành: Công nghệ sinh học
Giảng viên hướng dẫn: TS. Hoàng Quốc Khánh
HVCH. Ngô Đức Duy
Sinh viên thực hiện: Châu Thị Thùy Linh
MSSV: 1411100757 Lớp: 14DSH01
TP. Hồ Chí Minh, 2018
Đồ Án Tốt Nghiệp
LỜI CAM ĐOAN
Đồ án tốt nghiệp này là công trình nghiên cứu của bản thân tôi dưới sự hướng dẫn
của TS. Hoàng Quốc Khánh và HVCH. Ngô Đức Duy, thực hiện tại Viện Sinh học Nhiệt
đới. Những số liệu và kết quả phân tích trong đề tài này hoàn toàn trung thực, không sao
chép từ bất kì nguồn tài liệu tham khảo nào khác dưới bất kỳ hình thức nào. Một số nội
dung trong đồ án tốt nghiệp có tham khảo và sử dụng dữ liệu trích dẫn được công bố công
khai trên các bài báo khoa học, website, tác phẩm theo danh mục tài liệu tham khảo của
đồ án.
Nếu có bất cứ sự sao chép và không trung thực trong đồ án này, người thực hiện đề
tài xin hoàn toàn chịu trách nhiệm trước Viện Khoa học ứng dụng Hutech và trước Ban
Giám Hiệu trường Đại học Công nghệ Thành phố Hồ Chí Minh.
Ngày … tháng … năm 2018
Sinh viên thực hiện
Châu Thị Thùy Linh
Đồ Án Tốt Nghiệp
MỤC LỤC
DANH MỤC CÁC TỪ VIẾT TẮT .................................................................................. i
DANH MỤC HÌNH ẢNH ............................................................................................... ii
DANH MỤC BẢNG ..................................................................................................... iii
MỞ ĐẦU ......................................................................................................................... 1
1. Tính cấp thiết của đề tài ....................................................................................... 1
2. Tình hình nghiên cứu ............................................................................................ 2
2.1 Tình hình nghiên cứu trên thế giới ................................................................... 2
2.2 Tình hình nghiên cứu trong nước ..................................................................... 4
3. Mục đích nghiên cứu ............................................................................................ 6
4. Nhiệm vụ nghiên cứu ........................................................................................... 6
5. Phương pháp nghiên cứu ...................................................................................... 6
6. Các kết quả đạt được ............................................................................................ 6
7. Kết cấu đồ án tốt nghiệp ....................................................................................... 7
CHƯƠNG 1: TỔNG QUAN TÀI LIỆU ......................................................................... 8
1.1 Tình hình xâm nhập mặn ở Việt Nam và các hướng giải quyết hiện nay ................. 8
1.1.1 Tình hình xâm nhập mặn ở Việt Nam ............................................................... 8
1.1.2 Nguyên nhân gây ra xâm nhập mặn .................................................................. 9
1.1.3 Các cách khắc phục xâm nhập mặn hiện nay .................................................. 10
1.2 Các cơ chế khử muối ............................................................................................... 12
1.2.1 Cơ chế khử muối trong tự nhiên ...................................................................... 12
1.2.2 Cơ chế khử muối của thực vật ......................................................................... 12
1.2.3 Cơ chế khử muối của động vật......................................................................... 13
1.2.4 Cơ chế khử muối của vi sinh vật ...................................................................... 14
1.3 Giới thiệu về nhóm vi khuẩn quang hợp ................................................................. 15
1.4 Định danh bằng phương pháp sinh học phân tử ...................................................... 17
1.4.1 Nguyên tắc ....................................................................................................... 17
Đồ Án Tốt Nghiệp
1.4.2 Phương pháp ly trích DNA vi sinh vật ............................................................. 17
1.4.3 PCR trong định danh vi sinh vật ...................................................................... 18
1.4.4 Xây dựng cây phát sinh loài ............................................................................. 21
CHƯƠNG 2: PHƯƠNG PHÁP VÀ VẬT LIỆU NGHIÊN CỨU ................................ 22
2.1 Thời gian và địa điểm nghiên cứu ........................................................................... 22
2.2 Vật liệu nghiên cứu.................................................................................................. 22
2.2.1 Dụng cụ và thiết bị ........................................................................................... 22
2.2.2 Giống vi khuẩn ................................................................................................. 22
2.2.3 Hóa chất ........................................................................................................... 22
2.2.4 Các phần mềm sử dụng .................................................................................... 23
2.3 Phương pháp nghiên cứu ......................................................................................... 24
2.3.1 Sơ đồ nghiên cứu .............................................................................................. 24
2.3.2 Thu mẫu ........................................................................................................... 25
2.3.3 Tăng sinh .......................................................................................................... 27
2.3.4 Chọn lọc vi khuẩn quang hợp .......................................................................... 27
2.3.5 Bảo quản ........................................................................................................... 28
2.3.6 Chọn lọc các chủng vi khuẩn có khả năng chịu mặn ....................................... 28
2.3.7 Chọn lọc các chủng vi khuẩn có khả năng hấp thu mặn .................................. 28
2.3.8 Định danh các chủng vi khuẩn ......................................................................... 29
CHƯƠNG 3: KẾT QUẢ VÀ BIỆN LUẬN .................................................................. 32
3.1 Kết quả tăng sinh của vi khuẩn ................................................................................ 32
3.2 Kết quả phân lập vi khuẩn ....................................................................................... 33
3.3 Kết quả quan sát hình thái vi khuẩn ........................................................................ 36
3.4 Kết quả khảo sát khả năng chịu mặn ....................................................................... 39
3.5 Kết quả khảo sát khả năng hấp thụ mặn .................................................................. 42
3.6 Định danh ................................................................................................................ 45
3.6.1 Ly trích, thu nhận DNA ................................................................................... 44
Đồ Án Tốt Nghiệp
3.6.2 Nhân sợi DNA bằng phương pháp PCR .......................................................... 45
3.6.3 Xác định trình tự DNA – So sánh với ngân hàng dữ liệu gen NCBI ............... 46
CHƯƠNG 4: KẾT LUẬN VÀ KIẾN NGHỊ ................................................................ 51
4.1 Kết luận.................................................................................................................... 51
4.2 Kiến nghị ................................................................................................................. 51
TÀI LIỆU THAM KHẢO ............................................................................................. 52
PHỤ LỤC HÌNH ẢNH ................................................................................................. 53