BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO
ĐẠI HỌC NÔNG LÂM TP. HỒ CHÍ MINH
BỘ MÔN CÔNG NGHỆ SINH HỌC

KHÓA LUẬN TỐT NGHIỆP
NGHIÊN CỨU ĐA DẠNG DI TRUYỀN VÀ XÁC ĐỊNH MARKER
LIÊN KẾT TÍNH KHÁNG BỆNH HÉO ĐỎ ĐẦU LÁ
TRÊN CÂY DỨA CAYENNE (Ananas comosus)
BẰNG PHƢƠNG PHÁP RAPD
Ngành học: CÔNG NGHỆ SINH HỌC
Niên khóa: 2003-2007
Sinh viên thực hiện: NGUYỄN HỒNG PHONG
Thành phố Hồ Chí Minh
Tháng 9/2007
BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO
ĐẠI HỌC NÔNG LÂM TP. HỒ CHÍ MINH
BỘ MÔN CÔNG NGHỆ SINH HỌC

NGHIÊN CỨU ĐA DẠNG DI TRUYỀN VÀ XÁC ĐỊNH MARKER
LIÊN KẾT TÍNH KHÁNG BỆNH HÉO ĐỎ ĐẦU LÁ
TRÊN CÂY DỨA CAYENNE (Ananas comosus)
BẰNG PHƢƠNG PHÁP RAPD
Giáo viên hƣớng dẫn: Sinh viên thực hiện:
TS. TRẦN THỊ DUNG NGUYỄN HỒNG PHONG
CN. LƢU PHÚC LỢI
Thành phố Hồ Chí Minh
Tháng 9/2007
iii
LỜI CẢM ƠN
Xin chân thành cảm ơn:
- Ban Giám Hiệu trƣờng Đại học Nông Lâm Tp. Hồ Chí Minh đã tạo mọi điều
kiện cho tôi trong suốt thời gian học tập.
- Các thầy cô trong Bộ môn Công Nghệ Sinh Học cùng các thầy cô đã trực
tiếp giảng dạy trong suốt bốn năm qua.
- TS. Trần Thị Dung và CN. Lƣu Phúc Lợi đã tận tình hƣớng dẫn và động viên
trong thời gian thực hiện đề tài tốt nghiệp.
- TS. Lê Đình Đôn đã hƣớng dẫn và góp ý cho tôi khi tiến hành chủng rệp tại
nhà lƣới.
- CN. Hồ Việt Thế và các anh chị phụ trách phòng CNSH thực vật thuộc
Trung tâm phân tích thí nghiệm Hóa Sinh - Đại học Nông Lâm Tp. Hồ Chí Minh đã
giúp đỡ trong suốt thời gian ở phòng thí nghiệm.
- Chị Tôn Bảo Linh, chị Biện Thị Lan Thanh đã góp ý và giúp đỡ tôi trong quá
trình làm đề tài.
- Toàn thể lớp CNSH29 đã hỗ trợ và động viên tôi trong suốt thời gian học tập
tại trƣờng.
- Thành kính ghi ơn ba mẹ cùng những ngƣời thân trong gia đình luôn tạo điều
kiện và động viên để con đạt đƣợc thành quả nhƣ ngày hôm nay.
Tháng 9 năm 2007
Nguyễn Hồng Phong
iv
TÓM TẮT
NGUYỄN HỒNG PHONG – Lớp DH03SH, Đại học Nông Lâm Tp. HCM.
Đề tài “Nghiên cứu đa dạng di truyền và xác định marker liên kết tính kháng
bệnh héo đỏ đầu lá trên cây dứa Cayenne (Ananas comosus) bằng phƣơng pháp
RAPD” dƣới sự hƣớng dẫn của TS. Trần Thị Dung và CN. Lƣu Phúc Lợi đƣợc thực
hiện tại Trung tâm phân tích thí nghiệm hóa sinh và khu nhà lƣới bảo vệ thực vật
khoa Nông học Đại học Nông Lâm Tp. HCM.
Nội dung nghiên cứu gồm:
Đánh giá đa dạng di truyền các giống dứa Cayenne tại Tp. HCM bằng kỹ
thuật RAPD.
Nuôi rệp sáp và tiến hành lây nhiễm virus PMWaV thông qua vector là
rệp sáp.
Xác định marker RAPD liên kết tính kháng bệnh héo đỏ đầu lá trên dứa
Cayenne.
Các kết quả thu đƣợc:
Kết quả cây phân nhóm di truyền cho thấy giữa nhóm Cayenne và đối
chứng Queen có hệ số tƣơng đồng là 0,9. Nhóm dứa Cayenne phân thành
2 nhóm nhỏ: nhóm 1 gồm 2 giống Cayenne Trung Quốc và Thái Lan,
nhóm 2 là giống Lâm Đồng. Mức tƣơng đồng giữa 2 nhóm khoảng 0,92.
Kết quả kiểm tra độ tin cậy bằng phần mềm winboot cho thấy cây phân
nhóm di truyền tạo ra là có độ tin cậy cao nhất.
Kết quả nuôi rệp sáp cho thấy rệp có thể phát triển tốt trên bí đỏ và trong
điều kiện 25-26oC rệp phát triển tốt hơn trong điều kiện 33-34oC.
Đã lây nhiễm đƣợc bệnh héo đỏ đầu lá lên dứa Cayenne với tỷ lệ 35,66%
cây có biểu hiện bệnh.
Chƣa phát hiện đƣợc marker liên kết rõ ràng với kiểu hình kháng bệnh
héo đỏ đầu lá.
v
SUMMARY
Studying genetic diversity and detect markers associated with resistance
to wilt disease in cayenne pineapple by RAPD-PCR
Supervisor: Tran Thi Dung1; Luu Phuc Loi1, BSc
Student: Nguyễn Hồng Phong1
1Department of Biotechnology, Nong Lam university, Ho Chi Minh city
Cayenne pineapple is an important crop in Ho Chi Minh city for domestic
consumption and export. But today most varietys have been plant is imports and
have many pests, especially wilt disease. To develop pineapple industry of this
area, its need to research genetic variation of varietys in this area and find the type
of wilt resistance. In this study, we analysed genetic variation of 3 varietys of
Cayenne pineapple in Ho Chi Minh city and found markers associated with wilt
resistant trait by using 32 primer RAPD and received these results:
- 6 primers gave DNA polymorphisms in 3 Cayenne varietys and 2 controls.
OPAC10 have hightest allen number in Cayenne. UPGMA and bootstrap analysis
on the basis of RAPD data clearly showed that 3 Cayenne varietys belong to two
major clusters with 92% similarity. The first cluster includes Thailand and China
varietys with 98% similarity. The Second cluster is Lam Dong variety.
- The results of rearing mealybug show that mealybug can grow on pumpkin
and the development of mealybug at 25 – 26oC is better than 33 – 34oC.
- Two primers gave most DNA polymorphisms in pineapple when analysed
genetic variation were used to detect marker associated with wilt resistant trait in
Cayenne pineapple. But non marker was detected.