Lý luận y học cổ truyền là môn học nền tảng, trang bị kiến thức về những học thuyết cơ bản như âm dương, ngũ hành, tạng tượng, khí – huyết – tân dịch và kinh lạc. Đây là cơ sở lý luận quan trọng giúp sinh viên hiểu rõ cơ chế phát sinh bệnh tật và định hướng trong chẩn đoán, phòng bệnh và điều trị bằng phương pháp y học cổ truyền.