ƯƠ

CH

NG 1

CÁC PH

NG PHÁP XÁC Đ NH VI  Ự

ƯƠ Ậ

SINH V T TRONG TH C PH M

ƯƠ CH NG 1

Ộ Ố ƯƠ

M T S  PH

NG PHÁP XÁC Đ NH

VI SINH V TẬ

ƯỜ

Ấ I. 1. HÓA CH T VÀ MÔI TR

NG PHÂN

TÍCH VI SINH V TẬ

ể ệ ậ ườ ­Trong phân tích, ki m nghi m vi sinh v t, môi tr ng

ệ ậ ệ ầ c n  cho  vi c  tăng  sinh,  phân  l p,  phân  bi t,  nhân

ề ả ấ ậ ố ị ả gi ng, c y chuy n, b o qu n, đ nh danh vi sinh v t…

ườ ứ ầ ầ ầ ­  Môi  tr ề ủ ng  c n  ch a  đ y  đ   các  thành  ph n  v

ồ ượ ạ ngu n carbon,  đ m, khoáng và vi l ng  … và có các

ệ ợ đi u ki n lý hóa thích h p ề

ƯỜ

Ạ PHÂN LO I MÔI TR

NG NUÔI C Y VSV

ồ ố * Theo ngu n g c

ự ­ T  nhiên

ổ ợ ­ T ng h p

ợ ổ ­ Bán t ng h p

ậ ạ * Theo tr ng thái v t lý

­ L ng (Brothe) ­ R nắ

ắ ỏ ­ Bán l ng (bán r n)

ƯỜ

Ạ PHÂN LO I MÔI TR

NG NUÔI C Y VSV

ụ *  Theo m c đích

ườ ề ­ Môi tr ng ti n tăng sinh

ườ ­ Môi tr ng tăng sinh

ườ ọ ọ ­ Môi tr ng ch n l c

ườ ệ ­ Môi tr ng phân bi t

ườ ử ­ Môi tr ệ ng th  nghi m sinh hóa

PHƯƠNG PHÁP PHA CHẾ MÔI TRƯỜNG

• Môi tr ườ ẩ

ng t ị ế ế  pha ch – Ch n b  nguyên li u: Cân, đong thành ph n ầ ệ – Pha ch : Hòa tan, b  sung agar (môi tr ườ ổ ng

ụ ụ

0C/30p)

ấ r n)ắ – L cọ – Đi u ch nh pH ề – Phân ph i vào d ng c ố – H p kh  trùng (121 ử

• Môi trường đông khô: Được sử dụng phổ biến trong các phòng kiểm

nghiệm vi sinh – Cân lượng môi trường – Bổ sung nước (theo tỷ lệ), hòa tan – Phân phối vào dụng cụ chứa – Hấp khử trùng (1210C/15’)

Note: Thông thường môi trường được pha chế có

giá trị pH thích hợp, không cần phải hiệu chỉnh pH sau khi được pha chế .

ẩ ươ ườ ọ Vi khu n gram d ng trên môi tr ng ch n

ọ l c CAN (Colistan Nalidixic Acid Agar )

ườ ọ S. epidermidis và S. aureus trên môi tr ng ch n

ệ ọ l c – phân bi t  Mannitol Salt Agar (MSA)

ườ ể Môi tr ả ng ki m tra kh  năng sinh Indol

ườ ườ ả ả Môi tr Môi tr ng ki m tra kh  năng lên men Dextrose  ng ki m tra kh  năng lên men Dextrose ể ể

(Glucose)  (Glucose)

Ỹ Ẫ

Ậ Ấ Ả

Ậ Ẫ

Ẫ I.2. K  THU T L Y M U, V N CHUY N  Ả M U VÀ B O QU N M U  TH C  PH MẨ

Ấ K  HO CH L Y M U TH C  PH MẨ ế ầ

ế ố ộ ế ẫ ạ ấ t c n có các y u t M t k  ho ch l y m u chi ti sau:

ượ ằ ả ậ c phép n m trong kho ng lân c n gi ớ i

(cid:0) ạ n, c, m, M ­ n: s  m u th ố ẫ ­ c: s  m u đ ố ẫ  c (cid:0) M)

ậ ộ ả ấ

ậ ộ ậ ả h n (m  ­ m: kho ng ch p nh n (m t đ  vi sinh M;  ấ

(cid:0) ườ thông th ng 10 x m M

ề ổ ứ ụ ẩ ố ượ Ví d : Tiêu chu n v  t ng s  vsv trong sp tr ng đ c

thanh trùng Pasteur: n=5, c=2, m= 5.104, M= 106

CFU/25g

ế ạ ộ ­ K  ho ch 2 thu c tính

ỉ ­ Ch  nêu ra m

ế ấ ả ẫ ­ N u t t c  các m u ẫ (cid:0) m ho c  ặ (cid:0) c m u trong n

ử ậ ẫ ấ m u th  >m: Ch p nh n lô hàng

ử ế ẫ ẫ ố ừ ­ N u >c m u trong s  n m u th  >m: t ố  ch i lô

hàng

ế ạ ộ ­ K  ho ch 3 thu c tính

ặ ả ­ Đ t ra c  m và  M

ỉ ườ ả ưỡ ủ ­ Ch  tiêu “m” th ng ph n ánh ng ng trên c a

GMP

ấ ỉ ớ ạ ­ Ch  tiêu “M” đánh d u gi i h n trên (nguy

ể hi m/không ch p nh n.

ế ấ ả ậ ấ t c  các m u

­ N u t ử ằ ậ ẫ (cid:0) m ho c ặ (cid:0) c m u trong n  ẫ (cid:0) M: Ch p nh n lô  ấ ả

ẫ m u th  n m trong kho ng >m và  hàng

ế ẫ ả ẫ ­ N u >c m u trong n m u th  n m trong kho ng

ố ộ ử ằ ừ ẫ >M: T  ch i lô hàng >m và (cid:0) M Ho c có m t m u  ặ

ự ế ấ ẫ ạ ọ ­ L a ch n k  ho ch l y m u

ố ượ ế ạ ộ ­ K  ho ch 2 thu c tính: Đ i t ng vsv quan tâm

ượ ự ẩ không đ c phép có trong th c ph m;

ự ế ế ạ ẩ ộ ộ ­ K  ho ch 3 thu c tính: N u cho th c ph m m t

ộ ơ ị ể ấ ị ố ượ s  l ng nh t đ nh vsv trong m t đ n v  th  tích.

KẾ HOẠCH THU MẪU THỰC PHẨM

M u:ẫ

­ Ph i mang tính

đ i di n

ờ ệ  (nhi u th i đi m, vi trí) ử ụ

ế

ẫ     ­ Đ/v m u tp đã bi

t: s  d ng que bông vô trùng

ề ặ

ấ ị

quét 1 di n tích b  m t nh t đ nh or c t lát 2­3mm) ễ  vi sinh v t ngo i lai (ch a

­ Tránh s  t p nhi m ự ạ

ệ ộ ơ ấ

t đ , n i l y m u,

m u trong các bình b ng nh a có n p vô trùng) ­ Ghi chú m uẫ : th i gian, nhi ậ

ươ

ng ti n v n chuy n, …

ph

ố ượ

S  l

ẫ ng m u c n  l yấ 1

Th i đi m l y m u

ơ ấ N i l y  m uẫ

ỉ Ch  tiêu VSV ki m tra

Qui  mô  nhỏ

Qui  mô  v aừ

Qui  mô  l n ớ

ư

CSGM trâu bò

1 ­ 3 4 ­ 6

ướ

­ VKHK TS ­ Enterobacteriaceae ­ Salmonella

7 ­  12

ướ c  khi  Sau  khi  khám  th t,  tr ế ị ụ ơ đ a thân th t đi tiêu th /s  ch    ẫ ạ ặ ho c  tr c  khi  làm  l nh,  m u  ượ c  thu  th p  trong  vòng  30  đ phút.

ướ

ư

c khi  ụ ơ

CSGM  l nợ

1 ­ 3 4 ­ 6

ướ

­ VKHK TS ­ Enterobacteriaceae ­ Salmonella

7 ­  12

ế ẫ ạ c khi làm l nh, m u  c thu th p trong vòng 30

ị Sau khi khám th t, tr đ a thân th t đi tiêu th /s  ch    ặ ho c tr ượ đ phút.

ướ

ư

c khi  ụ ơ

1­ 3 4 ­ 6

ướ

CSGM  ừ c u, dê,  chó, ng aự

­ VKHK TS ­ Enterobacteriaceae ­ Salmonella

7 ­  12

ế ẫ ạ c khi làm l nh, m u  c thu th p trong vòng 30

ị Sau khi khám th t, tr đ a thân th t đi tiêu th /s  ch    ặ ho c tr ượ đ phút.

ươ ẫ Ph ị ấ ng pháp l y m u th t

ố ượ

S  l

ẫ ng m u c n  l yấ 1

Th i đi m l y m u

ơ ấ N i l y  m uẫ

ỉ Ch  tiêu VSV ki m tra

Qui  mô  nhỏ

Qui  mô  v aừ

Qui  mô  l n ớ

CSGM  gia c mầ 2

1 ­ 3

7 ­ 12

4 ­  6

­ VKHK TS ­ Enterobacteriaceae ­ Salmonella ­ Campylobacter

ị ư Sau khi đ a thân th t đi làm  ờ ả ấ ạ  (c  trong  l nh ít nh t 1,5 gi ặ ạ kho làm l nh chúng ho c sau  ị ạ i trên dây)  khi treo thân th t l ư ướ ặ c khi đ a đi tiêu  ho c tr ế ụ ơ th /s  ch . ọ

ầ ế

ơ ở C  s  pha  ế ơ ọ l c/s  ch

ặ ậ

1 ­ 3

7 ­ 12

4 ­  6

ế ặ

­ VKHK TS ­ E.coli ­ Salmonella ­ VSV khác khi yêu  c uầ

ắ ươ Sau  khi  l c  x ng,  b t  đ u  làm l nh ho c  đông l nh ti p  theo,  thu  th p  m u  là  các  ế ị ơ ọ mi ng th t pha l c, th t s  ch   ướ ị ho c th t xay tr c khi bao gói  ặ chân không ho c bao gói kín.

ạ ờ ẫ ấ

ơ

ạ ấ Cho 1 kho l nh l y  ị ẫ ạ i 5  5 đ n v  m u t ị v  trí.

ư ạ ­ VKHK  a l nh ­ Enterobacteriaceae ­ Salmonella

ơ ở ả C  s  b o  ả qu n (Kho  l nh)ạ

ạ ộ ạ

ạ Trong  kho  l nh,  t i  th i  đi m  ị ẫ ả b o qu n m u. M u l y là th t  ạ ạ i  5  l nh  ho c  l nh  đông  t đi m: 4 góc và 1 gi a. G p l i  là 1 m u.ẫ

ả ạ ẩ :  Các s n ph m l nh đông

ồ ­ Lau c n phía ngoài PE

ặ ­ Đ t vào khay tráng men đã vô trùng

0

ư ể ồ ự nhiên (T

­ Đ a vào bu ng vô trùng đ  rã đông t phòng); 2­50C (18h); 450C (15 phút)

ẫ ồ ộ : M u đ  h p

ế ể ạ ộ ồ ở ị ­ Ki m tra h p có b  ph ng, bi n d ng, h  …

ằ ồ ­ Lau chùi b ng c n bên ngoài

ể ể ư ­ Đ a vào phòng vô trùng đ  ki m

ủ Các sp bao bì, nylon, th y tinh …

ủ ể ộ ­ Ki m tra đ  kín c a bao bì

ồ ­ Lau c n phía ngoài

ể ể ư ­ Đ a vào phòng vô trùng đ  ki m

Ể V N CHUY N VÀ B O QU N M U  TH C PH M ể :

Trong quá trình v n chuy n

0C cho đ n khi phân

ả ượ ả ở ả ế ẫ      ­ M u ph i đ c b o qu n ­20

tích (0­40C)

ả ẫ ệ

ươ ậ ­ M u ph i xét nghi m trong vòng 36h (6h) ­ Vi sinh v t có th  b  t n th ể ị ổ ng nên trong

ườ ầ ạ ợ ề nhi u tr ng h p c n giai đo n tăng sinh.

Ị Ẫ

CHU N B  M U TH C PH M

ả ẫ ướ ­ Gi i đông m u tr c khi phân tích

. Đk vô trùng (2­50C trong 18h, 450C trong 15

ế ợ ắ ộ ả ể ẫ ố ứ phút k t h p l c bình ch a m u đ  tăng t c đ  gi i

ấ ệ ộ ẫ ồ đông và đ ng nh t nhi t đ  trong m u)

ẫ ấ ồ ­ Đ ng nh t m u

ẫ ắ ẫ ỏ ắ ỹ . Đk vô trùng, m u l ng (l c k ), m u r n

(stomacher)

­ Cân m uẫ

ố . Đk vô trùng, sai s  cho phép ± 0,1g

ị ị ượ . Đ nh tính: 10g; đ nh l ng: 25g

Stomacher

ặ SP đ c hoàn toàn :

ố ứ nghi n nát trong c i s  vô

→ẫ 10g(25g) m u  → ứ ẵ ề  Erlen có ch a s n bi th y tinh và 90ml

ố ể ấ ướ ị ặ ầ ẫ c mu i sinh lý   hút ph n d ch đ  c y m u,

ủ trùng  ướ (225ml) n c c t vô trùng ho c n → ắ ề ắ  l c đ u, l ng c n  ộ đ  pha loãng 10 → ặ ­1 (10­2)

ừ ặ ừ ỏ : Các sp v a đ c v a l ng

→ ẫ ả ướ c)

ắ ặ ỏ  c i nh  vô  → ề  Erlen  ể ắ ề  l c đ u, đ  l ng c n

ủ ể ấ ầ ố ẫ Cân 100g m u (c  cái l n n → ị trùng, nghi n   cân 10g (d ch nghi n)  → (90ml NMSL + bi th y tinh)  → ẫ ị  hút ph n d ch đ  c y m u.

ỏ : Sp l ng hoàn toàn

ử ụ ứ ế ễ ẫ ự ­ S  d ng tr c ti p m u ho c pha loãng tùy  ẩ ộ theo m c đ  nhi m b n.

ẫ ố ướ ấ ­ L c k  bình ch a m u, hút 10ml m u cho vào  ệ t c mu i sinh lý ti

ộ ắ ứ ẫ ướ ẵ Erlen có s n 90ml n c c t hay n trùng (đ  pha loãng 10 ­1)

ố ơ ướ

ị ướ ế ầ ố ­ Dung d ch pha loãng: T t h n nên dùng n 0,1%; n c pepton  c mu i sinh lý (0,85%), trong buffer n u c n.

Ệ I. 3. TH  NGHI M SINH HÓA

ậ Trong k  thu t phân tích vi sinh v t

­ Đ nh danh vi sinh v t

ự ậ : d a vào

­ Các đ c đi m v

ề ki u hình

ư

ượ

đ

ệ c th c hi n b i các

­ Các p/  sinh hóa ậ ch ng vi sinh v t

ư

ể ự

­ Các p/

sinh hóa có th  th c hi n theo 3 cách

:

ề ­ Truy n th ng

­ B  KITộ

ế ị ự ộ

­ Thi

t b  t

đ ng

TRUY N TH NG

ả Th  nghi m kh  năng lên men

ườ ưở ể ở ồ ộ ng theo con đ ng

•Xác đ nh kh  năng s  d ng m t ngu n carbon  ị ử ụ ả ấ ị nh t đ nh b i vsv đ  tăng tr lên men

ạ ả ơ

2) t o thành làm gi m  ườ

→ ổ ượ •Sp (r pH môi tr ữ u, acid h u c , CO ườ  thay đ i màu môi tr ng ng

ượ ẩ ằ ố ổ c b y b ng  ng durham làm n i

ạ • CO2 t o ra đ ng.ố

ả  Th  nghi m kh  năng lên men

­

­

+

+

ử ụ ỏ ng s  d ng: Phenol Red broth base: đ  (pH

• Môi tr → 7,4) ườ  vàng (pH 6,8)

ể ị

ộ ộ ườ ng ru t): E.coli, Klebsiella,

• Dùng đ  đ nh danh các vsv thu c h   ọ Enterobacteriacea (vk đ Staphylococcus (+); Corynebacterium (­)

ử ệ ả Th  nghi m kh  năng oxy hóa – lên men

(TN Hugh –Leifson)

ị ấ ồ

ườ ơ ng c n cung c p ngu n  ng là

ượ •Xác đ nh vi sinh v t d  d ầ ậ ị ưỡ ấ ữ ướ ạ i d ng ch t h u c , th carbon d ử ụ carbonhydrate. Vsv s  d ng CBH này làm ngu n  ườ năng l ồ ấ ng lên men hay hô h p ng theo con đ

ườ ườ ng t o môi tr ng có tính

• Quá trình lên men th ạ ấ ơ acid cao h n quá trình hô h p.

ườ ị ỉ ng Hugh­ Leifson có ch  th  pH là

• Môi tr bromothymol blue (pH = 6.0: vàng; pH= 7,6: xanh  d ng)

ươ

ử ệ •Th  nghi m Hugh – Leifson

ố ệ ượ ủ c ph

ố ườ ề ặ ỏ ứ ­ 2  ng nghi m ch a mt hugh­Leifson; 1  ng đ ng. paraffin l ng vô trùng trên b  m t môi tr

ấ ủ ­ C y đâm sâu vsv, 24­48h trong cùng đk

•Sau p/ :ư

ề ừ ị ề ặ  trên b  m t và

ủ ầ ­ Lên men: c  2  ng b  oxh đ u t ả ố ph n sâu c a mt

ấ ố ị

ủ ế ố ở ị ố ề ặ ề ừ  trên b  m t xu ng  ầ ỉ  ph n

­ Hô h p:  ng k  khí b  oxh đ u t ị ầ ph n sâu c a mt;  ng hi u khí ch  b  acid hóa  đáy

ử ệ Th  nghi m Hugh­Leifson

Th  nghi m Bile Esculin

ệ ậ ự ủ ả

• Phân bi t vi sinh v t d a trên kh  năng th y phân  ế liên k t glucoside trong esculin thành esculentin và  glucose

ư ớ ố ắ ạ ứ ợ v i mu i s t t o ph c h p màu nâu

• Esculentin p/ hay đen

• MT: Aesculin Medium hay Edwards

ứ ổ • Sau p/ : hóa nâu hay đen (+); ko đ i màu (­)

­

+

ử ệ Th  nghi m Bile Escusin

ử ệ ế ả ưỡ Th  nghi m kh  năng bi n d ng citrate

ượ ử ụ ấ ồ c s  d ng làm ngu n carbon duy nh t

• Citrate đ ủ c a vsv.

ế ưỡ ổ ỳ ườ • Sp bi n d ng citrate thay đ i tu  vào pH môi tr ng

ề pH ki m: acetate và formate

pH trung tính: acetate và CO2

pH acid: acetoin và lactate

ứ ấ ỉ

ị  pH trung tính có màu xanh l c, pH  ươ ề •Mt Simmons citrate ch a ch t ch  th  màu  ở Bromothymol blue  ki m có màu xanh d ng (pH>7,6).

ư ụ ươ • Sau p/ : mt có màu xanh l c (­); xanh d ng (+)

­

+

ườ ấ ỉ ị ng Simmons citrate agar có ch t ch  th  màu

Môi tr bromothymol blue.

ả ứ ụ ươ ng (+) Sau ph n  ng: Xanh l c (­); xanh d

ế

ưỡ

Th  nghi m kh  năng bi n d

ng malonate

+

­

ườ ứ ­ Môi tr ng manolate broth có ch a bromothymol bue

ư ụ ươ Sau p/ : Xanh l c (­); xanh d ng (+)

ử ệ Th  nghi m catalase

ệ ậ ị ế ậ • Phân bi t vi sinh v t hi u khí và vi sinh v t k  khí

• VSV hi u khí có enzyme catalase có kh  năng  phân gi ế i Hả 2O2 H→ 2O và O2

• Thí nghi m: ệ

→ ữ ạ ọ ố l nh) ỏ  nh  1 gi t sinh kh i vsv

t Họ lên 1 gi H2O2 30% (gi 2O2

ủ ọ Bacillus, Micrococcus, S i b t (+):

Staphylococcus

ấ ọ ệ Không xu t hi n b t khí (­): Clostridium,

Streptococcus

ệ  Th  nghi m catalase

­

+

­

+

ử ệ Th  nghi m decarboxylase

ị ạ ườ ạ ẩ ộ

ự ạ

2

→ ư ả • Phân lo i và đ nh danh các lo i vi khu n đ ng ru t  ả ứ d a trên lo i enzyme decarboxylase xúc tác ph n  ng  ườ ng phân gi ặ i 1 a.a đ c tr ng tăng pH môi tr CO→

ạ • Có 3 lo i enzyme: ODC, LDC và ADC (ADH)

ườ ứ ỉ

• Môi tr ị ng Decarboxylase basal medium ch a ch  th   ạ bromocrezol purple và 1 lo i a.a (ornithin, lysin, arginin)

ư • Sau p/ : Vàng (­), tím (+)

Th  nghi m decarboxylase

­

+

ử ệ Th  nghi m coagulase

ị t

ả ầ

ế ụ ế ươ ạ •Đ nh danh Staphylococcus, loài này có kh  năng ti ế ế  các thành ph n huy t  enzyme coagulase làm k t t ố ươ ng t o kh i đông huy t t t ng

ệ ượ ế ươ ự ệ ớ c th c hi n v i huy t t ỏ ng th  hay

ử ườ ạ •Th  nghi m đ ng i d ng đông khô

ệ ế ố • Ti n hành trên phi n kính/ ng nghi m ế

ư ả •Sau p/ (kho ng 4 phút)

ư ệ ế ấ Xu t hi n đám ng ng k t: +

ư ư ế Ko có p/ ng ng k t: ­

Th  nghi m Coagulase

+

­

ử ệ Th  nghi m urease

ủ ủ ố ố

ị ị ệ ệ ạ ạ Proteus Proteus •Xác đ nh kh  năng t o enzyme urease c a 1 s  vsv,  Xác đ nh kh  năng t o enzyme urease c a 1 s  vsv,  ặ ặ đ c bi đ c bi ả ả t là nhóm  t là nhóm

3 và

ả i ure thành NH

→ tăng pH môi tr ư  phân gi •Enzyme này xúc tác p/ ườ ng CO2

ườ ỏ

ng l ng Rustigian Stuart’s Urea broth hay mt  ỉ ị ỏ ứ ặ •Môi tr đ c Christensen Urea ch a ch  th  đ  phenol

ư ổ ỏ • Sau p/ : không đ i màu (màu vàng cam): ­; đ  tím:+

ệ  Th  nghi m urease

­

++

++++

ử ệ Th  nghi m genlatinase

ế ả ả t enzyme genlatinase phân gi i

• Đánh giá kh  năng ti genlatine thành polypeptide và a.a

ườ ượ ổ ấ ng nuôi c y vsv đ

ế ủ • Môi tr c b  sung gelnatine  ổ ặ ho c nuôi c y vsv trên mt gelatine có b  sung 5­10ml  trichloacetic acid TCA là k t t a gelatine.

• Sau p/ :ứ

Ố ệ ạ ả ị ng nghi m th ch nghiêng b  tan ch y: +

ổ ạ Không thay đ i tr ng thái: ­

ủ * Ch ng vsv: Aeromonas hydrophyla (+); E.coli (­)

­

+

ử ệ Th  nghi m gelatinase

ử ệ ả Th  nghi m kh  năng sinh H

2S

ị ỳ i các a.a ch a l u hu nh

ả ứ ư  H→ 2S nh  enzyme  ờ

•Xác đ nh kh  năng phân gi ả (cystein, cystin, methionin)  desulfuahydrase

ạ ế ủ ỉ ị

ườ ắ ớ • H2S t o k t t a màu đen v i ch  th  sulfide (Fe II, Fe III,  ứ amonium sulfate s t …) ch a trong môi tr n.

ườ ử ệ • Môi tr ng th  nghi m: KIA, TSI, SIM, PIA, BSA

ệ ệ ấ ấ ấ

• Sau nuôi c y: Xu t hi n màu đen (+), ko xu t hi n  màu (­)

• VSV: E.coli (+), Klebsiella (­), Proteus mirabilis (­)

Thöû nghieäm khaû naêng sinh H2S

ử ệ ả Th  nghi m kh  năng sinh indol

ị ủ ể ả

•Xác đ nh kh  năng chuy n hóa các sp trung gian c a  quá trình oxy hóa thành indol.

ượ ờ ứ ớ ố ị c xác đ nh nh  p/

v i thu c p­  ứ ạ ỏ • Indol đ dimethylaminobanzaldehide t o ph c quinon co màu đ

ướ ử ố ệ c trypton, MIU, SIM; thu c th  là

• MT th  nghi m: n ử Kovacs và Erlich

ư ề ặ ệ ớ ấ ỏ : xu t hi n l p màu đ  trên b  m t mt (+), màu

• Sau p/ vàng (­)

• VSV: E.coli (+), Klebsiella (­), Serratia marcescen (­),  Proteus rettgeri (+)

ả Th  nghi m kh  năng sinh idol

­

+

ả Th  nghi m kh  năng sinh idol

ử ệ Th  nghi m KIA, TSI

ườ ờ ể ử ệ ồ ng KIA, TSI s  d ng đ ng th i đ  th  nghi m

ử ụ

2S.

•Môi tr ử ụ ồ ả kh  năng s  d ng các ngu n carbon khác nhau  ả (glucose và lactose) và kh  năng sinh H

ứ ấ ỉ ị

•KIA ch a 1%lactose, 0,1% glucose, ch t ch  th  Phenol  red; TSI có thêm 1% succrose

•Trên mt KIA:

ề ặ ầ ỏ ­ glucose (+): B  m t có màu đ , ph n sâu màu vàng

ả ề ặ ề ầ

­ glucose, lactose: c  b  m t và ph n sâu đ u có màu  vàng

ạ ế ứ ­ H2S: có màu đen trong th ch và có v t n t

sS nh  Naờ

ườ ng và

2SO3 trong tp môi tr ắ

2S nh  Amonium citrat s t.

ậ ờ ử ­ Th  nghi m H ế nh n bi ệ t H

ệ Th  nghi m KIA, TSI

ử ử ệ Th  nghi m nitrase (kh  nitrate)

ử ụ ể ả

• Đánh giá kh  năng s  d ng enzyme nitratase đ  kh   ử nitrate thành nitrite và các sp khác

ạ ẽ ượ ế ờ ậ c nh n bi

• Nitrit t o thành s  đ ớ ả ứ t nh  ph n  ng v i  sulphanilamide và N­napthylenediamide hydrochloride  ở ấ ồ ứ  pH acid cho ph c ch t màu h ng

• Mt nitrate broth, sodium nitrate

ư ử ố : khi thêm thu c th  vào và acid hóa môi

• Sau p/ ngườ tr

ồ Màu h ng: +

ấ ồ ệ Không xu t hi n màu h ng: ­

ử ệ Th  nghi m nitratase

ử ệ Th  nghi m oxidase

ự ệ ủ ệ ị

•Nh m xác đ nh s  hi n di n c a h  enzyme oxidase  ệ ở ằ  vsv

ạ ượ ử ệ ố

ự ệ ủ

→ ệ  indolphenol có màu xanh

• Ho t tính oxidase đ ờ c phát hi n nh  thu c th  p­ ế phenylenediamin, n u có s  hi n di n c a enzyme,  ử ị thu c th  b  oxy hóa  d ố ngươ

ườ ng th  nghi m: nutrient aga; l y 1 ít sinh

ấ ố ử ẩ

• Môi tr ử ệ ấ ọ ấ ố ặ kh i đ t trên 1 t m gi y l c có t m thu c th  p­ phenylenediamin

ử ệ ươ ổ • Sau th  nghi m: Xanh d ng (+); không đ i màu (­)

ệ Th  nghi m oxidase

ử ệ Th  nghi m ONPG

ị β­galactosidase tham gia

ở •Xác đ nh ho t tính enzyme  ạ vào quá trình lên men lactose vsv.

ử ườ ệ ng th  nghi m: ONPG broth ch a o­

ứ ạ

• Môi tr nitrophenyl – D – galactopyranoside, sp t o thành o­  nitrophenol có màu vàng

• VSV: Serratia marcescens (+), Proteus rettgeri (­)

ư ổ • Sau p/ : màu vàng (+); ko đ i màu (­)

ệ Th  nghi m ONPG

+

­

ử ệ Th  nghi m MR (Methyl Red)

ệ ự t vsv d a vào s  khác bi

ệ t trong quá trình  ừ ự  s  lên men

ế ố ổ

ử ổ ử ố • Phân bi ự ạ t o và duy trì các sp có tính acid t ạ glucose. VSV lên men glucose t o và duy trì các sp  ế có tính acid làm đ i màu thu c th . N u sp acid ti p  →ụ t c   các sp trung tính: không đ i màu thu c th

ấ ỉ ị • Ch t ch  th  màu pH mt là methyl red

ử ệ ể ỏ

ổ • Sau th  nghi m: mt chuy n màu đ  (+), mt không  đ i màu (­)

• VSV: Proteus rettgeri (+), Serratia marcescens (­)

Th  nghi m MR (Methyl Red)

_                  +                +                +

Th  nghi m VP (Voges­Proskauer

)

ử ệ Th  nghi m VP (Vosges­ Proskauer)

ệ ộ ng ru t

ượ ạ c t o ra

• Phân bi ọ ườ t các loài vk trong h  đ ự ự Enterobacteriaceae, d a vào s  oxh acetoin đ ừ t 2,3 butadiol thành diacetyl.

ự ị c xác đ nh d a vào p/

ượ ủ ớ ư ế ợ  k t h p v i  ỏ ứ ạ • Diacetyl đ guanidine c a pepton t o ph c màu đ

• MTTN: MR­VP

ử ố •Thu c th : Barritt, Koblentz ch a ứ α­naphton và KOH

ư ỏ ổ • Sau p/ : màu đ  (+), ko thay đ i màu (­)

• VSV: E. coli (­), Enterobacter cloacea (+)

ệ Th  nghi m cAMP

Cyclic adenosine monophosphate

(cAMP, cyclic AMP or 3'­5'­cyclic adenosine monophosphate)

ệ ­ Phân bi t các nhóm Streptococcus.

ự ư ủ ố ệ  CAMP th c hi n gi a nhân t

ữ ế t ra và

ạ CAMP c a  β­hemolysin do  ủ β­

­

ế ầ ­ P/ Streptococcus nhóm B ti Staphylococcus aureus làm tăng ho t tính c a  ỡ ồ hemolysin gây phá v  h ng c u  (tan huy t)

ệ ử ờ staphylococcus aureus

ủ ườ ệ ấ ng c y vuông góc cách

• Th  nghi m đ ng th i ch ng  ồ ử ủ và ch ng th  nghi m, 2 đ nhau 2mm

ệ  Th  nghi m CAMP

+

­

­ Mttn: Tryptose Blood Agar Base

ế : có vùng tan huy t (+), không có vùng tan

• Sau p/ ư huy t (­)ế

• VSV: Strep. agalactiar (­), Strep nhóm B (+)

Th  nghi m tính di đ ng

KHÔNG TRUY N TH NG

ọ 1. Ph

ươ ng pháp phát quang sinh h c ATP trong giám  ệ sát v  sinh

ươ 2.  Ph ng pháp Elisa (Enzyme­linked

ImmunoSorbent Assay)

ươ ử 3.  Ph ng pháp lai phân t (Hybridization)

ươ 4.  Ph ng pháp PCR (Polymerase Chain Reaction)

ươ ộ ố 5. M t s  ph ử ng pháp th  nhanh khác

ậ ộ ậ ỹ ­ K  thu t phân tách và tăng m t đ

ậ ỹ ­ K  thu t màng petri (petrifilm)

ỹ ậ ­ K  thu t Redigel

ỹ ệ

ở ậ ộ ẫ ­ K  thu t đ  d n đi n, tr  kháng  (conductance/impedance)

ượ ­ KT đo vi l ng calorie (microcalorimetry)

ạ ứ ­ KT đo m c phóng x

ọ 1. Ph

ươ ng pháp phát quang sinh h c ATP trong giám  ệ sát v  sinh

ử ấ ả ế ố ATP có m t trong t bào s ng,

ặ t c  các t → nhận biết các chất sống tồn ệ

­ Phân t ự s  phát hi n ATP  tại.

- ATP được phát hiện nhờ lượng ánh sáng phát ra

thông qua sự kết hợp với 1 enzyme luciferase nhờ một máy đo ánh sáng

- Ưu điểm: nhạy (1pg ATP = 10-12g), nhanh (vài phút)

- Nhược điểm: đắt tiền, hóa chất ổn định sự phát sáng, cồng kềnh (đã có sự cải tiến để mang đi được)

Luciferase + Luciferin + ATP (cid:0)

Luciferase­Luciferin AMP + PPi

Oxyluciferin + AMP + CO2 + hv

Luciferase­Luciferin AMP + O2 (cid:0)                                                                                            (phát quang)

ả ứ ế ơ C  ch  ph n  ng

ẹ ề ụ ụ D ng c  qu t b   m tặ

Máy đo  sáng

ẹ ề ặ ụ ụ D ng c  qu t b  m t Clean ­ Trace

ươ 2. Ph ng pháp Elisa (Enzyme­linked

ImmunoSorbent Assay)

PP elisa

­ Nguyên t c:  S  d ng  ắ ữ ế

ẽ ượ ẫ

ể ơ ủ  ph  lên  kháng th  đ n dòng kháng nguyên m c ụ ữ ạ  l i  c gi ể ứ ấ ề ặ ế ế

ư ắ ử ụ ế ngoài nh ng đĩa gi ng. N u có  tiêu trong m u, kháng nguyên này s  đ ổ trên b  m t gi ng. N u b  sung kháng th  th  c p  có g n enzyme nh   horseradish peroxidase….

3. Lai phân t

(Hybridization)

ự ế

ệ ộ

ộ ụ ộ

ệ ộ ộ

ệ ộ ừ ừ

t

t đ  t ơ

Nguyên t c:ắ  d a vào s  bi n tính tách m ch  ự ử ủ t đ  nóng ch y Tm  i nhi c a phân t  DNA t ơ ạ thành 2 m ch đ n (pp đo đ  đ c) ­N u gi m nhi ả ế t đ  đ t ng t: không có s  tái  ở ạ ắ ặ i b t c p tr  l ­ N u taế ả  gi m nhi ạ ặ c p c a các m ch đ n DNA:

ắ ự  thì có s  tái b t   laiử

các phân t

ủ ­ Đ c đi m c a lai phân t

ỉ ả

ắ ặ ệ ố  s  tái b t c p ch  x y ra  ổ

ặ ữ

ệ Đ c hi u tuy t đ i: gi a hai trình t

hoàn toàn b  sung

b  sung có th  là DNA, RNA d n

ế

ể ử

lai DNA­DNA,

ự ổ Các trình t đ n hình thành các phân t DNA­RNA, RNA­RNA

ng d ng lai phân t

ệ ử ể  đ  phát hi n vi sinh v t  ẩ ự trong th c ph m? ộ ố

ượ

ậ ng vi sinh v t và đ c t

ị ườ

ng đã

­ Đ nh l ị ­ S  d ng m u dò (probes), trên th  tr ử ụ có các b  kit (clostridium botulinum – Gene­ trak; Escherichia coli – Gene­trak;  staphylococcus aureus – AccuProbe; …)

Southern blot method

Southern blot method

Dot & slot bot method

Dot & slot bot method

ƯƠ

NG PHÁP PCR

4. PH (Polymerase chain reaction)

ươ

ể ổ ế ợ ạ ầ

ủ ả ng b n sao c a khuôn này thành hàng tri u b n

ộ ặ ả ờ

ồ (Karl Mullis và c ng s , ệ ạ ặ

­ Ph ự ng pháp PCR dùng đ  t ng h p DNA d a  ố trên khuôn DNA ban đ u, khuy ch đ i, nhân s   ệ ượ l sao nh  enzyme polymerase và m t c p m i  (prime) đ c hi u cho đo n DNA này  1985)

ổ ươ ng pháp PCR cho phép t ng h p r t nhanh

ợ ấ ệ t. Ðây là  ệ ươ ệ ậ

ộ ố ượ ủ ộ

ng pháp hi n đ i và thu n ti n cho vi c xác  ự ng vi  ậ ớ ộ ­ Ph ạ và chính xác t ng đo n DNA riêng bi ệ ạ ph ặ ủ ị đ nh s  có m t c a m t gen c a m t đ i t sinh v t v i đ  chính xác cao.

ệ ượ ể

ệ ầ ạ ệ ế ệ ộ

ẩ ẩ ử ụ c s  d ng đ  phát hi n, t o  ­ Hi n nay pp PCR đ ệ đ t bi n gen, ch n đoán b nh, phát hi n m m b nh  ự có trong th c ph m …

ề ả ứ ỳ ặ ạ ố ế i n i ti p.

ỳ ồ ướ : c

ơ ạ ạ : M ch DNA tách thành m ch đ n (94­

0C,

ồ ắ ặ ạ ớ

ạ ộ ổ

0C, 30s – vài phút) ề ầ ướ ặ ạ c l p l ả 6 b n sao

i nhi u l n, sau 30­40 chu

­ Ph n  ng PCR g m nhi u chu k  l p l ồ ỗ M i chu k  g m 3 b • Bi n tính ế 950C, 30s) • Lai: Các m i b t c p v i m ch khuôn (40­70 30­60s) • Kéo dài: Enzyme polymerase ho t đ ng, t ng  h p DNA (72 ỳ ­ Chu k  3 b ỳ ẽ ạ k  s  t o ra 10

ả ứ ượ ộ

ướ ở Sau ph n  ng PCR, DNA đ c nhu m b i ethidium  ệ bromide, quan sát qua đi n di s n ph m PCR trong  gel agarose và quan sat d ả i tia UV

Máy đi n ệ di đ ngứ

B n đi n di

Máy đi n ệ di ngang

t (Máy PCR

Máy luân nhi

ệ realtime)

Các thành phần của phản ứng PCR

ế ể ổ

­ DNA polymerase: c n thi

t đ  t ng h p DNA

ộ  trình t

ạ ộ ố ủ

ệ ổ

ư ị ậ

­ DNA m ch khu n: ạ  DNA m c tiêu đ c  ặ ụ ậ tr ng cho vi sinh v t m c tiêu ho c là gen quy  ợ đ nh vi c t ng h p m t lo i đ c t  c a vi sinh  v t này

ộ ầ

ắ ặ

ạ ớ

­ M iồ : là nh ng đo n DNA ng n có kh  năng  b t c p b  sung v i m t đ u c a m ch khuôn

ướ

c, dung d ch

­ Các lo i nucleotid A, T, X, G; n đ m, ion Mg

2+

ự ệ : Quy trình th c hi n

ậ ượ ấ ­ Tăng sinh: vi sinh v t đ c nuôi c y tăng sinh

ườ ọ ọ ờ trong môi tr ng ch n l c (TSB) 10­20 gi

ấ ị ế ­ Thu d ch nuôi c y, tách chi ậ t DNA vi sinh v t

ả ứ ự ệ ­ Th c hi n ph n  ng PCR

ế ệ ọ ả ­ Đi n di trên gel agarose 1,5%, Đ c k t qu

trên đèn UV

LOCAD­PTS reader [left] and swabbing unit [right]

Ệ ĐI N DI (GEL ELECTROPHORESIS)

Ệ ĐI N DI (GEL ELECTROPHORESIS)

ệ Đi n di ngang

ứ ệ Đi n di đ ng

Ệ ĐI N DI (GEL ELECTROPHORESIS)

Ệ ĐI N DI (GEL ELECTROPHORESIS)

Ệ ĐI N DI (GEL ELECTROPHORESIS)