
TNU Journal of Science and Technology
230(05): 239 - 245
http://jst.tnu.edu.vn 239 Email: jst@tnu.edu.vn
STUDY ON rpoC1 GENE SEQUENCE CHARACTERISTICS IN
ANCIENT TEA TREES (Camellia sinensis var. assamica) IN
THE NORTHERN PROVINCES OF VIETNAM
Bui Thuy Lien1,2, Tran Gia Huy3, Ong Xuan Phong1, Chu Duc Ha4, Le Chi Toan1, La Viet Hong1*
1Hanoi Pedagogical University 2, 2Hoa Lu University,
3Can Tho University, 4VNU University of Engineering and Technology
ARTICLE INFO
ABSTRACT
Received:
04/10/2024
Tea plant (Camellia sinensis), a species of the Theaceae family, contains
many natural antioxidant compounds such as EGCG, flavanol, and
phenolic acid. In the North of Vietnam, ancient Shan tea populations are
considered endemic genetic resources. This study aims to investigate the
genetic characteristics of the rpoC1 gene region of four Shan tea
individuals collected in three provinces of Lao Cai, Yen Bai, and Ha
Giang. The amplicon size of the rpoC1 gene was approximately 500 bp
in length. The DNA sequences were trimmed using the Bioedit program
and compared for genetic similarity with species of the Theaceae family
by using the MEGA-X software. All four tea samples were completely
similar to other species of the genus Camellia on the NCBI database,
illustrating that rpoC1 is a highly conserved sequence region of the
genus Camellia. In addition, the results of variant analysis identified 7
SNPs compared with other genera in the Theaceae family. The
phylogenetic diagram shows two clusters with a genetic distance of 0.02,
in which tea samples belonging to the genus Camellia are in the same
clade, revealing that the rpoC1 gene region reflects the genetic
characteristics of the genus Camellia.
Revised:
06/02/2025
Published:
07/02/2025
KEYWORDS
Ancient tea
Camellia sinensis
rpoC1
SNPs
Theaceae
NGHIÊN CỨU ĐẶC ĐIỂM TRÌNH TỰ GENE
rpoC1
Ở CÂY CHÈ SHAN CỔ THỤ
(Camellia sinensis var. assamica) TẠI CÁC TỈNH PHÍA BẮC VIỆT NAM
Bùi Thùy Liên1,2, Trần Gia Huy3, Ong Xuân Phong1, Chu Đức Hà4, Lê Chí Toàn1, La Việt Hồng1*
1Trường Đại học Sư phạm Hà Nội 2, 2Trường Đại học Hoa Lư
3Trường Đại học Cần Thơ, 4Trường Đại học Công nghệ - ĐH Quốc gia Hà Nội
THÔNG TIN BÀI BÁO
TÓM TẮT
Ngày nhận bài:
04/10/2024
Cây chè (Camellia sinensis), một loài thuộc họ Chè chứa nhiều hợp chất
chống oxy hóa tự nhiên như EGCG, flavanol, phenolic acid. Ở phía Bắc
Việt Nam, các quần thể chè Shan cổ thụ được xem là nguồn gene đặc
hữu. Nghiên cứu này được thực hiện nhằm khảo sát đặc điểm di truyền
vùng gene rpoC1 của bốn cá thể chè Shan thu thập tại ba tỉnh Lào Cai,
Yên Bái và Hà Giang. Kết quả PCR khuếch đại đoạn gene rpoC1 có kích
thước khoảng 500 bp. Trình tự DNA được hiệu chỉnh bằng chương trình
Bioedit và so sánh mức độ tương đồng di truyền với các loài thuộc họ
Theaceae bằng chương trình MEGA-X. Cả bốn mẫu chè đều có sự tương
đồng hoàn toàn với các loài khác thuộc chi Camellia trên cơ sở dữ liệu
NCBI, cho thấy rpoC1 là vùng trình tự có tính bảo tồn cao của chi Chè.
Bên cạnh đó, kết quả phân tích biến thể đã xác định 7 SNPs so với các
chi khác trong họ Theaceae. Giản đồ phả hệ thể hiện 2 nhóm chính với
khoảng cách di truyền là 0,02, trong đó các mẫu chè thuộc chi Camellia
ở cùng một phân nhóm cho thấy vùng gene rpoC1 phản ảnh đặc điểm di
truyền đặc trưng của chi Camellia.
Ngày hoàn thiện:
06/02/2025
Ngày đăng:
07/02/2025
TỪ KHÓA
Chè cổ thụ
Camellia sinensis
rpoC1
SNPs
Họ Chè
DOI: https://doi.org/10.34238/tnu-jst.11243
* Corresponding author. Email: laviethong@hpu2.edu.vn