Upload
Nâng cấp VIP
Trang chủ » Khoa Học Tự Nhiên » Sinh học
6 trang
13 lượt xem
1
0

Rapid dereplication of microbial isolates using matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry: A mini-review

Matrix-Assisted Laser Desorption Ionization Time-Of-Flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF MS) has become one of the most popular methods for the rapid, cost-effective and accurate classification and characterization of cultivable microorganisms. Due to its simple sample preparation and short measurement time, MALDI-TOF MS is an excellent choice for the high-throughput study of microbial isolates from rhizospheres or plants grown under diverse environmental conditions. While clinical isolates have a higher identification rate than environmental isolates due to the focus of commercial mass spectral libraries on the former, no identification is necessary in the dereplication step of large environmental studies. The grouping of large sets of isolates according to their intact protein profiles can be performed without knowledge of their taxonomy. Thus, this method is easily applicable to environmental samples containing microorganisms from yet undescribed phylogenetic origins. The main strategies applied to achieve effective dereplication are, first, expanding existing mass spectral libraries and, second, using an additional statistical analysis step to group measured mass spectra and identify unique isolates. In this review, these aspects are addressed. It closes with a prospective view on how MALDI-TOF MS-based microbial characterisation can accelerate the exploitation of plant-associated microbiota.

Từ khoá:

caygaocaolon1

Rapid dereplication

Matrix-assisted laser desorption

Desorption ionization time-of-flight

Mass spectrometry

Expansion of mass spectral databases

Share
/
6

Có thể bạn quan tâm

Screening of Monascus purpureus strain with monacolin K activity and citrinin-free characteristics for red yeast rice production by LC-MS/MS analysis by LC-MS/MS analysis

Screening of Monascus purpureus strain with monacolin K activity and citrinin-free characteristics for red yeast rice production by LC-MS/MS analysis by LC-MS/MS analysis

11 trang
Extraction and investigation of the chemical composition of essential oil from Ocimum africanum L.

Extraction and investigation of the chemical composition of essential oil from Ocimum africanum L.

7 trang
Synthesis and evaluation of the acetylcholinesterase inhibitory effect of novel heteroaromatic derivatives bearing a 2-(5-(pyridin-2-yl)-1H-tetrazol-1-yl)acetamide scaffold

Synthesis and evaluation of the acetylcholinesterase inhibitory effect of novel heteroaromatic derivatives bearing a 2-(5-(pyridin-2-yl)-1H-tetrazol-1-yl)acetamide scaffold

11 trang
Định danh loài một số chủng nấm men phân lập từ bệnh nhân bằng kỹ thuật khối phổ MALDI - TOF (Maldi Tof Mass Spectrometry) và giải trình tự gen

Định danh loài một số chủng nấm men phân lập từ bệnh nhân bằng kỹ thuật khối phổ MALDI - TOF (Maldi Tof Mass Spectrometry) và giải trình tự gen

6 trang
Quantitative determination of carvedilol in human plasma by highperformance liquid chromatography using fluorescence detection

Quantitative determination of carvedilol in human plasma by highperformance liquid chromatography using fluorescence detection

6 trang
Contamination of phthalic acid esters (PAEs) in surface sediment samples collected from Rao Cai River in Ha Tinh, Vietnam

Contamination of phthalic acid esters (PAEs) in surface sediment samples collected from Rao Cai River in Ha Tinh, Vietnam

7 trang
Determination of trace metal concentration in wastewater Ho Chi Minh city using the inductively coupled plasma mass spectrometry

Determination of trace metal concentration in wastewater Ho Chi Minh city using the inductively coupled plasma mass spectrometry

7 trang
Báo cáo khoa học:  Affinity purification-mass spectrometry Powerful tools for the characterization of protein complexes

Báo cáo khoa học: Affinity purification-mass spectrometry Powerful tools for the characterization of protein complexes

9 trang
Báo cáo khoa học:  Reduction of S-nitrosoglutathione by human alcohol dehydrogenase 3 is an irreversible reaction as analysed by electrospray mass spectrometry

Báo cáo khoa học: Reduction of S-nitrosoglutathione by human alcohol dehydrogenase 3 is an irreversible reaction as analysed by electrospray mass spectrometry

8 trang
Báo cáo khoa học: Systematic quantification of complex metabolic flux networks using stable isotopes and mass spectrometry

Báo cáo khoa học: Systematic quantification of complex metabolic flux networks using stable isotopes and mass spectrometry

18 trang
Báo cáo khoa học: Si-face stereospecificity at C5 of coenzyme F420 for F420H2 oxidase from methanogenic Archaea as determined by mass spectrometry

Báo cáo khoa học: Si-face stereospecificity at C5 of coenzyme F420 for F420H2 oxidase from methanogenic Archaea as determined by mass spectrometry

6 trang
Báo cáo khoa học: Chain initiation on type I modular polyketide synthases revealed by limited proteolysis and ion-trap mass spectrometry

Báo cáo khoa học: Chain initiation on type I modular polyketide synthases revealed by limited proteolysis and ion-trap mass spectrometry

15 trang
Báo cáo khoa học: Determination of thioxylo-oligosaccharide binding to family 11 xylanases using electrospray ionization Fourier transform ion cyclotron resonance mass spectrometry and X-ray crystallography

Báo cáo khoa học: Determination of thioxylo-oligosaccharide binding to family 11 xylanases using electrospray ionization Fourier transform ion cyclotron resonance mass spectrometry and X-ray crystallography

17 trang
Báo cáo khoa học:  Natural-abundance isotope ratio mass spectrometry as a means of evaluating carbon redistribution during glucose–citrate cofermentation by Lactococcus lactis

Báo cáo khoa học: Natural-abundance isotope ratio mass spectrometry as a means of evaluating carbon redistribution during glucose–citrate cofermentation by Lactococcus lactis

9 trang
Báo cáo khoa học:  Monitoring ligand-mediated nuclear receptor–coregulator interactions by noncovalent mass spectrometry

Báo cáo khoa học: Monitoring ligand-mediated nuclear receptor–coregulator interactions by noncovalent mass spectrometry

10 trang
Báo cáo khóa học: Quantitative analysis, using MALDI-TOF mass spectrometry, of the N-terminal hydrolysis and cyclization reactions of the activation 2 process of onconase

Báo cáo khóa học: Quantitative analysis, using MALDI-TOF mass spectrometry, of the N-terminal hydrolysis and cyclization reactions of the activation 2 process of onconase

9 trang
Báo cáo khóa học:  Determination by electrospray mass spectrometry and 1H-NMR spectroscopy of primary structures of variously fucosylated neutral oligosaccharides based on the iso-lacto-N-octaose core

Báo cáo khóa học: Determination by electrospray mass spectrometry and 1H-NMR spectroscopy of primary structures of variously fucosylated neutral oligosaccharides based on the iso-lacto-N-octaose core

15 trang
Báo cáo khoa học: A functional polymorphism of apolipoprotein C1 detected by mass spectrometry

Báo cáo khoa học: A functional polymorphism of apolipoprotein C1 detected by mass spectrometry

9 trang
Báo cáo khoa học: A mutagenic analysis of the RNase mechanism of the bacterial Kid toxin by mass spectrometry

Báo cáo khoa học: A mutagenic analysis of the RNase mechanism of the bacterial Kid toxin by mass spectrometry

14 trang
Báo cáo khoa học: The changing patterns of covalent active site occupancy during catalysis on a modular polyketide synthase multienzyme revealed by ion-trap mass spectrometry

Báo cáo khoa học: The changing patterns of covalent active site occupancy during catalysis on a modular polyketide synthase multienzyme revealed by ion-trap mass spectrometry

13 trang

Tài liêu mới

Câu hỏi ôn tập môn Vi sinh môi trường

Câu hỏi ôn tập môn Vi sinh môi trường

27 trang
Câu hỏi ôn tập Sinh học tế bào

Câu hỏi ôn tập Sinh học tế bào

25 trang
Câu hỏi ôn tập Ký sinh trùng

Câu hỏi ôn tập Ký sinh trùng

39 trang
Bài giảng Các quá trình sinh học của cơ thể

Bài giảng Các quá trình sinh học của cơ thể

30 trang
Câu hỏi trắc nghiệm ôn tập Vi sinh năm 2025 có đáp án

Câu hỏi trắc nghiệm ôn tập Vi sinh năm 2025 có đáp án

43 trang
Câu hỏi ôn tập môn Phân loại thực vật

Câu hỏi ôn tập môn Phân loại thực vật

17 trang
Câu hỏi ôn tập Sinh học cơ thể

Câu hỏi ôn tập Sinh học cơ thể

5 trang
Câu hỏi ôn tập môn Công nghệ sinh học nấm ăn và nấm dược liệu

Câu hỏi ôn tập môn Công nghệ sinh học nấm ăn và nấm dược liệu

2 trang
Đề cương ôn tập Sinh học di truyền

Đề cương ôn tập Sinh học di truyền

17 trang
Bài giảng Di truyền vi khuẩn

Bài giảng Di truyền vi khuẩn

24 trang
Nghiên cứu thành phần hoá học của phân đoạn chiết dichloromethane của cây bông ổi (Lantana camara L.) thu hái tại vùng ven biển Thái Bình, Việt Nam

Nghiên cứu thành phần hoá học của phân đoạn chiết dichloromethane của cây bông ổi (Lantana camara L.) thu hái tại vùng ven biển Thái Bình, Việt Nam

6 trang
A study on the reactivity and physicochemical properties of coatings based on acrylated black seed oil coatings through crosslinking at ambient temperature

A study on the reactivity and physicochemical properties of coatings based on acrylated black seed oil coatings through crosslinking at ambient temperature

7 trang
Nghiên cứu điều kiện trích ly siêu âm dầu từ hạt cây Sacha inchi (Plukenetia volubilis)

Nghiên cứu điều kiện trích ly siêu âm dầu từ hạt cây Sacha inchi (Plukenetia volubilis)

5 trang
Các hợp chất phenolic từ cặn chiết dichloromethane của chủng vi nấm biển Aspergillus sp. M589 phân lập từ mẫu hải miên vàng Biemna sp. (CB-5-3-7) ở vùng biển quần đảo Cát Bà (Hải Phòng)

Các hợp chất phenolic từ cặn chiết dichloromethane của chủng vi nấm biển Aspergillus sp. M589 phân lập từ mẫu hải miên vàng Biemna sp. (CB-5-3-7) ở vùng biển quần đảo Cát Bà (Hải Phòng)

5 trang
Ảnh hưởng của tinh bột ngô biến tính và pectin đến tính chất hóa lý, hoạt chất sinh học, hoạt tính chống ôxy hóa và ức chế enzyme α-glucosidase của bột vi bao giàu hoạt chất sinh học từ vỏ quả ca cao (Theobroma cacao L.)

Ảnh hưởng của tinh bột ngô biến tính và pectin đến tính chất hóa lý, hoạt chất sinh học, hoạt tính chống ôxy hóa và ức chế enzyme α-glucosidase của bột vi bao giàu hoạt chất sinh học từ vỏ quả ca cao (Theobroma cacao L.)

10 trang

AI tóm tắt

- Giúp bạn nắm bắt nội dung tài liệu nhanh chóng!

Giới thiệu tài liệu

Đối tượng sử dụng

Từ khoá chính

Nội dung tóm tắt

Giới thiệu

Về chúng tôi

Việc làm

Quảng cáo

Liên hệ

Chính sách

Thoả thuận sử dụng

Chính sách bảo mật

Chính sách hoàn tiền

DMCA

Hỗ trợ

Hướng dẫn sử dụng

Đăng ký tài khoản VIP

Zalo/Tel:

093 303 0098

Email:

support@tailieu.vn

Phương thức thanh toán

Layer 1

Theo dõi chúng tôi

Facebook

Youtube

TikTok

Chịu trách nhiệm nội dung: Nguyễn Công Hà. ©2025 Công ty TNHH Tài Liệu trực tuyến Vi Na.
Địa chỉ: 54A Nơ Trang Long, P. Bình Thạnh, TP.HCM - Điện thoại: 0283 5102 888 - Email: info@tailieu.vn
Giấy phép Mạng Xã Hội số: 670/GP-BTTTT cấp ngày 30/11/2015