ĐẠI HỌC QUỐC GIA HÀ NỘI
TRƯỜNG ĐẠI HỌC Y DƯỢC
ĐINH XUÂN TÔN TÀI
ĐÁNH GIÁ TÁC DỤNG ỨC CHẾ ENZYM HER2 CỦA
CÁC HỢP CHẤT ISOFLAVONE TRONG ĐỊNH
HƯỚNG ĐIỀU TRỊ UNG THƯ VÚ BẰNG PHƯƠNG
PHÁP DOCKING PHÂN TỬ
KHÓA LUẬN TỐT NGHIỆP ĐẠI HỌC NGÀNH DƯỢC HỌC
HÀ NỘI - 2022
ĐẠI HỌC QUỐC GIA HÀ NỘI
TRƯỜNG ĐẠI HỌC Y DƯỢC
ĐINH XUÂN TÔN TÀI
ĐÁNH GIÁ TÁC DỤNG ỨC CHẾ ENZYM HER2 CỦA CÁC HỢP
CHẤT ISOFLAVONE TRONG ĐỊNH HƯỚNG ĐIỀU TRỊ UNG THƯ
VÚ BẰNG PHƯƠNG PHÁP DOCKING PHÂN TỬ
KHÓA LUẬN TỐT NGHIỆP ĐẠI HỌC
(NGÀNH DƯỢC HỌC)
KHÓA: QH.2017.Y
NGƯỜI HƯỚNG DẪN: PGS. TS. Vũ Mạnh Hùng
ThS. Nguyễn Thị Huyền
HÀ NỘI - 2022
Lời cảm ơn
Đầu tiên, tôi xin bày tỏ lòng biết ơn sâu sắc và gửi lời cảm ơn chân thành
nhất tới PGS. TS Bùi Thanh Tùng, Trưởng bộ môn Dược lý, Trường Đại học
Y Dược, Đại học Quốc Gia Hà nội và PGS. TS Vũ Mạnh Hùng công tác tại
Học viện Quân y là những người đã đồng hành, tận tình hướng dẫn và chỉ bảo
cho tôi từ những ngày đầu tiên trên con đường học tập và trong suốt thời gian
tôi thực hiện khóa luận này.
Tôi xin chân thành cảm ơn cô ThS. Nguyễn Thị Huyền công tác tại
Trường Đại Học Y Dược - Đại học Quốc gia Hà Nội cũng đã chỉ bảo và giúp
đỡ tận tình từ những ngày đầu khi nhận đề tài.
Cùng với đó, tôi cũng xin gửi lời cảm ơn tới ban lãnh đạo, thầy cô Trường
Đại học Y dược, Đại học Quốc gia Hà Nội đã tận tình giúp đỡ và giảng dạy để
tôi được học tập, nghiên cứu, rèn luyện tại đây trong suốt 5 năm qua và thực
hiện đề tài này.
Cuối cùng, tôi xin bày tỏ lòng biết ơn sâu sắc tới gia đình, những người
thân luôn sát cánh, đồng hành, ủng hộ tôi trong quá trình học tập và nghiên cứu
hoàn thành khóa luận.
Luận văn của tôi đã được hoàn thành với nhiều cố gắng tuy nhiên do kiến
thức, kỹ năng hạn chế nên không thể thiếu những thiếu sót. Tôi rất mong nhận
được những ý kiến đóng góp của các thầy cô, những người đi trước để khóa
luận của tôi hoàn thiện hơn.
Hà Nội, ngày 30 tháng 5 năm 2022
Sinh viên
Đinh Xuân Tôn Tài
MỤC LỤC
DANH MỤC KÝ HIỆU VÀ CHỮ VIẾT TẮT
DANH MỤC HÌNH VẼ
DANH MỤC BẢNG
ĐẶT VẤN ĐỀ ................................................................................................... 1
CHƯƠNG 1. TỔNG QUAN ........................................................................... 3
1.1. Tổng quan bệnh ung thư vú .................................................................. 3
1.2. Phân loại ung thư vú ............................................................................. 4
1.3. Điều trị ung thư vú ................................................................................ 4
1.3.1. Điều trị ung thư vú giai đoạn 0 ...................................................... 5
1.3.2. Điều trị ung thư vú giai đoạn I: ...................................................... 5
1.3.3. Điều trị ung thư vú giai đoạn II ...................................................... 5
1.3.4. Điều trị ung thư vú giai đoạn III .................................................... 6
1.3.5. Điều trị ung thư vú giai đoạn IV .................................................... 7
1.3.6. Điều trị đích trong ung thư vú ........................................................ 8
1.4. Tổng quan về The Epidermal Growth Factor Receptor ....................... 8
1.4.1. Khái niệm The Epidermal Growth Factor Receptor ...................... 8
1.4.2. HER2 trong ung thư và các chất ức chế HER2 .............................. 9
1.5. Tổng quan về isoflavone .................................................................... 10
1.6. Kỹ thuật docking phân tử ................................................................... 11
1.6.1. Đại cương về phương pháp docking phân tử ............................... 11
1.6.2. Quy trình Docking ........................................................................ 13
1.6.3. Quy tắc Lipinski về các hợp chất giống thuốc ............................. 13
CHƯƠNG 2. NGUYÊN LIỆU, THIẾT BỊ, NỘI DUNG VÀ PHƯƠNG
PHÁP NGHIÊN CỨU ................................................................................... 15
2.1. Nguyên liệu và thiết bị ....................................................................... 15
2.1.1. Cấu trúc protein ............................................................................ 15
2.1.2. Cấu trúc phối tử ............................................................................ 15
2.1.3. Cấu trúc chất chứng ...................................................................... 16
2.1.4. Thiết bị và phần mềm ................................................................... 16
2.2. Nội dung nghiên cứu .......................................................................... 16
2.3. Phương pháp nghiên cứu .................................................................... 17
2.3.1. Mô phỏng protein docking ........................................................... 17
2.3.2. Nghiên cứu các đặc điểm giống thuốc ......................................... 19
2.3.3. Nghiên cứu các đặc tính dược động học và độc tính (ADMET) . 20
CHƯƠNG 3. KẾT QUẢ VÀ BÀN LUẬN .................................................. 21
3.1. Mô phỏng docking phân tử ................................................................. 21
3.1.1. Redock 03Q .................................................................................. 21
3.1.2. Tìm kiếm các chất tiềm năng từ kết quả docking ........................ 23
3.2. Sàng lọc các hợp chất giống thuốc ..................................................... 28
3.3. Dự đoán thông số ADMET ................................................................ 30
CHƯƠNG 4. BÀN LUẬN ............................................................................. 37
4.1. Kết quả ................................................................................................ 37
4.1.1 Genistein (ID: 5280961) .................................................................. 37
4.2.1 Biochanin A (ID: 5280373) ............................................................. 38
4.2. Về phương pháp ................................................................................. 38
KẾT LUẬN VÀ KIẾN NGHỊ ...................................................................... 41
TÀI LIỆU THAM KHẢO