Trong chương trình đào tạo, Bệnh học y học cổ truyền giữ vai trò quan trọng trong việc giúp sinh viên hiểu rõ các nguyên nhân gây bệnh, cơ chế bệnh sinh, biểu hiện lâm sàng và nguyên tắc điều trị theo y học cổ truyền. Nội dung học phần tập trung vào việc phân tích các bệnh chứng theo lý luận tạng phủ, kinh lạc và biện chứng luận trị, gắn liền với nhiều tình huống bệnh lý thực tiễn.
Giáo trình Y học cổ truyền gồm các nội dung: Lý luận cơ bản (âm dương, ngũ hành), kinh lạc, châm cứu, trồng cây thuốc; Đại cương về kinh lạc, kỹ thuật châm cứu; Bệnh học y học cổ truyền.