VI SINH THỰC PHẨM
GVGD: Bùi Hồng Quân
Biên soạn: Nguyễn Minh Hiền
TÀI LIỆU THAM KHẢO
Nguyễn Lân Dũng, 2005. Vi sinh vật học đại cương
Nguyễn Đức Lượng, 1996. Công Nghệ vi sinh tập 1, 2, 3. ĐH Bách Khoa Tp. HCM
Tô Minh Châu và ctv, 1999. Vi sinh vật học đại cương. ĐH Nông Lâm Tp. HCM
1
………………….
CHƯƠNG I. MỞ ĐẦU
1.1 ĐỐI TƯỢNG VÀ NHIỆM VỤ CỦA VI SINH HỌC
1.2 VAI TRÒ CỦA VSV
1.3 LỊCH SỬ PHÁT TRIỂN CỦA VI SINH HỌC
1.4. ĐỊNH DANH VI SINH VẬT
1.5 VỊ TRÍ MÔN HỌC VÀ NHIỆM VỤ NGƯỜI HỌC
1.1 ĐỐI TƯỢNG & NHIỆM VỤ CỦA VI SINH HỌC
ĐỐI TƯỢNG: VSV (Microbiology = micro + bios + logos)
NHIỆM VỤ: Nghiên cứu hình thái, cấu tạo, hoạt động sống của VSV
VSV (Microorganism): là những cơ thể sống nhỏ bé mà mắt thường có thể không nhìn thấy được. Muốn thấy được chúng phải quan sát dưới kính hiển vi
2
Các nhóm VSV Virus Vi khuẩn (bacteria) Nấm mốc (mold) Nấm men (yeast) Vi tảo (algae)
Virus Vi khuẩn Nấm mốc
3
Nấm men Vi tảo Nguyên sinh động vật
Vị trí phân loại của vi sinh vật
Theo R. H. Whitataker, thế giới sinh vật gồm 5 giới
(cid:1)Giới khởi sinh (Monera hay prokaryote): vi khuẩn
và tảo lam
(cid:1)Giới nguyên sinh (Protista): tảo đơn bào, nấm đơn
bào có lông roi, nguyên sinh động vật.
(cid:1)Giới thực vật (Plantae)
(cid:1)Giới Nấm (Fungi)
(cid:1)Giới động vật (Animalia)
Vi sinh vật tập trung vào Monera, Protista và Fungi
Vị trí phân loại của VSV (theo cấu trúc tế bào)
Prokaryote Nhân phân hóa chưa hoàn chỉnh Chưa có màng bao nhân, chưa hình thành tiểu hạch Trong nhóm này có: vi khuẩn, xạ khuẩn, niêm vi khuẩn, tảo lam …
4
Eukaryote Nhân phân hóa hoàn toàn, có màng nhân và tiểu hạch. Eukaryote đơn bào: nấm men, tảo đơn bào Eukaryote đa bào: nấm mốc, nấm bậc cao, thực vật, động vật. Đặc biệt: Virus chưa có cấu tạo tế bào – hình thái sống đặc biệt nằm giữa giới vật sống và chất vô sinh
ĐẶC ĐIỂM CHUNG CỦA VSV
Kích thước nhỏ bé.
Sinh trưởng, sinh sản nhanh
Thích nghi cao
Vết tích vi khuẩn lam cách đây 3,5 tỷ năm
Vết tích Gloeodiniopsis cách đây 1,5 tỷ năm
Vết tích Palaeolyngbya cách đây 950 triệu năm
5
Phân bố rộng, đa dạng về chủng loại
1.2 VAI TRÒ CỦA VSV
1.2.1 VAI TRÒ TÍCH CỰC
Trong nông nghiệp
1.2.1 VAI TRÒ TIÊU CỰC
Trong bảo vệ môi trường
Trong nông nghiệp
Trong công nghiệp
Trong bảo vệ môi trường
Trong Chế biến thực phẩm
Trong công nghiệp
Trong Chế biến thực phẩm
Trong y tế
Tác động tích cực của VSV
Trong y tế
• Tham gia quá trình tuần hoàn vật chất trong tự nhiên:
phân giải chất hữu cơ, khởi đầu chuỗi thức ăn, tham gia chu trình carbon, nitơ, oxi …
• Trong công nghệ hóa: tham gia sản xuất các chất hóa
học khó sản xuất (cồn, acid hữu cơ, enzyme …)
• Trong y học: vaccin, các chất kháng sinh, các vitamin,
acid amin, hormon …
6
• Trong chế biến, bảo quản thực phẩm: sản xuất bột ngọt, sản xuất sinh khối, sản xuất rượu bia, lên men sản xuất thực phẩm, ……
Tác động tiêu cực của VSV
Vi sinh vật là nguyên nhân gây ra các căn bệnh
chết người: dịch hạc, ung thư, AIDS …
- Là tác nhân gây bệnh cho động vật và thực vật
- Làm hư hỏng lương thực thực phẩm
- ……
Nấm Rhizoctonia solani làm mốc trắng gốc, cây héo, lá gốc héo vàng, bó mạch thâm đen sau vài ngày cây cà chua, khoai tây bị bệnh sẽ chết.
VK Ralstonia solanacearum cây héo đột ngột, lá vẫn còn xanh, có thể héo từng cành, bó mạch hóa nâu chứa dịch nhờn màu trắng đục.
7
8
Bệnh do Staphylococcus areus
Vaccin phòng cúm A H5N1 của Cty Sản xuất vaccin và Sinh phẩm số 1 thuộc Viện Vệ sinh dịch tễ thử Trung ương được nghiệm trên người với sự cho phép của Bộ Y tế vào cuối tháng 3/ 2008
1.3 LỊCH SỬ PHÁT TRIỂN CỦA VI SINH HỌC
THỜI TIỀN SỬ: Người tiền sử biết sản xuất bia, bánh mỳ từ ngũ cốc
NỀN VĂN MINH NÔNG NGHIỆP: (4000 năm B.C) phát hiện những hình ảnh khảo cổ thể hiện việc uống rượu của Người Xume.
9
NỀN VĂN MINH CỦA NGƯỜI HY LẠP thờ thần Rượu Bacchus và NGƯỜI LA MÃ thờ thần Rượu Dionysus.
Khái quát lịch sử phát triển VSV học
Vi sinh học hiện đại
Trước khi có KHV
Sau khi có KHV
Vi sinh học thực nghiệm
Trước khi có KHV
•Con người chưa ý thức được sự hiện diện của VSV
•Biết ứng dụng VSV vào chế biến và bảo quản thực phẩm: ủ rượu, làm bánh mì, làm mắm, tương, chao …
•Chịu đựng những trận đại dịch (đậu mùa, dịch hạch …) do VSV gây ra
Khái quát lịch sử phát triển VSV học (tt)
Sau khi có KHV 1675, chiếc KHV đầu tiên do Leewenhoek phát minh Vi sinh vật học giai đoạn này tập trung vào mô tả hình thái của VSV
Antoni van Leeuwenhoek
(1632-1723)
10
Lịch sử VSV học - Sau khi có KHV (tt)
Robert Hook (1635-1703)
Robert Hook, nhà khoa học Anh, “cha đẻ của KHV quang học” đã sử dụng nguồn sáng khi soi KHV. 1665, ông xuất bản cuốn “Hình ảnh hiển vi” giới thiệu rất nhiều đối tượng mà mắt thường không thấy rõ được.
KHV quang học
Lịch sử VSV học - Sau khi có KHV (tt)
David Brewster (1781-1868)
1812, huân tước David Brewster ngâm vật kính và mẫu vật trong một chất lỏng (chủ yếu là glycerine) có độ khúc xạ gần với thủy tinh, có thể triệt tiêu sự sai lệch và tán sắc khi ánh sáng đi qua các môi chất có độ khúc xạ khác nhau.
11
Ông là người đầu tiên sử dụng kính lọc màu để thu được ánh sáng đơn sắc.
Ernst Abbe
Lịch sử VSV học - Sau khi có KHV (tt) Ernst Abbe (1840-1905) và Carl Zeiss (1816-1888) (2 nhà khoa học Mỹ) đã thử 300 chất để tìm ra dầu ngâm kính tốt nhất (dầu Tuyết tùng (huile de cèdre) hiện đang được dùng khi sử dụng vật kính x100 . 1886, Abbe phát minh ra bộ tụ quang
Frederik Zernike (1888-1966) phát minh KHV tương phản pha, có thể quan sát vật thể sống trong suốt không màu mà không cần cố định, nhuộm màu như xoắn thể gây bệnh giang mai. 1953, Ông nhận giải Nobel do những đóng góp xuất sắc trong lĩnh vực sinh học.
Improvements of the microcopes
XIX Century
12
KHV huỳnh quang giúp thấy một số chất hoá học trong tế bào chưa bị tổn thương. Nguồn sáng của KHV huỳnh quang là đèn thuỷ ngân tạo ra một chùm nhiễu tia xanh và tia UV. Các gương lọc ánh sáng và gương tán sắc đặc biệt sẽ phản chiếu lên bản quan sát những tia bước sóng ngắn. Các tia UV tác động gây ra hiện tượng huỳnh quang và làm cho bản quan sát phát ra những tia sáng huỳnh quang có bước sóng dài hơn. Độ dài bước sóng bức xạ huỳnh quang luôn dài hơn độ dài bước sóng bức xạ gây ra nó. Các vật thể có khả năng huỳnh quang bắt đầu phát sáng rõ ràng và mỗi chất có một bức xạ huỳnh quang đặc trưng. VD: chất diệp lục có bức xạ huỳnh quang màu đỏ tươi
Lịch sử VSV học - Sau khi có KHV (tt)
Lịch sử VSV học - Sau khi có KHV (tt)
1938, KHV điện tử ra đời tại Mỹ.
chân phải ống đặt bị
Nguyên lý: dùng 1 chùm điện tử thay thế cho ánh sáng. Do dòng điện tử không đi qua được thấu kính nên phải dùng những điện từ trường để hội tụ chùm điện tử, tất cả thiết không. trong KHV quang học hiện đại nhất có độ phóng đại 2.500 lần.
13
KHV điện tử có thể phóng đại 40.000 lần, thậm chí có thể phân biệt được 2-3 Å, nhưng chỉ có thể phân biệt rõ nét những hạt từ 20 Å trở lên.
Lịch sử VSV học - Vi sinh học thực nghiệm
• Mô tả hình thái VSV, khám phá các đặc tính sinh
lý, sinh hóa của vsv, xác định vai trò của vsv.
• Hoàn thiện các qui trình lên men cổ truyền, ứng
dụng vào sx công nghiệp
• Các nhà khoa học:
L. Pasteur, R. Koch
Bình cổ ngỗng
Nhà bác học thiên tài
Louis Pasteur (27.12.1822 - 28.9.1895)
9.1879, ông tìm ra nguyên lý của việc tiêm phòng bệnh dịch tả ở gà và việc làm giảm độc lực của các VSV, nền tảng của việc tiêm phòng bằng vaccin sau này, ông đã làm giảm độc lực VK nhiệt thán và chế ra được vaccin phòng bệnh có hiệu quả cho đàn súc. gia Ông lấy tuỷ sống con thỏ bị bệnh dại và làm cho VK này yếu đi. Sau đó, tiêm vào em bé bị chó dại cắn tên là Yoseph Meister (9tuổi) vào ngày 06/7/1885. Kết quả thành công ngoài sức tưởng tượng của ông: người bệnh khỏi hẳn.
Louis Pasteur, nhà bác học người Pháp sống thế kỷ 19, cha đẻ của lý thuyết lên men (1857), vi khuẩn và vắcxin trừ bệnh chó dại (1886), nghành sát trùng.
1880, ông phát hiện tụ cầu khuẩn gây mụn nhọt và viêm tuỷ xương, nhiễm trùng hậu sản là do một VK có tên là liên cầu khuẩn.
14
Lịch sử VSV học - Vi sinh học thực nghiệm (tt)
First Fermentation concept, or Pasteur concept in 1857, “Fermentation is the transformation process of the sugar to alcohol in presence of "la vie sans l'air" (means life without air).
Conclusions of Pasteur from its study of wines: The alcoholic fermentation of grape juice occur only in presence of yeasts. in The wine acidification occur presence of bacteria. When the grape juice is heated the fermentation do not take place. When the wine (the sugar) is heated the acidification do not occur.
Lịch sử VSV học - Vi sinh học thực nghiệm (tt)
1881, đưa ra pp phân lập VSV
Nhà khoa học Đức Robert Koch (1843-1910)
15
1884, tìm ra trực khuẩn bệnh lao
Mô hình chuỗi xoắn kép DNA của waston – crick 1953
Nhà sinh học, bác sĩ, dược sĩ người Scotland (phía Bắc nước Anh)
Người mở ra kỷ nguyên sử dụng kháng sinh trong y học.
Alexander Fleming (6.8.1881 – 11.3.1955)
1945, Fleming, Ernst Boris Chain, Howard Walter Florey được trao Giải thưởng Nobel y học do tìm và phân tách được Penicilin – loại kháng sinh đầu tiên trong việc điều trị những bệnh nhiễm trùng.
Năm 1922, tình cờ Fleming phát hiện một đĩa petri nuôi cấy vi khhuẩn, khuẩn lạc không mọc được ở chỗ có dịch từ mũi ông rơi vào. Và sau đó không lâu, ông công bố về lysozyme, có vai trò kháng khuẩn. Nhờ phát minh này, Fleming trở nên nổi tiếng, được giới y học Anh biết đến.
9.1928, phụ tá của Fleming phát hiện thấy trong đĩa petri cấy VK xuất hiện một loại nấm màu xanh nhạt. Anh đổ đĩa petri ấy vào một đĩa khác, lúc ấy trên đĩa petri cũ còn lưu lại những đường vân xanh của loại nấm ấy. Fleming nghĩ rằng đó là dấu vết của những VK đã chết, ông lấy một giọt dịch của đĩa petri bỏ đi đem quan sát dưới KHV và phát hiện rằng không hề có dấu vết của liên cầu khuẩn trong đó.
16
Lịch sử VSV học - Vi sinh học hiện đại
• Giai đoạn phát triển rực rỡ của công
nghệ lên men
• Các sản phẩm lên men ứng dụng rộng rãi: trong thú y, y học, thực phẩm, môi trường …
• Vi sinh học hiện đại đang làm thay
đổi cuộc sống của con người
CÁC MỐC QUAN TRỌNG TRONG LỊCH SỬ PHÁT TRIỂN VI SINH HỌC
1667 Van Leuwenhoek lần đầu tiên quan sát tế bào bằng kính hiển vi.
1798 Jenner lần đầu tiêm chủng vaccin phòng bệnh đậu mùa cho 1 đứa trẻ.
1857 Pasteur phát hiện quá trình lên men
1864 Pasteur phát minh phương pháp thanh trùng Pasteur
1881 Robert Koch đề xuất phương pháp phân lập VK
1882 - 1884 Koch phát hiện trực khuẩn gây bệnh lao
1884 Gram đề xuất kỹ thuật nhuộm Gram
17
CÁC MỐC QUAN TRỌNG TRONG LỊCH SỬ PHÁT TRIỂN VI SINH HỌC (tt)
1887 Petri đề xuất dùng hộp petri
1898 Shiga phát hiện trực khuẩn lỵ
1928 Alexander Fleming khám phá ra penicillin
1942 Kính hiển vi điện tử được sử dụng để xác định và phân loại thực khuẩn thể
1953 Stanley phát hiện virut kết tinh
1953 Walson và Crick khám phá ra cấu trúc của DNA
1959 Stewart tìm ra nguyên nhân virut với bệnh ung thư
1989 Bisho và Varmus phát hiện gen ung thư
Các giới (kingdoms) sinh vật
18
1.4. Định danh và Phân loại
Hệ thống phân loại sinh vật (Biological Classification)
Các nhóm được sử dụng để phân loại vi sinh vật
19
Luật danh pháp sinh vật
• Bao gồm những qui tắc về đặt tên vi sinh vật
– Luật quốc tế danh pháp động vật (ICZN)
– Luật quốc tế danh pháp thực vật (ICBN)
– Luật quốc tế danh pháp vi sinh vật (ICNB)
• Hiện nay có 3 bộ luật danh pháp
• Luật danh pháp không có tính chất pháp lý, việc
tuân thủ dựa trên tính tự nguyện
20
CÁCH ĐẶT TÊN VSV Nhà phân loại Linnaes (TK 18) thiết lập hệ nhị thức danh pháp với nguyên tắc như sau: (cid:2)Mỗi loại VSV riêng biệt được công nhận là một loài. (cid:2)Mỗi loài được đặt một tên gồm 2 từ: Từ đầu tiên là tên giống (bắt đầu với chữ viết hoa), từ thứ 2 là tên loài (viết thường). (cid:2)Tên đặc biệt thường giải thích tên giống và cho biết một vài thông tin bổ sung về vi sinh vật. Escherichia (tên của Escherich) coli (ký sinh trong ruột) (cid:2)Cách viết tên VSV: gạch dưới (viết tay), in nghiêng (trong tài liệu in). (cid:2)Cách viết tắt: chỉ viết tắt sau khi đã viết tên đầy đủ. Sau tên giống viết tắt là một dấu chấm (E. coli)
Luật danh pháp sinh vật (tt)
Tên đầy đủ
Tên viết tắt
Staph. aureus Ps. fluorescens E. coli C. botulinum B. cereus Lb. acidophilus Strep. salivarius subsp thermophilus P. citrinum Sacc. cerevisiae
Staphylococcus aureus Pseudomonas fluorescens Escherichia coli Clostridium botulinum Bacillus cereus Lactobacillus acidophilus Streptococcus salivarius subsp thermophilus Penicillium citrinum Saccharomyces cerevisiae
ĐẶT TÊN CHO 1 VSV MỚI
ĐỔI TÊN VSV
(cid:2)Theo nguyên tắc quốc tế
(cid:2)Liên quan đến sự nhận diện và miêu tả hình thái tế bào, đặc tính di truyền….
Tên VSV có thể (sử dụng các kỹ thuật phân tích trình tự AND, ARN…) thay đổi khi có những nghiên cứu mới cho thấy tên cũ có những giới hạn nhất định về tính chất…
Tên cũ
Tên mới
Streptococcus lactis
Lactococcus lactis subsp lactis
Streptococcus cremoris Streptococcus diacetylactis
Lactococcus lactis subsp cremoris Lactococcus lactis subs lactis var diacetylactis diacetyla diacetylactis lactis var
Streptococcus thermophilus
Streptococcus salivarius subsp thermophilus
Lactobacillus bulgaricus
Lactobacillus delbreukii subsp bulgaricus
21
Tính chất của tên khoa học
• Tính duy nhất: Tên mỗi taxon là duy nhất, không
trùng với các tên khác.
• Tính phổ cập: Để trao đổi thông tin, các nhà khoa
học buộc phải học tên khoa học của sinh vật. Tên
các loài sinh vật được gọi theo tiếng Latin.
• Tính ổn định: Ủy ban Danh pháp Quốc tế đóng vai
trò giữ ổn định cho hệ thống danh pháp quốc tế.
Ví dụ về phân loại VSV
22
• Kingdom: Bacteria • Phylum: Proteobacteria • Class: Gamma Proteobacteria • Order: Enterobacteriales • Family: Enterobacteriaceae • Genus: Salmonella • Species: S. bongori, S. enterica, S. typhi
Các nhóm VK (Theo hệ thống phân loại của Bergeys)
Nhóm
Họ
Giống
Campylobacter
Xoắn thể và vi khuẩn cong
Spirallaceae
Pseudomonadaceae
Pseudomonas, Altermonas, Gluconobacter, Xanthomonas, Shewanella
Trực khuẩn và cầu khuẩn G- dạng hiếu khí
Halobaterium, Halococcus
Hallobacteriaceae
Alcaligenes, Acetobacter, Brucella
Những loại chưa xác định
Enterobacteriaceae
Trực khuẩn hiếu khí tùy ý, G-
Escherichia, Citrobacter, Samonella, Shigella, Klebsiella, Enterobacter, Serratia, Proteus, Yersinia, Erwinia, Haffnia, Arizona, Pantoea
Vibrio, Aeromonas
Vibrionaceae
Flavobacterium, Chromobacterium
Những giống chưa xác định
Moraxella, Acinetobacter, Psychrobacter
Neisseriaceae
Song cầu khuẩn và diplococcobacilli G-
Micrococcus, Staphylococcus
Micrococcaceae
Cầu khuẩn G+
Streptococcaceae
Streptococcus, Leuconostoc, Pediococcus, Lactococcus, Enterococcus, Carnobacterium, Vagococcus
Sarcina
Peptococceaceae
Clostridium, Bacillus
Baciliaceae
Trực khuẩn và cầu khuẩn sinh nội bào tử
Lactobacillus, Brochothrix
Lactobacilliacae
Trực khuẩn có hình dạng đều đặn, G+, không sinh bào tử
Listeria
Những giống chưa xác định
Arthrobacter, Brevibacterium, Propionibacterim
khuẩn
dạng
Coryne
Trực khuẩn không sinh bào tử có hình dạng không đều
Vi (Coryneform bacteria)
Phân loại nấm: dựa vào vòng đời, cấu trúc, phương thức sinh sản. Những nhóm nấm rất quan trọng trong vi sinh môi trường
Loại nấm
Hình thức sinh sản
Ví dụ
Zygomycetes (nấm tiếp hợp)
Hữu tính: sản suất ra các bào tử tiếp hợp. Vô tính:bằng bào tử kín trong túi bào tử.
Nấm sợi: Rhizopus, Mucor và Thamnidium.
Ascomyces (nấm túi, nấm nang)
Schizosaccharomyces. Nấm sợi Byssochlamys, Eurotium và Xeromyces
Hữu tính: sinh ra các bào tử kín hình thành trong những cấu trúc chuyên biệt dạng túi được gọi là nang (mỗi nang chứa 8 bào tử túi).
Basidomycetes (nấm đảm)
tạo ra quả thể phức tạp. Mỗi đảm sinh ra 4 bào tử đảm.
Deuteromycetes (nấm bất toàn)
Nấm sợi: hệ khuẩn ty sinh sản vô tính bằng cách hình thành conidia (bào tử trần). Các nấm men sinh sản nhờ nảy chồi
Nấm sợi: Penicillium, Aspergillus, Nấm men: Rhodotorula và Candida
23
Phân loại vi rút: dựa vào nhóm vật chủ bị nhiễm như: động vật, thực vật vi khuẩn hay nấm mốc. Phân loại các virus vào các nhóm, có liên quan đến: (cid:3) Loại bệnh do virus gây ra (cid:3) Loại acid nucleic có trong tế bào – cầu hay thẳng, DNA chuỗi đơn hay chuỗi kép hay RNA (cid:3) Cấu trúc của protein màng (cid:3) Dạng virus trần hay có vỏ
1.5 VỊ TRÍ MÔN HỌC-NHIỆM VỤ NGƯỜI HỌC
VỊ TRÍ MÔN HỌC
CÁC CHUYÊN NGÀNH VỀ VI SINH VẬT HỌC
MICROBIOLOGY
BACTERIOLOGY
MYCOLOGY
PHYCOLOGY
PROTOZOOLOGY
VIROLOGY
24
VỊ TRÍ MÔN HỌC
CÁC LĨNH VỰC NGHIÊN CỨU CHUYÊN BIỆT
FOOD MICROBIOLOGY
MEDICAL MICROBIOLOGY
MICROBIOLOY
ENVIROMENTAL MICROBIOLOGY
AGRICULTURAL MICROBIOLOGY
INDUSTRIAL MICROBIOLOGY/ BIOTECHNOLOGY
1.5 VỊ TRÍ MÔN HỌC-NHIỆM VỤ NGƯỜI HỌC
NHIỆM VỤ NGƯỜI HỌC
25