BỘ GIÁO DỤC
VÀ ĐÀO TẠO
VIỆN HÀN LÂM KHOA HỌC
VÀ CÔNG NGHỆ VIỆT NAM
HỌC VIỆN KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ
Nguyễn Minh Chiến
NGHIÊN CỨU ĐẶC ĐIỂM BETA-GLUCOSIDASE
DỰA TRÊN PHÂN TÍCH DỮ LIỆU DNA METAGENOME CỦA VI
KHUẨN TRONG DẠ CỎ DÊ
LUẬN VĂN THẠC SĨ SINH HỌC
Hà Nội - 2024
BỘ GIÁO DỤC
VÀ ĐÀO TẠO
VIỆN HÀN LÂM KHOA HỌC
VÀ CÔNG NGHỆ VIỆT NAM
HỌC VIỆN KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ
Nguyễn Minh Chiến
NGHIÊN CỨU ĐẶC ĐIỂM BETA-GLUCOSIDASE
DỰA TRÊN PHÂN TÍCH DỮ LIỆU DNA METAGENOME CỦA VI
KHUẨN TRONG DẠ CỎ DÊ
LUẬN VĂN THẠC SĨ SINH HỌC
Ngành: Sinh học thực nghiệm
Mã số: 8 42 01 14
NGƯỜI HƯỚNG DẪN KHOA HỌC:
PGS. TS Đỗ Thị Huyền
Hà Nội - 2024
i
MỤC LỤC
DANH MỤC KÍ HIỆU, CHỮ VIẾT TẮT ....................................................... iii
DANH MỤC BẢNG ......................................................................................... v
DANH MỤC HÌNH VẼ, ĐỒ THỊ ................................................................... vi
MỞ ĐẦU ........................................................................................................... 1
Chương 1. TỔNG QUAN NGHIÊN CỨU ....................................................... 3
1.1. TỔNG QUAN VỀ BETA-GLUCOSIDASE ............................................. 3
1.1.1. Vị trí của beta-glucosidase trong phức hệ cellulase................................ 3
1.1.2. Phân loại beta-glucosidase ...................................................................... 4
1.1.3. Cơ chế xúc tác của beta-glucosidase ....................................................... 4
1.1.4. Ứng dụng của beta-glucosidase .............................................................. 6
1.2. MỘT SỐ ĐẶC ĐIỂM CỦA BETA-GLUCOSIDASE .............................. 9
1.2.1. Cấu trúc module của cellulase ................................................................ 9
1.2.2. Một số tính chất của beta-glucosidase từ vi khuẩn ............................... 12
1.3. ỨNG DỤNG CỦA CÔNG NGHỆ METAGENOMICS TRONG KHAI
THÁC NGUỒN ENZYME MỚI .................................................................... 14
1.3.1.Tổng quan về metagenome .................................................................... 14
1.3.2. Công nghệ Metagenomics tạo dữ liệu lớn cho khai thác gen ............... 15
1.3.3. Khai thác beta-glucosidase từ dữ liệu metagenome ............................. 16
Chương 2. ĐỐI TƯỢNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU .................. 18
2.1. ĐỐI TƯỢNG NGHIÊN CỨU ................................................................. 18
2.2. PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU ............................................................ 19
2.2.1. Phương pháp khai thác các trình tự beta-glucosidase từ bộ dữ liệu DNA
metagenome .................................................................................................... 19
2.2.2. Phương pháp ước đoán phổ kích thước phân tử, pI của beta-glucosidase
......................................................................................................................... 19
2.2.3. Phương pháp ước đoán vùng pH hoạt động của các beta-glucosidase . 19
2.2.4. Phương pháp ước đoán khả năng chịu nhiệt của enzyme ..................... 20
2.2.5. Phương pháp xác định cấu trúc module của các beta-glucosidase ....... 20
2.2.6. Phương pháp dự đoán cấu trúc không gian của các beta-glucosidase .. 21