4/9/2013
1
Phép phân tích hệ thống
cây phát sinh loài
(Phylogeny Analysis)
TRƢỜNG ĐẠI HỌC CN THỰC PHẨM TPHCM
KHOA CNSH & KTMT
HỆ ĐẠI HỌC
Chƣơng 4
ThS. Nguyễn Thành Luân
luannt@cntp.edu.vn
Bioinformatics
Các ứng dụng thực tiễn
Bioinformatics
4/9/2013
2
Bioinformatics
Bioinformatics
Câu hỏi
Tại sao ngày nay vẫn còn tồn tại
những động vật có cấu tạo phức tạp
như động vật có xương sống bên
cạnh động vật nguyên sinh có cấu
tạo rất đơn giản?
Bioinformatics
Tìm hiểu các quan hệ loài
4/9/2013
3
Bioinformatics
CÂY PHÁT SINH LOÀI LÀ GÌ?
Miêu tả lịch sử tiến hóa của một nhóm
loài với những đặc tính khác nhau
nhưng có cùng mối quan hệ họ hàng
với nhau và cùng hình thành từ một tổ
tiên trong quá khứ
PHYLOGENETIC TREE
Bioinformatics
Cây phát sinh loài
(Phylogeny)
Cây phát sinh loài „kể lại‟các thời
điểm „lâu đời nhất‟ trong mối quan
hệ loài từ 1 tổ tiên chung.
Biểu hiện tổ tiên chung cho tất cả các
loài/gene trong cây phát sinh
Các loài gần nhau, có khoảng cách từ gốc
đến ngọn sát nhau có thể là họ hàng „gần‟
của nhau trong 1 thời điểm ở quá khứ
Bioinformatics
Ý nghĩa cây phát sinh loài
Phản ánh
Mức độ quan hệ giữa các nhóm loài sinh
vật
Quá trình tiến hoá của các nhóm sinh vật
từ thấp đến cao, từ đơn giản đến phức
tạp.
Biết được số lượng của các nhóm động
vật
4/9/2013
4
Bioinformatics 10
Tác phẩm “Nguồn gốc các loài”
Tác giả: Charles Darwin
Xuất bản năm 1859
Giới thiệu giả thuyết các loài tiến hóa
là kết quả của quá trình chọn lọc tự
nhiên
Quyển sách gây tranh cãi vì mâu
thuẫn với niềm tin tôn giáo
Bioinformatics 11
Charles Darwin (1809 – 1882)
HMS Beagle
Bioinformatics 12
Hành trình trên chuyến tàu
Beagle
1831 - 1836
4/9/2013
5
Bioinformatics 13
Cây phát sinh loài đầu tiên
được vẽ
Bioinformatics 14
Ý tưởng về cây phát sinh loài
Bioinformatics 15
Ý tưởng …
Darwin cho rằng các loài có chung
một nguồn gốc khi ông quan sát các
loài “tương tự” trong suốt chuyến
hành trình