Ureaplasma urealyticum Real-time PCR

Chia sẻ: Thẩm Đường | Ngày: | Loại File: PDF | Số trang:4

Thêm vào BST

Báo xấu

4
lượt xem 1
download

Download Vui lòng tải xuống để xem tài liệu đầy đủ

Tài liệu hướng dẫn quy trình kỹ thuật "Ureaplasma urealyticum Real-time PCR" thông tin đến bạn đọc những nội dung về: mục đích và nguyên lý, chuẩn bị phương tiện - hóa chất, phiếu xét nghiệm, các bước tiến hành kỹ thuật, nhận định kết quả, những sai sót và xử trí,... Mời các bạn cùng tham khảo!

Chủ đề:

Bình luận(0) Đăng nhập để gửi bình luận!

Lưu

Nội dung Text: Ureaplasma urealyticum Real-time PCR

Ureaplasma urealyticum Real-time PCR I. MỤC ĐÍCH VÀ NGUYÊN LÝ 1. Mục đích Xác định sự có m t DNA c a Ureaplasma urealyticum trong bệnh phẩm c a người. 2. Nguyên lý Dựa trên nguyên lý kỹ thuật Real-time PCR. II. CHUẨN BỊ 1. Người thực hiện - Người thực hiện: Nhân viên xét nghiệm đã được đào tạo và có chứng chỉ ho c chứng nhận v chuyên ngành Vi sinh (và/ho c sinh học phân tử/ sinh học/công nghệ sinh học). - Người nhận định và phê duyệt kết quả: Người thực hiện có trình độ đại học ho c sau đại học v chuyên ngành Vi sinh (và/ho c sinh học phân tử/ sinh học/công nghệ sinh học). 2. Phương tiện, hóa chất (Ví dụ hoặc tương đương) 2.1. Trang thiết bị - T an toàn sinh học cấp 2 - Máy nhiệt - Máy ly tâm > 12000 gpm/phút - Máy ly tâm dùng cho tube 0,2 ml - Máy vortex - Máy Real-time PCR - Ống Eppendorf 1,5 ml ho c 2 ml - Các loại Micropipette đi u chỉnh được: 1000µl, 200µl, 100µl, 10µl - Đầu côn có màng lọc 10 μl, 100 μl, 200 μl và 1000 μl - T lạnh thường - T âm sâu (200C) ho c (-700C) (nếu có) - Bộ lưu điện 2.2. Dụng cụ, hóa chất và vật tư tiêu hao (bao gồm nội kiểm, ngoại kiểm) STT Chi phí hóa chất, vật tư tiêu hao Đơn vị 1 Dụng cụ lấy bệnh phẩm Cái 2 Găng không bột tal cái 99
STT Chi phí hóa chất, vật tư tiêu hao Đơn vị 3 Khay đựng bệnh phẩm Cái 4 Hộp vận chuyển bệnh phẩm Test 5 Sinh phẩm chẩn đoán Test Khấu hao sinh phẩm cho chạy chứng, kiểm tra chất Test 6 lượng 7 Kit tách chiết DNA Test 9 Ống Falcon 50 ml Cái 10 Eppendorf 1,7 ml Tube 11 Eppendorf 0,2 ml Tube 12 Đầu côn 10 µl có lọc Cái 13 Đầu côn 30 µl Cái 14 Đầu côn 200 µl có lọc Cái 15 Đầu côn 1ml có lọc Cái 16 Water-DEPC treated ml 17 Giấy thấm Cuộn 18 Giấy xét nghiệm Tờ 19 Sổ lưu kết quả xét nghiệm Tờ 20 Bút viết kính Cái 21 Bút bi Cái 22 M Cái 23 Khẩu trang Cái 24 Găng tay xử lý dụng cụ Đôi 25 Quần áo bảo hộ Bộ 26 Dung dịch xà phòng rửa tay ml 27 Cồn sát trùng tay nhanh ml 28 Dung dịch khử trùng ml 29 Khăn lau tay Cái 30 Ngoại kiểm (EQAS) (nếu thực hiện)* * Ghi chú: - Chi phí ngoại kiểm cho quy trình kỹ thuật được tính cụ thể theo Chương trình ngoại kiểm (EQAS) là 1/200 tổng chi phí dụng cụ, hóa chất, vật tư tiêu hao (với số lần ngoại kiểm trung bình 2 lần/1 năm). 100
3. Bệnh phẩm M ho c dịch niệu đạo, âm đạo, dịch ngoáy họng. 4. Phiếu xét nghiệm Đi n đầy đ thông tin theo mẫu phiếu yêu cầu III. CÁC BƯỚC TIẾN HÀNH Các bước tiến hành thực hiện theo phương tiện, hóa chất được ví dụ trên. 1. Lấy bệnh phẩm Theo đúng quy định c a chuyên ngành Vi sinh (Xem Phụ lục). 2. Tiến hành kỹ thuật: VD sinh phẩm hóa chất vật tư tiêu hao Ureaplasma urealyticum rPCR kít ho c tương đương 2.1. Tách chiết DNA 2.2. Cho một lượng mẫu DNA tách chiết được vào các ống phản ứng PCR có chứa các thành phần cần thiết c a kit 2.3. Chạy phản ứng PCR theo chu trình nhiệt thích hợp trên máy Real-time PCR 2.4. Đọc kết quả IV. NHẬN ĐỊNH KẾT QUẢ Bước 1: Kiểm tra nguy cơ ngoại nhiễm - Kết quả chứng (-) không có đường tín hiệu khuyếch đại với kênh màu FAM: mẫu không bị ngoại nhiễm. - Kết quả chứng (-) có đường tín hiệu khuyếch đại với kênh màu FAM: mẫu bị ngoại nhiễm, phải tiến hành tách chiết DNA lại. Bước 2: Kiểm tra độ nhạy - Chọn chứng (+) và chứng (-) và phân tích trên kênh màu FAM và HEX - Kết quả chứng (-) có đường tín hiệu khuyếch đại với kênh màu HEX: PCR không bị ức chế. - Kết quả chứng (-) không có đường tín hiệu khuyếch đại ho c tín hiệu thấp với kênh màu HEX, PCR bị ức chế toàn phần hay một phần, tách chiết DNA lại ho c pha loãng DNA trước khi chạy PCR. Bước 3: Xác định mẫu dương tính - Mẫu có tín hiệu huỳnh quang với kênh màu FAM và có Ct: là những mẫu dương tính - Các mẫu có Ct
HEX  mẫu bị ức chế cần tiến hành lại PCR với DNA đã pha loãng ho c tách chiết lại. Nếu kết quả vẫn như cũ thì phải lấy lại mẫu bệnh phẩm làm xét nghiệm. V. NHỮNG SAI SÓT VÀ XỬ TRÍ - Phản ứng dương tính giả: do tạp nhiễm từ môi trường - Phản ứng âm tính giả: do phản ứng PCR bị ức chế - Để hạn chế các hiện tượng trên phải tuân th ch t chẽ quy trình kỹ thuật. 102