Vi sinh vật thú y là môn học nghiên cứu các loại vi sinh vật có lợi và có hại trong ngành chăn nuôi thú y, đặc biệt là các vi sinh vật gây bệnh trên động vật. Môn học trang bị kiến thức về đặc điểm sinh học, cơ chế gây bệnh, miễn dịch học và ứng dụng trong chẩn đoán, phòng bệnh và sản xuất vắc-xin.