Giải trình tự bộ gene gấu tiền sử từ kỷ Pleistocene

Chia sẻ: Nguyen Phuonganh | Ngày: | Loại File: PDF | Số trang:5

Thêm vào BST

Báo xấu

130
lượt xem 5
download

Download Vui lòng tải xuống để xem tài liệu đầy đủ

DNA cổ đại Mặc dù DNA bộ và tạo thư gene chứa đựng viện nhiều thông tin hơn, các nghiên cứu DNA cổ đại chỉ dừng lại ở mức độ khuếch đại trình tự ty thể. Tuy vậy, trong công trình này, Noonan và cộng sự đã thiết lập thư viện metagenomic với DNA không khuếch đại được, tách từ xương của hai con gấu tiền sử đã tuyệt chủng cách đây 40.000 năm.

Chủ đề:

Bình luận(0) Đăng nhập để gửi bình luận!

Lưu

Nội dung Text: Giải trình tự bộ gene gấu tiền sử từ kỷ Pleistocene

Giải trình tự bộ gene gấu tiền sử từ kỷ Pleistocene Sơ đồ tách DNA cổ đại và tạo thư viện
DNA cổ đại Mặc dù DNA bộ và tạo thư gene chứa đựng viện nhiều thông tin hơn, các nghiên cứu DNA cổ đại chỉ dừng lại ở mức độ khuếch đại trình tự ty thể. Tuy vậy, trong công trình này, Noonan và cộng sự đã thiết lập thư viện metagenomic với DNA không khuếch đại được, tách từ xương của hai con gấu tiền sử đã tuyệt chủng cách đây 40.000 năm. Phân tích xấp xỉ 1Mb trình tự từ mỗi thư viện cho thấy mặc dù bị lẫn nhiều trình tự từ vi khuẩn, 5,8 và 1,1% các dòng chứa đoạn gắn (insert), thu được 26.861 bp trình tự
của bộ gene gấu tiền sử. Tiếp đó các tác giả so sánh trình tự của gấu tiền sử và gấu hiện đại. Kết quả cho thấy mối quan hệ tiến hóa của các loài này. Cách tiếp cận metagenomic sử dụng trong nghiên cứu này củng cố thêm tính khả thi của các chương trình giải trình tự DNA bộ gene của sinh vật cổ đại. Genomic sequencing of Pleistocene cave bears. Noonan JP, Hofreiter M, Smith D, Priest JR, Rohland N, Rabeder G,
Krause J, Detter JC, Paabo S, Rubin EM Science. 2005 Jul 22;309(5734):597-9 Sau đây là đánh giá về nghiên cứu này tại F1000 ngày 16-9-2005 F1000 Factor 6.0 Barbara Trask University of Washington, United States of America CELL BIOLOGY Bài báo này một lần nữa cho thấy vai trò to lớn của “metagenomics”, trong đó toàn bộ trình tự bộ gene
trong môi trường (từ mỏ khai thác axit cho đến biển Sargasso) được tách dòng mà không cần định danh trước vào một thư viện. Sau đó chọn dòng ngẫu nhiên từ thư viện này để giải trình tự. Trong nghiên cứu này, các tác giả sử dụng kỹ thuật kể trên để thu nhận trình tự DNA tách từ răng gấu tiền sử. Mặc dù vẫn bị lấn DNA vi khuẩn và người hiện đại, họ vẫn phân tích được các trình tự của các loài đã tuyệt chủng từ 40.000 năm trước. Công trình này mở ra khả năng thu nhận thông tin trình tự DNA từ các loài đã tuyệt chủng khác.