
637
XÉT NGHIỆM XÁC ĐỊNH ĐỘT BIẾN GEN EGFR VÀ K-RAS
BẰNG GIẢI TRÌNH TỰ CHUỖI DNA TRÊN KHỐI PARAFFIN
I. ĐẠI CƢƠNG
Xác định đột biến gen bằng giải trình tự chuỗi là phương pháp sử dụng các kỹ
thuật sinh học phân tử nhằm xác định các đột biến gen.
II. CHỈ ĐỊNH
Theo chỉ định của Bác sĩ lâm sàng
III. H A CHẤT VÀ TRANG THIẾT BỊ
- Máy PCR
- Máy giải trình tự gen
- Các hóa chất đi kèm
IV. CÁC BƢỚC TIẾN HÀNH
- Bệnh phẩm được cắt làm tiêu bản dùng cho chẩn đoán giải phẫu bệnh.
- Vùng mô ung thư được đánh dấu trên lam kính
- Cạo mô ung thư bào tube ly tâm 1,5 ml
- Cho xylen vào tube ly tâm 2 lần để khử paraffin
- Rửa lại bằng ethanol và để khô trước khi ủ với proteinase K ở 480C/16 giờ
- Tinh sạch sản phẩm DNA
- Kết tủa DNA bằng ethanol tuyệt đối
- Tách DNA bằng kit KAPA
- Khuyếch đại exon bằng PCR Master Mix của KAPA
- Chạy điện di trên gel Argarone 1
- Tinh sạch sản phẩm PCR bằng nitrogen kit
- PCR sản phẩm đã tinh sạch với BigDye kit
- Tinh sạch sản phẩm BigDye bằng Zymmo kit
- Giải trình tự gen bằng máy ABI 3130
- Phân tích kết quả giải trình tự bằng phần mềm có sẵn