15
Vibrio cholerae real-time PCR
I. MỤC ĐÍCH VÀ NGUYÊN LÝ
1. Mục đích
Xác định sự m t gen đ c trưng c a Vibrio cholerae trong mẫu bệnh phẩm
phân c a người.
2. Nguyên lý
Dựa trên nguyên lý c a kỹ thuật Real-time PCR.
II. CHUẨN BỊ
1. Người thực hiện
- Người thực hiện: Nhân viên xét nghiệm đã được đào tạo và có chứng chỉ
ho c chứng nhận v chuyên ngành Vi sinh (và/ho c sinh học phân tử/ sinh
học/công nghệ sinh học).
- Người nhận định phê duyệt kết quả: Người thực hiện trình độ đại
học ho c sau đại học v chuyên ngành Vi sinh (và/ho c sinh học phân tử/ sinh
học/công nghệ sinh học).
2. Phương tiện, hóa chất (Ví dụ hoặc tương đương)
2.1 Trang thiết bị
- T an toàn Sinh học cấp 2
- Máy Real-time PCR
- Máy in màu
- Máy ly tâm > 12000 gpm/phút
- Máy nhiệt
- y vortex
- Pipette
2.2 Dụng cụ, hóa chất và vật tư tiêu hao (bao gồm nội kiểm, ngoại kiểm)
STT
Chi phí hóa chất, vật tư tiêu hao
Đơn vị
1
Lọ lấy bệnh phẩm
Lọ
2
Panh
Cái
3
Khay đựng bệnh phẩm
Cái
4
Hộp vận chuyển bệnh phẩm
Test
5
Tube đựng bệnh phẩm
Cái
6
Găng không có bột (DNase-RNase free)
Cái
7
Sinh phẩm và vật tư tiêu hao cho chẩn đoán
Test
8
Khấu hao sinh phẩm cho chẩn đoán kiểm tra chất
lượng
Test
9
Kit tách chiết DNA
Test
10
Ống Eppendorf 1,5 ml
Tube
11
Ống Eppendorf 0,2 ml
Tube
16
12
Đầu côn 10 ul có lọc
Cái
13
Đầu côn 30 ul
Cái
14
Đầu côn 200 ul có lọc
Cái
15
Đầu côn 1 ml có lọc
Cái
16
Ethanol BDH
ml
17
Water-DEPC Treated
ml
18
Giấy thấm
Cuộn
19
Giấy xét nghiệm
Tờ
20
Sổ lưu kết quả xét nghiệm
Tờ
21
Bút viết kính
Cái
22
Bút bi
Cái
23
Cái
24
Khẩu trang
Cái
25
Găng tay
Đôi
26
Găng tay xử lý dụng cụ
Đôi
27
Quần áo
Bộ
28
Dung dịch xà phòng rửa tay
ml
29
Cồn sát trùng tay nhanh
ml
30
Dung dịch khử trùng
ml
31
Khăn lau tay
cái
32
Ngoại kiểm (nếu có)*
* Ghi chú: Chi phí ngoại kiểm cho quy trình kỹ thuật được tính cụ thể theo
Chương trình ngoại kiểm (EQAS) là 1/50 tổng chi phí dụng cụ, hóa chất, vật
tiêu hao (với số lần ngoại kiểm trung bình 3 lần/1 năm).
3 Bệnh phẩm
Bệnh phẩm phân
4 Phiếu xét nghiệm
Đi n đầy đ thông tin theo mẫu phiếu yêu cầu
III. CÁC BƯỚC TIẾN HÀNH
1. Lấy bệnh phẩm
Theo đúng quy định c a chuyên ngành Vi sinh.
2. Tiến hành kỹ thuật
2.1 Tách chiết DNA tổng số
2.2 Thực hiện Real-time PCR
2.3 Phân tích và đánh giá kết quả
2.4 In và trả kết quả
17
3. Thời gian thực hiện: 4 tiếng
IV. NHẬN ĐỊNH KẾT QUẢ
Chứng dương phải xuất hiện đồ thị huỳnh quang trên đường giới hạn
bản, chứng âm không bất kỳ đường đồ thị huỳnh quang nào xuất hiện.
Đường đồ thị huỳnh quang c a mẫu thể xuất hiện ho c không xuất hiện trên
đường giới hạn cơ bản, căn cứ vào đó để kết luận kết quả.
V. NHỮNG SAI SÓT VÀ XỬ TRÍ
- Trong trường hợp positive control (PC) negative (NC) xuất hiện
không đúng với diễn giải phần IV thì phải kiểm tra lại Master mix , chứng
dương và quá trình tách DNA tổng số, và thực hiện lại toàn bộ xét nghiệm.
- Nếu đường đồ thị huỳnh quang c a mẫu xuất hiện ngoài chu kthứ
40 thì phải cẩn thận kiểm tra và đánh giá lại mẫu.