Báo cáo sử dụng phần mềm ChemDaw2(ChemOffice)

Chia sẻ: Nhu Thuy Thuy | Ngày: | Loại File: DOC | Số trang:32

Thêm vào BST

Báo xấu

352
lượt xem 88
download

Download Vui lòng tải xuống để xem tài liệu đầy đủ

Hiện nay, công nghệ thông tin ngày càng phát triển, nó có mặt trong hầu hết các ngành nghề. Dạy học cũng không phải là ngoại lệ. Việc ứng dụng công nghệ thông tin vào giảng dạy giúp giáo viên linh hoạt hơn trong việc soạn giáo án và thiết kế bài giảng sinh động hơn, từ đó sẽ gây được hứng thú cho học sinh. Hơn nữa, sẽ tiết kiệm nhiều thời gian. Đặc biệt trong môn Hóa học việc vẽ công thức cấu tạo của các chất và viết phương trình phản ứng là công việc thường xuyên...

Chủ đề:

Bình luận(0) Đăng nhập để gửi bình luận!

Lưu

Nội dung Text: Báo cáo sử dụng phần mềm ChemDaw2(ChemOffice)

Sử dụng phần mềm ChemDraw (ChemOffice) GVHD: PGS.TS Bùi Thọ Thanh Báo cáo sử dụng phần mềm ChemDaw2 (ChemOffice) 1 H VTH: Giảng Thị Như Thùy
Sử dụng phần mềm ChemDraw (ChemOffice) GVHD: PGS.TS Bùi Thọ Thanh MỤC LỤC PH ẦN MỞ ĐẦU............................................................................................................. 3 I. Lí do chọn đề tài ................................ ......................................................................... 4 II. Mục đích nghiên cứu................................................................................................. 4 III. Nhiệm vụ nghiên cứu ............................................................................................... 4 IV. Đối tượng và khách thể nghiên cứu ........................................................................ 4 V. Phạm vi nghiên cứ u ................................ ................................................................... 4 PH ẦN NỘI DUNG ................................ ......................................................................... 5 CÁC ỨNG DỤNG CƠ BẢN .......................................................................................... 5 Chương II. HƯỚNG DẪN SỬ DỤNG PH ẦN MỀM.................................................... 6 II.1. Cài đặt phần mềm ChemOffice vào máy tính ................................ ....................... 6 Bước 3. Chọn I accept the terms in the license agreement ................................................ 7 Bước 6. Chọn next để tiếp tụ c. Sau đó chọn Install ......................................................... 8 Bước 7. Nhấn finish để kết thúc quá trình cài đặt ................................ ............................. 9 II.2. PHẦN MỀM CHEMDRAW ULTRA 8.0 .......................................................... 10 II.2.1. Khởi động chương trình................................ .................................................... 10 II.2.2. Giới thiệu và cách sử dụng thanh menu ................................ ........................... 11 II.2.2.1 File menu ................................................................................................ ......... 11 II.2.2.2 Edit menu................................................................................................ ......... 13 II.2.3. Giới thiệu và cách sử dụng các thanh công cụ ................................................. 16 Liên kết có hướng và liên kết cho nhận: ..................................................................... 21 Vẽ công thức các hợp chất ................................ ................................ ........................... 21 CHƯƠNG III: ỨNG DỤNG ........................................................................................ 22 Giới thiệu một vài ứng dụng co bản của ChemDraw ................................................. 22 III.1 Vẽ mô hình lai hóa ............................................................................................... 22 III.2 Vẽ cấ u trúc phân tử ............................................................................................. 24 2 H VTH: Giảng Thị Như Thùy
Sử dụng phần mềm ChemDraw (ChemOffice) GVHD: PGS.TS Bùi Thọ Thanh Ví dụ 1: Vẽ cấu trúc phân tử 2,4,6- tribromphenol ................................................... 24 Bước 1 : Vẽ vòng benzen ................................................................................................ 24 Bước 2 : Vẽ liên kết đ ơn ................................................................ ................................ .. 24 Bước 3 : Vẽ nguyên tử hoặc nhóm nguyên tử ................................ ................................ .. 24 Ví dụ 3: Vẽ cấu trúc phân tử theo cách biểu diễn Newman ...................................... 27 Click công cụ chọn orbital trống, click vào nguyên tử cần vẽ ................................ .. 28 Chọn cấu trúc phía sau và xoay 1800 ................................ .............................................. 28 III.3 Chuyển 2D sang 3D ................................................................ ............................ 28 Click OK ta được công thức cấu tạo củ a benzyl amin .................................................... 29 Bước 2 : Chuyển cấu trúc hóa họ c từ 2D sang 3D .......................................................... 29 III.4 Thiết kế mô hình thí nghiệm ................................................................ ............... 29 Bước 2 : Vẽ lò đốt nóng, bình cầu, ống sinh hàn ............................................................. 30 III.5 Vẽ cơ chế phản ứng.............................................................................................. 31 Bước 1:Vẽ các cấu trúc hóa học cơ bản ................................................................ ......... 31 Bước 2: Vẽ thêm các công th ức hóa họ c................................................................ ......... 31 Bước 3: Vẽ thêm công thức hóa học ................................................................ ............... 32 Bước 4: Vẽ mũi tên thẳng, cong: dùng công cụ vẽ mũi tên ..................................... 32 III.6 Dự đoán phổ cộng hưởng từ hạt nhân của phân tử (1H – NMR và 13C - NMR). ................................ ................................ ....................................................................... 32 Bước 1: Vẽ công thức củ a phân tử phenyl acetate .......................................................... 32 Vào menu Structure, chọn Predict 1H – NMR Shifts ho ặc Predict 13C – NMR Shifts33 PH ẦN K ẾT LUẬN................................ ....................................................................... 34 TÀI LIỆU THAM KHẢO ................................ ................................ ........................... 35 PHẦN MỞ ĐẦU 3 H VTH: Giảng Thị Như Thùy
Sử dụng phần mềm ChemDraw (ChemOffice) GVHD: PGS.TS Bùi Thọ Thanh I. Lí do chọn đề tài Hiện nay, công nghệ thông tin ngày càng phát triển, nó có m ặt trong hầu hết các n gành nghề. Dạy học cũng không ph ải là ngoại lệ. Việc ứng dụng công nghệ thông tin vào giảng d ạy giúp giáo viên linh ho ạt hơn trong việc soạn giáo án và thiết kế bài giảng sinh động hơn, từ đó sẽ gây được hứ ng thú cho họ c sinh. Hơn nữ a, sẽ tiết kiệm nhiều thời gian. Đặc biệt trong môn Hóa học việc vẽ công th ức cấu tạo của các chất và viết phương trình phản ứng là công việc thư ờng xuyên và không th ể thiếu . Để làm được việc này cần sử dụng các phần mềm chuyên biệt, đồng th ời cũng phải biết cách sử dụng nó. Trong khi đó hiện nay có rất ít tài liệu hướng dẫn cách sử dụng các ph ần m ềm Hóa học. Hiện nay có rất nhiều ph ần mềm hóa họ c hỗ trợ cho việc đ ó, đồng thời có th ể tính toán được góc liên kết, độ dài liên kết, năng lượng liên kết… Chemoffice là mộ t trong nh ững phần m ềm có ứng dụng đó, nó rất cần thiết trong việc trình bày công thức phân tử trong không gian 2 chiều và 3 chiều, viết chuỗ i phản ứng, phương trình hóa học, và những công thức phân tử ph ức tạp... II. Mục đích nghiên cứu Biểu diễn công thứ c hóa học các ch ất, viết phương trình ph ản ứng…đ ể phục vụ cho việc thiết kế giáo án. III. Nhiệm vụ nghiên cứu Tìm hiểu và khai thác những tính năng củ a chương trình ChemDraw đ ể vẽ cấu trúc các chất… IV. Đối tượng và khách thể nghiên cứu - Đối tượng: phần m ềm chemDraw - Khách th ể: quá trình dạy và học hóa học V. Phạm vi nghiên cứ u - Vẽ cấu trúc các hợp ch ất hữu cơ phức tạp, cơ ch ế phản ứng hóa học… - Vẽ mô hình lai hóa - Thiết kế mô hình thí nghiệm. -… 4 H VTH: Giảng Thị Như Thùy
Sử dụng phần mềm ChemDraw (ChemOffice) GVHD: PGS.TS Bùi Thọ Thanh PH ẦN NỘI DUNG Chương I. TỔNG QUAN VỀ CHEMOFFICE ChemOffice và BioOffice có th ể chạy trên điều hành Microsoft Windows. ChemOffice chỉ dành cho hệ đ iều hành Windows. ChemOffice Ultra là bộ phần m ềm đ ầy đủ nhất củ a trường Đại học Cambridge. Với ChemDraw Ultra 8.0 các bạn có thể viết công thức, phương trình hóa học, chuỗi phản ứng mà không m ất nhiều công sức như làm trong word hay các phần m ềm hóa họ c như ChemSketch hay Chemwin. Hơn nữa, ChemDraw Ultra 8.0 có th ể đọ c tên hâu h ết các hợp chất hữu cơ (cả những hợp chất dị vòng phứ c tạp), đ ặc biệt có thể đo phổ cộng hưởng từ hạt nhân củ a tất cả các chất.  CÁC Ứ NG DỤNG CƠ BẢN ChemDraw BioDraw Ultra biểu diễn công thức hóa học. Phần m ềm này giúp tạo các văn bản, các hình vẽ, các dụng cụ thí nghiệm hóa học, các công thức hóa học của các h ợp chất tự nhiên quan trọng cùng với các cấu tạo cơ b ản về nguyên tử các nguyên tố hóa học. ChemDraw hỗ trợ biểu diễn các công thức hóa học, đồng phân cấu tạo, đồng phân h ình học, đồng phân quang học với các kiểu công thức khác nhau như công thứ c Fisher, phối cảnh, Newman. 5 H VTH: Giảng Thị Như Thùy
Sử dụng phần mềm ChemDraw (ChemOffice) GVHD: PGS.TS Bùi Thọ Thanh Chương II. HƯỚNG DẪN SỬ DỤNG PHẦN MỀM ( CHEMOFFICE ) II.1. Cài đặt phần mềm ChemOffice vào máy tính Bước 1 . Nhắp đúp vào biểu tượng để b ắt đầu cài đặt. Khi đó xuất hiện cửa sổ: Bước 2. Chọn next để tiếp tụ c: 6 H VTH: Giảng Thị Như Thùy
Sử dụng phần mềm ChemDraw (ChemOffice) GVHD: PGS.TS Bùi Thọ Thanh Bước 3 . Chọn I accept the terms in the license agreement Bước 4. Điền vào b ản đăng kí theo mẫu: 7 H VTH: Giảng Thị Như Thùy
Sử dụng phần mềm ChemDraw (ChemOffice) GVHD: PGS.TS Bùi Thọ Thanh Bước 5. Chọn next để tiếp tụ c: Bước 6. Chọn next để tiếp tụ c. Sau đó chọn Install 8 H VTH: Giảng Thị Như Thùy
Sử dụng phần mềm ChemDraw (ChemOffice) GVHD: PGS.TS Bùi Thọ Thanh  Chương trình cài đ ặt vào máy: Bước 7. Nhấn finish để kết thúc quá trình cài đặt 9 H VTH: Giảng Thị Như Thùy
Sử dụng phần mềm ChemDraw (ChemOffice) GVHD: PGS.TS Bùi Thọ Thanh II.2. PHẦN MỀM CHEMDRAW ULTRA 8.0 II.2.1. Khởi động chương trình Chọn: Star/Program/ChemOffice 2004/Chem Draw Ultra 8.0 hoặc nhấp đúp vào biểu tượng trên màn hình Màn hình làm việc của chương trình sẽ xuất hiện: 10 H VTH: Giảng Thị Như Thùy
Sử dụng phần mềm ChemDraw (ChemOffice) GVHD: PGS.TS Bùi Thọ Thanh II.2.2. Giới thiệu và cách sử dụng thanh menu II.2.2.1 File menu Ngoài các lệnh thông thường, còn có: Open Special : Chứa các cấu trúc hóa học củ a amino acids, aromatics (hidrocacbon phương hướng), cycloalkanes, …và các dụng cụ thí nghiệm hóa họ c.  List nicknames: Liệt kê tên thông thường củ a mộ t số chất, liệt kê tên riêng của cấu trúc và cho phép đưa cấu trúc vào văn bản hiện hành. Ví d ụ: - Chọn lệnh File/List Nicknames, hộp tho ại List Nicknames xu ất hiện. 11 H VTH: Giảng Thị Như Thùy
Sử dụng phần mềm ChemDraw (ChemOffice) GVHD: PGS.TS Bùi Thọ Thanh - Ch ọn tên cấu trúc trong hộp thoại List Nicknames rồi Click Paste, tên cấu trúc xuất h iện. - Click chuộ t phải vào tên cấu trúc, chọn lệnh Expand Label (hoặc chọn lệnh Expand Label từ menu Structure), cấu trúc xu ất hiện. O  O C  Ngoài ra còn có một số tùy ch ọn phụ c vụ việc in văn b ản trên ChemDraw nằm trong lệnh Preferences…. 12 H VTH: Giảng Thị Như Thùy
Sử dụng phần mềm ChemDraw (ChemOffice) GVHD: PGS.TS Bùi Thọ Thanh II.2.2.2 Edit menu Ngoài các lệnh thông thường, còn có:  Get 3D Model : Chuyển cấu trúc hóa họ c dạng 2 D sang cấu trúc hóa học dạng 3D (m ặc nhiên là dạng que).  Insert Graphic… : Chèn hình từ các file của ChemDraw ho ặc các file hình.  Insert Object… : Chèn đối tượng từ các chương trình khác như Word, Excel, Equation,… 13 H VTH: Giảng Thị Như Thùy
Sử dụng phần mềm ChemDraw (ChemOffice) GVHD: PGS.TS Bùi Thọ Thanh II.2.2.3 View menu Ch ứa các lệnh hiện hoặc ẩn các cửa sổ thông tin về cấu trúc và các thanh công cụ. Ví d ụ: chọn lệnh view/show Periodic Table Window, b ảng hệ thống tuần hoàn xuất h iện: - Click chọn nguyên tố bất kì, sẽ xuất hiện tên nguyên tố và số thứ tự : 14 H VTH: Giảng Thị Như Thùy
Sử dụng phần mềm ChemDraw (ChemOffice) GVHD: PGS.TS Bùi Thọ Thanh II.2.2.4 Object menu Ngoài các lệnh đã biết như Align, Group, Ungroup, …, đặc biệt có thêm lệnh Add Frame: Bao bên ngoài cấu trúc các cặp n goặc ho ặc hình chữ nhật, rất hữu ích trong việc vẽ các phức ch ất. II.2.2.5 Structure menu  Check Structure: kiểm tra cấu trúc được chọn. Nếu cấu trúc đúng, sẽ hiển thị hộp thoại thông báo không tìm thấy lỗ i; nếu cấu trúc sai, sẽ h iển thị hộp thoại thông báo chỗ sai.  Contract Label: Thay th ế (“nén”) ph ần cấu trúc được chọn bằng tên do người dùng tự đặt. Lưu ý đây không phải là lệnh ngược với lệnh Expand Label, vì lệnh này không cho phép nén phần cấu trúc chứa các n guyên tố gốc h ữu cơ. Define Nickname: Cho phép người dùng định ngh ĩa tên riêng cho phần cấu trúc được chọn để có th ể sử dụng lại.  Convert Name to Structure: Vẽ cấu trúc hóa họ c từ tên hóa học.  Convert Structure to Name: gọi tên hóa họ c của cấu trúc hóa học được chọn. 15 H VTH: Giảng Thị Như Thùy
Sử dụng phần mềm ChemDraw (ChemOffice) GVHD: PGS.TS Bùi Thọ Thanh II.2.2.6 Text menu Gồm các lệnh liên quan đến đ ịnh dạng văn bản. II.2.2.7 Curves menu Thay đổ i kiểu đường vẽ cho các loại hình không thuộ c cấu trúc hóa học, như các dụng cụ phòng thí nghiệm,… II.2.3. Giới thiệu và cách sử dụng các thanh công cụ Liên kết (vách liên tụ c) Liên kết đôi Liên kết (vách đứt đo ạn) Liên kết không xác định Liên kết có hướng ra phía sau Liên kết đám Liên kết có hướng ra phía trước Liên kết có hướng trống Liên kết không xác định (có dạng sóng) 16 H VTH: Giảng Thị Như Thùy
Sử dụng phần mềm ChemDraw (ChemOffice) GVHD: PGS.TS Bùi Thọ Thanh Drawing Element: Công cụ vẽ, dùng để vẽ những h ình sau: 17 H VTH: Giảng Thị Như Thùy
Sử dụng phần mềm ChemDraw (ChemOffice) GVHD: PGS.TS Bùi Thọ Thanh Templates: Các mẫu (công thức). Mẫu Aromatics: Mẫu Bicyclics: 18 H VTH: Giảng Thị Như Thùy
Sử dụng phần mềm ChemDraw (ChemOffice) GVHD: PGS.TS Bùi Thọ Thanh Mẫu Clipsware phần 1: Mẫu Clipsware phần 2:  Cách vẽ liên kết trong phân tử - Có thể sử dụng bảng MultiBond để tạo ra những liên kết đa dưới đây: 19 H VTH: Giảng Thị Như Thùy
Sử dụng phần mềm ChemDraw (ChemOffice) GVHD: PGS.TS Bùi Thọ Thanh Liên hết đôi: Có 3 cách vẽ một liên kết đôi: - Dùng công cụ Double Bond - Click chuột thêm một lần lên liên kết đơn - Click chuột phải một lần lên liên kết đ ơn rồi chọn Double rồi Plain trong b ảng dưới 20 H VTH: Giảng Thị Như Thùy