iii
MþC LþC
DANH MþC CÁC B¾NG ........................................................................................ vi
DANH MþC CÁC HÌNH V¾, 4Þ THÞ .................................................................. vii
MÞ 4¾U .................................................................................................................... 1
NÞI DUNG ................................................................................................................ 4
CH¯¡NG 1. TÞNG QUAN NGHIÊN CþU ............................................................ 4
1.1. KKS là mßt v¿n Nß toàn c¿u ............................................................................ 4
1.2. Mßt sß nghiên cÿu vß tình tr¿ng KKS cÿa vi khu¿n trong môi tr±ßng thuÿ
sinh trên th¿ gißi ..................................................................................................... 7
1.3. Mßt sß nghiên cÿu vß KKS trong nuôi trßng thÿy h¿i s¿n ............................ 11
1.4. Thÿc tr¿ng KKS ß Vißt Nam và nghiên cÿu vß KKS t¿i sông Mekong ........ 13
CH¯¡NG 2. 4ÞI T¯þNG VÀ PH¯¡NG PHÁP NGHIÊN CþU ....................... 17
2.1. Thu và b¿o qu¿n m¿u ..................................................................................... 17
2.2. Xÿ lý m¿u ...................................................................................................... 19
2.2.1 Xÿ lý m¿u cho tách chi¿t DNA ................................................................ 19
2.2.2. Xÿ lý các m¿u cho nuôi c¿y vi khu¿n ..................................................... 19
2.3. Phân l¿p vi khu¿n và Nßnh danh b¿ng ph±¡ng pháp MALDI-TOF MS ........ 20
2.4. Xác Nßnh kh¿ n‰ng KKS cÿa các chÿng vi khu¿n phân l¿p b¿ng ph±¡ng pháp
khu¿ch tán trên N)a th¿ch ...................................................................................... 20
2.5. 4ßnh l±ÿng gen KKS b¿ng ph¿n ÿng tßng hÿp chußi polymerase thßi gian
thÿc nh¿m Ních (qPCR nh¿m Ních) ....................................................................... 21
2.6. Xÿ lý sß lißu ................................................................................................... 23
CH¯¡NG 3. K¾T QU¾ VÀ TH¾O LU¾N ........................................................... 24
3.1. Phân l¿p và Nßnh danh vi khu¿n ..................................................................... 24
3.2. K¿t qu¿ Nánh giá kh¿ n‰ng KKS cÿa các vi khu¿n phân l¿p N±ÿc ................ 25
3.3. K¿t qu¿ Nßnh l±ÿng gen KKS b¿ng ph±¡ng pháp qPCR nh¿m Ních .............. 35
3.3.1. K¿t qu¿ tách DNA ................................................................................... 35
3.3.2. K¿t qu¿ t¿o N±ßng chu¿n cho qPCR nh¿m Ních ...................................... 36
3.3.3. K¿t qu¿ Nßnh l±ÿng gen KKS .................................................................. 36
K¾T LU¾N VÀ KI¾N NGHÞ .................................................................................. 48
K¾T LU¾N .............................................................................................................. 48
