Kỹ thuật PCR: Luận văn Thạc sĩ chẩn đoán bệnh tôm chết sớm và biện pháp phòng trị

ĐẠI HỌC HUẾ

TRƯỜNG ĐẠI HỌC NÔNG LÂM

DÆÅNG VIÃÚT PHÆÅNG TUÁÚN

SÆÍ DUÛNG KYÎ THUÁÛT PCR TRONG

CHÁØN ÂOAÏN

BÃÛNH TÄM CHÃÚT SÅÏM VAÌ ÂÃÖ XUÁÚT

BIÃÛN PHAÏP PHOÌNG TRË

LUÁÛN VÀN THAÛC SÉ KHOA HOÜC NÄNG NGHIÃÛP

Chuyãn ngaình: NUÄI TRÄÖNG THUÍY SAÍN

. Maî säú:

60.62.03.01

62.03.01

NGÆÅÌI HÆÅÏNG DÁÙN KHOA HOÜC

PGS.TS. NGUYÃÙN QUANG LINH

HUẾ - 2015

PDF Watermark Remover DEMO : Purchase from www.PDFWatermarkRemover.com to remove the watermark

LỜI CAM ĐOAN

Tôi xin cam đoan đây là công trình nghiên cứu của riêng tôi. Các số liệu, kết quả

nêu trong luận văn là trung thực và chưa có ai công bố trong bất kỳ công trình nghiên

cứu nào. Tôi tin tưởng rằng các thông tin trích dẫn trong luận văn đều đã được chỉ rõ

nguồn gốc.

Thừa Thiên Huế, tháng 9 năm 2015

Tác giả

Dương Viết Phương Tuấn

PDF Watermark Remover DEMO : Purchase from www.PDFWatermarkRemover.com to remove the watermark

LỜI CẢM ƠN

Để hoàn thành khóa học cao học K19 (niên khóa 2013-2015), cũng như bản

luận văn tốt nghiệp, tôi xin chân thành cảm ơn sự tạo điều kiên của Trường đại học

Nông Lâm, Đại Học Huế và phòng Đào tạo sau đại học Trường đại học Nông Lâm.

Đặc biệt xin chân thành cảm ơn thầy giáo, PGS.TS Nguyễn Quang Linh -

Người hướng dẫn khoa học đã tận tình hướng dẫn cho tôi trong suốt quá trình thực

hiện đề tài và các hoạt động nghiên cứu. Các thầy cô giáo đã giảng dạy tôi trong

suốt quá trình học tập tại khoa Thủy sản, Trường đại học Nông Lâm. Qua đây, tôi

xin gửi lời cảm ơn chân thành đến Chi cục Thú Y, tỉnh Quảng Bình và Sở Nông

nghiệp và Phát triển nông thôn tỉnh, Cơ quan thú y vùng 4 và Trung tâm chẩn đoán

Nam Khoa, Hồ Chí Minh đã tạo điều kiện giúp đỡ và hỗ trợ nhiệt tình cho tôi hoàn

thành luận văn thạc sỹ khoa học. Xin cảm ơn gia đình, bạn bè, người thân đã ủng

hộ và động viên tôi trong suốt quá trình học tập.

Tuy nhiên, kiến thức là vô hạn nên chắc chắn đề tài sẽ không tránh khỏi

những thiếu sót, rất mong nhận được sự thông cảm, chia sẽ và góp ý để luận văn

có thể hoàn thiện hơn!

Trân trọng cảm ơn!

Huế, ngày 12 tháng 9 năm 2015

Học viên thực hiện

DƯƠNG VIẾT PHƯƠNG TUẤN

PDF Watermark Remover DEMO : Purchase from www.PDFWatermarkRemover.com to remove the watermark

iii

MỤC LỤC

PHẦN MỞ ĐẦU ............................................................................................................. 1

1. Tính cấp thiết của đề tài ............................................................................................... 1

2. Mục tiêu nghiên cứu .................................................................................................... 1

3. Ý nghĩa khoa học và thực tiễn ..................................................................................... 2

Chương 1. TỔNG QUAN CÁC VẤN ĐỀ NGHIÊN CỨU ............................................ 3

1.1. TỔNG QUAN VỀ NUÔI TÔM CHÂN TRẮNG .................................................... 3

1.1.1. Tình hinh nghề nuôi tôm thẻ chân trắng trên thế giới ........................................... 3

1.1.2. Tại Việt Nam ......................................................................................................... 3

1.1.3. Tình hình nuôi tôm thẻ chân trắng ở Quảng Bình ................................................. 6

1.2. TỔNG QUAN VỀ DỊCH BỆNH EMS TRÊN TÔM ............................................... 7

1.2.1. Tình hình dịch bệnh EMS trên thế giới ................................................................. 7

1.2.3. Tình hình dịch tể bệnh EMS ở Quảng Bình .......................................................... 9

1.3. ĐẶC ĐIỂM VÀ TÍNH CHẤT GÂY BỆNH CỦA VI KHUẨN ........................... 10

1.3.1. Nghiên cứu về đặc điểm gây bệnh của vi khuẩn V. parahaemolyticus ............... 10

1.3.2. Dấu hiệu nhận biết triệu chứng tôm chết sớm .................................................. 16

1.4. TỔNG QUAN VỀ KỸ THUẬT PCR ĐỂ CHẨN ĐOÁN BỆNH TÔM CHẾT SỚM . 18

1.4.1. Khái niệm và nguyên lý hoạt động ...................................................................... 18

1.4.2. Các bước biến tính trong chu kỳ ......................................................................... 19

1.4.3. Trình tự DNA cần nhân bản ................................................................................ 20

1.4.4. Đoạn mồi (Primer) ............................................................................................... 20

1.4.5. dNTP (deoxy nucleoside triphosphate) ............................................................... 21

1.4.6. Enzyme DNA polymerase chịu nhiệt .................................................................. 21

1.4.7. Dung dịch đệm cho phản ứng PCR ..................................................................... 21

1.4.8. Ứng dụng PCR trong thủy sản............................................................................. 21

1.4.9. Các phương pháp giải trình tự gene ..................................................................... 22

CHƯƠNG 2. NỘI DUNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU ............................... 27

2.1. ĐỐI TƯỢNG, THỜI GIAN VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU ..................... 27

2.1.1. Đối tượng và khách thể ....................................................................................... 27

2.1.2. Thời gian nghiên cứu: .......................................................................................... 27

2.1.3. Địa điểm nghiên cứu............................................................................................ 27

PDF Watermark Remover DEMO : Purchase from www.PDFWatermarkRemover.com to remove the watermark

2.2. NỘI DUNG NGHIÊN CỨU .................................................................................. 27

2.2.1. Các nội dung nghiên cứu ..................................................................................... 27

2.2.2. Các chỉ tiêu nghiên cứu ....................................................................................... 27

2.3. PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU .......................................................................... 28

2.3.1. Sơ đồ nghiên cứu ................................................................................................. 28

2.3.2. Bố trí thí nghiệm .................................................................................................. 28

2.4. VẬT LIỆU, PHƯƠNG TIỆN VÀ PHƯƠNG PHÁP ............................................. 29

2.4.1. Dụng cụ và máy móc ........................................................................................... 29

2.4.2. Vật liệu làm thí nghiệm ....................................................................................... 29

2.4.3. Phương pháp thu mẫu .......................................................................................... 29

2.4.4. Phương pháp nuôi cấy và định danh vi khuẩn .................................................... 29

2.4.5. Quy trình PCR ..................................................................................................... 31

CHƯƠNG 3. KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU VÀ THẢO LUẬN ...................................... 34

3.1. TÌNH HÌNH DỊCH BỆNH VÀ TÍNH NGUY HẠI CỦA BỆNH EMS TRÊN

TÔM THẺ CHÂN TRẮNG Ở QUẢNG BÌNH ............................................................ 34

3.2. ĐẶC ĐIỂM VI KHUẨN V. PARAHAEMOLYTICUS ........................................... 36

3.2.1. Dấu hiệu bệnh lý của tôm thu từ ao nuôi............................................................. 36

3.2.2. Kết quả nuôi cấy và phân lập V.parahaemolyticus ............................................. 37

3.2.3. Đặc điểm hình thái ............................................................................................... 38

3.2.4. Đặc điểm sinh hóa của vi khuẩn V. parahaemolyticus........................................ 38

3.2.5. Kết quả giám định bằng PCR .............................................................................. 40

3.3. Kết quả giải trình gen 16S ...................................................................................... 40

3.3. BIỆN PHÁP PHÒNG TRỊ BỆNH EMS TRÊN TÔM THẺ CHÂN TRẮNG Ở

QUẢNG BÌNH .............................................................................................................. 49

3.3.1. Kết quả điều tra kháng sinh và chế phẩm sinh học ............................................. 49

3.3.2. Các biện pháp kỹ thuật khác áp dụng .................................................................. 50

CHƯƠNG 4. KẾT LUẬN VÀ KIẾN NGHỊ ................................................................ 57

4.1. Kết luận................................................................................................................... 57

4.2. Kiến Nghị ............................................................................................................... 57

TÀI LIỆU THAM KHẢO ............................................................................................. 58

PHỤ LỤC ...................................................................................................................... 60

PDF Watermark Remover DEMO : Purchase from www.PDFWatermarkRemover.com to remove the watermark

Luận văn Thạc sĩ Khoa học Nông nghiệp: Sử dụng kỹ thuật PCR trong chẩn đoán bệnh tôm chết sớm và đề xuất biện pháp phòng trị

Chủ đề:

Tài liệu liên quan

Tài liêu mới

AI tóm tắt

Giới thiệu tài liệu

Đối tượng sử dụng

Từ khoá chính

Nội dung tóm tắt

Hỗ trợ

Phương thức thanh toán

Theo dõi chúng tôi