Ứng dụng chỉ thị phân tử chọn lọc cá thể mang locus gen Sub1 ở quần thể BC2F1 trong chọn tạo giống lúa Bắc Thơm 7 chịu ngập
lượt xem 2
download
Bài viết Ứng dụng chỉ thị phân tử chọn lọc cá thể mang locus gen Sub1 ở quần thể BC2F1 trong chọn tạo giống lúa Bắc Thơm 7 chịu ngập trình bày xác định chỉ thị phân tử đa hình tại vị trí vùng locus gen Sub1 giữa giống lúa BT7 và IR64-Sub1; Xác định chỉ thị phân tử đa hình trên 12 nhiễm sắc thể giữa giống lúa BT7 và IR64-Sub1 phục vụ chọn lọc nền di truyền; Ứng dụng chỉ thị phân tử trong chọn lọc cá thể Bắc thơm 7 mang QTL/gen Sub1 trong quần thể BC2F1.
Bình luận(0) Đăng nhập để gửi bình luận!
Nội dung Text: Ứng dụng chỉ thị phân tử chọn lọc cá thể mang locus gen Sub1 ở quần thể BC2F1 trong chọn tạo giống lúa Bắc Thơm 7 chịu ngập
- T¹p chÝ khoa häc vµ c«ng nghÖ n«ng nghiÖp ViÖt Nam ỨNG DỤNG CHỈ THỊ PHÂN TỬ CHỌN LỌC CÁ THỂ MANG LOCUS GEN SUB1 Ở QUẦN THỂ BC2F1 TRONG CHỌN TẠO GIỐNG LÚA BẮC THƠM 7 CHỊU NGẬP Tạ Hồng Lĩnh, Lê Hùng Lĩnh, Trần Đăng Khánh, Lê Thị Thu, Nguyễn Văn Luận, Lê Huy Hàm SUMMARY Using molecular markers to select plants carrying Sub1 in BC2F1 population for improving Bac Thom 7 tolerance of submergence Vietnam is one of the most vulnerable countries to climate change in Asia. Rice is a principle foo d in Vietnam and plays an important role as an economic activity in this country. Rice yield in the Red River Delta can be significantly reduced by climate change. Sea level rise and flash flooding occur at various degrees which cause directly adverse effects to hundreds ha of growing rice. To improve rice tolerance with submergence is a vital work to minimize the risks from climate change. Successful application of MABC methods to select a line namely No 19 in BC2F1 populations which have genetic background up to 89,8%.The submergence tolerance rice line should be developed in the frequent flooding areas in the Red River Delta to cope with climate change. Keywords: Bac Thom 7 (BT7), Marker-assisted backcrossing (MABC); submergence tolerance. dụng thành công tại Viện Nghiên cứu lúa I. §ÆT VÊN §Ò Quốc t (IRRI) trong việc quy tụ ây trồng quan trọng nhất ở Việt chịu ngập vào một số giống lúa hiện đang Nam đồng thời cũng là nguồn thức ăn chính trồng ph bi n ở các nước Đông cho hơn một nửa dân số th giới. Việt Nam Phương pháp MABC thi t là nước xuất khẩu gạo đứng thứ 2 trên th thực, hiệu qu trong việc quy tụ giới sau Thái Lan, chi m kho ng 50% t ng quy định tính trạng di truyền số lượng s n lượng gạo thương mại trên th giới. Lúa (QTL) hay gen vào giống mới cho phép rút gạo là nguồn thu ngoại tệ lớn nhất của nền ngắn quá trình chọn lọc. Việc ứng dụng chỉ nông nghiệp xuất khẩu Việt Nam và cũng là thị phân tử k t hợp lai trở lại từ 2 đ n 3 th nguồn thức ăn chính của gần 90 triệu dân số hệ có thể thu được cá thể với nền di truyền trong nước. Đồng bằng sông Hồng có s n của giống mẹ và mang gen chuyển. Các lượng gạo chi m 17% s n lượng gạo trong dòng này cho tự thụ, thu hạt để ti n hành toàn quốc. S n lượng gạo Việt Nam có thể thử nghiệm trên đồng ruộng. Từ những gi m đáng kể bi n đ i khí hậu gây ngập thành công trên cho thấy việc ứng dụng chỉ lụt. Do đó, đáp ứng s n lượng lúa ở vùng thị phân tử xác định cá thể mang QTL/gen đồng bằng sông Hồng thông qua công tác trong chọn tạo giống lúa Bắc thơm 7 họn tạo giống lúa có kh năng chịu ngập chịu ngập là h t sức cần thi t. năng suất cao là h t sức cần thi t và có ý nghĩa cho an toàn lương thực và tăng thu II. VËT LIÖU Vµ PH¦¥NG PH¸P NGHI£N CøU nhập của nông dân tại vùng chịu nh hưởng 1. Vật liệu nghiên cứu của bi n đ i khí hậu. : Giống lúa thuần được hương pháp chọn giống nhờ chỉ thị nhập nội từ IRRI mang locus gen chịu phân tử và lai trở lại (MABC) đã được ứng ngập được dùng là dòng bố.
- T¹p chÝ khoa häc vµ c«ng nghÖ n«ng nghiÖp ViÖt Nam Bắc thơm 7 là giố lúa được sử dụng Một số kỹ thuật trong phòng thí làm giống mẹ nhận locus gen chịu nghiệm (Kỹ thuật tách chi t và tinh sạch ngập. Bắc thơm 7 hiện là giống lúa đang ADN, Phương pháp PCR với mồi SSR, Kỹ được trồng khá ph bi n tại một số tỉnh thuật hân tích k t qu trên gel đồng bằng sông Hồng có năng suất cao, chất lượng gạo khá. Các chỉ thị phân tử SSR tại vị trí vùng III. KÕT QU¶ Vµ TH¶O LUËN 12 nhiễm sắc thể. 1. Xác định chỉ thị phân tử đa hình tại vị 6 cá thể th hệ F trí vùng locus gen Sub1 giữa giống lúa được xác định và chọn lọc bằng 2 chỉ thị BT7 và IR64-Sub1 phân tử ART5 và RM25181. là locus gen chịu ngập đã được 18 cá thể th hệ BC lập b n đồ chi ti t trên nhiễm sắc thể 9 bằng đã được sàng quần thể gồm cá thể với kho ng lọc thông qua 2 chỉ thị phân tử SC3 và Dựa vào k t qu lập b n đồ chi ti t locus gen 2. Phương pháp nghiên cứu các chỉ thị phân tử liên k t với locus gen Phương pháp chọn giống bằng chỉ thị đã được sử dụng. Trong nghiên cứu phân tử và lai trở lại (MABC chỉ thị phân tử trên NST9 đã được kh o sát nhằm xác định chỉ thị phân tử đa hình giữa giống lúa Bắc thơm 7 và IR64 Phương pháp xử lý số liệu: Số liệu K t qu kh o sát đã xác định được 11 được xử lý thống kê trên máy tính thông chỉ thị cho k t qu đa hình giữa giống Bắc qua chương trình EXCEL2007, thơm 7 và IR64 trong đó có 5 chỉ thị phương liên k t với vùng QTL/gen với các pháp phân tích thống kê khác. thông tin chi ti t được thể hiện ở b ng 1. B ng 1. Danh sách chỉ thị cho k t qu đa hình tại vị trí vùng QTL/gen NST9 giữa Bắc thơm 7 Vị trí Độ dài đoạn nhân Nhiệt độ gắn mồi TT Tên chỉ thị Trình tự xuôi/ngược (Mb) (bp) (oC) GAGAGGACGATGGCACTATTGG 1 RM23662 0,4 149 60 CGAGGAACTTGATTCGCATGG GCAGTGTCCAACCATCTGTG 2 RM5688 1,7 150 55 ATCTGGTCACCCTTTGCTTG CAGGGAAAGAGATGGTGGA 3 ART5 2,6 124 55 TTGGCCCTAGGTTGTTTCAG GCTAGTGCAGGGTTGACACA 4 SC3 6,8 217 55 CTCTGGCCGTTTCATGGTAT TGCCACATGTTGAGAGTGATGC 5 RM23877 6,3 327 60 TACGCAAGCCATGACAATTCG
- T¹p chÝ khoa häc vµ c«ng nghÖ n«ng nghiÖp ViÖt Nam 2. Xác định chỉ thị phân tử đa hình trên truyền, chỉ thị phân tử được sử dụng 12 nhiễm sắc thể giữa giống lúa BT7 và kh o sát đa hình giữa giống lúa Bắc thơm 7 IR64-Sub1 phục vụ chọn lọc nền di K t qu kh o sát xác định truyền được 58 chỉ thị phân tử cho đa hình giữa Để xác định chỉ thị phân tử đa hình trên Các chỉ thị đa hình và 12 nhiễm sắc thể phục vụ chọn lọc nền di vị trí được thể hiện ở b n đồ hình 1. Bản đồ các chỉ thị phân tử đa hình giữa giống Số các NST được biểu thị bằng số ở hỉ thị phân tử SSR đa hình ở phía bên trái các , tương ứng vị trí chỉ thị phân tử ghi bên ph i NST. Vùng đen biểu thị vị trí QTL/gen Sub1. Vị trí và thứ tự chỉ thị phân tử được xây dựng dựa trên b n đồ Nipponbare (TIGR v. 3 pseudo 3. Ứng dụng chỉ thị phân tử trong chọn K t qu đã xác định được 57 cá thể lọc cá thể Bắc thơm 7 mang QTL/gen bằng chỉ thị phân tử Sub1 trong quần thể BC2F1 (hình 2) từ 235 cá thể thể mang locus gen ệu số 4, 6, 7, Quần thể BC sử dụng cứu được xây dựng từ t hợp lai trở lại (Backcross) giữa cá thể BC giống lúa BT7. Cá thể BC đã được xác định mang locus gen chịu ngập bằng hai chỉ thị phân tử SSR liên k t chặt là k t qu kiểm tra di với truyền các cá thể , ký hiệu A là di Trong thí nghiệm này, cá thể đã truyền của giống lúa Bắc thơm 7; B là di được kiểm tra xác định mang locus gen truyền của giống lúa IR64 với chỉ thị bằng hai chỉ thị phân tử ART5 và phân tử ART5 và H là dị hợp tử.
- T¹p chÝ khoa häc vµ c«ng nghÖ n«ng nghiÖp ViÖt Nam (tiếp theo) (tiếp theo) (tiếp theo) Hình 2: Kết quả chạy điện di trên 235 cá thể BC (sử dụng chỉ thị phân tử ART5) BT: Bắc thơm 7, Sub1: IR64 235: Các cá cá thể lai BC A: Bắc thơm Sub1, H: Dị hợp tử Trong thí nghiệm này, ngoài ART5, chỉ thị phân tử cũng được sử dụng xác định di truyền với cá thể BC K t qu 87 cá thể đã được xác định cụ thể 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253 và được thể hiện ở hình 3.
- T¹p chÝ khoa häc vµ c«ng nghÖ n«ng nghiÖp ViÖt Nam (tiếp theo) (tiếp theo) (tiếp theo) (tiếp theo) (tiếp the Hình 3: Kết quả chạy điện di trên 25 cá thể BC (sử dụng chỉ thị phân tử RM23877) BT: Bắc thơm 7, Sub1: IR64 259: Các cá cá thể lai BC A: Bắc thơm 7, B:IR64 Sub1, H: Dị hợp tử, O: không có k t qu Như vậy việc sử dụng 2 chỉ thị phân tử Chọn lọc ề ề ố đã xác định được 42 cá ể ầ ể thể mang QTL/gen phục vụ việc chọn Để chọn lọc những cá thể mang nền di lọc nền di truyền BC được ký hiệu: 4, 7, truyền giống nhận gen cao nhất, 53 chỉ thị phân tử đa hình giữa BT7 và IR64 trên c 12 NST được sử dụng để sàng lọc. t qu đã xác định được 8 cá thể có nền di
- T¹p chÝ khoa häc vµ c«ng nghÖ n«ng nghiÖp ViÖt Nam truyền giống BT7 từ 70 75%, 19 cá thể mang nền di truyền từ 80 85%, 3 cá thể mang nền di truyền từ 75 80%, 12 cá thể mang nền di truyền từ 85 mẹ (thế hệ BC2F1) 19 20 18 16 14 12 Số cá thể 12 10 8 8 Số cá thể 6 4 3 2 0 0 70-75 75-80 80-85 85-90 >90 Tỷ lệ (%) Tỷ lệ các cá thể mang nền di truyền giống mẹ ( Hình 5 là k t qu phân tích di truyền phần mềm Graphical genotypes 2 thể số 19 với nền di truyền cao nhất giống nhận gen BT7 chương : B n đồ di truyền của cá thể số 19 Ghi chú: Thứ tự của các NST được biểu thị bằng số ở phía dưới và danh sách các chỉ thị dùng trong kh o sát nền di truyền ở phía bên trái, tương ứng vị trí chỉ thị phân tử ghi bên ph i NST. Vùng đen biểu thị nền di truyền giống BT7, vùng sáng biểu thị nền di truyền giống IR64 Sub1.Vị trí và thứ tự chỉ thị phân tử được xây dựng dựa trên phần mềm GGT2. IV. KÕT LUËN Vµ §Ò NGHÞ Ứng dụng phương pháp chọn giống nhờ chỉ thị phân tử và lai hồi quy đã xác định và 1. Kết luận chọn lọc được số 19 mang locus gen K t qu kh o sát xác định được 58 chỉ có nền di truyền của giống nhận gen Bắc thị phân tử cho đa hình giữa IR64 thơm 7 là 89,8%. từ 378 chỉ thị phân tử trên 12 NST.
- T¹p chÝ khoa häc vµ c«ng nghÖ n«ng nghiÖp ViÖt Nam 2. Đề nghị Cần ti p tục nghiên cứu phát triển cá ), “ thể đã chọn tạo được trong thí nghiệm ở các ”, th hệ ti p theo (B ...) đồng thời ti n hành đánh giá kiểu gen, kiểu hình của các cá thể để tạo giống mang locus gen nhưng vẫn giữ được nền di truyền hoàn toàn giống Bắc thơm 7. TÀI LIỆU THAM KHẢO “ ”, Bui Chi Buu, (2011), “ ”, Ngày nhận bài: 6/2/2012 Người phản biện: PGS. TS. Nguyễn Văn Viết, ngày 8/2/2012 Ngày duyệt đăng: 20/3/2012 TẠO MÔ SẸO VÀ TÁI SINH CÂY IN VITRO TỪ PHÔI NON MỘT SỐ GIỐNG LÚA INDICA Nguyễn Văn Khiêm, Nguyễn Văn Cửu, Phạm Hồng Quân, Phùng Thị Phương Nhung, Vũ Thu Hằng, Lưu Thị Mỹ Dung, Đỗ Năng Vịnh SUMMARY In vitro plant regeneration from immature embryos of indica rice cultivars In this study, immature embryos of 18 indica rice cultivars growing in Vietnam such as Khang Dan 18, Huong Xuyen 5, DT36, DT37, DT42, Phieu Huong 1, QR1, Xi-23, IR64, Bac Thom 7, Bac Thom 8, VS1, Lua Thom LT1, Lua Thom LT2, Lua Thom LT10, Tieu Huong 138, Khang Dan dot bien and IR56 were used for callus induction and plant regeneration. It took about 6 weeks to obtain whole regeneration plants that could be transferred to the greenhouse. Callus induction and plant regeneration were carried out on MS (1962) medium containing phytohormones. After 2 weeks of culture, 52.0-72.67% seeds induced embryogenic callus (depending on cultivars). The plant regeneration frequency ranged 10.0-37.14% (depending on cultivars). Frequencies of callus induction and plant regeneration derived from immature embryos depending on immature age and rice cultivars. Survival plant frequency was more than 95% in the greenhouse after 4 weeks. All regenerated plants were fertile and set seeds. There were no morphological variations observed. Keywords: Embryogenic callus, immature embryos, plant regeneration, indica.
CÓ THỂ BẠN MUỐN DOWNLOAD
-
Ứng dụng chỉ thị phân tử ADN trong chọn tạo giống cà chua chín chậm chứa gen rin
7 p | 87 | 4
-
Nghiên cứu ứng dụng chỉ thị phân tử phát hiện gen thoát cổ bông EUI phục vụ công tác tạo dòng mẹ lúa lai
14 p | 19 | 3
-
Ứng dụng chỉ thị phân tử để chọn hạt gạo không bạc bụng trong quần thể lai hồi giao của tổ hợp lúa OM3673/TLR434//OM3673
7 p | 42 | 3
-
Tình hình nghiên cứu ứng dụng các chỉ thị phân tử trong đánh giá các mô hình lai tạo giống lợn
7 p | 39 | 3
-
Ứng dụng chỉ thị phân tử chọn giống lúa có hàm lượng amylose thấp trên quần thể lai hồi giao OM6976/JASMINE 85//OM6976
6 p | 61 | 3
-
Ứng dụng chỉ thị phân tử trong chọn lọc cá thể mang QTL/gen (tăng số hạt trên bông) từ quần thể F2, F3 (tổ hợp lai KC25/KD18) phục vụ công tác chọn tạo giống lúa cao sản
7 p | 4 | 2
-
Ứng dụng chỉ thị SCoT đánh giá đa dạng di truyền một số giống vú sữa (Chrysophyllum cainito) ở Việt Nam
7 p | 16 | 2
-
Ứng dụng chỉ thị phân tử nâng cao kích thước hạt trong chọn giống đậu phộng (Arachis hypogaea L) tại đồng bằng sông Cửu Long
7 p | 7 | 2
-
Ứng dụng chỉ thị phân tử microsatellite trong truy xuất phả hệ quần đàn cá tra (Pangasianodon hypophthalmus) chọn giống
6 p | 15 | 2
-
Ứng dụng công nghệ chỉ thị phân tử trong chọn tạo giống lúa thuần kháng rầy nâu
6 p | 5 | 2
-
Ứng dụng chỉ thị phân tử trong chọn tạo giống lúa chịu ngập AS996-Sub1
6 p | 28 | 2
-
Ứng dụng chỉ thị phân tử chọn lọc cá thể BC1F1 (tổ hợp lai KD18/KC25) mang QTL/gen tăng số hạt trên bông và có nền di truyền cao nhất giống nhận gen
6 p | 65 | 2
-
Đánh giá tính đồng nhất của mẫu giống bạch chỉ (Argelica dahurica) bằng chỉ thị phân tử ISSR
6 p | 33 | 2
-
Ứng dụng chỉ thị phân tử ADN chọn tạo giống lúa kháng bệnh bạc lá
0 p | 42 | 2
-
Ứng dụng chỉ thị phân tử liên kết với các gen Xa7, Xa21 để tạo vật liệu khởi đầu phục vụ cho công tác chọn tạo giống lúa kháng bệnh bạc lá
7 p | 5 | 2
-
Ứng dụng chỉ thị phân tử trong chọn tạo giống lạc kháng bệnh đốm lá muộn
0 p | 57 | 1
-
Nghiên cứu ứng dụng phương pháp MABC trong chọn tạo giống lúa chịu ngập AS996
5 p | 70 | 1
Chịu trách nhiệm nội dung:
Nguyễn Công Hà - Giám đốc Công ty TNHH TÀI LIỆU TRỰC TUYẾN VI NA
LIÊN HỆ
Địa chỉ: P402, 54A Nơ Trang Long, Phường 14, Q.Bình Thạnh, TP.HCM
Hotline: 093 303 0098
Email: support@tailieu.vn