Quadruplexes

G-quadruplex (G4) là acid nucleic có cấu trúc bậc hai được hình thành bởi các trình tự giàu guanine. G4 hiện diện phổ biến trong tất cả các bản phiên mã và bộ gen của sinh vật. Bài viết tập trung thảo luận về những ứng dụng của tương tác đặc hiệu giữa peptide RHAU và G4 song song trong những phản ứng sinh hóa.

11p vithomson 02-07-2024 2 1   Download

Xác định sự hình thành cấu trúc G-quadruplex trong DNA là cần thiết để thiết kế các phân tử nhỏ (thuốc) nhắm mục tiêu Gquadruplex. Bài viết trình bày việc đánh giá khả năng nhận diện đặc hiệu cấu trúc DNA G-quadruplex song song của RHAU140-CFP bằng thiết bị đo huỳnh quang.

8p vispacex 16-11-2023 9 4   Download

Trong nghiên cứu này, nuclease mới được phát triển có khả năng nhắm mục tiêu G-quadruplex song song và thực hiện chức năng cắt tại vị trí đặc hiệu. Enzyme mới được tạo ra bằng phương pháp kết hợp phân tử peptit RHAU53 có khả năng nhận diện G-quadruplex song song với vùng protein xúc tác cắt của Fok1, tạo nên protein dung hợp RHAU53-Fok1.

7p kimphuong17 01-08-2023 7 2   Download

Sự dimer protein đóng vai trò quan trọng trong hầu hết các quá trình sinh học như phiên mã, sao chép, truyền tín hiệu, hoạt hóa enzyme...Do đó, kiểm soát sự dimer của protein sẽ giúp điều hòa các quá trình này trong tế bào. Trong nghiên cứu này, kiểm soát sự dimer hóa của protein được thực hiện bởi trình tự DNA chứa 2 cấu trúc G-quadruplex (2G4).

9p vithales 19-04-2022 18 3   Download

Bài viết tiến hành nghiên cứu khả năng dimer hóa protein liên kết với peptide RHAU có kích thước lớn hơn (53 amino acid) của cấu trúc G-quadruplex T95-2T nhằm đa dạng hóa các lựa chọn phục vụ cho các nghiên cứu trên tế bào trong tương lai.

11p angicungduoc11 18-04-2021 48 3   Download

G-quadurplex (G4) formation plays a role in many biological processes such as replication, transcription, translation, and telomeric maintenance. Stabilization of G4 structure by peptide has recently emerged as a potential approach in the regulation of protein expression. In this study, we reported on regulation of cyan fluorescent protein (CFP) expression by the interaction of G4 and RNA helicase associated with AU-rich elements (RHAU) peptide in E. coli.

7p larachdumlanat127 02-01-2021 5 1   Download

G-quadruplex DNA hay RNA là cấu trúc bậc hai xuất hiện ở những vùng giàu Guanine có cấu trúc 4 sợi được hình thành bởi những G-tetrad xếp chồng lên nhau. Sự hình thành cấu trúc G-quadruplex trong DNA hay RNA đóng vai trò quan trọng trong các quá trình sinh học của tế bào như: sao chép DNA, phiên mã, dịch mã và đặc biệt trong quá trình kéo dài của telomer. Do đó, G-quadruplex được xem là mục tiêu quan trọng cho các quá trình điều hòa và kiểm soát các hoạt động của tế bào có liên quan gen.

10p kaiyuan1121 27-08-2018 82 3   Download

This study examines the characteristics of binding of berberine to the human telomeric d[AG3(T2AG3 )3] quadruplex. By employing UV-visible spectroscopy, fluorescence spectroscopy and isothermal titration calorime-try, we found that the binding affinity of berberine to the human telomeric quadruplex is 10 6 .

13p galaxyss3 07-03-2013 34 3   Download

Naturally occurring G-rich DNA sequences that are able to form G-quad-ruplex structures appear as potential targets for anti-cancer chemotherapy, and therefore play an important role in cellular processes, such as cell aging, death and carcinogenesis.

9p vinaphone15 27-02-2013 44 3   Download

Guanine-rich DNA sequences have the ability to fold into four-stranded structures called G-quadruplexes, and are considered as promising antican-cer targets. Although the G-quadruplex structure is composed of quartets and interspersed loops, in the genome it is also flanked on each side by numerous bases.

13p vinaphone15 25-02-2013 38 3   Download

Homologous recombination is a very important cellular process, as it pro-vides a major pathway for the repair of DNA double-strand breaks. This complex process is affected by many factors within cells. Here, we have studied the effect of monovalent cations (K + ,Na + , and NH4 + ) on the outcome of recombination events, as their presence affects the biochemical activities of the proteins involved in recombination as well as the structure of DNA.

11p viettel02 22-02-2013 39 3   Download

G-quadruplex motifs constitute unusual DNA secondary structures formed by stacking of planar hydrogen-bonded G-tetrads. Recent genome-wide bioinformatics and experimental analyses have suggested the interesting possibility that G-quadruplex motifs could be cis-regulatory elements.

11p viettel02 19-02-2013 26 3   Download

Alternate DNA structures that deviate from B-form double-stranded DNA such as G-quadruplex (G4) DNA can be formed by sequences that are widely distributed throughout the human genome. G-quadruplex secondary structures, formed by the stacking of planar quartets composed of four guanines that interact by Hoogsteen hydrogen bonding, can affect cellular DNA replication and transcription, and influence genomic stability.

19p viettel02 19-02-2013 30 4   Download

The presence and biological importance of DNA secondary structures in eukaryotic promoters are becoming increasingly recognized among chemists and biologists as bioinformatics in vitro and in vivo evidence for these structures in the c-Myc, c-Kit, KRAS, PDGF-A, hTERT, Rb, RET and Hif-1apromoters accumulates.

0p viettel02 19-02-2013 49 3   Download

Four-stranded G-rich DNA structures called G-quadruplexes have been the subject of increasing interest recently. Experimental and computational techniques have been used to implicate them in important biological pro-cesses such as transcription and translation.

7p viettel02 19-02-2013 36 3   Download

Tham khảo luận văn - đề án 'báo cáo khoa học: dna g-quadruplex: structure, function and human disease ´ ´ jaime gomez-marquez', luận văn - báo cáo, báo cáo khoa học phục vụ nhu cầu học tập, nghiên cứu và làm việc hiệu quả

1p viettel02 19-02-2013 40 3   Download

The innate immune response of insects includes induced expression of genes encoding a variety of antimicrobial peptides. The signaling pathways that stimulate this gene expression have been well characterized by genetic analy-sis in Drosophila melanogaster, but are not well understood in most other insect species.

11p mobifone23 18-01-2013 48 4   Download

Telomeres play an important role in cellular aging and cancer. Human telomeric DNA and RNA G-rich sequences are capable of forming a four-stranded structure, known as the G-quadruplex. Such a structure might be important for telomere biology and a good target for drug design.

8p mobifone23 18-01-2013 42 6   Download

The 3¢-ends of human chromosomal DNA terminate in short single-stranded guanine-rich tandem-repeat sequences. In cancer cells, these are associated with the telomere-maintenance enzyme telomerase together with the end-binding protein hPOT1.

9p mobifone23 18-01-2013 41 5   Download

Thermodynamic and kinetic studies complement high-resolution structures of G-quadruplexes. Such studies are essential for a thorough understanding of the mechanisms that govern quadruplex folding and conformational changes in quadruplexes.

16p mobifone23 18-01-2013 34 5   Download