Thiết kế cặp mồi PCR

Đa hình C677T trên gene MTHFR là một yếu tố nguy cơ của nhiều bệnh lý khác nhau, bao gồm vô sinh nam. Mục tiêu: Đề tài được thực hiện nhằm các mục tiêu: Hoàn thiện kỹ thuật PCR-RFLP với cặp mồi tự thiết kế để xác định đa hình C677T trên gene MTHFR; Xác định tỷ lệ các đa hình tại C677T của gene MTHFR trên nhóm người tình nguyện và nhóm bệnh nhân có bất thường tinh dịch đồ.

8p vifaye 20-09-2024 3 1   Download

Nghiên cứu nhằm khảo sát vị trí thiết kế mồi trên trình tự giàu CpG của Alu để sử dụng cho phản ứng real time PCR đặc hiệu methyl hóa (quantitative Methylation Specific PCR-qMSP) cho phép đánh giá được sự thay đổi methyl hóa Alu ở 25 cặp mẫu mô ung thư/liền kề của bệnh nhân ung thư vú tại Việt Nam.

9p visergeyne 18-06-2024 1 1   Download

Bài viết trình bày việc xây dựng quy trình real-time PCR SYBR chẩn đoán biến thể rs1801275 trên gen IL4-Rα. Phương pháp nghiên cứu: Thiết kế các đoạn mồi đặc hiệu alen phát hiện biến thể rs1801275 trên gen IL4-Rα bằng công cụ primer-BLAST (NCBI, Hoa Kỳ). Đánh giá độ đặc hiệu, tối ưu hóa nồng độ và nhiệt độ bắt cặp của đoạn mồi đã thiết kế.

6p vibego 02-02-2024 7 1   Download

Bài viết trình bày việc xây dựng quy trình giải trình tự Sanger khảo sát năm biến thể trên các gen PNPLA3, TM6SF2, MBOAT7 và GCKR liên quan đến bệnh gan nhiễm mỡ không do rượu (NAFLD). Đối tượng và phương pháp nghiên cứu: Tối ưu hóa quy trình ly trích DNA có ly giải hồng cầu bằng dung dịch ACK, thiết kế 5 cặp đoạn mồi đặc hiệu cho các biến thể, tối ưu hóa nhiệt độ bắt cặp của phản ứng PCR và tối ưu hóa phản ứng giải trình tự Sanger trên hệ thống Applied Biosystems 3500 (ThermoFishser).

6p vianapatricia 28-06-2022 24 4   Download

Bài giảng Công cụ di truyền mới trong chọn tạo giống cây trồng: Chương 3.2 - TS. Vũ Thị Thúy Hằng cung cấp đến học viên các kiến thức về mồi PCR/PCR primer; nguyên tắc chung trong thiết kế mồi; một số phần mềm trong thiết kế mồi;... Mời các bạn cùng tham khảo chi tiết nội dung bài giảng!

14p bachkhinhdaluu 10-12-2021 22 2   Download

Bài giảng Công nghệ Gene: Chương 5 PCR và các ứng dụng trong kỹ thuật di truyền, cung cấp cho người học những kiến thức như: Nhắc lại nguyên tắc của kỹ thuật PCR truyền thống; Các biến thể của kỹ thuật PCR và ứng dụng. Mời các bạn cùng tham khảo!

31p caphesuadathemhanh 03-12-2021 29 2   Download

Tách chiết và thu nhận được DNA tổng số của 15 mẫu thân lá cây lúa (Oryza sativa) trồng tại các vùng có độ mặn khác nhau ở Đồng bằng sông Cửu Long. Thiết kế và sàng lọc thu được các cặp mồi đặc hiệu HKT1;4-1, HKT1;4-2, HKT1;4-3 khuếch đại các vùng mã hóa gene OsHKT1;4 của cây lúa bằng kỹ thuật PCR.

8p vining2711 09-08-2021 16 1   Download

Tách chiết và thu nhận được DNA tổng số của 15 mẫu cá rô đồng (Anabas testudineus) tại các vùng có độ mặn khác nhau ở Đồng bằng sông Cửu Long. Thiết kế và sàng lọc thu được cặp mồi đặc hiệu DNA/Aqp1-f và DNA/Aqp1-r để khuếch đại gene AQP1aa bằng kỹ thuật PCR. Giải trình tự, ráp nối và chú thích thành công gene AQP1aa.

6p vining2711 09-08-2021 22 2   Download

Nghiên cứu này tiến hành tối ưu hóa phản ứng realtime PCR với cặp mồi và mẫu dò được thiết kế nhằm phát hiện gen đặc hiệu cfb của GBS. Các thí nghiệm tối ưu hóa được thực hiện trên chủng S. agalactiae ATCC 13813. Độ đặc hiệu của quy trình tối ưu được kiểm tra trên DNA của chủng Staphylococcus aureus ATCC 25923, Gardnerella vaginalis và Chlamydia trachomatis.

13p viaespa2711 31-07-2021 20 3   Download

Nghiên cứu này tập trung vào việc thiết kế cặp primer chuyên biệt và xây dựng quy trình PCR để phân biệt tam thất hoang và tam thất bắc. Kết quả nghiên cứu đã thiết kế được một cặp primer chuyên biệt và quy trình PCR có khả năng phân biệt hai loại tam thất này trong mẫu thực tế. Mời các bạn cùng tham khảo!

7p wangxinling 23-07-2021 18 3   Download

Mục đích nghiên cứu đề tài là nghiên cứu thông tin của gen GmCHI của cây đậu tương, thiết kế cặp mồi PCR và nhân bản đoạn mã hóa của gen GmCHI1A từ giống đậu tương có hàm lượng isoflavone cao. Tách dòng, giải trình tự nucleotide và phân tích đặc điểm của gen GmCHI1A phân lập từ cây đậu tương.

139p elysale 09-06-2021 26 4   Download

Bài viết phát triển kỹ thuật real-time PCR để xác định chính xác KSTSR P. malariae, phân biệt với các loài Plasmodium gây bệnh sốt rét khác bằng cặp mồi, probe được thiết kế đặc hiệu cho gen ty thể cytochrome b (cyt b) với nhiều bản sao trong KSTSR, giúp tăng độ nhạy của phản ứng.

9p kequaidan8 02-11-2020 40 4   Download

Nghiên cứu này tiến hành thiết kế và tối ưu hóa phản ứng multiplex PCR sử dụng 6 cặp mồi khuếch đại các gen đích VrrA, pagA, capA và ypo2088, pla, caf1 chẩn đoán đồng thời B. anthracis và Y. pestis trên các chủng đã xác định có đầy đủ plasmid độc. Đây là cơ sở cho việc chế tạo kit multiplex PCR chẩn đoán đồng thời B. anthracis và Y. pestis từ mẫu bệnh phẩm lâm sàng và môi trường.

7p vibandar2711 13-07-2020 38 2   Download

Bài viết sử dụng cùng lúc 4 cặp mồi, trong 4 tube PCR riêng biệt, được thiết kế tại các vùng gene bảo thủ tương ứng trên 4 ORFs (OFR1 - OFR4) của bộ gene PYMoV trong cùng 1 phản ứng PCR với yêu cầu cả 4 cặp mồi đều cho kết quả dương tính rõ trên DNA của mỗi mẫu nhi m bệnh và đều âm tính trên mẫu đối chứng khỏe. Các cặp mồi này chỉ được đề xuất sử dụng khi chúng đều cho kết quả tương tự trong phản ứng RT-PCR, ở bước tiếp theo, sử dụng RNA tổng số tách chiết từ cùng 1 mẫu giám định.

5p kethamoi5 27-05-2020 42 1   Download

Với mục đích khảo sát các đa hình các nucleotide đơn (SNPs) thuộc vùng D-loop của hệ gen ty thể, chúng tôi đã thu thập mẫu máu của 81 cá thể người Việt Nam thuộc hai dân tộc Kinh và Mảng. Sử dụng kỹ thuật PCR và các cặp mồi được thiết kế đặc hiệu, hai đoạn siêu biến HV-I và HV-II với kích thước tương ứng 693 bp và 689 bp đã được khuếch đại thành công.

10p viathena2711 08-10-2019 23 1   Download

Trong nghiên cứu này, đoạn gen mã hóa cho protein M của chủng virus gây Hội chứng rối loạn sinh sản và hô hấp ở lợn (VN07196) được khuếch đại bằng phản ứng PCR sử dụng khuôn là plasmid pGEM-PRRS (VN07196) với cặp mồi đặc hiệu, được gắn kết với promoter 35S, Histag và Cmyc, ELP, nhân dòng trong vector pRTRA và thiết kế vào cấu trúc vetor chuyển gen thực vật pCB301-35S-M-Histag-Cmyc-100xELP.

8p viathena2711 08-10-2019 30 4   Download

Trong nghiên cứu này, cấu trúc biểu hiện gen OsNAC45 đã được thiết kế đặt dưới sự điều khiển của promoter hoạt động cảm ứng stress Rd29A và chuyển vào cây ngô (Zea mays) thông qua vi khuẩn Agrobacterium tumefaciens. Các dòng ngô tái sinh mang một bản sao cấu trúc chuyển gen đã được sàng lọc bằng bằng PCR và Real-time qPCR với cặp mồi đặc hiệu.

8p viathena2711 08-10-2019 31 2   Download

Mục tiêu nghiên cứu của bài viết nhằm thiết kế và tối ưu hóa phản ứng multiplex PCR sử dụng 6 cặp mồi khuếch đại gen đích VrrA, pagA, capA và ypo2088, pla, caf1 chẩn đoán đồng thời B. anthracis và Y. pestis trên các chủng đã xác định có đầy đủ plasmid độc. Đây là cơ sở cho việc chế tạo kit multiplex PCR chẩn đoán đồng thời B. anthracis và Y. pestis từ mẫu bệnh phẩm lâm sàng và môi trường.

8p trieusuper 15-09-2018 62 2   Download

Trong bài báo này, chúng tôi trình bày kết quả tối ưu trình tự gen OPHC2 biểu hiện trong thực vật và thiết kế vector chuyển gen mang cấu trúc 35S-OPHC2opt-cmyc-KDEL-NOS (pBIN121/OPHC2). Vector này đã chuyển vào chủng vi khuẩn A. tumefaciens CV58 và kiểm tra bằng PCR với cặp mồi đặc hiệu. Đây là cơ sở để tạo cây chuyển gen mang gen OPHC2 để phân hủy thuốc trừ sâu Mep tồn dư trong môi trường.

6p cumeo2004 02-07-2018 72 1   Download

Trong nghiên cứu này, chúng tôi lần đầu tiên tiến hành phân lập đoạn gen Rho từ mẫu mô gan tôm sú bị bệnh đốm trắng. Để khuếch đại một phần đoạn gen Rho bằng kỹ thuật RT - PCR, cặp mồi suy diễn được thiết kế dựa trên trình tự amino acid bảo thủ của protein Rho ở một số loài đã biết. Sau đó, sản phẩm RT-PCR được tạo dòng trong vector pCR2.1 và tiến hành xác định trình tự. Trình tự đoạn gen Rho thu được có kích thước 272 bp, mã hóa 90 amino acid.

6p cumeo2425 02-07-2018 66 1   Download