Cấu trúc PDB

Nghiên cứu này mô tả đánh giá sàng lọc in silico về các hợp chất thực vật của cây Chùa dù nhằm mục tiêu vào yếu tố hoại tử khối u α (TNF-α) bằng phương pháp mô phỏng gắn kết phân tử (molecular docking). Cấu trúc phân tử đã được thực hiện để xem xét mô hình gắn kết của các hợp chất thực vật cây Chùa dù cùng với cấu trúc tinh thể của TNF-α (PDB ID: 2AZ5) bằng cách sử dụng chương trình AutoDock Vina, tiếp theo là nghiên cứu về các axit amin tương tác và tác động của chúng đối với khả năng ức chế của các hợp chất tiềm năng.

8p viritesh 02-04-2024 6 2   Download

Với mục tiêu ức chế tương tác IL-5 và IL-5R, nghiên cứu này được thực hiện để tìm kiếm các chất phân tử nhỏ có khả năng gắn kết lên IL-5 hoặc thụ thể của IL-5. Đối tượng của nghiên cứu bao gồm cấu trúc 3D của IL-5, cấu trúc 3D của thụ thể IL- 5 và tương tác protein-protein của IL-5 và thụ thể IL-5, với PDB ID là 3VA2 có độ phân giải 2,703 Å tại ngân hàng dữ liệu protein.

9p kimphuong1130 28-09-2023 7 2   Download

Bài viết trình bày phương pháp so sánh hai cấu trúc protein. Thực hiện xếp chồng và rút ngắn khoảng cách giữa nguyên tử Carbon-α của các phần tử hai protein để tìm ra được mô hình tương đồng cao nhất của hai protein. Nguồn protein thực hiện trong phương pháp được lấy từ ngân hàng protein thế giới - Protein Data Bank (PDB). Mặc dù có nhiều phương pháp thực hiện so sánh cấu trúc, nhưng vẫn còn nhiều vấn đề cần nghiên cứu và mở rộng.

5p advanger2 06-05-2018 63 1   Download

Bài giảng Tin sinh học đại cương - Chương 2: Tìm kiếm trình tự tương đồng trên ngân hàng dữ liệu nêu lên một số ngân hàng dữ liệu trình tự, cơ sở dữ liệu cấu trúc PDB, BLAST trong việc tìm kiếm tương đồng.

20p maiyeumaiyeu26 23-12-2016 106 25   Download

Giới thiệu PDB (PDB.org) là một kho lưu trữ dữ liệu cấu trúc về các phân tử sinh học, chủ yếu là các protein, có quy mô toàn cầu. PDB (Ngân hàng dữ liệu Protein) do một số tổ chức thành viên có trách nhiệm quản lý cho phép ký gửi, bảo trì, xử lý và cung cấp miễn phí dữ liệu sinh học này cho cộng đồng khoa học. Để tạo ra việc trao đổi dữ liệu linh hoạt, có khả năng mở rộng và dễ dàng, dữ liệu PDB có sẵn theo định dạng XML. Định dạng XML...

15p buncha_1 11-05-2013 80 5   Download