Khai thác chuỗi sinh phổ biến

Bệnh hại do vi khuẩn, virus là mối đe dọa nghiêm trọng đối với ngành sản xuất chuối trên thế giới nói chung, Việt Nam nói riêng. Ngoài các biện pháp canh tác, việc khai thác và ứng dụng nguồn gen kháng - phần lớn thuộc họ gen NBS-LRR (Nucleotide binding site - Leucine rich repeat) trong chọn tạo, cải thiện giống chuối là phương thức bền vững để đối phó với dịch bệnh. Hệ gen loài chuối Musa acuminata được giải mã tạo tiền đề cho các nghiên cứu di truyền chuyên sâu, bao gồm xác định họ gen kháng NBS-LRR.

7p vishivnadar 21-01-2022 33 1   Download

Bài viết này chỉ ra cấu trúc của các chuỗi phổ biến dựa trên các chuỗi phổ biến đóng và các chuỗi sinh phổ biến. Dựa trên cấu trúc này, ta có thể phục hồi tất cả các chuỗi phổ biến từ các chuỗi phổ biến đóng và các chuỗi sinh phổ biến mà không cần quét lại cơ sở dữ liệu. Mời các bạn cùng tham khảo!

13p wangxinling 23-07-2021 12 1   Download

Bài viết đề xuất khái niệm tập FGHUS các chuỗi sinh phổ biến lợi ích cao, là một biểu diễn súc tích của FHUS, và một thuật toán mới hiệu quả để khai thác nó. Dựa vào hai chặn trên của độ đo lợi ích, hai chiến lược tỉa theo chiều rộng và sâu được thiết kế để loại bỏ nhanh các chuỗi ít phổ biến hoặc lợi ích thấp.

13p vithimphu2711 05-08-2020 24 1   Download