Mô hình docking

Huyết khối là một trong những nguyên nhân phổ biến gây tử vong. Những liệu pháp kháng tiểu cầu hiện tại vẫn tồn tại nhiều tác dụng phụ, hoặc khiến bệnh nhân không đáp ứng với trị liệu. Vì vậy, nghiên cứu và phát triển các thuốc kháng tiểu cầu mới là mục tiêu quan trọng trong cải thiện điều trị bệnh. Mục tiêu của nghiên cứu này là thiết kế các dẫn chất flavonoid và curcumin có khả năng ức chế trên receptor glycoprotein (GP) IIb/IIIa.

8p vifaye 20-09-2024 3 1   Download

Nghiên cứu "Sàng lọc các hợp chất có khả năng ức chế protein p37 của virus đậu mùa khỉ bằng mô hình docking phân tử" được thực hiện với mục tiêu xây dựng cấu trúc protein và mô hình sàng lọc ảo các chất ức chế p37 để phòng ngừa và điều trị MPXV.

12p gaupanda051 13-09-2024 3 1   Download

Hiện nay, vấn đề về sức khỏe đang được quan tâm và tìm hướng giải quyết nhiều nhất liên quan đến ung thư. Nghiên cứu này đã mô tả thiết kế và tổng hợp các chất ức chế HDAC gốc cinnamoylhydroxamic acid bằng cách sử dụng amide làm đơn vị liên kết.

10p viambani 18-06-2024 5 1   Download

Bài viết trình bày việc thiết kế và tổng hợp một số các hợp chất dựa trên N-hydroxycinnamamide và mở rộng thêm một vài hợp chất N-hydroxybenzamide mang các đơn vị liên kết amide (Hình 1e) nhằm bổ sung vào kho dữ liệu các hợp chất có khả năng ức chế HDAC tiềm năng.

11p viambani 18-06-2024 5 1   Download

Nghiên cứu này mô tả đánh giá sàng lọc in silico về các hợp chất thực vật của cây Chùa dù nhằm mục tiêu vào yếu tố hoại tử khối u α (TNF-α) bằng phương pháp mô phỏng gắn kết phân tử (molecular docking). Cấu trúc phân tử đã được thực hiện để xem xét mô hình gắn kết của các hợp chất thực vật cây Chùa dù cùng với cấu trúc tinh thể của TNF-α (PDB ID: 2AZ5) bằng cách sử dụng chương trình AutoDock Vina, tiếp theo là nghiên cứu về các axit amin tương tác và tác động của chúng đối với khả năng ức chế của các hợp chất tiềm năng.

8p viritesh 02-04-2024 6 2   Download

Bài viết trình bày việc xây dựng mô hình pharmacophore từ các chất chủ vận và so sánh với mô hình từ các chất đối vận và phức hợp thụ thể dopamine D2 (D2R) - risperidon. Xây dựng mô hình docking trên D2R bằng cấu trúc tinh thể 6CM4.

15p virichard 28-03-2024 10 2   Download

Nghiên cứu "Đánh giá một số dẫn xuất N-Hydroxycinnamamide và N-Hydroxybenzamide mang đơn vị liên kết amide như là chất ức chế các Enzyme Histone Deacetylase nhóm I và II thông qua mô hình Docking phân tử" là tiền đề xác định các khung hóa học tiềm năng để ức chế chọn lọc HDAC nhóm I và II, làm cơ sở phát triển các dẫn xuất tương tự góp phần vào việc tìm kiếm các chất chống ung thư tiềm năng.

14p kimphuong1130 28-09-2023 16 2   Download

Ứng dụng phương pháp silico trong thiết kế các dẫn xuất isosteviol mới hướng tác dụng ức chế FXa. Phương pháp: Mạng nơ ron nhân tạo được sử dụng để xâydựng các mô hình liên quan định lượng cấu trúc-hoạt tính sinh học (QSAR) nhằm dự đoán tácdụng ức chế FXa. Mô phỏng docking phân tử được áp dụng để dự đoán khả năng liên kết củacác hợp chất đối với FXa.

9p viberbers 09-08-2023 9 2   Download

Nghiên cứu in silico nhằm tìm kiếm các chất ức chế Bcl-2 được tiến hành thực hiện với mục tiêu xây dựng mô hình 3Dpharmacophore, mô hình 2D QSAR để dự đoán hoạt tính ức chế protein Bcl-2, mô hình mô tả phân tử docking để đánh giá sự gắn kết của các chất ức chế với protein Bcl-2.

7p vihawkeye 02-06-2023 4 2   Download

Bài viết Nghiên cứu khả năng gắn kết in silico của các hợp chất tự nhiên ức chế HER2 định hướng điều trị ung thư vú nghiên cứu khả năng gắn kết của các hợp chất tự nhiên có tiềm năng ức chế hoạt động đích phân tử HER2 bằng phương pháp docking phân tử, từ đó, đưa ra các hợp chất tiềm năng trong phát triển thuốc điều trị ung thư vú.

10p vihawkeye 02-06-2023 9 2   Download

Đề tài "Nghiên cứu tác dụng ức chế enzym αglucosidase của cây Chè vằng (Jasminum subtriplinerve) trên mô hình in vitro và in silico" nghiên cứu nhằm đánh giá tác dụng ức chế enzym α-glucosidase của cây Chè vằng trên mô hình in vitro; xác định những hợp chất trong cây Chè vằng có tác dụng ức chế enzym αglucosidase bằng phương pháp docking phân tử.

53p unforgottennight09 26-10-2022 23 11   Download

Luận án Tiến sĩ Hóa học "Nghiên cứu tổng hợp và đánh giá hoạt tính gây độc tế bào các dẫn xuất của benzimidazole và indole" trình bày các nội dung chính sau: Tổng hợp các dẫn xuất benzimidazole dựa trên phản ứng ngưng tụ các dẫn xuất của ortho-phenylenediamine và benzaldehyde; Đánh giá hoạt tính ức chế tế bào ung thư của các dẫn xuất benzimidazole và indol; Đề xuất cơ chế ức chế tế bào ung thư của các dẫn xuất benzimidazole và indole có hoạt tính tốt nhất bằng mô hình mô tả phân tử docking.

179p viaudi 04-08-2022 15 5   Download

Bài viết trình bày về tính mới của nghiên cứu này về mặt hóa lý là cấu trúc có nhóm thế amine (vốn mang giá trị tương tác sinh học với các phân tử protein cao) của các dẫn xuất ở vị trí C-3 trên vòng 4-hydroxycoumarin mà các nghiên cứu trước chưa công bố. Mời các bạn cùng tham khảo!

7p limingao 28-06-2021 28 2   Download

Khảo sát mô hình ức chế enzyme Acetylcholinesterase bởi các dẫn xuất β-lactam bằng phương pháp hóa tính toán với kỹ thuật protein docking. Qua đó, thực hiện tiên lượng, đánh giá các yếu tố ảnh hưởng tới hiệu quả ức chế enzyme, góp phần định hướng cho các nhà nghiên cứu tương lai xây dựng mô hình chất ức chế hiệu quả hơn.

8p vihera2711 03-10-2019 51 2   Download

Mô hình QSAR được sử dụng để phát triển các mô hình dự đoán và thiết kế các chất ức chế HDAC6 mới. Mô hình docking phân tử được áp dụng để dự đoán khả năng tương tác giữa các chất ức chế HDAC6 với vùng xúc tác của HDAC6.

8p viaugustus2711 06-09-2019 115 7   Download

Hội chứng chuyển hóa là yếu tố chính làm gia tăng nguy cơ bệnh tim mạch và đái tháo đường typ 2. Tuy vậy, hội chứng này vẫn chưa được chính thức công nhận là một chỉ định điều trị và các phương pháp điều trị hiện nay chỉ có thể làm giảm triệu chứng của từng rối loạn chuyển hóa riêng lẻ.

7p viaugustus2711 06-09-2019 26 2   Download

Trong những năm gần đây, 11-beta-hydroxysteroid dehydrogenase 1 (11-βHSD1), enzym quan trọng trong hoạt động glucocorticoid tại mô, được chứng minh là một đích tác động tiềm năng trong điều trị hội chứng chuyển hóa. Trong đề tài này, mô hình 2D-QSAR và docking trên nhóm dẫn chất quinolyl benzamid được xây dựng nhằm xác định tương tác của các chất ức chế với acid amin tại khoang gắn kết của 11-β-HSD1, đồng thời sàng lọc, dự đoán các chất có khả năng ức chế 11-β-HSD1.

7p viaugustus2711 06-09-2019 54 2   Download

Trong nghiên cứu này, hai phương pháp sàng lọc ảo là mô hình mô tả phân tử docking và 3D-pharmacophore đã được sử dụng để sàng lọc các chất ức chế HER2 mới.

8p viaugustus2711 06-09-2019 61 4   Download

Xây dựng các mô hình 2D-QSAR và sử dụng mô hình docking để khảo sát khả năng gắn kết của dẫn chất oxadiazol và pyrazol với telomerase. Từ đó dự đoán khả năng ức chế telomerase của các thuốc sẵn có trên thị trường và định hướng thiết kế tìm ra những chất mới có khả năng ức chế telomerase.

6p viedison2711 03-09-2019 64 4   Download

Nghiên cứu chủ yếu tập trung phát triển chất ức chế enzym MCR-1 để khôi phục hoạt tính kháng sinh. Đề tài tiến hành xây dựng mô hình 3D-pharmacophore và mô hình mô tả phân tử docking để tìm kiếm các chất có khả năng ức chế enzym MCR-1.

6p viedison2711 03-09-2019 48 3   Download