Phần mềm phân tích dna

Bài viết trình bày việc thiết kế các bộ primer/probe đặc hiệu để có thể phát hiện đồng thời 4 gen kháng colistin từ mcr-1 đến mcr-4 bằng kỹ thuật Multiplex Realtime PCR. Các trình tự DNA của các gen từ mcr-1 đến mcr-4 được phân tích bằng các phần mềm tin sinh học (Clustal Omega, BioEdit, Fast PCR) để thiết kế 4 bộ primer/probe đặc hiệu cho các gen tương ứng.

6p vibecca 01-10-2024 1 0   Download

Trong nghiên cu này, trình tự đoạn COI sẽ được khuyếch đại bằng cặp mồi đặc hiệu COI-21F/COI-812R từ DNA tổng số tách chiết từ các cá thể rầy nâu thu thập trên lúa và cỏ môi ở Việt Nam. Sản phẩm PCR được giải trình tự, so sánh và phân tích bằng phần mềm MEGA5 để xác định mối quan hệ gia phả của chúng với các trình tự trên GenBank.

5p vithor 20-07-2023 12 2   Download

Bài viết giới thiệu ba phần mềm để định danh cây dược liệu với ví dụ minh họa là định danh mẫu Thổ nhân sâm (Talinum paniculatum) bằng mã vạch vùng ITS. Kết quả nghiên cứu của bài báo cho thấy quy trình phối hợp ba phần mềm để định danh cây dược liệu bằng DNA cho kết quả chính xác nhất.

7p trinhthamhodang1214 05-08-2020 82 4   Download

Nghiên cứu được thực hiện với mục tiêu nhằm xây dựng quy trình khuếch đại toàn bộ 15 exon của gen APC bằng phản ứng PCR và giải trình tự gen APC. DNA được tách chiết từ máu ngoại vi của 15 người khỏe mạnh. Các exon của gen được khuếch đại bằng 29 cặp mồi, sản phẩm PCR sau đó được giải trình tự bằng máy tự động. Kết quả được phân tích bằng phần mềm chuyên dụng.

7p hanh_tv14 26-01-2019 64 4   Download

Sáu mẫu cây thuộc chi Artocarpus trong thí nghiệm được thu thập từ một số địa điểm khác nhau thuộc các tỉnh Tiền Giang, Cần Thơ, và TPHCM. Trước hết, mức độ đa bội thể của các mẫu được xác định thông qua phương pháp dòng chảy tế bào (Flow cytometry). Các mẫu DNA sau khi ly trích được dùng để thực hiện phản ứng PCR với các cặp mồi ITS1/ITS4 (White et al. 1990) và matK-VF/matK-VR (Tina, 2005) để khuếch đại vùng gene ITS và matK. Trình tự của hai gene này sau đó được phân tích bằng phần mềm PAUP 4.0 theo phương pháp...

9p sunshine_4 18-07-2013 80 4   Download

Cũng như nhiều loại cây trồng khác cây cao su bị nhiễm nhiều loại bệnh. Trong đó đáng kể nhất là bệnh rụng lá Corynespora gây ra bởi nấm C. cassiicola đang được xem là bệnh chính ở các vùng trồng cao su trên thế giới (P. romruensukharom và cộng sự, 2005; Silva và cộng sự, 2003, 2004). Ở Việt Nam hiện nay số lượng dvt bị nhiễm bệnh tăng lên nhiều và cũng đã xuất hiện tại một số công ty cao su tại Đông Nam Bộ. Hiện nay bệnh đang trong giai đoạn tích lũy và có thể...

82p canhchuon_1 20-06-2013 138 23   Download

Nghiên cứu này được tiến hành tại phòng thí nghiệm Sinh học phân tử - Khoa Công nghệ sinh học, Trường Đại học Nông nghiệp Hà Nội với 60 mẫu giống khoai môn - sọ được thu thập tại các địa phương khác nhau, để đánh giá đa dạng di truyền các mẫu giống khoai môn - sọ với 2 loại chỉ thị DNA là RAPD và SSRs. Sản phẩm PCR của hai chỉ thị này được phân tích bằng phần mềm NTSYSpc 2.1 Kết quả 67 allen được nhân lên đối với 5 chỉ thị RAPD, trong đó có...

6p banhukute 18-06-2013 123 12   Download

Tin Học Sinh Học giao dịch với các thuật toán, cơ sở dữ liệu và hệ thống thông tin, công nghệ web, trí thông minh nhân tạo và lý thuyết tính toán, thông tin và tính toán mềm, phần mềm kỹ thuật, khai thác dữ liệu, xử lý hình ảnh, mô hình hóa và mô phỏng, xử lý tín hiệu, toán học rời rạc......

64p thanhthao567 20-12-2011 237 72   Download

SỬ DỤNG CÁC ENZYME THÔNG DỤNG TRONG SINH HỌC PHÂN TỬ 1. ENZYME GIỚI HẠN (RESTRICTION ENZYME) 2. POLYMERASE (DNA, RNA) 3. NUCLEASE (DNase, RNase) 4. LIGASE 24 MỘT SỐ ENZYME GIỚI HẠN (RE) 25 MỘT SỐ ENZYME GIỚI HẠN (RE) 26 CÁC ENDO- & EXONUCLEASE Loại enzyme Cơ chất Vị trí nhận biết và cắt trên DNA, RNA 27 LẬP BẢN ĐỒ CẮT GIỚI HẠN (RESTRICTION MAP) Trình tự DNA cần nghiên cứu được cắt với nhiều RE, theo các tổ hợp cắt đơn, cắt phối hợp. Các sản phẩm cắt sau đó được phân tích bằng điện di và xử lý với các phần mềm vi tính để xây...

7p thachthaoxanh 23-08-2011 179 46   Download

Khai thác dữ liệu trên mạng Internet: Nguyên tắc cơ bản về tìm kiếm thông tin trên Internet. Giới thiệu về CSDL sinh học lớn trên mạng Internet. Khai khác các phần mềm trực tuyến: Blast (tìm kiếm trình tự tương đồng), ORFfinder (tìm khung đọc mở) của NCBI.

42p ngovanquang12c3 17-12-2010 429 167   Download

Các phần mềm phân tích hình ảnh đóng góp vai trò thiết yếu trong việc khai thác và phân tích dữ liệu hình ảnh trong các thí nghiệm điện di protein 2 chiều. Những phát kiến mới đây trong kỹ thuật phân tích hình ảnh cùng với sự tăng tốc của các thiết bị phần cứng đã cho phép chuẩn hóa những phân tích và có thể ứng dụng ở những thí nghiệm với quy mô lớn.

5p heoxinhkute7 10-12-2010 276 60   Download

Mục tiêu của bài học: Thiết kế được những trình tự primer cho những trình tự DNA khuôn (vi sinh vật, virus và các động vật khác); phân tích được những thông số của primer qua các phần mềm. PCR là một kỹ thuật duy nhất để khuếch đại một mẫu DNA mong muốn khuếch đại( ví dụ những đoạn gene của vi sinh vật, vi khuẩn hay những đoạn gene của người và những động vật khác).

47p vuminhduong_88 13-07-2010 818 140   Download

Đối với nhau theo một thứ tự tuyến tính bất kỳ (poly-peptide chains)... nhanh và mạnh thế nào, được nối ghép, dịch chuyển, và. thay đổi nhanh thế nào, etc.Khai thác dữ liệu trên mạng Internet: Nguyên tắc cơ bản về tìm kiếm thông tin trên Internet. Giới thiệu về CSDL sinh học lớn trên mạng Internet. Khai khác các phần mềm trực tuyến: Blast (tìm kiếm...

31p hongle 24-06-2009 808 388   Download