Phân tích dữ liệu biểu hiện gen

Bài viết Dấu ấn gen của Lichen phẳng miệng qua phân tích dữ liệu phiên mã trình bày các nội dung: Biểu hiện gen của dữ liệu phiên mã; Phân tích gen biểu hiện khác biệt; Kết quả phân tích các DEG trong mỗi bộ dữ liệu và các DEG trùng lặp giữa các tập dữ liệu.

7p vifilm 11-10-2024 4 1   Download

Bài viết phân tích dữ liệu microarray từ bộ dữ liệu GSE62350 được thực hiện trên chuột ở một số điều kiện khác nhau nhằm khảo sát các đặc điểm biểu hiện mRNA của gen Mest và các gen liên quan đến quá trình tăng sinh và mở rộng mô mỡ.

6p viberbers 09-08-2023 8 3   Download

Bài viết này sẽ hệ thống lại một cách khoa học các kiến thức về mô hình hồi quy LASSO và ứng dụng LASSO trong phân tích dữ liệu ung thư vú. Kết quả cho thấy, LASSO hoạt động tương đối tốt trong phân tích mức độ biểu hiện gen và chỉ ra được những gen có liên quan tới gen gây ung thư vú BRC1 là các gen NBR2, AASDH, KIAA2013, VPS25, NBR1, SEC22C, RPL27, CBLN3, KHDRBS1, XRCC2.

8p vimarissamayer 02-06-2022 28 3   Download

Mục tiêu của nghiên cứu này nhằm khai thác mức độ biểu hiện của 52 gen mã hóa MRP chưa rõ chức năng ở sắn dựa trên việc tái phân tích các dữ liệu microarray trong điều kiện xử lý stress phi sinh học.

9p viirenerosenfeld 02-06-2022 23 2   Download

Mục tiêu của nghiên cứu này nhằm xác định các nhóm gen chính có mức độ biểu hiện khác biệt (DEG) tại mẫu rễ trong điều kiện stress hạn và mặn ở cây đậu gà (Cicer arietinum). Bằng cách khai thác các bộ dữ liệu microarray liên quan đến stress hạn và mặn ở đậu gà, tổng cộng 41 DEG (|fold-change| ≥ 15), bao gồm 15 DEG tăng cường biểu hiện mạnh (fold-change ≥ 15) và 26 DEG kìm hãm biểu hiện mạnh (fold-change ≤ -15) đã được sàng lọc ở mẫu rễ trong điều kiện stress hạn và mặn ở cây đậu gà.

8p viginnirometty 04-05-2022 17 2   Download

Nghiên cứu và phân tích dữ liệu lớn về hệ gen sinh vật được ứng dụng trong nhiều lĩnh vực và có tác động lớn đến đời sống xã hội trên quy mô toàn cầu. Nhờ sự ra đời của các công nghệ giải trình tự gen thế hệ mới, hệ gen sinh vật có thể nhanh chóng được xác định. Nhiều quốc gia đã chú trọng đến thúc đẩy và đầu tư cho các hoạt động nghiên cứu và ứng dụng dữ liệu hệ gen. Mời các bạn tham khảo!

18p spiritedaway36 25-11-2021 55 1   Download

Đề tài này trình bày về họ gen mã hóa tiểu phần YA được mô tả và phân tích trên hệ gen tham chiếu của A. hypochondriacus. Các phân tích đặc điểm cấu trúc gen, xây dựng sơ đồ hình cây, dữ liệu protein và đánh giá biểu hiện gen trong các mô, cơ quan đã được thực hiện sử dụng công cụ tin sinh học. Mời các bạn cùng tham khảo!

6p thehungergames 14-08-2021 34 2   Download

Trong bài báo này, theo hướng tiếp cận của Lí thuyết thông tin, chúng tôi đề xuất một mở rộng của độ đo thông tin tương hỗ có điều kiện trong trường hợp nhiều biến. Sau đó, chúng tôi giới thiệu một phương pháp mới sử dụng cả hai độ đo là độ đo thông tin tương hỗ (MI) và độ đo thông tin tương hỗ có điều kiện (CMI) để phát hiện các mối quan hệ giữa các gen, từ đó tái tạo mạng điều khiển gen.

10p tamynhan8 04-11-2020 30 3   Download

Trong bài báo này, chúng tôi trình bày một hướng tiếp cận mới dựa trên các thuật toán biclustering (phân cụm hai chiều) để tìm các mẫu quan trọng từ lượng lớn dữ liệu biểu hiện gen. Cụ thể, chúng tôi giới thiệu thuật toán dựa trên cây hậu tố CCC-biclustering, sau đó thực nghiệm trên hai tập dữ liệu biểu hiện gen theo thời gian.

13p tamynhan8 04-11-2020 25 2   Download

Bài viết cung cấp một số dữ liệu phân tử về cơ chế xâm nhiễm tiềm năng của M. oryzae dựa trên việc phân tích và khai thác dữ liệu biểu hiện của các gen mã hóa cho enzyme polysaccharide monooxygenases (PMO) và các gen liên quan tới quá trình hình thành thể bám.

8p viirene2711 01-10-2020 26 0   Download

Mucopolysaccharidosis týp I là một bệnh di truyền gen lặn rất hiếm gặp do thiếu hụt enzym α-L-iduronidase cần thiết của lysosom để giáng hóa dermatan sulfate và heparan sulfate. Mục tiêu: mô tả đặc điểm lâm sàng, phân tích đột biến gen IDUA trên một số bệnh nhi mắc mucopolysaccharidosis týp I tại Bệnh viện Nhi Trung ương. Đối tượng và phương pháp: 5 bệnh nhân mucopolysaccharidosis týp I được chẩn đoán dựa trên phân tích các dữ liệu lâm sàng và hoạt độ enzym. 3 bệnh nhân được phân tích gen.

9p chauchaungayxua1 02-12-2019 31 3   Download

Cơ sở dữ liệu về trình tự promoter đã chứng minh trình tự ADN đích CCTCCTCC có mặt phổ biến trong các promoter cảm ứng với điều kiện stress của các gen chức năng liên quan đến stress như hạn, mặn và lạnh. Ngoài ra, các nghiên cứu phân tích chức năng của hai promoter cảm ứng với stress cho thấy promoter JRC0332 biểu hiện đặc trưng trong điều kiện lạnh và promoter JRC0528 biểu hiện trong điều kiện mặn, hạn, lạnh và có mặt ABA. Cả hai promoter này đều có chứa trình tự đích.

9p trinhthamhodang 24-10-2019 31 2   Download

Trong bài viết này, chúng tôi đã tìm được 121 protein giàu Met (AtMRP) từ cơ sở dữ liệu genome của cây Arabidopsis thaliana, trong đó, khoảng 50% số gen là chưa được xác định chức năng. Dựa trên các nghiên cứu trước đây về biểu hiện của gen trong điều kiện bất lợi, chúng tôi đã xác định được 23 và 16 gen AtMRP có mức độ phiên mã tăng và giảm tương ứng trong điều kiện hạn, 11 và 17 gen có mức biểu hiện tăng và giảm khi xử lý mặn.

9p jangni 16-04-2018 76 3   Download