Kích thước bộ gen

Chia sẻ: Nguyễn Thị Phương Anh | Ngày: | Loại File: PDF | Số trang:6

Thêm vào BST

Báo xấu

218
lượt xem 14
download

Download Vui lòng tải xuống để xem tài liệu đầy đủ

Kích thước bộ gen Các bộ gen của một sinh vật là tập hợp của các gen quy định cụ thể như thế nào kiểu hình của nó sẽ phát triển (theo một tập hợp các điều kiện môi trường). Trong ý nghĩa này, sau đó, lưỡng bội sinh vật (như chúng ta) có chứa hai bộ gen, một thừa hưởng từ mẹ của chúng tôi, một người khác từ người cha của chúng tôi.

Chủ đề:

Bình luận(0) Đăng nhập để gửi bình luận!

Lưu

Nội dung Text: Kích thước bộ gen

Kích thước bộ gen Các bộ gen của một sinh vật là tập hợp của các gen quy định cụ thể như thế nào kiểu hình của nó sẽ phát triển (theo một tập hợp các điều kiện môi trường). Trong ý nghĩa này, sau đó, lưỡng bội sinh vật (như chúng ta) có chứa hai bộ gen, một thừa hưởng từ mẹ của chúng tôi, một người khác từ người cha của chúng tôi. Bảng dưới đây đưa ra một lựa chọn các kích thước bộ gen của người đại diện trong danh sách đang phát triển nhanh chóng của các sinh vật có bộ gen đã được lập trình tự. Bảng các gen kích cỡ (đơn bội) Base cặp Gen Ghi chú φX174 5,386 11 virus của E. coli Nhân ty thể 16,569 37 Epstein-Barr (EBV) 172,282 80 nguyên nhân bạch cầu đơn nhân Thành viên này ký sinh của Archaea có bộ gen nhỏ nhất Nanoarchaeum 490,885 552 equitans của một sinh vật thật sự chưa tìm thấy. tất cả những gì còn lại của bộ gen nucleomorph của hạt nhân của một loại tảo 551,264 511 Guillardia theta đỏ (một eukaryote ) chìm từ lâu bởi eukaryote khác Mycoplasma 580,073 485 genitalium hai trong số những sinh vật nhỏ nhất đúng Mycoplasma 816,394 680 pneumoniae vi khuẩn này gây ra các bệnh Chlamydia 1,042,519 936 truyền qua đường tình dục phổ trachomatis biến nhất ( STD ) tại Hoa Kỳ vi khuẩn gây bệnh sốt phát ban Rickettsia prowazekii 1,111,523 834 dịch bệnh Treponema pallidum 1,138,011 1,039 vi khuẩn gây bệnh giang mai
Một virus (của một amip) với một Mimivirus 1,181,404 1,262 bộ gen lớn hơn so với sáu sinh vật di động trên genome nhỏ nhất được tìm thấy Pelagibacter ubique 1,308,759 1,354 trong một sống tự do sinh vật (biển α-proteobacterium ) Borrelia burgdorferi 1,44 x 10 6 1,738 vi khuẩn gây bệnh Lyme [ Lưu ý ] thường xuyên gây ra ngộ độc thực Campylobacter jejuni 1,641,481 1,708 phẩm Chánh nguyên nhân gây ra viêm Helicobacter pylori 1,667,867 1,589 loét dạ dày (không phải căng thẳng và chế độ ăn uống) Thermoplasma 1,564,905 1,509 Những vi sinh vật đơn bào như vi acidophilum khuẩn điển hình nhưng gen của họ Methanococcus 1,664,970 1,783 như vậy là khác với cả vi khuẩn và jannaschii sinh vật nhân chuẩn mà họ được Aeropyrum pernix 1,669,695 1,885 phân loại trong một vương quốc thứ ba: Archaea . Methanobacterium 1,751,377 2,008 thermoautotrophicum Haemophilus 1,830,138 1,738 vi khuẩn gây nhiễm trùng tai giữa influenzae Streptococcus 2,160,837 2,236 các phế cầu khuẩn pneumoniae Nhóm A; nguyên nhân dịch bệnh thường xuyên của bệnh viêm Neisseria meningitidis 2,184,406 2,185 màng não ở những nước kém phát triển. Nhóm B, là nguyên nhân thường Neisseria meningitidis 2,272,351 2,221 gặp nhất của viêm màng não ở Mỹ Encephalitozoon (Cộng thêm 69 gene RNA), một 2,507,519 1,997 cuniculi ký sinh eukaryote . Propionibacterium 2,560,265 2,333 nguyên nhân gây mụn trứng cá acnes Listeria 2853 của các protein này mã hóa; 2,944,528 2,926 monocytogenes các RNA phần còn lại Deinococcus 3,284,156 3,187 trên 2 nhiễm sắc thể và 2 plasmid,
radiodurans vi khuẩn lưu ý khả năng chống chịu thiệt hại bức xạ một biển cyanobacterium ("màu Synechocystis 3,573,470 4,003 xanh-màu xanh lá cây tảo") trong 2 nhiễm sắc thể, gây ra bệnh Vibrio cholerae 4,033,460 3,890 tả Mycobacterium 4,411,532 3,959 nguyên nhân gây bệnh lao tuberculosis Mycobacterium leprae 3,268,203 1,604 nguyên nhân gây bệnh phong Bacillus subtilis 4,214,814 4,779 vi khuẩn khác 4290 của các gen này mã hóa E. coli K-12 4,639,221 4,377 protein, các RNA phần còn lại căng thẳng đó là gây bệnh cho E. coli O157: H7 5,44 x 10 6 5,416 người; có 1.346 gen không tìm thấy trong E. coli K-12 Vector hữu ích để làm cho cây Agrobacterium 4,674,062 5,419 biến đổi gen ; cổ phiếu nhiều gen tumefaciens với meliloti Sinorhizobium + 2 plasmid với 372 gene hoạt Salmonella enterica 4,809,037 4,395 động, nguyên nhân gây bệnh var Typhi thương hàn Salmonella enterica + 1 plasmid với 102 gene hoạt 4,857,432 4,450 var Typhimurium động trên 1 nhiễm sắc thể + 3 plasmid; Yersinia pestis 4,826,100 4,052 gây bệnh dịch hạch Phân hạch nấm Schizosaccharomyces 12,462,637 4,929 men. Một eukaryote với gen ít pombe hơn so với bốn vi khuẩn dưới đây. đất cho các nhà máy vi khuẩn gây Ralstonia 5,810,922 5,129 bệnh nhiều; 1681 của các gen của solanacearum nó vào một plasmid lớn Pseudomonas Ngày càng phổ biến gây ra các 6,3 x 10 6 5,570 aeruginosa nhiễm trùng cơ hội ở người. Một xạ khuẩn có thân nhân cung Streptomyces 6,667,507 7,842 cấp cho chúng tôi nhiều thuốc coelicolor kháng sinh
Các vật cộng sinh sinh cố định Sinorhizobium đạm của cỏ linh lăng. Bộ gen bao 6,691,694 6,204 meliloti gồm một nhiễm sắc thể và 2 plasmid lớn. Saccharomyces Nấm men nảy chồi. Một 12,495,682 5,770 cerevisiae eukaryote. Cyanidioschyzon 16,520,305 5,331 Một đơn bào tảo đỏ . merolae Plus 53 RNA gen. Nguyên nhân Plasmodium 22,853,764 5,268 dạng nguy hiểm nhất của bệnh sốt falciparum rét. Thalassiosira Một tảo cát . 144 Plus lạp lục và 34,5 x 10 6 11,242 pseudonana 40 loại protein mã hóa gene ti thể Neurospora crassa 38,639,769 10,082 498 Plus RNA gen. Sinh vật đơn bào này tự do sống cuộc sống như amoeboid một cả hai và tạo thành một flagellated. 4133 của các gen của nó cũng được tìm thấy ở sinh vật nhân chuẩn khác cho thấy rằng họ đã có mặt trong Naegleria gruberi 41 x 10 6 15,727 tổ tiên chung của tất cả các sinh vật nhân chuẩn . Sự đa dạng về chức năng mã hóa bởi các gene cũng cho rằng tổ tiên chung của tất cả các sinh vật nhân chuẩn tự nó đã phức tạp như nhiều ngày nay các thành viên đơn bào. Caenorhabditis Việc đầu tiên metazoan được lập 100,258,171 21,733 elegans trình tự. ~ một thực vật có hoa ( thực vật hạt Arabidopsis thaliana 115,409,949 28.000 kín ) Xem lưu ý. Drosophila ~ 122,653,977 các "ruồi" melanogaster 17.000 Anopheles gambiae 278,244,063 13,683 Vector muỗi sốt rét . Mặc dù Tetraodon dường như có Tetraodon nigroviridis 3,42 x 10 8 27,918 nhiều gen mã hóa protein hơn so (một cá nóc) với chúng tôi, nó đã ít hơn
nhiều "rác" DNA vì vậy tổng số bộ gen của nó là khoảng một phần mười kích thước của chúng ta. Gạo 3,9 x 10 8 28,236 ~ Con hải đởm 8,14 x 10 8 23.300 Cá ngựa vằn 1,2 x 10 9 15,761 Chó 2,4 x 10 9 19,300 ~ Con người 3,3 x 10 9 [ Liên kết để biết thêm chi tiết. ] 21.000 ~ Chuột 3,4 x 10 9 23.000 Động vật lưỡng cư 10 9 -10 11 ? Psilotum nudum 2,5 x 10 11 ? Lưu ý Lưu ý: Tổng gen cho Borrelia burgdorferi là dựa trên 853 gene trên nhiễm sắc thể đơn của nó (trong 910.724 cặp cơ sở) cộng với 430 gen vào ngày 11 trong số 17 plasmid nó chứa. Arabidopsis thaliana là một nhà máy (trong gia đình mù tạc) có bộ gen nhỏ nhất được biết đến trong vương quốc thực vật và vì lý do này đã trở thành một yêu thích của các phân tử sinh học thực vật. Mặc dù Psilotum nudum (đôi khi được gọi là "đánh kem dương xỉ") là một nhà máy đến nay đơn giản hơn so với cây Arabidopsis (nó không có lá thật, hoa, hoặc trái cây), nó có 3000 lần DNA nhiều. Không ai biết tại sao, nhưng 80% trở lên của nó được lặp đi lặp lại DNA không chứa thông tin di truyền. Đây cũng là trường hợp đối với một số động vật lưỡng cư, trong đó có 30 lần như DNA nhiều như chúng tôi nhưng chắc chắn không phải 30 lần như phức tạp. Tổng số lượng DNA trong bộ gen đơn bội được gọi là của nó C giá trị . Việc thiếu một mối quan hệ phù hợp giữa giá trị C và phức tạp của một sinh vật (ví dụ, động vật lưỡng cư so với động vật có vú) được gọi là nghịch lý giá trị C . Có bao nhiêu gen hiện nó đi để làm cho một sinh vật?
Các nhà khoa học tại Viện Nghiên cứu gen (nay là J. Craig Venter Institute) đã xác định các genitalium Mycoplasma đã theo trình tự làm việc này bằng cách phá hủy hệ thống gen của nó (bằng cách biến đổi chúng với phần thêm vào ) để xem những cái cần thiết cho cuộc sống và đó là có thể bỏ. Trong số 485-gen mã hóa protein, họ đã kết luận rằng chỉ có 381 trong số đó là thiết yếu cho cuộc sống.