XÁC ĐỊNH KIỂU GEN SIÊU VI VIÊM GAN B TRÊN BỆNH NHÂN XƠ GAN
lượt xem 10
download
Đặt vấn đề: Cấu trúc phân tử của siêu vi viêm gan B (SVVGB) được khảo sát nhằm tìm hiểu mối liên quan giữa kiểu gen siêu vi với những biểu hiện lâm sàng khác nhau của bệnh. Mục tiêu: Khảo sát tỉ lệ nhiễm các kiểu gen siêu vi viêm gan B trong nhóm bệnh nhân xơ gan và tìm hiểu sự liên quan giữa các kiểu gen với độ tuổi, giới và men gan. PHƯƠNG PHÁP: dựa vào sự hiện diện của HBV DNA trong mẫu bệnh phẩm, chúng tôi ứng dụng kỹ thuật Multiplex PCR để...
Bình luận(0) Đăng nhập để gửi bình luận!
Nội dung Text: XÁC ĐỊNH KIỂU GEN SIÊU VI VIÊM GAN B TRÊN BỆNH NHÂN XƠ GAN
- XÁC ĐỊNH KIỂU GEN SIÊU VI VIÊM GAN B TRÊN BỆNH NHÂN XƠ GAN Tóm tắt Đặt vấn đề: Cấu trúc phân tử của siêu vi viêm gan B (SVVGB) được khảo sát nhằm tìm hiểu mối liên quan giữa kiểu gen siêu vi với những biểu hiện lâm sàng khác nhau của bệnh. Mục tiêu: Khảo sát tỉ lệ nhiễm các kiểu gen siêu vi viêm gan B trong nhóm bệnh nhân xơ gan và tìm hiểu sự liên quan giữa các kiểu gen với độ tuổi, giới và men gan. PHƯƠNG PHÁP: dựa vào sự hiện diện của HBV DNA trong mẫu bệnh phẩm, chúng tôi ứng dụng kỹ thuật Multiplex PCR để xác định kiểu gen của siêu vi viêm gan B. Kết Quả: có một trường hợp nhiễm kiểu gen A (1,82%), 39 trường hợp nhiễm kiểu gen B (70,91%), 13 trường hợp nhiễm kiểu gen C (23,64%), 1 trường hợp tái tổ hợp hai kiểu gen B và C (1,82%), một trường hợp chưa xác định được kiểu gen, và không có trường hợp nào là kiểu gen D, E hoặc F cả. Như vậy tỉ số kiểu gen C/ kiểu gen B là 1/3. Khảo sát sự phân bố kiểu gen B và C theo phái thì thấy không có khác biệt. Kiểu gen B xuất hiện nhiều nhất ở độ tuổi 41 – 60, còn kiểu gen C thì xuất hiện nhiều nhất ở độ
- tuổi 51 – 60. Ngoài ra, người nhiễm kiểu gen B còn có men ALT cao hơn người nhiễm kiểu gen C với P = 0,085 nếu chọn ngưỡng là P < 0,1. Kết Luận: Kiểu gen B của siêu vi viêm gan B là kiểu gen xuất hiện nhiều hơn cả trong nhóm bệnh nhân xơ gan và người nhiễm kiểu gen B thường có men ALT cao hơn người nhiễm kiểu gen C. ABSTRACT Background: The molecular structure of hepatitis B virus (HBV) has been identified to investigate the relation between genotypes and different clinical outcomes of the disease. Objective: to establish the rate of HBV genotype infection among cirrhotic patients and to establish the relation between genotypes and age, sex and liver enzymes. Method: based on the presence of HBV DNA in the samples o f cirrhotic patients, we applied Multiplex PCR to identify genotypes of hepatitis B virus. Results: there were one patient infected with genotype A (1.82%), 39 patients infected with genotype B (70.91%), 13 patients infected with genotype C (23.64%), 1 patient infected with B and C recombinant, 1 undetermined case and no patients infected with genotypes D, E or F were
- found. Between genotype B and C, there was no significant difference in gender. The rate of genotype B was highest from the age of 41 to 60, while that of genotype C was highest from 51 to 60. Besides, patients infected with genotype B had higher level of ALT than patients infected with genotype C with P = 0.085 if we choose P < 0.1. Conclusion: HBV genotype B is the most common genotype among cirrhotic patients and patients infected with genotype B often have higher level of ALT than patients infected with genotype C. ĐẠI CƯƠNG Trong hơn một thập niên qua, đã có nhiều nghiên cứu về cấu trúc phân tử của siêu vi viêm gan B (SVVGB) nhằm tìm hiểu mối liên quan giữa cấu trúc siêu vi với những biểu hiện lâm sàng khác nhau của bệnh. Các bệnh cảnh lâm sàng nhiễm SVVGB rất thay đổi, chúng phụ thuộc một mặt nào đó vào độ tuổi của bệnh nhân và sự đáp ứng miễn dịch, mặt khác thì phụ thuộc vào chủng siêu vi gây nhiễm cho ký chủ. Cho đến nay người ta đã ghi nhận có 8 kiểu gen của SVVGB dựa vào sự khác biệt trên 8% của trình tự nucleotid, được đặt tên từ A đến H, và được phân bố theo những vị trí địa lý khác nhau trên thế giới. Kiểu gen A hiện diện ở Bắc Mỹ, Bắc Âu, Trung Phi và An độ. Kiểu gen B hiện diện ở Trung quốc, Indonesia, Nhật, Đài Loan và Việt nam. Kiểu gen C hiện diện ở Trung quốc, Hàn quốc, Nhật, Việt nam và
- Nam Thái Bình Dương. Kiểu gen D hiện diện ở Địa Trung Hải, Trung đông, An độ, Bắc Mỹ, Tây Ban Nha và Nga. Kiểu gen E hiện diện ở Tây và Nam châu Phi. Kiểu gen F hiện diện ở Nam và Trung Mỹ, Polynesia và ở Mỹ nhưng hiếm. Kiểu gen G được phát hiện ở châu Âu và ở Mỹ (hiếm). Kiểu gen H được phát hiện ở Trung Mỹ và ở Nhật (hiếm)(10,17). Hai kiểu gen sau cùng, G và H là hai kiểu gen được phát hiện gần đây nhất (4, 10, 13). Hai kiểu gen SVVGB hiện diện nhiều nhất ở Đông Nam Á là kiểu gen B và kiểu gen C. Trong nghiên cứu này, chúng tôi tìm hiểu về sự phân bố các kiểu gen của SVVGB trên những bệnh nhân bị xơ gan do nhiễm SVVGB và sự liên quan giữa các kiểu gen này với độ tuổi, phái và hoạt tính transaminase. VẬT LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP Đây là một nghiên cứu cắt ngang, với số mẫu khảo sát gồm 55 mẫu huyết thanh của những bệnh nhân bị xơ gan nhập viện tại Bệnh viện Bệnh Nhiệt đới TP Hồ Chí Minh hoặc khám tại Bệnh viện Đại học Y Dược TP Hồ Chí Minh trong khoản thời gian từ tháng 6/2005 đến tháng 8/2006, dựa trên tiêu chuẩn bệnh nhân có HBsAg dương tính có hội chứng suy tế bào gan và hội chứng tăng áp lực tĩnh mạch cửa, có hình ảnh siêu âm xơ gan. Ly trích ADN của siêu vi viêm gan B (HBV DNA) bằng guanidine thiocyanate, ethanol 70% và aceton, định tính HBV DNA bằng PCR(12), và
- sau đó ứng dụng kỹ thuật PCR tổ và Multiplex PCR đã được mô tả bởi Naito, 2001(8) để định kiểu gen. Sản phẩm PCR được chạy điện di trên thạch agarose 2% nhuộm với ethidium bromide và đọc kết quả với ánh sáng của đèn cực tím. Kích thước của các đoạn ADN đặc hiệu dựa vào chứng dương và một thang ADN chuẩn có những vạch cách nhau 100 đôi base (bp). Kích thước đoạn đặc hiệu của mỗi kiểu gen như sau: kiểu gen A 68 bp, kiểu gen B 281 bp, kiểu gen C 122 bp, kiểu gen D 119 bp, kiểu gen E 167 bp, kiểu gen F 97 bp. KẾT QUA Các dữ liệu được nhập và xử lý theo chương trình Stata 9. Tổng số mẫu khảo sát là 55 mẫu, trong đó nữ là 17 (tỉ lệ 31%) và nam là 38 (tỉ lệ 69%). Tỉ số nam / nữ là 38/17 = 2,24. Tuổi trung bình bị xơ gan là 51 + 12,32. Khảo sát bệnh nhân bị xơ gan theo độ tuổi, kết quả được ghi nhận như sau: N % Độ tuổi 25 – 2 3,6%
- 30 10 18,2% 31 – 13 23,6% 40 18 32,7% 41 – 9 16,4% 50 3 5,5% 51 – 60 61 – 70 > 70 Tổng 55 100% Như vậy, tuổi bị xơ gan nhiều nhất là trong khoản 51 – 60 tuổi. Trong 55 mẫu có HBV DNA dương tính trên, chúng tôi thực hiện PCR tổ và multiplex PCR để xác định kiểu gen. Kết quả được minh họa ở hình 1.
- Hình 1. Kết quả điện di kiểu gen SVVGB trên một số bệnh nhân xơ gan. Giếng M: thang ADN; A, B, C: các chứng dương kiểu gen A, kiểu gen B và kiểu gen C; mẫu 28, 31, 33 – 38: kiểu gen B; mẫu 29, 30, 32: kiểu gen C. Kết quả trên 55 bệnh nhân được ghi nhận như sau: Kiểu N % gen A 1 1,82%
- B 39 70,91% C 13 23,64% Tái tổ 1 1,82% hợp B,C D, E 0 0% hoặc F Chưa 1 1,82% xác định được Tổng 55 100% Như vậy kiểu gen A chỉ có một trường hợp và kiểu gen B thì nhiều nhất (70,91%). Có một trường hợp tái tổ hợp 2 kiểu gen B và C. Không phát hiện được kiểu gen nào là D, E, F cả. Và tỉ số kiểu gen C/B là 13/39 = 1/3, nghĩa là kiểu gen B xuất hiện nhiều gấp 3 lần kiểu gen C. Vì kiểu gen B và C chiếm đa số, nên chúng tôi tập trung khảo sát tiếp trên hai kiểu gen này và trên số bệnh nhân là 52 bệnh nhân. So sánh sự phân bố kiểu gen B và C theo phái, chúng tôi ghi nhận:
- Kiểu gen Tổng cộng B C Nư Phái N 12 3 15 % 30,77% 23,08% 28,85% theo kiểu gen Nam N 27 10 37 % 69,23% 76,92% 71,15% theo kiểu gen Tổng cộng N 39 13 52
- % 100% 100% 100% theo kiểu gen Nhận xét: sự phân bố kiểu gen B ở bệnh nhân nữ là 30,77%, ở bệnh nhân nam là 69,23%; sự phân bố kiểu gen C ở bệnh nhân nữ là 23,08%, ở bệnh nhân nam là 76,92%. Sự phân bố kiểu gen B và C theo phái không có gì khác biệt (P = 0,733). Khảo sát sự phân bố các kiểu gen B, C theo độ tuổi: Kiểu gen Tổng cộng B C N 2 0 2 Độ tuổi % 5,13% 0% 3,85% 25 theo - 30 kiểu gen
- N 7 2 9 % 17,95% 15,38% 17,31% 31 theo - 40 kiểu gen N 2 12 10 % 25,64% 15,38% 23,08% 41 theo - 50 kiểu gen N 17 10 7 % 25,64% 53,85% 32,69% 51 theo - 60 kiểu gen N 7 2 9 61
- - 70 % 17,95% 15,38% 17,31% theo kiểu gen N 3 0 3 % 7,69% 0% 5,77% > theo 70 kiểu gen N 39 13 52 % 100% 100% 100% Tổng cộng theo kiểu gen Nhận xét: kiểu gen B xuất hiện nhiều nhất ở độ tuổi 41 – 60, còn kiểu gen C thì xuất hiện nhiều nhất ở độ tuổi 51 - 60. Khi phân bệnh nhân xơ gan làm 2 nhóm tuổi, nhóm bệnh nhân trẻ (< 40 tuổi) và nhóm bệnh nhân lớn tuổi (> 40 tuổi) thì sự phân bố kiểu gen như sau:
- Kiểu gen Tổng cộng B C Nhóm < N 9 2 11 40 tuổi % 23,08 15,38 21,15 theo kiểu gen N 41 > 30 11 40 % 76,92 84,62 78,85 theo kiểu gen Tổng cộng N 39 13 52
- % 100% 100% 100% theo kiểu gen Nhận xét: Cả hai kiểu gen B và C đều xuất hiện ở bệnh nhân xơ gan trên 40 tuổi nhiều hơn bệnh nhân trẻ. Khảo sát hoạt độ men gan Kiểu Trung Độ gen bình (IU/L) lệch chuẩn ALT B 129 135 C 63 87 AST B 145 167 C 127 90 Những người nhiễm kiểu gen B có ALT trung bình là 135 ± 129 IU/L, và AST trung bình là 145 ± 167 IU/L, trong khi những người nhiễm kiểu gen C có ALT trung bình là 87 ± 63 IU/L, và AST trung bình là 127 ± 90
- IU/L. Người nhiễm kiểu gen B có men ALT cao hơn người nhiễm kiểu gen C với P = 0,085 nếu chọn ngưỡng là P< 0,1. BÀN LUẬN Trên thế giới gần đây đã có một số công trình nghiên cứu về sự liên quan giữa các kiểu gen SVVGB với bệnh cảnh xơ gan, cụ thể như sau: Kiểu gen C thường gặp ở bệnh nhân xơ gan hơn so với người lành mang bệnh cùng độ tuổi(5). Tần suất bệnh nhân nhiễm kiểu gen C bị xơ hóa và xơ gan thì cao hơn so với bệnh nhân nhiễm kiểu gen B(5,9,16). Kiểu gen SVVGB có ảnh hưởng đến sự phát triển của viêm gan mạn sang xơ gan; ở bệnh nhân có kiểu gen B thì sự phát triển từ viêm gan mạn sang xơ hóa và xơ gan xảy ra ít hơn so với kiểu gen C(6,9). Mặc dù bệnh nhân nhiễm kiểu gen B phát triển đến xơ hóa chậm hơn và có chuyển đổi huyết thanh sớm hơn bệnh nhân nhiễm kiểu gen C nhưng nguy cơ suốt đời phát triển đến xơ hóa và ung thư gan thì không có khác biệt so với kiểu gen C(16,19). Nghiên cứu của chúng tôi trên 55 bệnh nhân xơ gan là một nghiên cứu cắt ngang, mục đích tìm hiểu sự hiện diện của các kiểu gen và tần suất của các kiểu gen này, đồng thời tìm hiểu sự liên quan giũa kiểu gen SVVGB với tuổi, phái và men transaminase, do đó chúng tôi không theo dõi được từ đầu quá trình phát triển đến xơ gan của những bệnh nhân nhiễm SVVGB.
- Về sự xuất hiện của kiểu gen A, có một trường hợp trên 55 trường hợp, tỉ lệ là 1,82%. Theo y văn thế giới thì kiểu gen A xuất hiện ở Bắc Mỹ, Bắc Âu, Trung Phi và An độ. Tuy nhiên, một số nghiên cứu trên người Việt nam vẫn có thấy xuất hiện kiểu gen A, như trong nghiên cứu của Lê H. Song thực hiện bằng phương pháp PCR – RFLP để phát hiện kiểu gen trên bệnh nhân xơ gan ở khu vực miền Bắc(7) thì có đến 10/92 bệnh nhân mang kiểu gen A, tỉ lệ là 10,8%, tức là nhiều hơn nghiên cứu của chúng tôi. Nguyễn Thị Chí Mỹ với phương pháp multiplex PCR cũng đã phát hiện trong số 37 trường hợp có 2 trường hợp nhiễm kiểu gen A (5,4%) và bệnh nhân là những người bị viêm gan siêu vi B mãn tính(3). Bùi Hữu Hoàng với phương pháp INNO – LiPA cũng thấy có một trường hợp mang kiểu gen A trong số 25 người lành mang HBsAg mãn tính(2). Như vậy, bằng những phương pháp khác nhau và những bệnh cảnh lâm sàng khác nhau vẫn thấy xuất hiện kiểu gen A với một số lượng rất thấp ở bệnh nhân Việt nam. Trong nghiên cứu này, tần suất kiểu gen B thì cao hơn tần suất kiểu gen C (70,91% so với 23,64%). Nghiên cứu của Lê H. Song trên bệnh nhân xơ gan ở khu vực miền Bắc là 8/92 (8,7%) bệnh nhân nhiễm kiểu gen B và 13/92 bệnh nhân (14,1%) bệnh nhân nhiễm kiểu gen C, vậy theo tác giả này trong xơ gan thì kiểu gen C là nhiều hơn kiểu gen B(7). Còn trong một nghiên cứu của Bùi Hữu Hoàng năm 2003, trong 24 bệnh nhân xơ gan nhập viện tại
- bệnh viện Chợ rẫy thì có một bệnh nhân không xác định được kiểu gen, 10 bệnh nhân nhiễm kiểu gen B và 13 bệnh nhân nhiễm kiểu gen C(2). So kết quả của chúng tôi với nghiên cứu này chúng tôi có nhận xét như sau: Kiểu gen Kiểu Không Tổng B gen C định, số mẫu xác hoặc kiểu gen A, hoặc tái tổ hợp Bùi 10 13 1 24 Hữu Hoàng (42%) (54%) (4%) Chúng 13 3 55 39 tôi (23,64%) (5,46%) (70,91%) Như vậy, với số lượng mẫu của chúng tôi là nhiều hơn, chúng tôi đã xác định được kiểu gen B là kiểu gen chiếm ưu thế ở bệnh nhân xơ gan khu vực miền Nam. Trong một nghiên cứu khác của Kao năm 2000 tại Đài Loan thì trong 30 bệnh nhân bị xơ gan, có 9 bệnh nhân bị nhiễm kiểu gen B (30%) và 18 bệnh nhân bị nhiễm kiểu gen C (60%)(5). Trong nghiên cứu của Orito năm
- 2001 tại Nhật thì trong 29 bệnh nhân bị xơ gan, có 12 bệnh nhân bị nhiễm kiểu gen B và 112 bệnh nhân bị nhiễm kiểu gen C(11). Vậy ở Đài Loan cũng như ở Nhật, tỉ lệ bệnh nhân xơ gan có kiểu gen C thì cao hơn so với nghiên cứu của chúng tôi. Nhận xét về một trường hợp tái tổ hợp kiểu gen B và C được phát hiện trong nghiên cứu của chúng tôi, thì theo y văn cũng có xác nhận một số trường hợp tái tổ hợp B và C (7, 15, 20). KẾT LUẬN Theo nghiên cứu của chúng tôi: 1. Trong xơ gan do nhiễm SVVGB, có 3 kiểu gen siêu vi được ghi nhận: A, B và C, trong đó tỉ lệ kiểu gen B là cao nhất (70,91%); tỉ số kiểu gen C/B là 1/3. 2. Độ tuổi bị nhiễm nhiều nhất với cả 2 kiểu gen là 51 - 60 tuổi. 3. Trong xơ gan, bệnh nhân nhiễm kiểu gen B thường có men ALT cao hơn bệnh nhân nhiễm kiểu gen C.
CÓ THỂ BẠN MUỐN DOWNLOAD
-
ỨNG DỤNG KỸ THUẬT GIẢI TRÌNH TỰ CHUỖI ĐỂ XÁC ĐỊNH KIỂU GEN VÀ CÁC ĐỘT BIẾN KHÁNG THUỐC CỦA SIÊU VI VIÊM GAN B
19 p | 153 | 17
-
XÁC ĐỊNH KIỂU GEN VÀ CÁC ĐỘT BIẾN KHÁNG THUỐC CỦA SIÊU VI VIÊM GAN B BẰNG KỸ THUẬT GIẢI TRÌNH TỰ CHUỖI
17 p | 134 | 8
-
KIỂU GEN CỦA SIÊU VI VIÊM GAN C Ở VIỆT NAM
21 p | 156 | 5
-
Tỉ lệ phân bố kiểu gene của siêu vi viêm gan C
6 p | 94 | 4
-
Đặc điểm kiểu gen của siêu vi viêm gan B ở bệnh nhân viêm gan siêu vi B mạn tính
5 p | 54 | 4
-
Tỉ lệ khác nhau của kiểu gen siêu vi viêm gan C với 2 vùng giải trình tự khác nhau: 5’NC và NS5B của bệnh nhân Việt Nam tại Trung Tâm Y Khoa MEDIC
11 p | 25 | 4
-
Đánh giá mối liên quan giữa kiểu gen HCV với các đặc điểm cận lâm sàng trên bệnh nhân điều trị tại Trung tâm Bệnh Nhiệt đới, Bệnh viện Hữu nghị đa khoa Nghệ An
4 p | 8 | 2
-
Tần suất phân bố kiểu gene của siêu vi viêm gan C ở người Việt Nam dựa trên giải trình tự NS5B lượng mẫu lớn
4 p | 11 | 2
Chịu trách nhiệm nội dung:
Nguyễn Công Hà - Giám đốc Công ty TNHH TÀI LIỆU TRỰC TUYẾN VI NA
LIÊN HỆ
Địa chỉ: P402, 54A Nơ Trang Long, Phường 14, Q.Bình Thạnh, TP.HCM
Hotline: 093 303 0098
Email: support@tailieu.vn