Cơ sở dữ liệu Gene

Cơ sở dữ liệu tần suất các alen của 15 gen hệ Identifiler từ quần thể người Hoa ở các tỉnh phía Nam chưa từng được khảo sát trước đây, nhưng có ý nghĩa sâu sắc trong khoa học cũng như thực tiễn. Bài viết tập trung phân tích, đánh giá và kết luận giám định, có ý nghĩa cao kể cả về khoa học và thực tiễn.

8p vilarry 12-03-2024 8 2   Download

Bài viết trình bày xác định hộp RpoS và RpoN ở vùng promoter của ổ gen mã hóa cho hệ thống bài xuất số 3 ở Burkholderia pseudomallei (B. pseudomallei) bằng sinh tin học. Đối tượng – phương pháp nghiên cứu: Phần mềm DOOR và phần mềm HMMer 2.3.2. được sử dụng. Trình tự nhóm gene quan tâm và vùng promoter, truy xuất trên cơ sở dữ liệu NCBI.

7p vilarry 12-03-2024 10 1   Download

Bài viết Ứng dụng giải trình tự gene thế hệ mới (NGS) để sàng lọc đa hình nucleotide đơn (SNP) liên quan đến tính trạng tăng trưởng ở tu hài (Lutraria rhynchaen, Jonas 1844) tiến hành giải trình tự gen thế hệ mới và sàng lọc chỉ thị SNP cho hai nhóm tu hài và marker SNP sàng lọc được sẽ cung cấp nguồn cơ sở dữ liệu quan trọng phục vụ cho công tác chọn giống ở tu hài liên quan đến tính trạng tăng trưởng trong thời gian tới.

8p vinebula 02-06-2023 7 2   Download

Nghiên cứu này được thực hiện để xác định chức năng của miR-144-3p thông qua dự đoán đích tiềm năng bằng một số công cụ tin sinh học. Do số lượng gene đích của miRNA rất lớn, trong giới hạn nghiên cứu này, chúng tôi sàng lọc lại còn một gene đích có liên quan đến thoái hoá khớp. Kết quả dự đoán cho thấy ABCA1 có thể là gene mục tiêu của miR-144-3p trong tế bào khớp.

8p viellenkullman 13-05-2022 16 3   Download

Đoạn trình tự ITS1-5,8S-ITS2 của ba mẫu đông trùng hạ thảo G3, Q1 và Q2 được khảo sát lần lượt có 501, 502 và 484 nucleotit. Dựa trên cơ sở dữ liệu gene NCBI cho thấy cả ba mẫu đều thuộc loài nấm đông trùng hạ thảo Cordyceps militaris. Phân tích đặc điểm di truyền của ba mẫu này cho thấy Q1 và Q2 thuộc cùng một nhóm và tách biệt với G3. Trong đó Q2 có đoạn trình tự khuếch đại là ngắn nhất, tỉ lệ GC là cao nhất (59,09 %) và tỉ lệ AT là thấp nhất (40,91%). Bên cạnh sự khác biệt di truyền giữa ba mẫu khảo sát, hàm lượng adenosine và cordycepin của chúng cũng thể hiện sự khác nhau.

8p viwinter2711 18-10-2021 27 4   Download

Dựa trên giả thuyết “các protein có tương tác với nhau thường có chung một số chức năng nào đó”, trong nghiên cứu này, tác giả đưa ra một phương pháp dự đoán chức năng của protein dựa vào mạng tương tác protein và dữ liệu chú giải chức năng trong từ điển genes. Phương pháp của chúng tôi dựa trên các thuật toán phân cụm (clustering) proteins.

14p tamynhan8 04-11-2020 36 2   Download

Bài viết cung cấp một số dữ liệu phân tử về cơ chế xâm nhiễm tiềm năng của M. oryzae dựa trên việc phân tích và khai thác dữ liệu biểu hiện của các gen mã hóa cho enzyme polysaccharide monooxygenases (PMO) và các gen liên quan tới quá trình hình thành thể bám.

8p viirene2711 01-10-2020 25 0   Download

Mục tiêu của luận án là có được cơ sở dự liệu về trình tự peptide tín hiệu của gene α–amylase từ các chủng thuộc chi Bacillus. Tạo được hệ biểu hiện mang trình tự peptide tín hiệu đột biến làm tăng khả năng tiết α-amylase ngoại bào ở chủng Bacillus tái tổ hợp.

181p phongtitriet000 08-08-2019 31 5   Download

Việc hiểu biết một cách đầy đủ và khoa học về thành phần, đặc điểm sinh thái, tập tính hoạt động, thành phần thức ăn, tốc độ sinh trưởng... của một số loài bò sát là một điều rất cần thiết để nâng cao hiệu quả bảo tồn. Tuy nhiên nghiên cứu về bò sát ở đây chưa nhiều, bài báo này công bố nghiên cứu bước đầu về Thành phần loài và đặc điểm phân bố của bò sát ở Vườn Quốc gia Kon Ka Kinh, tỉnh Gia Lai để góp phần cung cấp dẫn liệu và cơ sở khoa học cho việc quản lí, bảo tồn nguồn gene sinh vật.

7p cathydoll1 09-01-2019 81 5   Download

Bài viết So sánh một số thuật toán phân cụm phổ cho dữ liệu biểu diễn Gene trình bày các thuật toán phân cụm phổ là một trong những thuật toán hiệu quả nhất để phân chia các gene thành các nhóm theo mức độ tương tự biểu diễn gene của chúng. Những phân nhóm như thế có thể đề xuất những gene tương ứng tương quan và/hoặc cùng được điều hòa và dẫn đến chỉ ra những gene đó có thể chia sẻ một vai trò sinh học chung,... Mời các bạn cùng tham khảo.

8p lehasiphuong 20-05-2018 67 1   Download

Xác định hoạt tính sinh học của interleukin - 2 (IL - 2) tái tổ hợp bằng phép thử sinh học trên tế bào CTLL2 ứng dụng các kỹ thuật sinh học phân tử trong phân loại, xác định và bảo tồn sự đa dạng nguồn gen các loài động vật, thực vật và vi sinh vật. Xây dựng các cơ sở dữ liệu và cung cấp thông tin trực tuyến về hệ gen học, hệ protein học và tin sinh học.

5p banhnamdua 25-07-2013 65 4   Download

Tạo phôi cá thể khảm bằng cấy chuyển tế bào Ứng dụng các kỹ thuật sinh học phân tử trong phân loại, xác định và bảo tồn sự đa dạng nguồn gen các loài động vật, thực vật và vi sinh vật. Xây dựng các cơ sở dữ liệu và cung cấp thông tin trực tuyến về hệ gen học, hệ protein học và tin sinh học.

7p banhnamdua 25-07-2013 62 4   Download

Một số tính chất hoá lý của lipase ngoại bào chủng Geotrichum sp. DTQ - 26.3 Ứng dụng các kỹ thuật sinh học phân tử trong phân loại, xác định và bảo tồn sự đa dạng nguồn gen các loài động vật, thực vật và vi sinh vật. Xây dựng các cơ sở dữ liệu và cung cấp thông tin trực tuyến về hệ gen học, hệ protein học và tin sinh học.

10p banhnamdua 25-07-2013 75 1   Download

Ứng dụng kỹ thuật real - time PCR để chẩn đoán nhanh cúm A/H5N1 và virus hợp bào đường hô hấp Ứng dụng các kỹ thuật sinh học phân tử trong phân loại, xác định và bảo tồn sự đa dạng nguồn gen các loài động vật, thực vật và vi sinh vật. Xây dựng các cơ sở dữ liệu và cung cấp thông tin trực tuyến về hệ gen học, hệ protein học và tin sinh học.

6p banhnamdua 25-07-2013 119 12   Download

HbA, nằm trên cánh ngắn nhiễm sắc thể 16 (16p13.3) gây ra sự giảm hoặc mất tổng hợp chuỗi alpha globin. Hemoglobin ở người trưởng thành bình thường có 2 chuỗi alpha globin và 2 chuỗi beta globin. Chuỗi alpha globin được tổng hợp từ 4 gen, trong đó có 2 gen HbA1 và 2 genHbA2. Số lượng của alpha globin phụ thuộc vào số gene hoạt động. Người càng có ít gene hoạt động thì càng mắc thể bệnh alpha thalassemia nặng hơn....

7p shift_12 18-07-2013 72 6   Download

Sự phát triển của ngành công nghệ thông tin trong những thập kỷ qua đã góp phần cải thiện chất lƣợng cuộc sống con ngƣời. Máy tính đã có mặt trong hầu hết các ngành khoa học, hỗ trợ con ngƣời giải quyết những công việc khó khăn và nhiều thời gian. Công nghệ sinh học đƣợc xem là ngành khoa học mũi nhọn của thế kỷ XXI. Với sự ra đời của kỹ thuật giải trình tự, nhiều bộ gene của sinh vật đã đƣợc giải mã, tạo ra một lƣợng dữ liệu sinh học khổng lồ. Điều này...

83p canhchuon_1 21-06-2013 99 22   Download

Xác định tất cả các gene của DNA người. Giải kí tự chuỗi của hơn 3 tỉ cặp base(base pair-bp) của DNA người. Lưu giữ thông tin trong cơ sở dữ liệu(data bases). Cải tiến các công cụ cho các phân tích dữ liệu. Chuyển giao kĩ thuật cho khu vực tư nhân. Vạch ra vấn đề đạo đức, luật pháp và xã hội. 1900: Dự án bộ gene người bắt đầu, được hướng dẫn bởi Jame D. Watson và sau này là Francis Collins. 26/06/2000: Công bố bản thảo hành động (working draft). 02/2001: Các phân tích của bản thảo hành động được công bố. 14/04/2003...

37p htc_12 13-05-2013 154 29   Download

Chương 6 KĨ THUẬT SINH HỌC PHÂN TỬ TRONG PHÂN TÍCH HỆ GENE Ở SINH VẬT Tóm tắt: Sinh học phân tử là nòng cốt của công nghệ sinh học. Phân tích sinh học phân tử được bắt đầu từ việc thu nhận dịch chiết ADN từ tế bào sống đủ sạch để thực hiện các phân tích tiếp theo. Tuỳ theo vật liệu nghiên cứu mà có phương pháp tách chiết ADN phù hợp. Dung dịch ADN sau khi kiểm tra hàm lượng và độ sạch được sử dụng để phân tích theo những mục đích khác nhau như Southem...

13p biodoc 30-08-2011 417 138   Download

Kể từ khi bộ gene của Phage Φ-X174 được xác định trình tự (1977) cho đến nay, trình tự DNA của rất nhiều loài sinh vật đã được lưu trữ trong các ngân hàng cơ sở dữ liệu gene. Những dữ liệu này sẽ được phân tích để tìm ra những gene cấu trúc (gene mã hoá cho một protein nào đó), cũng như tìm ra qui luật của những trình tự tương đồng giữa các protein).

6p poseidon05 26-07-2011 119 26   Download

Ngoài ra còn có những trình tự nucleotide giống với một gen đã biết nhưng trình tự đó không được phiên mã hoặc không được dịch mã. Chúng được gọi là giả gen (pseudogen). Một số gen gồm nhiều bản sao giống hệt nhau lặp đi lặp lại liên tục trên một vùng nhiễm sắc thể (tandem repeat genes). Ví dụ, gen mã cho ARNr, ARNt, histone vv... Như vậy, các gen eukaryot có thể phân thành các loại chính như sau: gen đơn lẻ, các gen thuộc một họ gen, gen lặp đi lặp lại liên tục...

19p poseidon02 18-07-2011 195 76   Download