Luận văn Thạc sĩ Khoa học: Phân lập vi khuẩn oxy hóa sắt ưa axit (FOB) phục vụ cho công nghệ tuyển khoáng sinh học

ĐẠI HỌC QUỐC GIA HÀ NỘI<br /> TRƢỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC TỰ NHIÊN<br /> --------------------<br /> <br /> NGUYỄN VĂN HƢNG<br /> <br /> PHÂN LẬP VI KHUẨN OXY HÓA SẮT ƢA AXIT<br /> (FOB) PHỤC VỤ CHO CÔNG NGHỆ<br /> TUYỂN KHOÁNG SINH HỌC<br /> <br /> LUẬN VĂN THẠC SĨ KHOA HỌC<br /> <br /> Hà Nội - 2017<br /> <br /> ĐẠI HỌC QUỐC GIA HÀ NỘI<br /> TRƢỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC TỰ NHIÊN<br /> --------------------<br /> <br /> NGUYỄN VĂN HƢNG<br /> <br /> PHÂN LẬP VI KHUẨN OXY HÓA SẮT ƢA AXIT<br /> (FOB) PHỤC VỤ CHO CÔNG NGHỆ<br /> TUYỂN KHOÁNG SINH HỌC<br /> Chuyên ngành: Vi sinh vật học<br /> Mã số: 60420107<br /> <br /> LUẬN VĂN THẠC SĨ KHOA HỌC<br /> <br /> Ngƣời hƣớng dẫn Khoa học: TS. Đinh Thúy Hằng<br /> PGS. TS. Ngô Tự Thành<br /> <br /> Hà Nội - 2017<br /> <br /> LỜI CẢM ƠN<br /> Qua thời gian hai năm nghiên cứu tại phòng Sinh thái Vi sinh vật - Viện Vi<br /> sinh vật và Công nghệ sinh học - Đại học Quốc gia Hà Nội, đến nay tôi đã hoàn<br /> thành luận án thạc sỹ với tiêu đề ―Phân lập vi khuẩn oxy hóa sắt ưa axit (FOB) để<br /> phục vụ cho công nghệ tuyển khoáng sinh học‖. Tôi đã nhận đƣợc sự giúp đỡ tận<br /> tình chu đáo của các thầy cô giáo, các cán bộ khoa học công tác tại Viện Vi sinh vật<br /> và Công nghệ sinh học và Trƣờng Đại học Khoa Học Tự Nhiên - ĐHQGHN.<br /> Đầu tiên, tôi xin gửi lời cảm ơn sâu sắc tới TS. Đinh Thúy Hằng, trƣởng<br /> phòng Sinh thái Vi sinh vật, Viện Vi sinh vật và CNSH – ĐHQGHN và PGS.TS.<br /> Ngô Tự Thành, cán bộ công tác tại Bộ môn Vi sinh vật học, trƣờng Đại học Khoa<br /> học Tự nhiên – ĐHQGHN là những ngƣời thầy đã trực tiếp hƣớng dẫn, động viên,<br /> giúp đỡ tạo điều kiện cho tôi trong suốt quá trình học tập, nghiên cứu vừa qua.<br /> Tôi xin chân thành cảm ơn Ban lãnh đạo Viện và các cán bộ công tác tại viện<br /> Vi sinh vật và CNSH đã tạo điều kiện cho tôi hoàn thành tốt nghiên cứu của mình.<br /> Tôi cũng vô cùng biết ơn các thầy cô Bộ môn Vi sinh vật học và Khoa Sinh học –<br /> Trƣờng Đại học Khoa học Tự nhiên đã nhiệt tình chỉ bảo, truyền đạt những kiến<br /> thức quý báu và giúp đỡ tôi trong quá trình học tập.<br /> Cuối cùng, tôi xin gửi lời cảm ơn gia đình, bạn bè và các đồng nghiệp tại<br /> Phòng Sinh thái vi sinh vật đã luôn khích lệ, giúp đỡ tôi trong quá trình học tập và<br /> trong cuộc sống.<br /> Tôi xin chân thành cảm ơn!<br /> Hà Nội, ngày<br /> <br /> tháng năm 2017<br /> <br /> Học viên<br /> <br /> Nguyễn Văn Hƣng<br /> <br /> DANH MỤC CÁC TỪ VIẾT TẮT<br /> At. ferridurans<br /> <br /> Acidithiobacillus ferridurans<br /> <br /> At. ferrivorans<br /> <br /> Acidithiobacillus ferrivorans<br /> <br /> At. ferrooxidans<br /> <br /> Acidithiobacillus ferrooxidans<br /> <br /> BacTech<br /> <br /> Bacterial Technology<br /> <br /> BIOX<br /> <br /> Biological Oxidation<br /> <br /> CI<br /> <br /> Chloroform Isoamyl Alcohol<br /> <br /> DGGE<br /> <br /> Denaturing Gradient Gel Electrophoresis<br /> <br /> EDTA<br /> <br /> Ethylenediaminetetraacetic acid<br /> <br /> EDX<br /> <br /> Energy Dispersive X-Ray Analysis<br /> <br /> FEMS<br /> <br /> Federation of European Microbiological Societies<br /> <br /> FISH<br /> <br /> Fluorescence in situ hybridization<br /> <br /> FOB<br /> <br /> Ferrous Oxidizing Bacteria<br /> <br /> HIOX<br /> <br /> High Temperature Bacterial Oxidation<br /> <br /> IAEA<br /> <br /> International Atomic Energy Agency<br /> <br /> MIT<br /> <br /> Massachusetts Institute of Technology<br /> <br /> LE<br /> <br /> Leaching Experiment<br /> <br /> L. ferriphylum<br /> <br /> Leptospirillum ferriphylum<br /> <br /> L. ferrooxidans<br /> <br /> Leptospirillum ferrooxidans<br /> <br /> PBS<br /> <br /> Phosphate-Buffered Saline<br /> <br /> SEM<br /> <br /> Scanning Electron Microscope<br /> <br /> TAE<br /> <br /> Tris-Acetate-EDTA<br /> <br /> DANH MỤC BẢNG<br /> Tên bảng<br /> <br /> Trang<br /> <br /> Bảng 1. 1. Ứng dụng công nghệ bioleaching trên thế giới.<br /> <br /> 3<br /> <br /> Bảng 1. 2. Nồng độ oxy tới hạn cho sự phát triển của At. ferrooxidans<br /> <br /> 11<br /> <br /> ở các nhiệt độ khác nhau.<br /> Bảng 1. 3. Nồng độ giới hạn các kim loại nặng cho sự phát triển của<br /> <br /> 15<br /> <br /> At. ferrooxidans<br /> Bảng 1. 4. Sản lƣợng đồng của Chile và trên thế giới đƣợc khai thác<br /> <br /> 22<br /> <br /> bằng công nghệ tuyển khoáng sinh học<br /> Bảng 1. 5. Ảnh hƣởng của bƣớc tiền xử lý quặng vàng bằng bioleachig<br /> <br /> 23<br /> <br /> tới hiệu suất khai thác tại một số doanh nghiệp khai thác<br /> khoáng sản trên thế giới<br /> Bảng 2. 1. Mồi PCR khuyếch đại các đoạn 16S rDNA dùng trong<br /> <br /> 25<br /> <br /> nghiên cứu<br /> Bảng 2. 2. Thành phần môi trƣờng 9K<br /> <br /> 26<br /> <br /> Bảng 2. 3. Thành phần phản ứng và chu kỳ nhiệt của PCR-DGGE<br /> <br /> 30<br /> <br /> Bảng 2. 4. Phản ứng PCR khuyếch đại 16S rDNA<br /> <br /> 31<br /> <br />