Giải trình tự sản phẩm PCR

Trong nghiên cu này, trình tự đoạn COI sẽ được khuyếch đại bằng cặp mồi đặc hiệu COI-21F/COI-812R từ DNA tổng số tách chiết từ các cá thể rầy nâu thu thập trên lúa và cỏ môi ở Việt Nam. Sản phẩm PCR được giải trình tự, so sánh và phân tích bằng phần mềm MEGA5 để xác định mối quan hệ gia phả của chúng với các trình tự trên GenBank.

5p vithor 20-07-2023 12 2   Download

Mục đích của nghiên cứu này là sử dụng kỹ thuật RT-PCR để chẩn đoán và phát hiện Cymbidium Mosaic Virus (CymMV) và Odontoglossum Ringspot Virus (ORSV) gây bệnh trên hoa lan nhằm đánh giá sự hiện diện của CymMV và ORSV tại vườn trồng và từ đó góp phần cung cấp thông tin trong việc hạn chế sự gây hại của CymMV và ORSV trên các vườn trồng hoa lan.ORSV) gây bệnh trên hoa lan bằng kỹ thuật PCR.

8p viargus 03-03-2023 10 2   Download

Mẫu nấm H022, ký sinh trên ấu trùng ve sầu, được phát hiện ở khu vực thị trấn Ea Knốp - Tỉnh Đăk Lăk. Mẫu nấm được thu nhận, đưa về phòng thí nghiệm để giải phẫu hình thái nhằm xác định tên loài. Đồng thời, DNA bộ gene được thu nhận bằng phương pháp phenol/chloroform để tiến hành khuếch đại các gene mục tiêu nrSSU, ITS, nrLSU, Rpb1, Tef1 bằng kỹ thuật PCR. Sản phẩm khuếch đại được giải trình tự và tiến hành phân tích phát sinh loài phân tử để hỗ trợ việc định danh.

15p vicolinzheng 14-12-2021 21 1   Download

Trong bài báo này, tiến hành khuếch đại các đoạn exon trên gen NPHS1 và PLCE1 ở hai bệnh nhân và các thành viên trong gia đình bệnh nhân mắc hội chứng thận hư bẩm sinh người Việt Nam. Sản phẩm PCR khuếch đại các đoạn exon được tinh sạch và giải trình tự trực tiếp trên máy giải trình tự tự động ABI 3500 Bio System (Mỹ).

7p princessmononoke 28-11-2021 19 2   Download

Với mục đích kiểm định cá Tra (Pangasianodon hypophthalmus), việc xây dựng quy trình phân tích đoạn Cytochrome b là cần thiết. Cặp mồi universal cho Cytb được sử dụng để nhân gen thuộc vùng gen ty thể thông qua PCR các mẫu cá Tra và một số loài cá da trơn khác với kích thước 430 bp. Sản phẩm PCR sau đó được tinh sạch và giải trình tự.

13p vimississippi2711 04-12-2020 35 1   Download

Bài viết thiết lập phương pháp xác định đột biến gen Jak2 V617F và CARL bằng cách phối hợp công nghệ PCR đặc hiệu hai hướng allele tích hợp công nghệ ARMS. Đối tượng và phương pháp: 64 bệnh phẩm máu ngoại vi thu thập từ các bệnh nhân có hội chứng tăng sản tủy, 02 mẫu chứng dương mang đột biến Jak2 V617F và 01 mẫu chứng mang đột biến CARL. Các mẫu chứng dương được pha vào mẫu ADN chân tóc người khỏe mạnh với các tỷ lệ giảm dần: 100, 50, 25, 5, 0,5 và 0% sau đó sử dụng DSA-PCR-ARMS để phát hiện xác định độ nhạy kỹ thuật và giải trình tự gene để xác định độ đặc hiệu của phương pháp.

8p kequaidan5 11-06-2020 41 1   Download

Nghiên cứu được thực hiện để xác định đặc điểm sinh học gen đặc trưng (gen InvA và Omp) của Salmonella phân lập được từ thực phẩm (thịt lợn, thịt gà) tại Việt Nam bằng giải trình tự sản phẩm PCR. Kết quả nghiên cứu cho thấy các đoạn gen đã khuếch đại có trình tự nucleotide tương đồng cao (> 99,9 %) so với trình tự nucleotide của các gen tương ứng đã công bố trong Ngân hàng gen quốc tế.

7p thayboitinhyeu 01-06-2020 64 2   Download

Nghiên cứu thực hiện xét nghiệm giải trình tự trực tiếp sản phẩm PCR khuếch đại một đoạn DNA trên vùng 5’-NC của HCV, phân tích các kết quả và rút ra các kinh nghiệm chủ yếu. Mời các bạn cùng tham khảo bài viết để nắm rõ nội dung chi tiết của đề tài nghiên cứu này.

8p hanh_tv18 20-02-2019 83 5   Download

Nghiên cứu được thực hiện với mục tiêu nhằm xây dựng quy trình khuếch đại toàn bộ 15 exon của gen APC bằng phản ứng PCR và giải trình tự gen APC. DNA được tách chiết từ máu ngoại vi của 15 người khỏe mạnh. Các exon của gen được khuếch đại bằng 29 cặp mồi, sản phẩm PCR sau đó được giải trình tự bằng máy tự động. Kết quả được phân tích bằng phần mềm chuyên dụng.

7p hanh_tv14 26-01-2019 64 4   Download

Điều tra giun móc ký sinh ở chó tại khu vực Hà Nội đã thu được 2 loài giun móc khác nhau dựa vào số lượng răng của chúng trong khoang miệng. Kết quả phân tích đoạn gen ty thể CO1 của chúng đã khẳng định các mẫu giun móc có 3 răng là loài Ancylostoma caninum, còn các mẫu có 2 răng là loài Ancylostoma ceylanicum.

7p vidanh95 12-12-2018 42 3   Download

Nội dung của bài viết trình bày về bệnh thần kinh thị giác di truyền LEBER - một rối loạn di truyền ti thể gây mất thị lực hoàn toàn mà không gây đau. Kết quả nghiên cứu cho thấy, bằng việc ứng dụng kỹ thuật PCR và kỹ thuật giải trình tự trực tiếp sản phẩm PCR, chúng tôi đã xây dựng thành công qui trình xét nghiệm chẩn đoán đột biến DNA ti thể trong bệnh LHON.

5p kloikloi 07-10-2017 136 4   Download

Ba mươi hai dòng vi khuẩn có khả năng phân hủy 2,4-D được phân lập trong đất lúa ở Tiền Giang và Sóc Trăng. Phổ điện di sản phẩm Box-PCR chứng tỏ chúng thuộc mười dòng vi khuẩn khác nhau. Kết quả giải trình tự gen 16S-rRNA cho thấy các dòng vi khuẩn đều thuộc lớp β-Proteobacteria, bộ Burkholderiales, họ Burkholderiaceae và được định danh lần lượt là Cupriavidus sp. ST1, Burkholderia sp. ST4, Cupriavidus sp. ST7, Cupriavidus sp. ST10, Burkholderia sp. ST14, Cupriavidus sp. TG2, Cupriavidus sp. TG3, Cupriavidus sp. TG16, Ralstonia sp. TG26, và Burkholderia sp. TG27.

6p sunshine_9 23-07-2013 93 5   Download

Real-time PCR là một phương pháp pcr mới. nó kiểm soát lượng huỳnh quang giải phóng ra trong phản ứng từ đó có thể biết được lượng sản phẩm PCR trong từng thời điểm (chu kỳ) của quá trình khuếch đại, trái ngược vơí PCR truyền thống chỉ biết được lượng sản phẩm được khuếch đại ở thời điểm cuối cùng của phản ứng khuếch đại

28p lalan38 29-03-2013 83 16   Download

Hình 4.5. Sản phẩm PCR lần thứ hai (1) và (3) PCR mẫu DL1 ở nồng độ 30ng và 10ng (2) và (4) PCR mẫu DL2 ở nồng độ 30ng và 10ng Ở hai mẫu một và hai là sản phẩm PCR của hai mẫu Phytophthora trên địa lan với nồng độ 30ng. Trong khi hai mẫu còn lại là kết quả thu được khi chạy PCR hai mẫu trên với nồng độ 10ng. Chúng tôi tạm thời không thể giải thích rõ ràng kết quả trên tuy nhiên nó cho ta thấy nồng độ DNA mẫu cũng quyết định kết quả...

21p zues04 20-06-2011 142 25   Download

51 4.3 Kết quả kiểm tra sản phẩm RT-PCR bằng phương pháp giải trình tự Các sản phẩm RT-PCR khi điện di trên gel agarose 1,5% đã thu được vạch DNA với kích thước 589 bp như mong đợi. Tuy nhiên, chưa thể đưa ra kết luận rằng đây chính là đoạn DNA đã nhân bản từ đoạn gene HSP 70 của PMWaV-1. Do đó, phương pháp giải trình tự được áp dụng để kiểm chứng lại các sản phẩm này. Có 2 mẫu sản phẩm RT-PCR dương tính trên điện di, một từ cây bệnh và một từ chồi...

10p zues03 19-06-2011 132 19   Download

- Lượng RNA thích hợp cho phản ứng tổng hợp cDNA là 5 µl. Quy trình nhiệt của phản ứng tổng hợp cDNA phải thay đổi so với kit (tăng thời gian của giai đoạn 42oC từ 30 phút lên 40 phút). Chu kỳ nhiệt trong phản ứng tổng hợp cDNA 25oC trong 5 phút 42oC trong 40 phút 85oC trong 5 phút Giữ ở 4oC - Nồng độ hóa chất phù hợp hợp với quy trình đã nêu, kết quả thu đƣợc không có sự hiện diện của sản phẩm phụ. ...

9p zues02 18-06-2011 77 7   Download

Đặt vấn đề: Xét nghiệm HCV genotype là xét nghiệm mà các bác sĩ lâm sàng cần xác định trước khi bắt đầu điều trị bệnh nhân nhiễm HCV để có thể quyết định thời gian điều trị. Có nhiều phương pháp để xác định genotype HCV, tuy nhiên tiêu chuẩn nhất và hữu dụng lâm sàng nhất vẫn là giải trình tự vùng 5’-NC. Mục tiêu nghiên cứu: Thực hiện xét nghiệm giải trình tự trực tiếp sản phẩm PCR khuếch đại một đoạn DNA trên vùng 5’-NC của HCV, phân tích các kết quả và rút ra...

13p truongthiuyen 09-05-2011 127 19   Download

Đặt vấn đề: Hiện nay, công ty Nam Khoa đã có kit PCR-ELISA để phát hiện và định genotype HPV và kit này đã triển khai sử dụng khá hữu hiệu tại một số phòng thí nghiệm tại TP. Hồ Chí Minh. Tuy nhiên hãy còn một tiếp cận khác để có thể định được genotype HPV, đó là sử dụng phương pháp giải trình tự để giải trình tự trực tiếp sản phẩm PCR đặc hiệu vùng gen L1 của HPV và so sánh trình tự này trên thư viện trình tự các genotype của HPV, nhờ vậy mà có thể cho được...

6p giangduongykhoa 07-05-2011 238 23   Download

Đặt vấn đề: Để có thể tiên đóan được hiệu quả điều trị đặc hiệu và quyết định được thời gian điều trị đặc hiệu cho bệnh nhân viêm gan mạn tính do nhiễm HCV, các nhà điều trị cần phải có thông tin về kiểu gen của HCV trên bệnh nhân. Trước đây, xét nghiệm xác định kiểu gen HCV phải được gửi sang Singapore để thực hiện với giá thành khá cao: trên 180USD/mẫu thử.

7p giangduongykhoa 07-05-2011 178 38   Download