Phân tích in silico

Bình bát (Annona glabra L.) là một loài phân bố rộng rãi ở nước ta với nhiều hoạt tính như chống ung thư, kháng HIV, kháng khuẩn, trị sốt rét, tiêu chảy, diệt ký sinh trùng,... Quá trình sàng lọc in vitro cho thấy dịch chiết methanol của Annona glabra L., ức chế hoạt tính của FtsZ GTPase nổi trội. Nghiên cứu này nhằm khảo sát khả năng ức chế FtsZ GTPase in silico của các chất chuyển hóa thứ cấp trong cây Bình bát.

8p vialicene 19-07-2024 4 3   Download

Bài viết trình bày kết quả phân lập từ vỏ thân cây cao su H. brasiliensis RRIV 209 một biến thể bản sao của gen TPS (ký hiệu HbTPS6L-X1). Thông qua kết quả phân tích cây tiến hóa, sự hiện diện của các motif bảo tồn, vùng trình tự peptide tín hiệu của protein và mức độ tương đồng về cấu trúc với các sesquiterpene synthase đã được nghiên cứu, HbTPS6L-X1 được dự đoán thuộc phân họ TPS-a, định vị trong tế bào chất và xúc tác chuyển hóa FPP thành các sesquiterpene.

7p vigojek 02-02-2024 15 1   Download

Kháng kháng sinh (KKS) là mối đe dọa sức khỏe cộng đồng và ảnh hưởng lớn đến con người. Pseudomonas aeruginosa (PA) là tác nhân gây ra nhiều bệnh nhiễm trùng và tỉ lệ xuất hiện kháng kháng sinh ở vi khuẩn này ngày càng gia tăng. Nghiên cứu này phân tích tần số xuất hiện gen KKS ở PA, từ đó tiến hành sàng lọc chất ức chế gen KKS có tần số xuất hiện cao nhất bằng phương pháp sàng lọc ảo in silico.

5p vipierre 30-09-2023 14 6   Download

Bài viết Phân tích in silico các gene mã hóa protein SWEET ở cây dền lấy hạt (Amaranthus hypochondriacus L.) được nghiên cứu nhằm mục tiêu xác định các gene mã hóa SWEET trong hệ gene của cây dền lấy hạt, phân tích các đặc điểm cấu trúc, sự phân bố của gene cũng như các đặc điểm hóa lý lý thuyết của các protein SWEET ở loài cây này và sự biểu hiện gene.

8p vispiderman 15-06-2023 11 3   Download

Luận văn "Sàng lọc in silico các hợp chất polyphenol có tác dụng ức chế enzym HMGCoA reductase định hướng điều trị rối loạn lipid máu" nghiên cứu sàng lọc các hợp chất polyphenol có tác dụng ức chế enzym HMG-CoA reductase bằng phương pháp docking phân tử; đánh giá các đặc điểm giống thuốc và phân tích các thông số dược động học và độc tính của các hợp chất tốt nhất thu được sau quá trình sàng lọc.

74p bigdargon08 13-02-2023 20 11   Download

Mục tiêu của đề tài "Sàng lọc in silico các hợp chất của cây Mỏ quạ (cudrania tricuspidata) có tác dụng ức chế enzym metalloprotein-9 định hướng điều trị ung thư" là sàng lọc một số hợp chất của cây Mỏ quạ có tác dụng ức chế MMP-9 bằng phương pháp Docking phân tử; mhân tích các đặc tính giống thuốc và đánh giá các thông số ADMET.

50p bigdargon08 13-02-2023 19 8   Download

Đề tài "Sàng lọc in silico các hợp chất alkaloid có tác dụng ức chế thụ thể ERalpha hướng điều trị bệnh ung thư vú" nghiên cứu nhằm 2 mục tiêu: Sàng lọc các hợp chất alkaloid có tác dụng ức chế thụ thể ER-alpha bằng phương pháp docking phân tử; phân tích các đặc điểm giống thuốc và tính toán các thông số dược động học và độc tính của các hợp chất tốt nhất thu được sau quá trình sàng lọc.

59p unforgottennight09 26-10-2022 24 12   Download

Đề tài "Nghiên cứu tác dụng chống lão hoá của Lãnh công (Fissistigma oldhamii (Hemsl.) Merr.) trên một số enzyme kết hợp mô hình dược lý mạng in silico" nghiên cứu nhằm đánh giá tác dụng sinh học của Lãnh công qua mô hình thu dọn gốc tự do DPPH và khả năng ức chế các enzyme Tyrosinase, Elastase và Hyaluronidase; phân tích, dự đoán cơ chế chống lão hóa của Lãnh công sử dụng phương pháp network pharmacology.

54p unforgottennight09 26-10-2022 22 9   Download

Nghiên cứu thuốc điều trị ung thư mới hiện nay đang là mối quan tâm hàng đầu của thế giới. Một trong số các mục tiêu phân tử đáng chú ý là enzym Histon Deacetylase 2 (HDAC2). Hiện nay, khoa học máy tính ngày càng được sử dụng rộng rãi trong tìm kiếm và phát triển thuốc mới.

6p viclerkmaxwel 16-02-2022 28 3   Download

Bệnh hại do vi khuẩn, virus là mối đe dọa nghiêm trọng đối với ngành sản xuất chuối trên thế giới nói chung, Việt Nam nói riêng. Ngoài các biện pháp canh tác, việc khai thác và ứng dụng nguồn gen kháng - phần lớn thuộc họ gen NBS-LRR (Nucleotide binding site - Leucine rich repeat) trong chọn tạo, cải thiện giống chuối là phương thức bền vững để đối phó với dịch bệnh. Hệ gen loài chuối Musa acuminata được giải mã tạo tiền đề cho các nghiên cứu di truyền chuyên sâu, bao gồm xác định họ gen kháng NBS-LRR.

7p vishivnadar 21-01-2022 33 1   Download

Mục tiêu của đề tài là xây dựng tổ hợp các hợp chất tự nhiên và sang lọc các hợp chất có tác dụng ức chế enzym HER2 bằng kĩ thuật docking phân tử; phân tích đặc tính giống thuốc và đánh giá các thông số ADMET. Mời các bạn cùng tham khảo nội dung chi tiết.

56p closefriend03 13-10-2021 42 10   Download

Nghiên cứu này có mục tiêu xác định các gene mã hóa SWEET trong hệ gene của cây ca cao, phân tích các đặc điểm cấu trúc, sự phân bố của gene cũng như các đặc điểm hóa lí lí thuyết của các protein SWEET ở loài cây này và sự biểu hiện gene. Những kết quả nghiên cứu này bước đầu cung cấp các thông tin khoa học về cấu trúc, chức năng của các SWEET của loài cây công nghiệp quan trọng này.

8p viwendy2711 05-10-2021 22 4   Download

Nghiên cứu này hướng tới mục tiêu xác định và phân tích đặc điểm của các gene SAP ở cây đu đủ, loại cây ăn quả nhiệt đới quan trọng, bằng các phương pháp tin sinh học, phương pháp nghiên cứu hiện đại, phổ biến trong công nghệ sinh học hiện đại. Mời các bạn cùng tham khảo!

8p thehungergames 14-08-2021 33 2   Download

Enzyme glutamate dehydrogenase (GDH, EC 1.4.1.2~4) xúc tác phản ứng thuận nghịch khử amin hóa glutamate tới a-ketoglutarate hoặc 2-oxoglutarate. Enzym này đóng vai trò quan trọng trong sự trao đổi amino acid của thực vật. Năm gene mã hóa GDH đã được xác định trong hệ gene của cây Đậu cove.

8p viwisconsin2711 22-01-2021 29 3   Download

Trong nghiên cứu này, thông tin về tiểu phần Nuclear factor-YB (NF-YB) ở cây rau dền (Amaranthus hypochondriacus) đã được phân tích một cách toàn diện thông qua các công cụ tin sinh học. Kết quả đã xác định được tổng số 16 thành viên trong họ NF-YB ở A. hypochondriacus. Phân tích cấu trúc cho thấy họ NF-YB có kích thước dao động từ 51 đến 328 axit amin, tương ứng với trọng lượng từ 5,58 đến 35,88 kilo Dalton. Giá trị điểm đẳng điện của NF-YB ở rau dền nằm trong khoảng từ axit (4,09) đến bazơ (9,95).

0p gaocaolon8 21-11-2020 49 1   Download

Xác gen DREB2 thuộc về phân nhóm A2 của họ tác nhân phiên mã DREB (dehydrationresponsive element binding), giữ vai trò quan trọng trong trả lời với các stress vô sinh ở thực vật. Trong công trình này, chúng tôi sử dụng cách tiếp cận in silico để xác định và phân tích bốn gen DREB2 của cây quýt (Citrus clementina).

5p vimoscow2711 28-08-2020 20 2   Download

Trong nghiên cứu này, họ gen mã hóa tiểu phần NF-YB (Nuclear factor-YB) đã được phân tích trên hệ gen cây cam ngọt (Citrus sinensis) bằng phương pháp tin sinh học. Kết quả đã xác định được 19 gen mã hóa cho họ NF-YB, CsNF-YB, trên hệ gen cam ngọt.

5p vimariecurie2711 01-08-2019 24 3   Download

Bằng phân tích in silico, chúng tôi đã xác định được 11 gen mã hóa cho các protein Dehydrin (DHN) trong hệ gen của cây đậu tương. Các protein suy diễn của các gen này đều có mang trình tự bảo thủ đặc hiệu cho DHN là phân mảnh K đã được báo cáo ở nhiều loài. Phân tích cây phát sinh chủng loại cho thấy, các DHN của cây đậu tương nằm trên ba nhánh khác nhau, có một số hiện tượng nhân gen xảy ra sau quá trình biệt hóa loài.

8p viboruto2711 17-05-2019 37 1   Download

Nhờ sử dụng các phương pháp nghiên cứu in silico, tác giả đã xác định và phân tích 10 gene KNOX ở trong hệ gene của cây dứa (Ananas comosusL.). Căn cứ vào kết quả phân tích cấu trúc và cây phả hệ, các gene KNOX của cây dứa được phân chia thành hai phân nhóm là phân nhóm I (năm gene) và phân nhóm II (năm gene).

4p vivant2711 01-02-2019 51 3   Download

Trong bài báo này, bằng phương pháp in silico chúng tôi xác định họ beta-amylase của cây đậu tương là họ đa gen, với tổng số 19 gen mã hóa cho các enzyme beta-amylase trong hệ gen của loài này. Trong đó, 19 gen beta-amylase của cây đậu tương phân bố trên 12 trong tổng số 20 nhiễm sắc thể. Kích thước lớn của họ gen beta-amylase ở đậu tương bắt nguồn từ nhiều sự kiện nhân gen được quan sát trong hệ gen, trong đó sự kiện nhân gen trên quy mô hệ gen (WGD) giữ vai trò chủ yếu.

14p jangni2 19-04-2018 51 1   Download