Luận văn Thạc sĩ Khoa học ngành Sinh học thực nghiệm: Nghiên cứu biến đổi số lượng bản sao ADN ti thể ở bệnh nhân ung thư vú

ĐẠI HỌC QUỐC GIA HÀ NỘI<br /> TRƯỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC TỰ NHIÊN<br /> --<br /> <br /> Nguyễn Hồng Nhung<br /> <br /> NGHIÊN CỨU BIẾN ĐỔI SỐ LƯỢNG<br /> BẢN SAO ADN TI THỂ Ở BỆNH NHÂN<br /> UNG THƯ VÚ<br /> <br /> LUẬN VĂN THẠC SĨ KHOA HỌC<br /> <br /> Hà Nội-2015<br /> <br /> ĐẠI HỌC QUỐC GIA HÀ NỘI<br /> TRƯỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC TỰ NHIÊN<br /> --<br /> <br /> Nguyễn Hồng Nhung<br /> <br /> NGHIÊN CỨU BIẾN ĐỔI SỐ LƯỢNG<br /> BẢN SAO ADN TI THỂ Ở BỆNH NHÂN<br /> UNG THƯ VÚ<br /> <br /> Chuyên ngành: Sinh học thực nghiệm<br /> Mã số: 60420114<br /> <br /> LUẬN VĂN THẠC SĨ KHOA HỌC<br /> <br /> Người hướng dẫn khoa học:<br /> <br /> PGS.TS. Trịnh Hồng Thái<br /> TS. Đỗ Minh Hà<br /> <br /> Hà Nội-2015<br /> <br /> LỜI CẢM ƠN<br /> Lời đầu tiên em xin chân thành bày tỏ lòng cảm ơn và kính trọng sâu sắc đối<br /> với thầy, PGS. TS. Trịnh Hồng Thái, người đã tận tình hướng dẫn em trong suốt<br /> quá trình học tập và thực hiện luận văn này. Thầy đã mở ra cho em những vấn đề<br /> khoa học rất lý thú, hướng em vào nghiên cứu các lĩnh vực hết sức thiết thực và vô<br /> cùng bổ ích, đồng thời tạo điều kiện thuận lợi cho em học tập và nghiên cứu. Em đã<br /> học hỏi được rất nhiều ở Thầy phong cách làm việc, cũng như phương pháp nghiên<br /> cứu khoa học.<br /> Em cũng xin trân trọng cảm ơn đến TS. Đỗ Minh Hà và thầy giáo, cô giáo<br /> trong khoa Sinh học, trường Đại học Khoa học Tự nhiên, đặc biệt là các thầy cô<br /> giáo trong bộ môn Sinh lý Thực vật và Hóa sinh học đã tận tình giảng dạy dìu dắt<br /> tôi trong suốt thời gian học tập tại trường.<br /> Em xin gửi lời cảm ơn chân thành tới các anh chị đã tận tình giúp đỡ và chỉ<br /> bảo tôi trong suốt quá trình học tập và thực hiện luận văn tại Phòng Proteomics và<br /> Sinh học Cấu trúc thuộc Phòng thí nghiệm Trọng điểm Công nghệ Enzyme và<br /> Protein, các bạn học viên cao học và các em sinh viên làm việc tại phòng, những<br /> người đã làm cùng tôi, luôn ở bên tôi lúc thất bại hay những lúc thành công.<br /> Trong quá trình thực hiện đề tài, tôi đã nhận được sự giúp đỡ và tạo điều<br /> kiện thuận lợi của PTNTĐ Công nghệ Enzym và Protein, Trường Đại học KHTN,<br /> sự giúp đỡ của các cán bộ nhân viên thuộc khoa Tế bào và Giải phẫu bệnh, bệnh<br /> viện K, Hà Nội trong việc cung cấp mẫu nghiên cứu. Tôi xin chân thành cảm ơn.<br /> Luận văn được thực hiện trong phạm vi nội dung và kinh phí củađề tài cấp<br /> nhà nước (mã số KC.04.10/11-15). Tôi xin chân thành cảm ơn.<br /> Con xin gửi lời cảm ơn sâu sắc đến Bố, Mẹ người đã vất vả nuôi con khôn<br /> lớn và dạy con những bài học làm người đầu tiên, con cảm ơn ông bà, cô<br /> chú…những người thân của con, những người luôn dành tình cảm và những lời<br /> động viên con.<br /> Và cuối cùng tôi xin cảm ơn các bạn bè của tôi, những người luôn ủng hộ và<br /> giúp đỡ tôi.<br /> Hà Nội, tháng 8 năm 2015<br /> Học viên<br /> <br /> Nguyễn Hồng Nhung<br /> <br /> DANH MỤC CÁC CHỮ VIẾT TẮT<br /> ADN<br /> <br /> Acid Deoxyribonucleic<br /> <br /> APS<br /> <br /> Ammonium persulfate<br /> <br /> ARN<br /> <br /> Acid Ribonucleic<br /> <br /> ATP<br /> <br /> Adenosine Triphosphate<br /> <br /> AcN<br /> <br /> Acetonitrile<br /> <br /> Bp<br /> <br /> Base pair (cặp bazơ)<br /> <br /> cs<br /> <br /> cộng sự<br /> <br /> EDTA<br /> <br /> Ethylenediaminetetraacetic Acid<br /> <br /> EtBr<br /> <br /> Ethidium Bromide<br /> <br /> HCC<br /> <br /> Ung thư biểu mô tế bào gan (Hepatocellular carcinoma)<br /> <br /> HPLC<br /> <br /> Sắc<br /> <br /> kí<br /> <br /> lỏng<br /> <br /> hiệu<br /> <br /> năng<br /> <br /> cao<br /> <br /> (High-performance<br /> <br /> liquid<br /> <br /> chromatography)<br /> MT/mt<br /> <br /> Mitochondria (ti thể)<br /> <br /> mtADN<br /> <br /> ADN ti thể (mitochondrial DNA)<br /> <br /> nADN<br /> <br /> ADN nhân (nuclear DNA)<br /> <br /> PCR<br /> <br /> Phản ứng chuỗi trùng hợp (polymerase chain reaction)<br /> <br /> Smac/DIABLO<br /> <br /> Chất hoạt hóa caspase thứ hai từ ti thể/ chất ức chế trực tiếp của<br /> protein gắn trong quá trình apoptosis trong điều kiện pI thấp.<br /> (Second<br /> <br /> mitochondria-derived<br /> <br /> activator<br /> <br /> of<br /> <br /> inhibitor of apoptosis-binding protein with low pI)<br /> TEA<br /> <br /> Triethylamine<br /> <br /> TEAA<br /> <br /> Triethylammonium acetate<br /> <br /> tARN<br /> <br /> ARN vận chuyển (transfer RNA)<br /> <br /> rARN<br /> <br /> ARN ribosome (RNA ribosome)<br /> <br /> caspase/direct<br /> <br /> DANH MỤC CÁC BẢNG<br /> Bảng 1<br /> <br /> Các hóa chất chính sử dụng cho nghiên cứu<br /> <br /> Bảng 2<br /> <br /> Thành phần hóa chất chạy HPLC<br /> <br /> Bảng 3<br /> <br /> Thành phần phản ứng PCR<br /> <br /> Bảng 4<br /> <br /> Thành phần phản ứng PCR thể tích 15 µl<br /> <br /> Bảng 5<br /> <br /> Công thức đổ gel polyacrylamide 10% bản 7cm<br /> <br /> Bảng 6<br /> <br /> Bảng 7<br /> <br /> Bảng 8<br /> <br /> Bảng 9<br /> <br /> Bảng 10<br /> <br /> Bảng 11<br /> <br /> Số liệu phân tích HPLC với các mẫu có tỉ số hàm lượng ADN chuẩn<br /> 400bp/100bp khác nhau<br /> Số liệu phân tích HPLC với các mẫu có tỉ số lượng mt/ACTB khác<br /> nhau<br /> Biến đổi tỉ số mt/ACTB trong các loại mẫu ở bệnh nhân ung thư vú<br /> và bệnh nhân u xơ vú<br /> Biến đổi tỉ số mt/ACTB và đặc điểm bệnh học ở bệnh nhân ung thư<br /> vú<br /> Biến đổi tỉ số mt/ACTB trong các loại mẫu ở bệnh nhân ung thư vú<br /> và bệnh nhân u xơ vú bằng phương pháp ImageJ<br /> Biến đổi tỉ số mt/ACTB và đặc điểm bệnh học ở bệnh nhân ung thư<br /> vú phân tích bằng phương pháp ImageJ<br /> <br />