Luận văn Thạc sĩ Khoa học: Nghiên cứu khả năng ứng dụng kit realtime PCR đa mồi Septifast trong chẩn đoán nhiễm trùng huyết ở trẻ em tại bệnh viện Nhi Trung ương

ĐẠI HỌC QUỐC GIA HÀ NỘI<br /> TRƢỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC TỰ NHIÊN<br /> -----------------------<br /> <br /> Nguyễn Minh Hằng<br /> <br /> NGHIÊN CỨU KHẢ NĂNG ỨNG DỤNG KIT REALTIME PCR ĐA MỒI<br /> SEPTIFAST TRONG CHẨN ĐOÁN NHIỄM TRÙNG HUYẾT Ở TRẺ EM<br /> TẠI BỆNH VIỆN NHI TRUNG ƢƠNG<br /> <br /> LUẬN VĂN THẠC SĨ KHOA HỌC<br /> <br /> Hà Nội - 2016<br /> <br /> ĐẠI HỌC QUỐC GIA HÀ NỘI<br /> TRƢỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC TỰ NHIÊN<br /> -----------------------<br /> <br /> Nguyễn Minh Hằng<br /> <br /> NGHIÊN CỨU KHẢ NĂNG ỨNG DỤNG KIT REALTIME PCR ĐA MỒI<br /> SEPTIFAST TRONG CHẨN ĐOÁN NHIỄM TRÙNG HUYẾT Ở TRẺ EM<br /> TẠI BỆNH VIỆN NHI TRUNG ƢƠNG<br /> <br /> Chuyên ngành: Vi sinh vật học<br /> Mã số: 60420107<br /> <br /> LUẬN VĂN THẠC SĨ KHOA HỌC<br /> <br /> NGƯỜI HƯỚNG DẪN KHOA HỌC: TS. PHÙNG THỊ BÍCH THỦY<br /> PGS.TS BÙI THỊ VIỆT HÀ<br /> <br /> Hà Nội - 2016<br /> <br /> Luận văn Thạc sĩ Khoa học<br /> <br /> Nguyễn Minh Hằng<br /> <br /> LỜI CẢM ƠN<br /> Trước hết, với lòng kính trọng và biết ơn sâu sắc, tôi xin gửi lời cảm ơn tới:<br /> TS. Phùng Thị Bích Thủy – Trưởng khoa Nghiên cứu Sinh học phân tử các<br /> bệnh Truyền nhiễm – Bệnh viện Nhi Trung Ương.<br /> PGS.TS. Bùi Thị Việt Hà– Chủ nhiệm bộ môn Vi sinh vật học – Trường Đại<br /> học Khoa học tự nhiên – Đại học Quốc Gia Hà Nội.<br /> Là những người thầy đã trực tiếp hướng dẫn, tận tình chỉ bảo, giúp đỡ và<br /> động viên tôi trong suốt quá trình tôi học tập, nghiên cứu và hoàn thành khóa luận.<br /> Tôi xin gửi lời cảm ơn chân thành tới Ban giám đốc Bệnh viện Nhi Trung<br /> Ương, phòng Tổ chức cán bộ, tập thể khoa Vi sinh, các anh chị và các bạn đồng<br /> nghiệp Khoa Nghiên cứu Sinh học phân tử các bệnh Truyền nhiễm - những người<br /> đã giúp đỡ và tạo điều kiện cho tôi rất nhiều để tôi có thể hoàn thành luận văn này.<br /> Tôi cũng xin bày tỏ lòng biết ơn tới Ban giám hiệu, phòng đào tạo Sau đại<br /> học, các thầy, cô giáo khoa Sinh học, Trường Đại học Khoa học Tự nhiên – Đại học<br /> Quốc Gia Hà Nội, đặc biệt là các thầy, cô giáo Bộ môn Vi sinh vật học đã truyền<br /> đạt cho tôi những kiến thức quý báu trong suốt quá trình học tập.<br /> Đồng thời tôi cũng xin chân thành cảm ơn các thầy cô trong hội đồng chấm<br /> luận văn tốt nghiệp đã cho tôi những ý kiến quý báu, giúp đỡ để tôi có thể bảo vệ<br /> thành công đề tài này.<br /> Cuối cùng, tôi xin gửi lời cảm ơn đến gia đình, bạn bè, những người đã tạo<br /> cho tôi điều kiện tốt nhất để hoàn thành luận văn.<br /> Hà Nội, ngày 01 tháng11 năm 2016<br /> Học viên<br /> Nguyễn Minh Hằng<br /> <br /> Khóa 2014 - 2016<br /> <br /> Luận văn Thạc sĩ Khoa học<br /> <br /> Nguyễn Minh Hằng<br /> <br /> MỤC LỤC<br /> LỜI CẢM ƠN .................................................................................................. 1<br /> MỤC LỤC ........................................................................................................ 2<br /> DANH MỤC CÁC BẢNG .............................................................................. 4<br /> DANH MỤC CÁC HÌNH ............................................................................... 5<br /> DANH MỤC CÁC KÝ HIỆU, CHỮ VIẾT TẮT ......................................... 6<br /> CHƢƠNG 1. TỔNG QUAN TÀI LIỆU ........................................................ 4<br /> 1.1. Tổng quan về nhiễm trùng huyết .................................................................4<br /> 1.2. Dịch tễ học bệnh nhiễm trùng huyết ...........................................................5<br /> 1.2.1 Trên thế giới................................................................................................5<br /> 1.2.2. Tình hình nhiễm trùng huyết tại Việt Nam..............................................7<br /> 1.3. Nguyên nhân gây nhiễm trùng huyết ở trẻ em............................................8<br /> 1.4. Cơ chế gây bệnh nhiễm trùng huyết ............................................................9<br /> 1.5. Các tác nhân gây bệnh nhiễm trùng huyết................................................10<br /> 1.5.1. Vi khuẩn Gram âm gây nhiễm trùng huyết ...........................................11<br /> 1.5.2. Vi khuẩn Gram dương gây nhiễm trùng huyết ......................................19<br /> 1.5.3. Nấm gây nhiễm trùng huyết ...................................................................29<br /> 1.6. Phƣơng pháp sinh học phân tử realtime PCR đa mồi Septifast trong<br /> chẩn đoán nhiễm trùng huyết ở trẻ em .............................................................34<br /> <br /> CHƢƠNG 2. ĐỐI TƢỢNG VÀ PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨUError! Bookmark n<br /> 2.1 Địa điểm nghiên cứu ......................................... Error! Bookmark not defined.<br /> 2.2 Thời gian nghiên cứu ........................................ Error! Bookmark not defined.<br /> 2.3 Đối tƣợng nghiên cứu ....................................... Error! Bookmark not defined.<br /> 2.3.1 Tiêu chuẩn lựa chọn .................................... Error! Bookmark not defined.<br /> 2.3.2. Tiêu chuẩn loại trừ ...................................... Error! Bookmark not defined.<br /> 2.4 Phƣơng pháp nghiên cứu ................................. Error! Bookmark not defined.<br /> 2.4.1 Thiết kế nghiên cứu...................................... Error! Bookmark not defined.<br /> <br /> Khóa 2014 - 2016<br /> <br /> Luận văn Thạc sĩ Khoa học<br /> <br /> Nguyễn Minh Hằng<br /> <br /> 2.4.2 Phương pháp lấy mẫu .................................. Error! Bookmark not defined.<br /> 2.4.3 Sơ đồ nghiên cứu .......................................... Error! Bookmark not defined.<br /> 2.5 Phƣơng pháp cấy máu truyền thống ............... Error! Bookmark not defined.<br /> 2.6 Phƣơng pháp realtime PCR đa mồi Septifast trong chẩn đoán nhiễm<br /> trùng huyết ở trẻ em ............................................... Error! Bookmark not defined.<br /> 2.6.1 Thiết bị, sinh phẩm và hóa chất................... Error! Bookmark not defined.<br /> 2.6.2 Bảo quản và lưu trữ ..................................... Error! Bookmark not defined.<br /> 2.6.3 Bệnh phẩm thu nhận.................................... Error! Bookmark not defined.<br /> 2.6.4 Quy trình thực hiện ...................................... Error! Bookmark not defined.<br /> <br /> CHƢƠNG 3. KẾT QUẢ VÀ BÀN LUẬN ...... Error! Bookmark not defined.<br /> 3.1. Tỷ lệ dƣơng tính với nhiễm trùng huyết bằng kỹ thuật realtime PCR đa<br /> mồi Septifast ............................................................ Error! Bookmark not defined.<br /> 3.2. Tỷ lệ các tác nhân gây nhiễm trùng huyết bằng kỹ thuật realtime PCR<br /> đa mồi Septifast ....................................................... Error! Bookmark not defined.<br /> 3.3. So sánh tỷ lệ phát hiện các tác nhân nhiễm trùng huyếtbằng 2 phƣơng<br /> pháp cấy máu truyền thống và realtime PCR đa mồi Septifast ............... Error!<br /> Bookmark not defined.<br /> 3.4. Tỷ lệ trẻ nhiễm trùng huyết theo giới tính .... Error! Bookmark not defined.<br /> 3.5. Đặc điểm nhiễm trùng huyết theo mùa.......... Error! Bookmark not defined.<br /> 3.6. Phân bố nhiễm trùng huyết theo nhóm tuổi .. Error! Bookmark not defined.<br /> 3.7. Mối liên quan giữa nhiễm trùng huyết với các chỉ số huyết học ....... Error!<br /> Bookmark not defined.<br /> <br /> KẾT LUẬN ........................................................ Error! Bookmark not defined.<br /> KIẾN NGHỊ ....................................................... Error! Bookmark not defined.<br /> TÀI LIỆU THAM KHẢO ........................................................................... 42<br /> <br /> Khóa 2014 - 2016<br /> <br />