Khảo sát các thứ ‐ týp (subtype) trên bệnh nhân nhiễm HIV tại thành phố Hồ Chí Minh

Nghiên cứu Y học <br /> <br /> Y Học TP. Hồ Chí Minh * Tập 18 * Phụ bản của Số 1 * 2014<br /> <br /> KHẢO SÁT CÁC THỨ‐TÝP (SUBTYPE)  <br /> TRÊN BỆNH NHÂN NHIỄM HIV TẠI THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH <br /> Huỳnh Minh Tuấn*,**, Nguyễn Kim Huyền*, Phạm Hùng Vân**, Nguyễn Thanh Bảo** <br /> <br /> TÓM TẮT <br /> Mở đầu: Cho đến nay, khả năng đột biến của siêu vi HIV‐1 tạo nên sự đa dạng sinh học nhằm tránh thoát <br /> hệ miễn dịch của ký chủ và đề kháng lại các thuốc kháng siêu vi vẫn là một thách thức trong việc điều trị căn <br /> bệnh thế kỷ này. Nhiều nghiên cứu cho thấy có sự  phân bố  khác nhau  theo  địa  lý  của  khoảng  11  thứ  týp  và <br /> khoảng 48 thể‐tái‐tổ‐hợp(CRF) của HIV‐1 khắp thế giới, và có sự khác biệt đáng kể về khả năng lây truyền cũng <br /> như diễn tiến bệnh. Tại Việt Nam vẫn còn ít số liệu công bố trong lĩnh vực này.  <br /> Mục  tiêu: Xác định thứ týp HIV‐1 đang lưu hành tại thành phố Hồ Chí Minh trong những năm 2010‐<br /> 2011. <br /> Phương pháp: Nghiên cứu được thiết kế theo phương pháp mô tả, tiền cứu, thực hiện tại Bệnh Viện Bệnh <br /> Nhiệt Đới TP. Hồ Chí Minh từ 1/2010 đến 12/2011. Cỡ mẫu: 200. Tiêu chuẩn chọn mẫu: người bệnh được chẩn <br /> đoán  xác  định  nhiễm  HIV‐1  theo  tiêu  chuẩn  chẩn  đoán  của  Bộ  Y  Tế  2009  (3),  chưa  từng  được  điều  trị  thuốc <br /> kháng siêu vi. Tiến hành ly trích RNA từ huyết tương, tổng hợp cDNA, khuếch đại và giải trình tự nucleotid <br /> vùng gen envelop. Sau đó, dùng phần mềm Mega 5.05 phân tích trình tự và xây dựng cây quan hệ tiến hóa. <br /> Kết quả: Trong 200 mẫu, có 185 mẫu (chiếm 92,5%) đã thành công trong việc khuếch đại, giải trình tự. Kết <br /> quả cụ thể cho thấy: 175 mẫu (chiếm 94,59%) thuộc thể‐tái‐tổ‐hợp CRF01_AE; 5 mẫu (chiếm 2,7%) thuộc thứ <br /> týp B; và 3 mẫu (chiếm 1,6%) thuộc thể‐tái‐tổ‐hợp CRF01_AE_B. <br /> Kết luận: Nghiên cứu đã góp phần khẳng định thể‐tái‐tổ‐hợp CRF01_AE của siêu vi HIV‐1 lưu hành chủ <br /> yếu ở thành phố Hồ Chí Minh. Bên cạnh đó vẫn có sự lưu hành của thứ týp B và đã bắt đầu có sự xuất hiện của <br /> thể‐tái‐tổ‐hợp CRF01_AE_B. <br /> Từ khóa: HIV‐1, thứ týp, CRF01_AE <br /> <br /> ABSTRACT <br /> HIV‐1 SUBTYPE DIVERSITY IN NAÏVE PATIENT IN HO CHI MINH CITY <br /> Huynh Minh Tuan, Nguyen Kim Huyen, Pham Hung Van, Nguyen Thanh Bao  <br />  * Y Hoc TP. Ho Chi Minh * Vol. 18 ‐ Supplement of No 1 ‐ 2014: 378 ‐ 383 <br /> Background:  To  date,  the  diversity  of  HIV‐1  mutations  for  avoiding  host  immune  system  and  resisting <br /> against  antiviral  drugs  remains  the  giant  challenge  to  human  being  for  successful  treatment  in  this  century. <br /> Many studies show different geographic distributions of about 11 subtypes and 48 circulating recombinant forms <br /> (CRFs) of HIV‐1, and big differences of transmission ability as well as disease progression. There is not much <br /> data of this issue in Vietnam. <br /> Objective: Determine the subtype of HIV‐1 inHo Chi Minh City during 2010‐2011. <br /> Methods:  This  study  was  designed  descriptively  and  prospectively,  performed  at  HCMC  Hospital  for <br /> Tropical Diseases from 1/2010 to 12/2011. Sample size: 200. Criteria for screening: naïve patients were diagnosed <br /> with  HIV  infection  following  Vietnam  Ministry  of  Health  2009  Guidelines  for  diagnosing  and  treatment <br /> HIV/AIDS(3).  Total  whole  blood  samples  were  extracted  RNA  from  plasma,  synthesized  cDNA,  amplified  and <br /> *Khoa Kiểm soát nhiễm khuẩn Bệnh viện Đại học Y Dược Tp. HCM <br /> ** Bộ môn Vi sinh – Khoa Y – Đại học Y Dược Tp. HCM <br /> <br />  <br /> <br />  <br /> <br /> Tác giả liên lạc: ThS Huỳnh Minh Tuấn ĐT: 0909349918 Email: huynhtuan@yds.edu.vn. <br /> <br /> 378<br /> <br /> Chuyên Đề Nội Khoa <br /> <br /> Y Học TP. Hồ Chí Minh * Tập 18 * Phụ bản của Số 1 * 2014 <br /> <br /> Nghiên cứu Y học<br /> <br /> sequenced envelop gene. Then, we used software Mega 5.05 to analyze sequences and build phylogenetic tree. <br /> Results:  Among  200  collected  samples,  the  results  show  that  185  (92.5%)  samples  were  amplified  and <br /> sequenced sucessfully. There are 175 individuals (94.59%) belong to CRF01_AE; 5 individuals (2.7%) belong to <br /> subtype B; and 3 individuals (1.6%) belong to CRF01_AE_B. <br /> Conclusion: Our study shows the major subtype in HCMC is CRF01_AE. Moreover, there is also subtype <br /> B and CRF01_AE_B. <br /> Keywords: HIV‐1, subtype, CRF01_AE <br /> <br /> ĐẶT VẤN ĐỀ <br /> Đã  hơn  30  năm  kể  từ  ngày  hội  chứng  suy <br /> giảm  miễn  dịch  mắc  phải  (AIDS  =  Acquired <br /> Immunodeficiency  Syndrome)  được  mô  tả  trên <br /> y  văn,  và  cũng  gần  bằng  ngần  ấy  thời  gian  tác <br /> nhân  gây  bệnh  được  xác  định  là  siêu  vi  HIV <br /> (Human  Immunodeficiency  Virus),  con  người <br /> vẫn chưa có được một loại thuốc nào có thể điều <br /> trị tận gốc căn bệnh thế kỷ này. Lý do lớn nhất <br /> có lẽ là do siêu vi HIV sở hữu nhiều cơ chế bảo <br /> vệ  khả  năng  tấn  công  vào  và  tồn  tại  được  bên <br /> trong tế bào ký chủ, và khả năng tránh thoát hệ <br /> miễn dịch cũng như là các loại thuốc kháng siêu <br /> vi.  Cơ  chế  được  nhắc  đến  nhiều  nhất  và  cũng <br /> được  ghi  nhận  là  thách  thức  lớn  nhất  cho  con <br /> người  trong  việc  chế  tạo  thuốc  điều  trị  là  khả <br /> năng đột biến di truyền của siêu vi, tạo nên một <br /> quần  thể  đa  dạng  bên  trong  một  người  bệnh <br /> nhiễm  HIV‐1,  và  do  vậy  có  thể  đáp  ứng  được, <br /> tồn tại được trước sự tấn công của hệ miễn dịch <br /> ký chủ và các thuốc kháng siêu vi. <br /> Siêu vi HIV‐1 gây nhiễm bệnh ở người được <br /> phân  thành  3  nhóm:  M  (Major),  O  (Outlier),  và <br /> N  (nonmajor,  nonoutlier).  Trong  nhóm  M,  siêu <br /> vi  được  phân  chia  thành  các  thứ  týp  (subtype) <br /> được định danh bằng các chữ cái; và dưới‐thứ‐<br /> týp  (sub‐subtype)  được  định  danh  bằng  các  số. <br /> Cho đến hiện nay đã xác định được A1, A2, A3, <br /> A4, B, C, D, F1, F2, G, H, J, K. Khác biệt di truyền <br /> giữa các cá thể siêu vi cùng một thứ týp khoảng <br /> 15‐20%,  khác  thứ  týp  có  thể  lên  đến  25‐30%(7). <br /> Ngoài  ra,  hiện  tượng  tái  tổ  hợp  giữa  các  cá  thể <br /> siêu vi khác thứ týp trong cùng một cơ thể người <br /> bệnh tạo ra một biến thể siêu vi mới cũng có khả <br /> năng  lây  truyền  từ  người  sang  người  và  gây <br /> bệnh,  gọi  là  thể‐tái‐tổ‐hợp  (CRF  =  Circulating <br /> <br /> Nhiễm<br /> <br /> Recombinant  Form),  ví  dụ  thể‐tái‐tổ‐hợp <br /> CRF01_AE được ghi nhận lưu hành ở Thái Lan <br /> từ năm 1998(6). <br /> Thứ týp khác nhau đã được ghi nhận có liên <br /> quan mật thiết đến quá trình lây lan và diễn tiến <br /> bệnh,  ví  dụ  siêu  vi  R5  (sử  dụng  đồng  thụ  thể <br /> CCR5) có khả năng lây lan mạnh, trong khi siêu <br /> vi X4 (sử dụng đồng thụ thể CXCR4) lại thường <br /> gắn với diễn tiến bệnh nhanh và nặng(8), hầu hết <br /> các siêu vi thuộc các thứ týp khác nhau sử dụng <br /> hai đồng thụ thể nói trên, riêng thứ týp D có ái <br /> tính với cả hai, trong thứ týp C, quần thể siêu vi <br /> X4 thấp hơp nếu so với thứ týp B(5). Một nghiên <br /> cứu cho thấy khả năng lây truyền mẹ‐con ở thứ <br /> týp  C  cũng  mạnh  hơn  so  với  thứ  týp  B(15),  và <br /> tương  tự  như  vậy  đối  với  khả  năng  lây  truyền <br /> qua  đường  tình  dục  khác  giới  giữa  C  với  A  và <br /> D(10). Một nghiên cứu ở Thái Lan cũng cho thấy <br /> khả  năng  lây  truyền  mạnh  mẽ  của  thể <br /> CRF01_AE so với thứ týp B(9). <br /> Đối  với  diễn  tiến  bệnh,  từ  rất  sớm  vào <br /> những năm 90 của thế kỷ trước, nghiên cứu của <br /> Kanki(11) đã cho thấy diễn tiến bệnh rất nhanh ở <br /> những phụ nữ nhiễm thứ týp C, D, G nếu so với <br /> A.  Một  nghiên  cứu  khác  trên  đoàn  thể  khoảng <br /> 1000 người Thái nhiễm thể CRF01_AE cho thấy <br /> thời  gian  sống  còn  trung  bình  ngắn  hơn  so  với <br /> đoàn thể người phương Tây nhiễm HIV(14). Một <br /> nghiên cứu khác trên người bệnh Uganda cũng <br /> cho thấy diễn tiến bệnh nhanh hơn, tỷ lệ tử vong <br /> cao  hơn  đối  với  thứ  týp  D  so  với  A(13).  Và  gần <br /> đây,  kết  quả  một  nghiên  cứu  trên  người  bệnh <br /> Kenya  cũng  cho  thấy  tỷ  lệ  tử  vong  cao  hơn,  số <br /> lượng tế bào CD4 sụt giảm nhanh hơn ở những <br /> người bệnh nhiễm thứ týp D so với A và C(1). <br /> Một  trong  những  yếu  tố  chủ  chốt  tạo  nên <br /> tính đa dạng sinh học của siêu vi HIV‐1 nằm ở <br /> <br /> 379<br /> <br /> Nghiên cứu Y học <br /> <br /> Y Học TP. Hồ Chí Minh * Tập 18 * Phụ bản của Số 1 * 2014<br /> <br /> chỗ  men  sao  chép  ngược  (RT=Reverse <br /> Transcriptase) của siêu vi thiếu khả năng sửa sai <br /> (proofreading)  trong  quá  trình  sao  chép,  dẫn <br /> đến một tỷ lệ đột biến rất cao (3,4x10‐5 mỗi cặp <br /> nucleotide mỗi chu kỳ sao chép). Nếu ước lượng <br /> chiều dài toàn bộ chuỗi RNA của siêu vi HIV‐1 <br /> là 10.000 nucleotide, tốc độ sao chép khoảng 10 <br /> tỷ virion một ngày, thì cứ mỗi ngày trôi qua sẽ <br /> có  hàng  triệu  biến  thể  siêu  vi  mới  được  tạo  ra <br /> bên trong cơ thể một người bệnh(2). <br /> <br /> ĐỐI TƯỢNG ‐ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU <br /> <br /> Theo các nghiên cứu đã công bố(6,14), phân bố <br /> thứ týp của siêu vi HIV‐1 như sau: <br /> <br /> khám  ngoại  trú  của  Bệnh  viện  Bệnh  Nhiệt  Đới <br /> <br /> Thứ týp<br /> A<br /> <br /> Vùng lưu hành<br /> Kenya<br /> Bắc Mỹ, Trung Mỹ, phía bờ tây<br /> B<br /> Nam Mỹ, Tây Âu, Úc Châu<br /> Ấn Độ, Châu Phi (các nước vùng<br /> C<br /> sừng châu Phi và Đông, Nam Phi)<br /> D<br /> Châu Phi (Sudan, Uganda…)<br /> B và CRF01_AE<br /> Đông Nam Châu Á<br /> CRF02_AG và các thể- Châu Phi (vùng Địa Trung Hải như<br /> tái-tổ-hợp khác<br /> Ai Cập, Algieri, Libya…)<br /> A, B, và các thể tái-tổNga, Đông Âu<br /> hợp giữa A và B<br /> B và các thể tái-tổ-hợp<br /> Nam Mỹ (Brasil, Argentina,<br /> giữa B và F<br /> Bolivia…)<br /> B, C, và các thể tái-tổTrung Quốc và các nước Trung Á<br /> hợp giữa B và C<br /> F, G, H, J, K, CRF01 và<br /> Châu Phi (Congo, Angola,<br /> các thể-tái-tổ-hợp khác<br /> Gabon…)<br /> <br /> Tại Việt Nam, số liệu nghiên cứu về vấn đề <br /> này  còn  tương  đối  ít,  một  số  nghiên  cứu  của <br /> các tác giả đi trước vào các năm 2004(12), 2010(16) <br /> và  2012(4)  cho  kết  quả  thứ  týp  lưu  hành  ở  các <br /> vùng  khảo  sát  thuộc  miền  Bắc  Việt  Nam  là <br /> CRF01_AE  và  E  (là  danh  pháp  cũ  của <br /> CRF01_AE).  Còn  ở  miền  Nam  thì  một  vài <br /> nghiên  cứu  cũng  cho  thấy  thứ  thể‐tái‐tổ‐hợp <br /> CRF01_AE  lưu  hành  chủ  yếu(17,18,).  Do  vậy, <br /> chúng tôi thực hiện nghiên cứu này nhằm mục <br /> đích khảo sát các thứ  týp lưu hành chủ yếu ở <br /> miền Nam, thông qua  những  người  bệnh  đến <br /> khám và điều trị tại Bệnh Viện Bệnh Nhiệt Đới <br /> TP.  Hồ  Chí  Minh,  là  tuyến  điều  trị  cao  nhất <br /> bệnh nhiễm HIV/AIDS tại miền Nam. <br /> <br /> Nghiên  cứu  được  thiết  kế  theo  phương <br /> pháp mô tả, tiền cứu, thực hiện tại Bệnh Viện <br /> Bệnh  Nhiệt  Đới  TP.  Hồ  Chí  Minh  từ  1/2010 <br /> đến 12/2011. <br /> <br /> Đối tượng <br /> Tổng  cộng  nhóm  nghiên  cứu  chúng  tôi  đã <br /> thu  thập  được  200  mẫu  máu  toàn  phần  người <br /> bệnh  HIV‐1  đến  khám  và  điều  trị  tại  phòng <br /> TP.HCM.  Mẫu  được  lấy  theo  phương  pháp <br /> ngẫu  nhiên  liên  tục  cho  đến  khi  kết  thúc.  Tiêu <br /> chuẩn chọn mẫu vào nghiên cứu là người bệnh <br /> được chẩn đoán xác định nhiễm HIV‐1 theo tiêu <br /> chuẩn chẩn đoán của Bộ Y Tế 2009(3), chưa được <br /> điều  trị  thuốc  kháng  siêu  vi  trước  đó,  trưởng <br /> thành  (≥  18  tuổi  tính  đến  thời  điểm  tham  gia <br /> nghiên  cứu)  và  đồng  ý  tham  gia  nghiên  cứu; <br /> không phân biệt tuổi, giới, tiền sử lây truyền, và <br /> giai đoạn tiến triển của bệnh. <br /> <br /> Ly trích huyết tương <br /> Mẫu máu toàn phần (8‐10ml) được cho vào <br /> ống  chống  đông  EDTAK3  (Nam  Khoa  Biotek, <br /> HCMC,  Vietnam),  được  vận  chuyển  từ  Bệnh <br /> Viện  Bệnh  Nhiệt  Đới  TP.  Hồ  Chí  Minh  về  Đại <br /> Học Y Dược TP. Hồ Chí Minh trong thùng xốp <br /> kín có đá khô không quá hai (02)  giờ  kể  từ  khi <br /> lấy mẫu, và được ly tách huyết tương ngay. <br /> Mẫu  máu  được  ly  tách  huyết  tương  bằng <br /> phương pháp ly tâm với tốc độ 5000vòng/phút, <br /> trong  10  phút  ở  nhịêt  độ  4oC.  Huyết  tương  ly <br /> tách  được  khoảng  3‐4ml,  được  aliquot  vào  các <br /> ống Effpendof 1,5ml và lưu ở ‐70°C đến khi thực <br /> hiện bước tiếp theo. <br /> <br /> Ly trích RNA siêu vi HIV‐1 <br /> Rã đông tự nhiên huyết tương đã lưu ở trên, <br /> ly  trích  RNA  bằng  cách  sử  dụng  150µl  huyết <br /> tương  và  bộ  kit  RNAPrep  (Nam  Khoa  Biotek, <br /> HCMC, Vietnam). Nguyên tắc của bộ kit này là <br /> sử  dụng  hợp  chất  phenol‐chloroform  làm  biến <br /> <br /> 380<br /> <br /> Chuyên Đề Nội Khoa <br /> <br /> Y Học TP. Hồ Chí Minh * Tập 18 * Phụ bản của Số 1 * 2014 <br /> <br /> Nghiên cứu Y học<br /> <br /> tính  protein  và  dùng  ethanol  để  làm  tủa  RNA <br /> <br /> Giải trình tự gen env <br /> <br /> của siêu vi HIV‐1. <br /> <br /> Sản phẩm từ  bước tinh  sạch  ở  trên  sẽ  được <br /> thực  hiện  giải  trình  tự  cả  2  mạch  bằng  bộ  kit <br /> BigDye  Terminator  Cycle  Sequencing  v3.1 <br /> (Applied  Biosystems,  Foster  CA,  USA)  với  mồi <br /> “xuôi” và “ngược” là Env7 và ED33, sau khi tất <br /> cả sản phẩm PCR được đánh dấu huỳnh quang, <br /> sẽ  được  “cô  đặc”  lại  và  huyền  phù  trong  20µl <br /> formamid để được phân tích trình tự nucleotide <br /> bằng máy giải trình tự tự động ABI Prism 3130xl <br /> (Applied Biosystems, Foster CA, USA). <br /> <br /> Tổng hợp cDNA từ RNA được ly trích ở trên <br /> Sản  phẩm  RNA  ly  trích  ở  bước  trên  được  sử <br /> dụng để tổng hợp thành cDNA bằng bộ kit cDNA <br /> Synthesis  (Nam  Khoa  Biotek,  HCMC,  Vietnam). <br /> Chu kỳ nhiệt được sử dụng là: 25oC trong 5 phút, <br /> 42oC trong 30 phút, 85oC trong 5 phút. <br /> <br /> Khuếch đại vùng gen env của HIV‐1 bằng <br /> phương  pháp  “nested”  PCR  và  tinh  sạch <br /> sản phẩm sau khuếch đại <br /> Sử dụng “Mồi ngoài” gồm: <br /> Env  31:  5’‐CAGTACAATGTACACATGG‐3’ <br /> (6955 to 6973) <br /> Env  8:  5’‐ATGGGAGGGGCATACATTG‐3’ <br /> (7522 to 7540) <br /> (ANRS công bố năm 2008) <br /> Với  chu  kỳ  nhiệt:  95  oC  trong  5  phút;  40 <br /> chu kỳ gồm 94 oC trong 30 giây, 50 oC trong 30 <br /> giây  và  72  oC  trong  1  phút;  sau  cùng  là  72  oC <br /> trong 10 phút <br /> Sử  dụng  “Mồi  trong”  gồm:  (đoạn khuếch đại <br /> có kích thước 374bp) <br /> Env  7:  5’‐AATGGCAGTCTAGCAGAAG‐3’ <br /> (7008 to 7026) <br /> ED33:  5’‐TTACAGTAGAAAAATTCCCCTC‐<br /> 3’ (7360 to 7381) <br /> (ANRS công bố năm 2008) <br /> Với  chu  kỳ  nhiệt:  95  oC  trong  5  phút;  40 <br /> chu kỳ gồm 94 oC trong 30 giây, 55 oC trong 30 <br /> giây  và  72 oC  trong  40  giây;  sau  cùng  là  72 oC <br /> trong 5 phút <br /> Khi  đã  thực  hiện  khuếch  đại  vùng  gen  env, <br /> chúng tôi cho sản phẩm PCR  chạy  điện  di  trên <br /> gel agarose 2% nhuộm ethidium bromide để xác <br /> định  sản  phẩm  chính  là  gen  env  (dựa  vào  kích <br /> thước đoạn khuếch đại). <br /> Tinh sạch toàn bộ sản phẩm PCR bằng bộ kit <br /> Purification (Qiagen, Hilden, Germany). <br /> <br /> Nhiễm<br /> <br /> Tinh sạch trình tự và phân tích cây quan hệ <br /> tiến hóa <br /> Trình  tự  nucleotide  “thô”  sau  khi  giải  sẽ <br /> được  “tinh  sạch”  bằng  phần  mềm  Mega  5.05. <br /> Chúng tôi xây dựng bộ chủng tham khảo và so <br /> sánh  chúng  với  trình  tự  nucleotide  các  mẫu <br /> tham  khảo  bằng  chức  năng  BLAST  của  cả  2 <br /> chương  trình  Stanford  Sequence  Analysis <br /> (http://hivdb.Stanford.edu/)  và  NCBI  HIV <br /> Subtyping  Tool  (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/). <br /> Kết quả của việc so sánh này là xây dựng được <br /> cây quan hệ tiến hóa của các mẫu trong nghiên <br /> cứu  dựa  theo  cách  tính  toán  của  phương  pháp <br /> neighbour‐joining. <br /> <br /> KẾT QUẢ & BÀN LUẬN <br /> Trong  200  mẫu  bệnh  phẩm  thu  thập  được, <br /> nhóm nghiên cứu chúng tôi đã thành công trong <br /> việc  khuếch  đại,  giải  và  phân  tích  trình  tự  của <br /> 183 mẫu (chiếm 91,5%). <br /> Kết quả phân tích cụ thể cho thấy: 173 mẫu <br /> (chiếm 94,53%) thuộc thể‐tái‐tổ‐hợp  CRF01_AE; <br /> 7 mẫu (chiếm 3,83%) thuộc thứ týp B; và 3 mẫu <br /> (chiếm <br /> 1,64%) <br /> thuộc <br /> thể‐tái‐tổ‐hợp <br /> CRF01_AE_B. Như vậy, kết quả nghiên cứu của <br /> chúng  tôi  một  mặt  khẳng  định  thêm  vào  kiến <br /> thức  về  dịch  tễ  học  phân  tử  của  HIV‐1  tại  Việt <br /> Nam  là  thể‐tái‐tổ‐hợp  CRF01_AE  chủ  yếu  lưu <br /> hành  ở  nước  ta;  một  mặt  cho  thấy  đã  bắt  đầu <br /> xuất hiện ngày càng nhiều hơn các thứ týp khác <br /> và  cả  các  thể‐tái‐tổ‐hợp  CRF  khác  (khi  so  sánh <br /> với các tác giả khác hoàn toàn chỉ phát hiện thể‐<br /> tái‐tổ‐hợp CRF01_AE)(4,12,16,17,18). Ví dụ nghiên cứu <br /> <br /> 381<br /> <br /> Y Học TP. Hồ Chí Minh * Tập 18 * Phụ bản của Số 1 * 2014<br /> <br /> Nghiên cứu Y học <br /> <br /> 5<br /> _15 0<br /> HDR _15 8<br /> R 8<br /> H D R _ 1 73<br /> 1<br /> HD R__1775<br /> H D R 16 2<br /> HD R__1663<br /> HD R _1 72<br /> HDDR _1 67<br /> H R<br /> _1 7 0<br /> HDDRR_11598<br /> H D R_ 15 80<br /> _ 1 8<br /> H<br /> HDDRR_ _17<br /> H D R<br /> H D<br /> H<br /> <br /> 0.2<br /> <br /> Kết quả nghiên cứu của chúng tôi cũng phù <br /> hợp với các kiến thức từ y văn thế giới cho thấy <br /> thể‐tái‐tổ‐hợp  CRF01_AE  lưu  hành  chủ  yếu  ở <br /> vùng Đông Nam Á(6,7,14). <br /> Ngoài  ra,  chúng  tôi  cũng  đã  xác  định  có  ít <br /> nhất  3  mẫu  thuộc  thể‐tái‐tổ‐hợp  CRF01_AE_B, <br /> theo quy ước của thế giới thì kết luận đây là thể <br /> CRF  chứ  không  phải  là  URF  (Unique <br /> Recombinant Form). <br /> Cây quan hệ tiến hóa giữa các thứ týp HIV‐1 <br /> dựa trên trình tự gen env: <br /> <br /> 0.4<br /> <br /> 0.6<br /> <br /> 0.8<br /> <br /> 382<br /> <br /> 20 4<br /> AE<br /> _1 0<br /> R _ 0 027 1<br /> 01 A E<br /> D R _ 03 7<br /> RFF01<br /> H D R _ 09 3<br /> C<br /> H D R _ 1<br /> H D R _1 44 3096 CR<br /> H D R _ 1 M 30<br /> H D R HC M<br /> H D N C<br /> H 7V NH118<br /> 9 7V _ 55<br /> 9 DR _0 03<br /> H DR _0 2<br /> H DR _00 4<br /> H DR _09<br /> H DR 100<br /> H DR_ 116<br /> H DR_ 01<br /> H DR_1 87<br /> H DR_0 2<br /> H R _11<br /> H D R _0 4 4<br /> HD R_056<br /> HD R_103<br /> HD _146<br /> HDR 230<br /> HDR_ 41<br /> HDR_1<br /> HDR_080<br /> HDR_107<br /> HDR_148<br /> HDR_184<br /> HDR_233<br /> HDR_012<br /> HDR_06<br /> 3<br /> HDR<br /> HDR _098<br /> HDR _038<br /> HDR _04<br /> HDR _04 9<br /> HDR _05 7<br /> HDR _05 7<br /> HD _ 8<br /> HD R 016<br /> H D R _00<br /> HD R__0171<br /> HD R 0<br /> HD R _0 6 4<br /> HD R _ 99<br /> HD R _0005<br /> H<br /> _ 2<br /> H D R 0 2<br /> H D R _0 73<br /> HDDRR__0875<br /> H<br /> JQ DRR_ _0 076 3<br /> 40 _0 07 62<br /> 31 82 4<br /> 02<br /> .1<br /> _B<br /> <br /> _B<br /> .1 _B B<br /> 69 7.1<br /> B<br /> 2_<br /> 07 12 3. 1_B B<br /> E_<br /> 1A<br /> 86 81 65484. .1_<br /> F0<br /> J N Y 7 5 8 6 1 678<br /> CR<br /> A Y 4 9 8 6 91<br /> A<br /> 7_<br /> 0<br /> FJ U7R__092 32<br /> E D R 8 52 6<br /> H D H 09<br /> 3<br /> H T<br /> 05DR__1995<br /> H DR _1<br /> H DR<br /> H<br /> <br /> H<br /> 9<br /> H D<br /> 9 8 8 V N EU<br /> 5 4 H D R_<br /> VN B<br /> ND G4 H71 DRR_0 12<br /> 17 CR D 86. _1 39 7<br /> CR F R_ 1_ 32<br /> 0<br /> H D F 01 A 8 B<br /> HD R01 A E 8<br /> HD R__24 E<br /> HD R 06 2<br /> HD R__06 9<br /> HD R_20155<br /> H D R _1 3 6<br /> 8<br /> H D R _05 3<br /> R<br /> HDR _05 9<br /> 3<br /> HDR _081<br /> HDR _072<br /> HDR _041<br /> _<br /> HDR_ 046<br /> 2<br /> HDR_2 48<br /> 3<br /> HDR_12 8<br /> 4<br /> HDR_093<br /> HDR_042<br /> HDR_066<br /> HDR_043<br /> HDR_048<br /> HDR_013<br /> HDR_019<br /> HDR_109<br /> HDR_234<br /> 3<br /> HDR_13 2<br /> 4<br /> HDR_1 37<br /> DR_0 23<br /> H R _1<br /> HD R_008<br /> HD R_181<br /> HD R_089<br /> 1<br /> HD R_01 2<br /> H D R _12 1<br /> D R_1252<br /> HD 0<br /> H DR_<br /> H<br /> <br /> H<br /> H D<br /> H D R<br /> HDDRR_ _16<br /> H<br /> _ 1<br /> H D R_ 15 49 1<br /> HDDRR_1 1663<br /> HD R _ 9<br /> HD R _11901<br /> H D R _1 56<br /> HD R__1757<br /> HD R _ 1 7 6<br /> HD R_117 5<br /> HD R_1 544<br /> 2<br /> H D R_12 9<br /> R<br /> HDR _17 8<br /> 1<br /> HDR _131<br /> HDR _130<br /> HDR _114<br /> _<br /> HDR_ 067<br /> 1<br /> HDR_0 04<br /> HDR_ 95<br /> HXB2_014<br /> env<br /> HDR_009<br /> HDR_106<br /> HDR_050<br /> HDR_136<br /> HDR_125<br /> HDR_197<br /> HDR_196<br /> HDR_194<br /> 7<br /> HDR_18 7<br /> 1<br /> HDR_1 92<br /> R_1 99<br /> H D R _1<br /> HD R_090<br /> H D R _108<br /> HD R_105<br /> 0<br /> HD R_07 1<br /> H D R _11 5<br /> D R_04 1<br /> H D 05<br /> H DR_ 1026<br /> H DR__00 9<br /> H DR _2202<br /> H DR _2 00<br /> H DR _2 861<br /> H DR _123 E<br /> H DRR_ A 60<br /> H D 01 0 61 9<br /> H R F R _ _0 2<br /> C D R _0<br /> 34 HHDDR<br /> 0<br /> H<br /> GX<br /> 05<br /> <br /> 0.0<br /> <br /> Phòng, Đà Nẵng, Khánh Hòa, Cần Thơ, công bố <br /> 100%  các  mẫu  nghiên  cứu  thuộc  chủng <br /> CRF01_AE(16). <br /> <br /> HDR_246<br /> HDR_247<br /> HDR_244<br /> HDR_241<br /> HDR_2<br /> HDR_ 43<br /> HDR_ 185<br /> HDR_ 249<br /> HDR 232<br /> 07C _235<br /> 97T N.HN0<br /> 74<br /> H H6<br /> FJDR_ -107 _CRF<br /> HD05 137 CRF01 01_AE<br /> AE<br /> HD R_3 CRF<br /> ME R 01 01 A<br /> E<br /> HD R _11 0<br /> HD R_LBD 5<br /> H<br /> 1 T<br /> H D R_ 45 RC2<br /> H D R _ 03<br /> CR<br /> HDDRR_11474<br /> F0 1<br /> H<br /> AE<br /> HDDRR__1438<br /> 1 3<br /> H<br /> HDDRR_ _13 34<br /> H R _ 1 9<br /> DR _ 0 40<br /> _1 1 1 0 7<br /> 19 0<br /> <br /> năm  2004  của  tác  giả  Kayoko  Kato  và  các  cộng <br /> sự thực hiện trên những người nghiện chích ma <br /> túy  ở  miền  Bắc  Việt  Nam  cho  kết  quả  rằng <br /> chủng HIV thứ týp E (là danh pháp cũ của thể‐<br /> tái‐tổ‐hợp CRF01_AE) là nổi trội ở khu vực này. <br /> Tạp chí AIDS Research and Human Retroviruses <br /> vào  năm  2012  công  bố  một  nghiên  cứu  của  tác <br /> giả  Rozina  Caridha  và  cộng  sự  cho  thấy  100% <br /> các  mẫu  thu  thập  được  trên  đối  tượng  phụ  nữ <br /> mang  thai  nhiễm  HIV  từ  2005‐2007  ở  Hà  Nội, <br /> Hải Phòng đều thuộc thể‐tái‐tổ‐hợp CRF01_AE. <br /> Trong năm 2010, Tạ Thị Thu Hồng và cộng sự ở <br /> Viện Vệ sinh dịch tễ trung ương đã khảo sát đột <br /> biến  kháng  thuốc  trên  đối  tượng  nhiễm  HIV <br /> chưa  điều  trị  tại  các  tỉnh/thành  Hà  Nội,  Hải <br /> <br />  <br /> <br /> Chuyên Đề Nội Khoa <br /> <br />