Luận văn Thạc sĩ Khoa học: Nghiên cứu đa dạng của hệ vi khuẩn và enzyme thủy phân lignocellulose từ dữ liệu metagenome của vi khuẩn trong dạ cỏ dê

ĐẠI HỌC QUỐC GIA HÀ NỘI<br /> TRƢỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC TỰ NHIÊN<br /> ---------------------<br /> <br /> LƢU HÀN LY<br /> <br /> NGHIÊN CỨU ĐA DẠNG HỆ VI KHUẨN<br /> VÀ ENZYME THỦY PHÂN LIGNOCELLULOSE<br /> TỪ DỮ LIỆU METAGENOME CỦA VI KHUẨN<br /> TRONG DẠ CỎ DÊ<br /> <br /> LUẬN VĂN THẠC SĨ KHOA HỌC<br /> <br /> Hà Nội – 2016<br /> <br /> ĐẠI HỌC QUỐC GIA HÀ NỘI<br /> TRƢỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC TỰ NHIÊN<br /> ---------------------<br /> <br /> LƢU HÀN LY<br /> <br /> NGHIÊN CỨU ĐA DẠNG HỆ VI KHUẨN<br /> VÀ ENZYME THỦY PHÂN LIGNOCELLULOSE<br /> TỪ DỮ LIỆU METAGENOME CỦA VI KHUẨN<br /> TRONG DẠ CỎ DÊ<br /> Chuyên ngành: Sinh học Thực nghiệm<br /> Mã số: 60420114<br /> <br /> LUẬN VĂN THẠC SĨ KHOA HỌC<br /> <br /> NGƯỜI HƯỚNG DẪN KHOA HỌC:<br /> <br /> TS. Đỗ Thị Huyền<br /> PGS.TS Nguyễn Lai Thành<br /> <br /> Hà Nội – 2016<br /> <br /> LỜI CAM ĐOAN<br /> Tôi xin cam đoan đây là công trình nghiên cứu của tôi, dưới sự hướng dẫn<br /> khoa học của TS. Đỗ Thị Huyền và PGS.TS. Nguyễn Lai Thành. Các nội dung<br /> nghiên cứu, kết quả trong đề tài này là trung thực và chưa từng được ai công bố<br /> dưới bất kỳ hình thức nào.<br /> Luận văn cũng sử dụng thông tin, số liệu từ các bài báo và nguồn tài liệu của<br /> các tác giả khác đều có trích dẫn và chú thích nguồn gốc đầy đủ.<br /> Nếu có bất kỳ sự gian lận nào tôi xin hoàn toàn chịu trách nhiệm về nội dung<br /> luận văn.<br /> Học viên<br /> <br /> Lƣu Hàn Ly<br /> <br /> LỜI CẢM ƠN<br /> Tôi xin gửi lời cảm ơn chân thành đến các thầy cô giáo khoa Sinh học,<br /> trường Đại học Khoa học Tự nhiên – Đại học Quốc gia Hà Nội đã trang bị kiến thức<br /> cho tôi trong suốt quá trình học tập.<br /> Đặc biệt, tôi xin bày tỏ lòng biết ơn sâu sắc đến TS. Đỗ Thị Huyền – Viện<br /> Công nghệ Sinh học và PGS.TS. Nguyễn Lai Thành – Khoa Sinh học – Đại học Khoa<br /> học Tự nhiên – ĐHQGHN đã tận tình chỉ bảo và giúp đỡ tôi trong suốt quá trình<br /> nghiên cứu đề tài và hoàn chỉnh bản Luận văn Thạc sĩ này. Xin được cảm ơn đề tài<br /> Độc lập cấp nhà nước mã số ĐTĐLCN.15/14: “Nghiên cứu metagenome của một số<br /> hệ sinh thái mini tiềm năng nhằm khai thác các gen mới mã hóa hệ enzyme chuyển<br /> hóa hiệu quả lignocellulose" do Viện Công nghệ sinh học chủ trì, Bộ Khoa học Công<br /> nghệ chủ quản đã hỗ trợ tôi về mọi phương diện để thực hiện nghiên cứu này.<br /> Tôi xin cảm ơn các cán bộ Phòng Kĩ thuật Di truyền - Viện Công nghệ Sinh<br /> học đã tạo điều kiện, giúp đỡ cho tôi hoàn thành đề tài nghiên cứu.<br /> Cuối cùng, tôi xin chân thành cảm ơn gia đình, bạn bè và đồng nghiệp đã<br /> luôn sát cánh hỗ trợ và động viên tôi về cả vật chất và tinh thần trong suốt quá trình<br /> học tập và nghiên cứu.<br /> Xin chân thành cảm ơn!<br /> Hà Nội, ngày<br /> <br /> tháng<br /> <br /> Học viên<br /> <br /> Lƣu Hàn Ly<br /> <br /> năm<br /> <br /> BẢNG KÍ HIỆU VÀ CHỮ VIẾT TẮT<br /> DNA<br /> <br /> Acid deoxyribonucleic<br /> <br /> RNA<br /> <br /> Acid ribonucleic<br /> <br /> PCR<br /> <br /> Polymerase chain reaction<br /> <br /> CBM<br /> <br /> Carbohydrate binding module<br /> <br /> GH<br /> <br /> Glycosyl hydrolase<br /> <br /> CE<br /> <br /> Carbohydrate esterase<br /> <br /> PL<br /> <br /> Polysaccharide lyase<br /> <br /> ORF<br /> <br /> Open reading frame<br /> <br /> KEGG<br /> <br /> Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes<br /> <br /> COG<br /> <br /> Cluster of Orthologous Groups<br /> <br /> CAZy<br /> <br /> Carbohydrate-Active enZYmes<br /> <br /> GO<br /> <br /> Gene Ontology<br /> <br /> OTUs<br /> <br /> Operation taxonomic units<br /> <br /> i<br /> <br />