Mạng tương tác protein

Nghiên cứu "Xây dựng mạng lưới tương tác hsa_circ_0000284/miRNA/mRNA liên quan bệnh mạch vành" sử dụng thuật toán tin sinh học để dự đoán mạng tương tác của hsa_circ_0000284/miRNA/mRNA trong bệnh mạch vành (CHD). Mạng lưới tương tác của hsa_circ_0000284/miRNA/mRNA được xây dựng với các gen liên quan chủ yếu đến việc điều chỉnh quá trình lão hóa, tuổi thọ và các quá trình tế bào, từ đó mạng tương tác càng cho thấy vai trò của chúng trong sự phát triển của CHD.

10p nhanchienthien 25-07-2023 11 3   Download

Bài giảng Dược lý học: Bài 2 Các yếu tố ảnh hưởng đến tác dụng của thuốc được biên soạn với mục tiêu nhằm giúp sinh viên trình bày được các đường đưa thuốc vào cơ thể và sự hấp thu thuốc; trình bày được ý nghĩa của sự liên kết thuốc với protein huyết tương; trình bày được ảnh hưởng của chuyển hóa thuốc với tác dụng sinh học và độc tính của thuốc; trình bày được các đường thải trừ thuốc; y nghĩa của các thông số dược động học.

51p tranghong0906 04-01-2023 32 10   Download

Nội dung chính của bài viết tập trung vào việc nghiên cứu công cụ phân tích mà có thể được sử dụng như một chỉ số đánh giá khả năng tắc nghẽn của dịch nổi và trong tương lai, có thể sử dụng công cụ này để dự đoán nhanh khả năng tắc nghẽn của màng.

12p vilarrypage 21-11-2021 32 3   Download

Mục tiêu của luận án là tìm hiểu các dạng bài toán dóng hàng các mạng protein nêu trên và các thuật toán giải chúng đã được đề xuất trong thời gian gần đây; Tìm hiểu các kỹ thuật tính toán mềm để từ đó thấy rõ ưu và nhược điểm của từng phương pháp. Trên cơ sở đó, đề xuất các thuật toán mới với chất lượng lời giải tốt hơn các thuật toán hiện tại trong thời gian ngắn hơn cho các bài toán này.

27p viyeri2711 14-09-2021 25 4   Download

Luận văn nghiên cứu xây dựng được các mạng tương tác protein (Protein-Protein Interraction Network – PPI Network) tương đối đầy đủ cho nhiều loài sinh vật. Bài toán dóng hàng mạng PPI là một bài toán quan trọng trong phân tích mạng PPI nói chung. Phương pháp tối ưu đàn kiến (Ant Colony Optimization - ACO) là cách tiếp cận metaheuristic, được giới thiệu bởi Dorigo năm 1991 đang được nghiên cứu và ứng dụng rộng rãi cho các bài toán tối ưu tổ hợp khó.

62p heavysweetness 04-08-2021 29 3   Download

Bài viết trình bày về tính mới của nghiên cứu này về mặt hóa lý là cấu trúc có nhóm thế amine (vốn mang giá trị tương tác sinh học với các phân tử protein cao) của các dẫn xuất ở vị trí C-3 trên vòng 4-hydroxycoumarin mà các nghiên cứu trước chưa công bố. Mời các bạn cùng tham khảo!

7p limingao 28-06-2021 28 2   Download

Bài viết trình bày việc xác định tỉ lệ kháng sinh phù hợp với chẩn đoán, xác định tỉ lệ kháng sinh được kê có liều dùng phù hợp, xác định tỉ lệ kháng sinh có thời gian điều trị phù hợp, tình hình sử dụng kháng sinh tại Bệnh viện.

11p viminnesota2711 22-03-2021 44 4   Download

Đề tài đã trình bày tổng quan về vi vút nói chung và vi rút HIV nói riêng. Tác giả tập trung vào vấn đề tương tác giữa RNA và protein NC đóng vai trò quan trọng như thế nào trong vòng đời của vi rút HIV. Hiện tượng phúc hợp giữa protein mang điện tích dương mà polymer (RNA) mang điện tích âm chủ yếu là do tương tác tĩnh điện, chính vì thế, chúng ta có thể áp dụng các phương pháp vật lý với hệ tĩnh điện để nghiên cứu sự phức hợp của protein với polymer.

56p capheviahe28 01-03-2021 21 3   Download

Bài viết đề xuất một phương thức cải tiến mới nhằm mục đích ưu tiên cho các gen liên quan đến những bệnh có tính chất trên bằng cách tăng cường trọng số liên kết cho các gen ở xa các gen gây bệnh đã biết. Thông qua kiểm chứng hiệu quả phân hạng của phương pháp này với 148 bệnh trên mạng tương tác protein của người và so sánh hiệu quả phân hạng của phương pháp đề xuất với các phương pháp nổi trội hiện có như bước ngẫu nhiên có quay lại (RWR) và dựa trên xác suất liên kết (ERIN).

7p quenchua9 20-11-2020 34 2   Download

Bài viết này giới thiệu một thuật toán metaheuristics hiệu quả, ACOPPI, để dóng hàng mạng PPI. Thuật toán ứng dụng phương pháp tối ưu đàn kiến xây dựng dóng hàng và kết hợp tìm kiếm cục bộ. Thực nghiệm cho thấy thuật toán đề xuất có điểm dóng hàng tốt hơn so với các thuật toán SPINAL, FastNA đã công bố.

5p quenchua9 20-11-2020 39 2   Download

Dựa trên giả thuyết “các protein có tương tác với nhau thường có chung một số chức năng nào đó”, trong nghiên cứu này, tác giả đưa ra một phương pháp dự đoán chức năng của protein dựa vào mạng tương tác protein và dữ liệu chú giải chức năng trong từ điển genes. Phương pháp của chúng tôi dựa trên các thuật toán phân cụm (clustering) proteins.

14p tamynhan8 04-11-2020 36 2   Download

Trong bài báo này, tác giả đề xuất một phương pháp tính toán dựa trên việc phân tích một mạng tích hợp các thông tin: mạng tương tác protein, mạng tương tác microRNA-gen, và các gen gây bệnh ung thư đã biết. Từ mạng tích hợp này, chúng tôi đưa ra phương pháp biểu diễn mới cho các gen dựa vào các tương tác trực tiếp và gián tiếp với các gen khác trong mạng.

9p tamynhan8 04-11-2020 17 2   Download

Luận văn đã nghiên cứu tổng quan về tương tác protein và bài toán dự đoán tương tác protein cũng như khái quát các kiến thức cơ bản của kỹ thuật học sâu, và đi sâu vào nghiên cứu mạng nơ ron tích chập. Đồng thời xây dựng thành công mô hình dự đoán tương tác protein sử dụng mạng nơ ron tích chập.

33p tamynhan0 04-07-2020 38 6   Download

Xác định các gen mới có liên quan đến bệnh là một bài toán quan trọng trong nghiên cứu y sinh. Đây có thể coi là bƣớc khởi đầu trong việc tìm ra phƣơng pháp điều trị cho các bệnh phát sinh do yếu tố di truyền.

13p vitomato2711 11-03-2020 26 2   Download

Interleukin-6 (IL-6) là một cytokine đa chức năng có hoạt tính rộng và có tác động lên hầu hết các loại tế bào của hệ miễn dịch như tế bào B, tế bào T, tế bào gan, tiền tế bào máu và các tế bào của hệ thần kinh trung ương. IL-6 được sản sinh bởi nhiều loại tế bào khác nhau và hoạt động như một cytokine tiền viêm và kháng viêm. Để có thể biểu hiện hiệu quả trong hệ prokaryote, gen IL-6 của gà đã được tách dòng được tối ưu hóa bằng chương trình Optimum Gene Codon Optimization Analysis và hệ số thích ứng codon đã tăng lên 0,89.

6p trinhthamhodang 24-10-2019 55 2   Download

Luận án được tổ chức nội dung như sau: Chương 1 giới thiệu tổng quan về tin sinh học, hai bài toán dóng hàng đồng thời nhiều mạng các vị trí liên kết protein và dóng hàng mạng tương tác protein-protein cùng một số vấn đề liên quan. Chương 2 trình bày ba thuật toán dựa trên phương pháp tối ưu đàn kiến để giải bài toán dóng hàng đồng thời nhiều mạng các vị trí liên kết của protein. Chương 3 trình bày ba thuật toán đề xuất để giải bài toán dóng hàng toàn cục hai mạng tương tác protein-protein.

132p hanh_tv26 04-04-2019 51 9   Download

Nội dung luận văn được chia thành 3 chương như sau: Chương 1 giới thiệu một cách sơ lược về bài toán dự đoán sự tương tác giữa các proteins cũng như các mô hình dự đoán tương ứng điển hình, gần đây nhất. Chương 2 trình bày các kiến thức cơ bản về mạng nơ ron, kỹ thuật học sâu và đi sâu vào mạng nơ ron tích chập. Chương 3 trình bày về xây dựng mô hình để dự đoán, các kết quả đạt được của mô hình đồng thời đi so sánh các kết quả của các phương pháp khác, qua đó có cái nhìn tổng quan về chất lượng của các phương pháp này.

33p hanh_tv26 04-04-2019 50 6   Download

Nội dung đề tài "Dự đoán sự tương tác giữa các protein dựa trên kỹ thuật học sâu" có cấu trúc được chia thành 3 chương nội dung trình bày về: Sơ lược về bài toán dự đoán sự tương tác giữa các proteins cũng như các mô hình dự đoán tương ứng điển hình, gần đây nhất; trình bày các kiến thức cơ bản về mạng nơ ron, kỹ thuật học sâu và đi sâu vào mạng nơ ron tích chập, trình bày về xây dựng mô hình để dự đoán, các kết quả đạt được của mô hình đồng thời đi so sánh các kết quả của các phương pháp khác.

47p hanh_tv26 04-04-2019 49 7   Download

Trong bài báo này, đề xuất một phương pháp mới để ưu tiên ứng viên gen bệnh bằng cách kết hợp học tập củng cố với thuật toán PageRank và gán các mục sư cho gen bệnh đã biết. Đánh giá bằng thực nghiệm phương pháp đề xuất về tương tác protein của con người kết nối mạng và so sánh hiệu suất của nó với các phương pháp tiên tiến, cụ thể là PageRank với các linh mục, Đi bộ ngẫu nhiên với Khởi động lại và K-Step Markov.

13p mat_vang1 15-01-2019 46 2   Download

Mục tiêu nghiên cứu của bài viết nhằm đánh giá tác dụng kháng ung thư của interleukin-12 (IL-12) tái tổ hợp trên mô hình chuột mang ung thư phổi (UTP). Đối tượng và phương pháp: ghép tế bào (TB) UTP chuột Lewis vào dưới da đùi phải 19 chuột nhắt trắng BALB/c, khi khối u phát triển với kích thước khoảng 7 - 10 mm đường kính.

6p jangni4 20-04-2018 42 1   Download